蒙靜雯,謝業(yè)焜,沈林林,李冬亮,祝 雯,詹家綏
(1.福建農(nóng)林大學(xué)植物病毒研究所,福建 福州 350002;2.湖北醫(yī)藥學(xué)院,湖北 十堰 442000)
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馬鈴薯早疫病菌Alternaria alternata交配型異型體MAT1-1和MAT1-2不同的致病力研究
蒙靜雯1,2,謝業(yè)焜1,沈林林1,李冬亮1,祝 雯1,詹家綏1
(1.福建農(nóng)林大學(xué)植物病毒研究所,福建 福州 350002;2.湖北醫(yī)藥學(xué)院,湖北 十堰 442000)
摘 要:從全國(guó)7個(gè)省份(黑龍江、內(nèi)蒙古、山東、河南、湖北、福建和云南)收集Alternaria alternata,采用SSR中性分子標(biāo)記和交配型特異性引物測(cè)定菌株并選出234株不同基因型的菌株,再用離體葉片法測(cè)量菌株的致病力(病斑面積)。結(jié)果表明,7個(gè)群體中來(lái)自南方群體比來(lái)自北方群體致病力強(qiáng),其中福建群體比山東群體的致病力高98.29%。MAT1-1交配型菌株和MAT1-2交配型菌株之間致病力存在顯著差異,MAT1-2交配型菌株致病力比MAT1-1交配型菌株平均高15.34%。
關(guān)鍵詞:Alternaria alternata;馬鈴薯早疫病;致病力;交配型;離體鑒定
在自然條件下,真菌可以通過無(wú)性、有性、準(zhǔn)性和異核等一系列生殖模式在世代間傳遞遺傳物質(zhì)[1],這些不同生殖模式對(duì)真菌本身種群結(jié)構(gòu)、進(jìn)化方向以及病害流行有著不同的影響[2]。真菌的生殖模式由交配型基因(MAT)調(diào)控,該基因由基因組保守區(qū)的基因簇組成編碼與性發(fā)育相關(guān)的多種蛋白[3-4]。對(duì)于許多異宗配合的真菌來(lái)說,有性生殖是由一個(gè)MAT1基因調(diào)控的,該基因編碼兩種不同的異型體(idiomorphs)MAT1-1 和MAT1-2,異型體間核酸序列缺乏相似性,編碼不同的結(jié)構(gòu)蛋白[4-6]。
動(dòng)植物的性別由性染色體決定,雖然真菌的性識(shí)別機(jī)理還不清楚,但其交配型基因區(qū)域中存在類似于動(dòng)物性染色體上發(fā)生的基因異位或者重排的現(xiàn)象,說明真菌和動(dòng)物在性別識(shí)別上可能具有相似的進(jìn)化特點(diǎn)[7]。動(dòng)物的雌性和雄性受到性染色體直接或者間接的影響,在形態(tài)和生理上存在差異,但真菌不同交配型是否存在形態(tài)、生理和生態(tài)特征的差異有待進(jìn)一步探討。部分研究表明有的真菌不同交配型的菌株在致病力、細(xì)胞生長(zhǎng)和維持細(xì)胞壁完整性的特征上存在一定差異[3,8-9]。例如在農(nóng)業(yè)上,小麥葉枯病菌(Zymoseptoria tritici)MAT1-1交配型菌株致病力比MAT1-2交配型菌株致病力高[10],煙曲霉(Aspergillus fumigatus)MAT1-1交配型比MAT1-2交配型有更強(qiáng)的侵染力[11];在臨床醫(yī)學(xué),新型隱球菌(Cryptococcus neoformans)α交配型菌株比a交配型菌株致病力更高[12]。
Alternaria alternata屬鏈格孢屬菌,在世界各地都可以引起早疫病害[13-16]。在自然條件下尚未發(fā)現(xiàn)早疫病菌有性生殖過程,因此一直被劃分為無(wú)性生殖真菌,但這種真菌仍然攜帶有兩個(gè)不同異型體MAT1-1 和MAT1-2的MAT1基因,控制有性生殖行為和有性孢子的產(chǎn)生[5-6]。Arie等[5]用PCR方法從A. alternata中克隆交配型MAT1基因序列,利用側(cè)翼區(qū)域?qū)AT1-2異型體全長(zhǎng)測(cè)序,發(fā)現(xiàn)MAT1-2蛋白中保守的high mobility group (HMG)區(qū)域,同時(shí)利用側(cè)翼區(qū)域設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增相反MAT1-1異型體。發(fā)現(xiàn)MAT1-1異型體至少包含1個(gè)假定alpha box區(qū)域蛋白基因的編碼區(qū),MAT1-2異型體至少包含1個(gè)假定HMG box區(qū)域蛋白基因的編碼區(qū)。通過異源表達(dá),在A. alternata的近緣種Cochliobolus heterostrophus 中證明MAT1基因有功能。
在自然條件下我國(guó)A. alternata 群體兩種不同交配型異型體的時(shí)空頻率分布呈等比例分布[17],與之前報(bào)道的結(jié)果一致[18-19],說明該病原在自然條件下可能存在隱性有性生殖,兩種交配型菌株有同樣的機(jī)會(huì)侵染寄主。本試驗(yàn)分析比較A. alternata的致病力,研究交配型基因除了決定真菌的性行為外,是否還具有其他生理生化作用。
1.1 試驗(yàn)材料
1.1.1 病葉收集 2011—2013年在我國(guó)7個(gè)省份(黑龍江、內(nèi)蒙古、山東、河南、湖北、福建和云南)收集有黑褐色同心圓壞死斑癥狀的馬鈴薯早疫病病葉[15],間隔1~2 m隨機(jī)采樣,每株植株上摘取1片病葉。
1.1.2 病原菌分離純化 收集的病葉用流動(dòng)的自來(lái)水沖洗后晾干,用75%酒精表面消毒2 min,再用無(wú)菌水反復(fù)洗3次,除去葉片表面水分,置于1%的水瓊脂(瓊脂粉10 g/L)培養(yǎng)基中保濕培養(yǎng)。在25℃培養(yǎng)24 h后挑取病斑長(zhǎng)出的菌絲,置于馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA:土豆200 g/L,葡萄糖20 g/L和瓊脂18 g/L)上培養(yǎng),25℃條件下培養(yǎng)5 d左右。對(duì)培養(yǎng)出來(lái)的菌絲做單孢分離,置于PDA培養(yǎng)基上培養(yǎng),完成純化。
1.1.3 病原菌鑒定和培養(yǎng) 使用光學(xué)顯微鏡進(jìn)行真菌形態(tài)學(xué)觀察[16,20]和采用真菌通用引物ITS1 和ITS4進(jìn)行PCR擴(kuò)增并測(cè)序。引物序列:ITS1 (5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGC-3′)和ITS4 (5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′)。收集純化后的菌絲提取DNA。經(jīng)過形態(tài)學(xué)和分子生物學(xué)方法,檢測(cè)鑒定為A. alternata。
1.1.4 主要試劑 Taq DNA 聚合酶、2×Taq PCR Master Mix、DNAMarker100bp均購(gòu)于北京全式金公司,2×EasyTaq PCR SuperMix(-dye)購(gòu)自北京Transgen 生物科技有限公司。瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒、Plant gDNA Kit 購(gòu)于Promage公司。PCR引物合成和測(cè)序由北京睿博興科生物技術(shù)有限公司和南京金斯瑞技術(shù)有限公司完成。其他常規(guī)試劑購(gòu)自上海生工生物工程公司。
1.1.5 主要儀器 臺(tái)式高速冷凍離心機(jī)、PCR擴(kuò)增儀(Applied Biosystems公司2720 thermal cycler儀器)、微量移液器(Eppendorf公司)、電泳儀、水平電泳槽、紫外反射投射儀、凝膠成像系統(tǒng)G:BOX F3(Syngene公司)、低溫冰箱。
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 提取病原菌總DNA 收集菌絲,按照植物總DNA提取試劑盒的使用說明來(lái)提取菌株總DNA,置于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 SSR標(biāo)記擴(kuò)增病原菌 使用8對(duì)微衛(wèi)星標(biāo)記(SSR標(biāo)記)[21-22]擴(kuò)增病原菌總DNA,擴(kuò)增體系(25 μL):12.5 μL反應(yīng)混合液2×EasyTaq PCR SuperMix(-dye),正反向引物(10 μmol/L)各1 μL,DNA模板1 μL,無(wú)菌水9.5 μL。SSR標(biāo)記的正向引物5′端用不同的熒光FAM、ROX、TAMRA標(biāo)記(北京睿博興科生物技術(shù)有限公司合成)。PCR程序:95℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,57℃退火30 s,72℃延伸30 s,35個(gè)循環(huán);72℃終延伸5 min。PCR產(chǎn)物由北京睿博興科生物技術(shù)有限公司完成測(cè)序。
根據(jù)每對(duì)SSR引物擴(kuò)增PCR 產(chǎn)物大小,使用GeneMaker軟件(SoftGenetics,Pennsylvania State University,America)進(jìn)行等位基因分配。相同引物擴(kuò)增相同大小條帶被作為1個(gè)等位基因。每個(gè)菌株多位點(diǎn)單倍型結(jié)合8對(duì)SSR位點(diǎn)等位基因一起組成。如果不同菌株間多位點(diǎn)單倍型都一致則認(rèn)為是同一個(gè)無(wú)性系中的個(gè)體,即無(wú)性生殖的后代。
1.2.3 交配型基因MAT1特異性引物擴(kuò)增病原菌 交配型特異性引物依據(jù)GenBank下載A. alternata交配型全序列GU735423.1 和GU735413.1設(shè)計(jì)(表1)。 引物A擴(kuò)增攜帶MAT1-1交配型異型體的病原菌,條帶大小為661 bp;引物B 擴(kuò)增攜帶MAT1-2交配型異型體的病原菌,條帶大小為494 bp。將兩種引物混合進(jìn)行PCR擴(kuò)增即雙重PCR。擴(kuò)增體系(20 μL):10×PCR 反應(yīng)緩沖液2 μL,dNTP(2.5 mmol/L)2 μL,DNA 聚合酶(5 U/μL)1 μL,A正反向引物(10 μmol/L)各1 μL,B正反向引物(10 μmol/L)各1 μL,DNA模板2 μL和無(wú)菌水9 μL。PCR程序:95℃預(yù)變性5 min;94℃變性60 s,53℃退火30 s,72℃延伸30 s,33個(gè)循環(huán);72℃終延伸10 min。用含有G8140 Golden ViewⅠ(北京Solarbio 科技有限公司)的1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物,100 V電泳1 h。在凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)果并記錄。
表1 擴(kuò)增鏈格孢屬真菌A. alternata交配型異型體的特異性引物序列信息
1.2.4 致病力試驗(yàn) 菌株按照采樣地點(diǎn)分成7個(gè)群體(黑龍江、內(nèi)蒙古、山東、河南、湖北、福建和云南群體)。每個(gè)群體挑選出約30種不同基因型A. alternata菌株置于PDA培養(yǎng)基,25℃條件下培養(yǎng)5 d。采用離體葉片法:摘取生長(zhǎng)周期4 周大小的Favorita品種健康葉片,用無(wú)菌水沖洗表面后晾干,置于1%的水瓊脂 (瓊脂粉10 g/L)培養(yǎng)基中保濕培養(yǎng)。在試供菌株的菌落邊緣打直徑為5 mm的菌餅,接在健康的馬鈴薯葉片背面(生長(zhǎng)4周大小Favorita品種葉片),每片葉子接1個(gè)菌餅,每株菌重復(fù)4次,對(duì)照接沒有菌的菌餅,置于22℃條件下16 h光照,8 h黑暗保濕培養(yǎng)。每天拍照記錄發(fā)病情況,用Assess軟件[23]測(cè)量第5天的病斑面積。
2.1 不同交配型病原菌致病力分布
根據(jù)SSR數(shù)據(jù),從7個(gè)群體選出234株不同基因型的株菌,進(jìn)行交配型和致病力鑒定。在這些菌株中,119株為MAT1-1,115株為MAT1-2,兩者的比例為1.03∶1,卡方檢測(cè)符合1∶1分布(χ2=0.04,df =1,P=0.84)。不同交配型菌株致病力分布趨勢(shì)相似(圖1)。病斑面積在0.5~2 cm2范圍內(nèi),MAT1-1交配型菌株數(shù)量大于MAT1-2交配型菌株數(shù)量,所占比例為75%、67%;病斑面積在3~5 cm2范圍以及7~11 cm2范圍內(nèi),MAT1-2交配型菌株數(shù)量大于MAT1-1交配型菌株數(shù)量,所占比例分別為13%與8%、5%與2% (圖1)。234株菌中不同交配型之間的病原菌致病力顯著不同,其中MAT1-1交配型菌株的病斑面積為0~9.31 cm2,平均病斑面積是1.72 cm2;MAT1-2交配型菌株的病斑面積為0~10.09 cm2,平均病斑面積是1.96 cm2。
圖1 不同交配型A. alternata致病力差異頻率分布
2.2 不同交配型病原菌致病力差異分析
表2 不同交配型和群體的A. alternata菌株致病力差異分析
方差分析結(jié)果表明不同群體、不同交配型的A. alternata在致病力上存在顯著差異(表2~表4)。由表3可知,在被分析的7個(gè)群體中,來(lái)自南方的群體比來(lái)自北方的群體致病力強(qiáng),福建的群體致病力最強(qiáng),山東的群體致病力最弱,兩者之間相差約1倍(2.32/1.17)。7個(gè)群體中除了河南和黑龍江群體外,MAT1-2交配型菌株致病力均顯著高于MAT1-1交配型菌株。7個(gè)群體中MAT1-2菌株致病力最強(qiáng)的是福建群體,最弱的是黑龍江群體;MAT1-1菌株致病力最強(qiáng)的是云南群體,最弱的是山東群體。總體來(lái)說,MAT1-2菌株的平均致病力為1.88,MAT1-1菌株的平均致病力為1.63,前者高于后者15.34%(表4)。
表3 最小顯著性差異法(LSD)比較7個(gè)A. alternata群體致病力差異
注:同列數(shù)據(jù)后大寫英文字母不同者表示差異極顯著,表4同。
表4 最小顯著性差異法(LSD)比較7個(gè)A. alternata群體內(nèi)不同交配型菌株致病力差異
本研究采用群體遺傳學(xué)的方法研究來(lái)自全國(guó)7個(gè)省份的A. alternata不同群體不同交配型的菌株致病力差異性。方差分析表明,導(dǎo)致菌株間致病力差異的原因由多因素決定,如菌株生長(zhǎng)環(huán)境、交配型和菌株遺傳背景等,進(jìn)而說明病原菌能否成功侵染寄主不僅與攜帶的毒性基因有關(guān)[24-25],還與基因組中微效多基因有關(guān)[10,26],這些基因?qū)曛虏×τ屑有赃z傳效應(yīng)[27]。
7個(gè)群體中南北方群體的菌株致病力有顯著差異,其中來(lái)自南方的福建群體比來(lái)自北方的山東群體致病力高98.29%,5/7群體中不同交配型菌株致病力有顯著差異。兩種不同的交配型致病力最強(qiáng)的群體分別是福建和云南,均屬于南方群體,平均而言7個(gè)群體中MAT1-2交配型菌株致病力比MAT1-1交配型菌株的高15.34%。同時(shí)在兩種交配型菌株致病力差異頻率分布圖中當(dāng)病斑面積< 3 cm2時(shí)MAT1-1交配型菌株數(shù)量大于MAT1-2交配型菌株;當(dāng)病斑面積> 3 cm2時(shí),MAT1-2交配型菌株數(shù)量大于MAT1-1交配型菌株。MAT1-2交配型菌株的病斑面比MAT1-1交配型菌株的大13.95%。
自然條件下在25~28℃、相對(duì)濕度70% 以上的環(huán)境里容易發(fā)生馬鈴薯早疫病病害[28]。本研究的7個(gè)群體中福建省地理環(huán)境(緯度最低、熱帶季風(fēng)氣候)更適合早疫病的發(fā)生,病原菌致病力相對(duì)較高。同時(shí)7個(gè)群體中MAT1-2菌株致病力最強(qiáng)的是福建群體,MAT1-1菌株致病力最強(qiáng)的是云南群體。總體來(lái)說,MAT1-2交配型菌株致病力比MAT1-1交配型菌株的強(qiáng)。 然而之前的研究發(fā)現(xiàn),在全國(guó)A. alternata 兩種不同交配型菌株空間分布頻率呈1∶1等比例分布特點(diǎn),高致病力的交配型菌株并沒有影響交配型菌株的頻率,這可能是由于其他生態(tài)特征與交配型的頻率依賴選擇導(dǎo)致[10]。對(duì)于有性和無(wú)性生殖交替循環(huán)的真菌來(lái)說,群體中暫時(shí)會(huì)出現(xiàn)更多致病力高的交配型菌株,但不同交配型菌株的分布頻率很快恢復(fù)到等比例分布的情況[29]。雖然與病原菌A. alternata致病力相關(guān)的生物因素和遺傳機(jī)制尚不清楚,試驗(yàn)結(jié)果表明在馬鈴薯葉片上A. alternata侵染、傳播過程中MAT1交配型基因有一定作用。
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(責(zé)任編輯 崔建勛)
Significant difference in pathogenicity of MAT1-1 and MAT1-2 isolates in potato pathogen Alternaria alternata
MENG Jing-wen1,2,XIE Ye-kun1,SHEN Lin-lin1,LI Dong-liang1,ZHU Wen1,ZHAN Jia-sui1
(1. Institute of Plant Virology,F(xiàn)ujian Agriculture and Forestry University,F(xiàn)uzhou 350002,China;2. Hubei University of Medicine,Shiyan 442000,China)
Abstract:Alternaria alternata collected from seven provinces (Heilongjiang,Inner Mongolia,Shandong,Henan,Hubei,F(xiàn)ujian and Yunnan)in China were molecularly characterized using neutral SSR markers and mating typespecific primers. Among them,234 distinct genotypes were selected for pathogenicity analysis by detached leaf assay. The result indicated that,on average,the pathogen from South displayed higher pathogenicity than that from North. For example,the pathogenicity of pathogen from Fujian was 98.29% higher than that from Shandong. The result also showed a significant difference in pathogenicity between MAT1-1 and MAT1-2 isolates. On average,MAT1-2 isolate displayed 15.34% higher pathogenicity than MAT1-1 isolate.
Key words:Alternaria alternata;potato early blight;pathogenicity;mating types;detached leaf inoculation
中圖分類號(hào):S432.1
文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A
文章編號(hào):1004-874X(2016)02-0089-05
收稿日期:2015-10-13
基金項(xiàng)目:國(guó)家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)(馬鈴薯)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-10)
作者簡(jiǎn)介:蒙靜雯(1985-),女,在讀博士生,E-mail:mjw175860836@163.com
通訊作者:詹家綏(1963-),男,博士,教授,E-mail:jiasui.zhan@fafu.edu.cn