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        中國農科院芝麻大規(guī)模全基因組關聯(lián)分析完成

        2016-04-10 05:34:07
        生物學教學 2016年5期
        關鍵詞:油脂關聯(lián)

        據(jù)科學網(wǎng)2015年11月25日報道,中國農科院油料所張秀榮研究團隊與中科院國家基因研究中心等單位合作,在國際上率先完成了芝麻高密度單倍型圖譜構建和主要農藝性狀大規(guī)模全基因組關聯(lián)分析,為芝麻遺傳改良等奠定了基礎。研究成果在線發(fā)表于《自然·通訊》雜志。

        芝麻是重要的油料作物,含油量高,富含不飽和脂肪酸、芝麻素等人體有益物質。芝麻為二倍體,基因組較小,是油脂相關性狀研究的理想作物。研究團隊在前期完成芝麻基因組測序基礎上,篩選來自29個國家705份芝麻資源進行全基因組測序,發(fā)掘500多萬個單核苷酸多態(tài)性(SNP),構建了芝麻高密度單倍型圖譜。

        分析發(fā)現(xiàn),芝麻資源分化為南、北方兩個生態(tài)類型。對與油脂和產量相關的56個重要農藝性狀進行的全基因關聯(lián)分析獲得關聯(lián)位點549個、候選基因46個。芝麻含油量不僅受油脂代謝酶類調控,還受其他基因調控(例如種皮顏色控制基因SiPPO、木質素合成基因SiNST1),這為油料作物含油量的遺傳改良提供了新思路。對芝麻種子脂肪酸成分的關聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)了多個脂肪酸代謝關鍵基因,初步解析了芝麻油脂代謝調控網(wǎng)絡。研究還發(fā)現(xiàn)一系列與產量相關基因,這些基因的積累是芝麻育成品種產量較地方品種高的重要因素。

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