席赫岐,史秀麗
(1.鄭州市第一中學,河南 鄭州 450052;2.鄭州市電子信息工程學校)
不同環(huán)境豐富度設置下豬血清蛋白SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳分析研究
席赫岐1,史秀麗2
(1.鄭州市第一中學,河南 鄭州 450052;2.鄭州市電子信息工程學校)
為考察不同環(huán)境豐富度設置對豬血清蛋白質(zhì)圖譜的影響,以不同環(huán)境豐富度設置下的豬血清為材料,分別針對豬血清1∶2、1∶3、1∶4、1∶5、1∶6、1∶7、1∶8、1∶9、1∶10的稀釋倍數(shù)和12%、10%、8%的分離膠濃度進行豬血清蛋白SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳參數(shù)優(yōu)化,并對豬血清蛋白質(zhì)圖譜進行分析。結(jié)果表明:豬血清的適宜稀釋倍數(shù)為1∶9;8%分離膠對于大于60kDa和小于50kDa的蛋白質(zhì)分離效果較好,12%分離膠對于50~60kDa間蛋白分離效果較好;共分離到豬血清蛋白質(zhì)21種,18種為各組樣品中均表達的蛋白質(zhì),3種為試驗組中差異化表達的蛋白,其中215.11kDa蛋白在試驗組各樣品中均表達;65.29kDa和52.04kDa這兩個蛋白分別僅在試驗組的樣品3、樣品2中表達。說明不同環(huán)境豐富度設置可以引起豬血清蛋白的差異化表達。
環(huán)境豐富度;豬血清蛋白;SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳;蛋白質(zhì)圖譜
動物血清中含有多種蛋白質(zhì),它們各自有獨特的結(jié)構和分子量,其含量的變化與動物的營養(yǎng)狀況、親緣關系、疾病診斷具有重要關系[1]。血清蛋白質(zhì)的研究常常是利用電泳技術,把血清中不同蛋白質(zhì)分離,進行蛋白質(zhì)圖譜、不同蛋白質(zhì)的定量定性與差異化分析。SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳以凝膠為支持物,根據(jù)凝膠孔徑大小不同,利用樣品的濃縮效應、電泳分離的電荷效應實現(xiàn)不同蛋白質(zhì)的分離。該電泳具有所需樣品量少、分辨率高、結(jié)果可以永久保存、便于樣品的分離、純度鑒定、多態(tài)性分析與分子量測定等優(yōu)點[2],正在被越來越多的血清蛋白質(zhì)研究者所應用[3-5]。
豬血清蛋白質(zhì)是一種重要的質(zhì)量性狀生化遺傳標記,其蛋白質(zhì)圖譜分析對豬的遺傳育種、飼養(yǎng)環(huán)境評價和疾病診斷有重要意義[6]。然而目前針對豬血清蛋白質(zhì)SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳分析的研究報道較少。閆美榮等[7]利用不連續(xù)聚丙烯酰胺凝膠圓盤電泳,把血清進行1∶2稀釋,分別采用7%和10%凝膠濃度,分析了黑豬血清蛋白質(zhì)和堿性磷酸酶同工酶生化位點遺傳多態(tài)性。SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳操作難度比較大,影響因素比較多,其中凝膠濃度的確定、樣品上樣量的多少是保障蛋白質(zhì)分離效果的基礎,然而針對豬血清蛋白質(zhì)電泳有關膠濃度、上樣量優(yōu)化參數(shù)以及利用SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳研究不同環(huán)境豐富度設置下豬血清蛋白質(zhì)圖譜的研究未見報道。該研究以不同環(huán)境豐富度設置下的豬血清為材料,針對血清稀釋倍數(shù)、分離膠濃度進行豬血清蛋白SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳參數(shù)優(yōu)化與豬血清蛋白質(zhì)圖譜分析研究,目的是建立穩(wěn)定的豬血清SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳體系,為豬血清蛋白質(zhì)組學研究奠定基礎。
1.1 試驗材料
1.1.1 豬血清 豬血清來自河南某規(guī)模豬場不同環(huán)境設置下的皮特蘭豬血清。環(huán)境設置以常規(guī)養(yǎng)殖環(huán)境為對照,在試驗組圈舍內(nèi)增加利于豬只啃咬、玩耍的鐵鏈、輪胎等玩具以增加圈舍內(nèi)的環(huán)境豐富度。血清的采集分別從對照組、試驗組隨機選取3頭豬,從耳靜脈采血5~10 ml,靜置30 min,3 000 r/min 20 min,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.1.2 主要試劑 標準蛋白質(zhì)MARKER(20 to 220 kDa),分子量依次為220、120、100、80、60、50、40、30、20kDa。電泳試劑為三羥甲基氨基甲烷(Tris)、丙烯酰胺(Acr)、N,N’-甲叉雙丙烯酰胺(Bis)、十二烷基磺酸鈉(SDS)、四甲基乙二胺(TEMED)、過硫酸銨、甘氨酸、溴酚藍、考馬斯亮藍R-250、甲醇、冰乙酸等。
1.1.3 儀器與設備 H-1850R臺式高速冷凍離心機,DYCZ-24DN型雙垂直電泳儀,DYY-2C型雙穩(wěn)定時電泳儀電源。
1.2 試驗方法
1.2.1 血清稀釋 豬血清稀釋倍數(shù)按照文獻[8]方法,取豬血清蛋白質(zhì)樣品,用pH6.8Tris-HCL緩沖液分別做1∶2、1∶3、1∶4、1∶5、1∶6、1∶7、1∶8、1∶9、1∶10稀釋混勻后,在沸水浴中加熱3~4 min,冷卻后備用,上樣量為10 μl,濃縮膠為3%、分離膠為12%,進行電泳,考察樣品稀釋倍數(shù)對電泳效果的影響。
1.2.2 分離膠濃度的選擇 根據(jù)確定的樣品稀釋倍數(shù),分別采用8%、10%、12%的分離膠進行電泳,標準marker的上樣量為5 μl,樣品上樣量10 μl,考察分離膠濃度對豬血清蛋白質(zhì)電泳效果的影響。
1.2.3 豬血清蛋白質(zhì)圖譜分析 按照參考文獻[9],以標準蛋白質(zhì)的遷移率為橫坐標,以其對應蛋白分子量的對數(shù)為縱坐標繪制標準曲線,根據(jù)樣品蛋白的遷移率計算相應蛋白的相對分子質(zhì)量。
2.1 樣品稀釋倍數(shù)對電泳效果的影響
血清中含有多種蛋白質(zhì),其中以白蛋白為最多,占血清蛋白的60%以上。相同上樣量情況下,適宜的稀釋倍數(shù)決定了蛋白質(zhì)的分離效果,豬血清蛋白質(zhì)樣品適宜稀釋倍數(shù)為1∶9。
2.2 分離膠濃度對豬血清蛋白質(zhì)電泳效果的影響
分離膠濃度不同,形成的凝膠孔徑不同,凝膠孔徑的大小隨凝膠濃度的增加而降低。通常需要根據(jù)分離蛋白分子量的大小配制不同孔徑的凝膠。標準蛋白marker在12%、10%、8%的分離膠中,分別跑出7、6、6條帶;在12%分離膠中,大于60kDa的蛋白質(zhì)分離效果不好,50~60kDa蛋白分離條帶較為清晰,40~50kDa蛋白質(zhì)分離效果不好;在10%分離膠中,大于60kDa的蛋白質(zhì)分離條帶中明顯優(yōu)于12%分離膠,但是各蛋白質(zhì)條帶間距離較小,分子量在60kDa左右的蛋白質(zhì)分離條帶不夠清晰。比較3種分離膠對豬血清蛋白質(zhì)電泳效果,可以明顯看出,8%分離膠對于大于60kDa蛋白質(zhì)的分離效果最好,小于50kDa蛋白質(zhì)的分離效果優(yōu)于10%、12%的分離膠效果;但對于50~60kDa蛋白質(zhì)分離效果以12%分離膠效果較好。
2.3 不同環(huán)境豐富度設置下豬血清蛋白質(zhì)圖譜分析
根據(jù)8%分離膠電泳結(jié)果,建立蛋白質(zhì)Marker的標準曲線,見下圖。根據(jù)試驗組、對照組每一條帶分離蛋白的遷移率,可以獲得相應蛋白的相對分子量,見下表??梢钥闯觯?%分離膠共分離到19種蛋白質(zhì),其中16種蛋白質(zhì)是所有豬血清共有的蛋白,分子量分別為319.52、275.64、231.63、177.28、156.74、133.10、113.02、101.12、91.03、75.29、65.29、63.26、57.53、48.85、43.27、41.26kDa。差異化表達的蛋白3種,分子量分別為215.11、65.29、52.04kDa。差異化表達的3種蛋白均出現(xiàn)在試驗組,其中215.11kD的蛋白在試驗組中均出現(xiàn),而在對照組中均不表達;65.29kDa和52.04kDa這兩個蛋白僅在試驗組的樣品3、樣品2中分別表達,在其他各組樣品中均沒有表達。在每種樣品中表達量較多的蛋白依次為75.29 kDa、65.29 kDa、91.03 kDa、43.27 kDa、177.28 kDa,并且在各樣品中表達量無顯著差異;而分子量為63.26kDa,雖然在所有樣品中都表達,但是在樣品3中的表達量明顯少于其他各樣品。說明試驗組中不同環(huán)境設施的增加,可以引起豬血清蛋白的差異化表達。
圖 蛋白質(zhì)Marker8%分離膠的標準曲線
表 不同環(huán)境設施下8%分離膠豬血清蛋白質(zhì)圖譜分析
3.1 不同分離膠濃度對豬血清蛋白電泳效果的影響
正確選擇適宜凝膠濃度是SDS-聚丙烯酸胺凝膠電泳成敗的關鍵[10]。凝膠濃度不同,電泳分辨率不同。該研究表明:不同的分離膠濃度,蛋白質(zhì)的泳動速率、帶間距離、條帶數(shù)量不同。比如12%分離膠時,各樣品中50~60kDa蛋白均可清晰分離到4條帶;而在8%分離膠中,條帶有重合現(xiàn)象,大部分樣品都少于4條帶。但是在8%分離膠中大于60kDa和小于50kDa的蛋白質(zhì)分離效果顯著優(yōu)于10%和12%的分離膠。該研究根據(jù)8%分離膠可分離到19種豬血清蛋白,而結(jié)合12%分離膠,則可以分離到21種豬血清蛋白,其中大于60kDa蛋白有14種,50~60kDa蛋白有4種,小于50kDa蛋白3種,遠高于文獻[7]所報道分離到黑豬血清蛋白10~12種。由此可見,分離任何一種混合蛋白,僅用一種凝膠濃度不能確定是否為最佳分離效果,需要將具有不同分子篩效應的一系列濃度的凝膠加以比較,才能根據(jù)蛋白質(zhì)的不同分子量范圍篩選出最合適的相應凝膠濃度。
3.2 不同環(huán)境豐富度設置對豬血清蛋白質(zhì)圖譜的影響
豬血清蛋白質(zhì)圖譜可以反映豬只血液中蛋白質(zhì)狀況,其表達量的多少和差異化表達,可以用來評價豬只的健康水平。在豬舍內(nèi)提供利于豬只天性表達的玩具等設施提高飼養(yǎng)環(huán)境的豐富度,是改善動物福利,實現(xiàn)健康養(yǎng)殖的有效措施[11]。環(huán)境豐富度的增加,促使畜禽能在“自然”環(huán)境中表現(xiàn)其“天性”行為,使其心理和生理都達到健康狀態(tài)[12]。該研究表明,在增設利于豬只啃咬、玩耍的鐵鏈、輪胎等玩具的試驗組豬只都差異化表達了215.11kDa蛋白,結(jié)合文獻[13]豬血清醋酸纖維薄膜電泳圖譜,推測該蛋白可能是免疫球蛋白的一種。此外65.29kDa和52.04kDa這兩個蛋白分別僅在試驗組的樣品3、樣品2中表達,產(chǎn)生這種現(xiàn)象的原因可能與豬只個體對環(huán)境豐富設施如鐵鏈或者輪胎的偏好傾向性不同有關,還有待進一步研究。
[1]楊貴強,徐紹剛,王建,等.幾種鮭鱒魚血清蛋白非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳的研究[J].海洋與湖沼,2013,44(4):1068-1072.
[2]鮑思元.DNA變性聚丙烯酰胺凝膠電泳的實驗教學改進[J].實驗科學與技術,2015,13(2):122-124.
[3]韋霄,張志勇,何敏,等.兩種分離人血清蛋白質(zhì)電泳技術的比較研究[J].中國熱帶醫(yī)學,2007,7(9):1550-1551.
[4]劉亭廷,彭程,馬云川,等.碳量子點熒光成像法應用于聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測人血清蛋白質(zhì)的研究[J].化學學報,2013,(71):962—966.
[5]張強敏,沈秋姑,張?zhí)?江西地方黑雞血清蛋白質(zhì)SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳[J].江西畜牧獸醫(yī)雜志,2001,(4):6-8.
[6]錢繼寧,朱善良,許曉鳳,等.山豬血清蛋白質(zhì)多態(tài)性聚丙烯酞胺凝膠電泳分析研究[J].江蘇教育學院學報(自然科學版),2006,23(3):5-9.
[7]閆美榮,侯金鳳.黑豬血清蛋白質(zhì)及堿性磷酸酶聚丙烯酰胺凝膠電泳分析[J].內(nèi)蒙古農(nóng)牧學院學報,1999,20(3):35-38.
[8]李慶章,吳永堯.生物化學實驗指導.中國農(nóng)業(yè)出版社,2011,(7):181-184.
[9]王宗仁,賈鳳蘭.八種動物血清蛋白的聚丙烯酷胺凝膠電泳和在進化中相互的關系[J].遺傳學報,1998,15(4):290-298.
[10]姚民昌,張維民.大豆聚丙烯酸胺凝膠電泳制膠濃度選擇[J].遼寧師范大學學報(自然科學版),1988,(1):51-54.
[11]席磊,施正香,耿愛蓮,等.生長育肥豬對環(huán)境豐富度材料的選擇傾向性研究[J].中國農(nóng)業(yè)大學學報,2007,12(6):75-79.
[12]劉世榮,劉雁征,李云開.規(guī)?;i場動物福利的環(huán)境豐富度調(diào)控技術研究進展[J].中國畜牧獸醫(yī),2007,34(12):129-132.
[13]陳書明,曹新鵬,胡軍,等.6種血清的醋酸纖維素薄膜電泳分析[J].山西農(nóng)業(yè)科學,2010,38(6):18-20.
S828
B
1004-5090(2016)12-0009-03
2016-10-16)