方雅麗 周 婷
(汕頭市公安局刑警支隊(duì)刑事技術(shù)中心,廣東汕頭515011)
汕頭地區(qū)漢族人群17個(gè)STR基因座遺傳多態(tài)性
方雅麗 周 婷
(汕頭市公安局刑警支隊(duì)刑事技術(shù)中心,廣東汕頭515011)
本文通過(guò)收集汕頭市712份漢族無(wú)關(guān)個(gè)體FTA血樣,對(duì)17個(gè)STR基因座遺傳多態(tài)性,進(jìn)行基因型檢測(cè),并計(jì)算其遺傳學(xué)參數(shù)。調(diào)查顯示,汕頭地區(qū)漢族人群17個(gè)STR基因座H為0.566~0.904,DP為0.744~0.984,PE為0.333~0.923,PIC為0.50~0.90,累積個(gè)體識(shí)別能力(CDP)為1~6.6434×10-21,累積非父排除率(CPE)為0.999999975201。汕頭地區(qū)漢族人群17個(gè)STR基因座有較高的鑒別能力,為法醫(yī)個(gè)體識(shí)別和親緣鑒定提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
法醫(yī)物證學(xué)STR基因座遺傳多態(tài)性汕頭地區(qū)
根據(jù)基因、人類(lèi)學(xué)和史學(xué)調(diào)查研究,潮汕人群是典型的中國(guó)南方漢族群體,現(xiàn)代潮汕人源自古中原漢族,主要是自秦漢以來(lái)大量的中原漢族移民與南方土著居民雜居后形成的[1][2]。本文對(duì)汕頭地區(qū)漢族群體D3S1358、Penta E、D18S51、D16S539、TH01、vWA、FGA、TPOX、D19S433、D5S818、D8S1179、CSF1PO、D7S820、D6S1043、D13S317、D2S1338、D21S11等17個(gè)STR基因座遺傳多態(tài)性進(jìn)行調(diào)查,為法醫(yī)個(gè)體識(shí)別和親緣鑒定提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。
汕頭市712份漢族無(wú)關(guān)個(gè)體FTA血樣,來(lái)源于汕頭市公安局DNA數(shù)據(jù)庫(kù)樣本。采用BSD QP自動(dòng)打孔機(jī)取樣本,美國(guó)Promega公司的PowerPlex?18D System試劑盒在9700型擴(kuò)增儀上對(duì)17個(gè)STR基因座進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增體系為10μL,PCR產(chǎn)物在ABI 3130XL型基因分析儀上電泳檢測(cè)。結(jié)果由Gene Mapper ID v 3.2軟件進(jìn)行分析。用直接計(jì)數(shù)法計(jì)算各基因座的基因型和基因頻率,利用Power stats和PIC Calc 0.6軟件獲得各基因座的雜合度(H)、個(gè)體識(shí)別能力(DP)、非父排除率(PE)、多態(tài)信息含量(PIC)等參數(shù),采用精確檢驗(yàn)法[3]進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)。
汕頭市漢族無(wú)關(guān)個(gè)體17個(gè)STR基因座等位基因及其分布頻率見(jiàn)表1。經(jīng)檢驗(yàn),P值均大于0.05,符合Hardy-Weinberg平衡定律。各基因座的群體遺傳學(xué)參數(shù)見(jiàn)表2。
在17個(gè)STR基因座中,H為0.566~0.904,DP為0.744~0.984,PE為0.333~0.923,PIC為0.50~0.90,由此計(jì)算出17個(gè)基因座的累積個(gè)體識(shí)別能力(CDP)為1~6.6434×10-21,累積非父排除率(CPE)為0.999999975201。Gill[4]等認(rèn)為雜合度(H)大于或等于0.7和個(gè)體識(shí)別能力(DP)大于或等于0.9的基因座有較高的鑒別能力,適于法醫(yī)學(xué)應(yīng)用。由表2可見(jiàn),除D3S1358、TH01、TPOX和CSF1PO以外,共有13個(gè)STR基因座H≥0.7,DP≥0.9,能夠滿足法醫(yī)學(xué)應(yīng)用中的親權(quán)鑒定和個(gè)體識(shí)別的需要。
在人群比較中,發(fā)現(xiàn)汕頭地區(qū)人群與廣州地區(qū)人群的15個(gè)STR基因座均無(wú)顯著性差異(P>0.05),[5]與中國(guó)漢族人群15個(gè)STR基因座的數(shù)據(jù)在CSF1PO基因座有顯著性差異(P<0.05),[6]與文獻(xiàn)7四川漢族人群19個(gè)STR基因座中D13S317、D5S818、D16S539、D8S1179、TPOX、CSF1PO、D19S433等7個(gè)基因座有顯著性差異,[7]可見(jiàn)汕頭地區(qū)的人群結(jié)構(gòu)與四川地區(qū)人群有較大的差異。(如表3所示)
表1 汕頭地區(qū)人群17個(gè)STR基因座等位基因頻率(n=712)
12 13 14 15 16 17 18 18.2 19 20 21 22 23 24 25 26 0.0386 0.1854 0.1973 0.1959 0.1390 0.0779 0.0421 0.0007 0.0309 0.0295 0.0246 0.0176 0.0084 0.0042 0.0028 0.0007 20 21 21.2 22 22.2 23 23.2 24 24.2 25 25.2 26 27 27.2 28 29 0.0358 0.1257 0.0049 0.1756 0.0042 0.2205 0.0140 0.1742 0.0070 0.1096 0.0042 0.0316 0.0140 0.0007 0.0021 0.0014 D8S1179 A 9 1 0 F 11 12 13 14 15 16 17 18 0.0014 0.1236 0.1046 0.1096 0.2086 0.1889 0.1678 0.0836 0.0105 0.0014 18 19 20 21 21.3 0.1805 0.1404 0.0527 0.0126 0.0007 32 32.2 33 33.2 34 34.2 0.0274 0.1397 0.0056 0.0583 0.0007 0.0028
表2 汕頭地區(qū)人群17個(gè)STR基因座的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析(n=712)
表3 汕頭地區(qū)人群與其他人群比較的P值表
[1]許麗娜,馮國(guó)英,周廣彪,等.常染色體STR的證據(jù)支持潮汕人的中原漢族起源[J].現(xiàn)代人類(lèi)學(xué)通訊,2008,2(8):11-16.
[2]李輝.分子人類(lèi)學(xué)所見(jiàn)歷史上閩越族群的消失[J].廣西民族大學(xué)學(xué)報(bào):哲學(xué)社會(huì)科學(xué)版,2007,29(2):42-48.
[3]Guo SW,Thompson EA.Performing the exact test of Hardy-Weinberg proportion for multiple alleles[J]. Biometrics,1992,48(2):361-372.
[4]Gill P A.New method of STR interpretation using in? ferential logic development of criminal intelligence da?taset[J].Int JLegMed,1996,109(1):14-22.
[5]劉長(zhǎng)暉,劉超,楊電,等.廣州地區(qū)人群15個(gè)STR基因座遺傳多態(tài)性[J].中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志,2007,22(5): 327-329.
[6]李海燕,臺(tái)運(yùn)春,陸惠玲.中國(guó)漢族人群15個(gè)STR基因座的等位基因頻率調(diào)查[J].中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志,2004,19(6):330-333.
[7]江繼平,王慶紅,張海軍,等.四川漢族人群19個(gè)STR基因座遺傳多態(tài)性[J].中國(guó)法醫(yī)學(xué)雜志,2012,27(3):236-237.