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        生命細(xì)胞微觀世界的觀察和探索
        ——TXM顯微成像

        2016-02-05 07:21:05王聲翔馮大敏潘志云王大江韋世強(qiáng)
        科學(xué)中國(guó)人 2016年36期
        關(guān)鍵詞:襯度尼克顯微鏡

        王聲翔,馮大敏,潘志云,王大江,韋世強(qiáng)

        中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)國(guó)家同步輻射實(shí)驗(yàn)室

        生命細(xì)胞微觀世界的觀察和探索
        ——TXM顯微成像

        王聲翔,馮大敏,潘志云,王大江,韋世強(qiáng)

        中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)國(guó)家同步輻射實(shí)驗(yàn)室

        生命世界是非常神奇的,并令人震撼。自從人類進(jìn)化到會(huì)出使用工具的技能,就永不停止地對(duì)生命活動(dòng)進(jìn)行探索和研究。隨著科技的進(jìn)步和文明的發(fā)展,對(duì)生命的研究也逐步從觸手可及的宏觀世界進(jìn)入未知的微觀世界。眾所周知,細(xì)小到微米尺度的細(xì)胞是生命組成的基本單位,各種不同的細(xì)胞聚集在一起,再通過(guò)復(fù)雜有規(guī)律地的連接聚集成一個(gè)鮮活的生命體。生命就象像是一部獨(dú)特精密的“機(jī)器”,能說(shuō)會(huì)動(dòng)卻也有生銹的時(shí)候,有獨(dú)特的思想和性格卻也總會(huì)發(fā)生變化。顯微成像就是能直接觀察生命細(xì)胞的一種技術(shù),它在生命科學(xué)和生命技術(shù)的進(jìn)步中一直發(fā)現(xiàn)和見(jiàn)證生命的奇跡。

        在人類認(rèn)識(shí)生命細(xì)胞及其活動(dòng)的過(guò)程中,顯微鏡一直是科學(xué)家觀察微觀生物世界的眼睛。1665年羅伯特·胡克,第一次用顯微鏡發(fā)現(xiàn)了植物細(xì)胞。自此,科學(xué)家通過(guò)對(duì)光學(xué)顯微鏡的改良和使用,陸續(xù)發(fā)現(xiàn)其他生物體細(xì)胞的存在,觀察到細(xì)胞分裂現(xiàn)象,建立了細(xì)胞學(xué)說(shuō),也論證了整個(gè)生物界在結(jié)構(gòu)上的統(tǒng)一性以及生命在演化上的共同起源。1931年,恩斯特·魯斯卡和克斯·克諾爾研制了世界上第一臺(tái)透射電子顯微鏡,并最先應(yīng)用在醫(yī)學(xué)和生物學(xué)領(lǐng)域。由于電子顯微鏡具有高分辨能力,可以看見(jiàn)細(xì)胞中的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)以及發(fā)現(xiàn)病毒。在后續(xù)研究中幾乎所有致病病毒的發(fā)現(xiàn)和認(rèn)證都依賴于電子顯微成像技術(shù)的運(yùn)用,如1970年英國(guó)學(xué)者戴恩等在電子顯微鏡下觀察到的乙肝病毒顆粒。這些在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的探索,每一次新發(fā)現(xiàn)都是激動(dòng)人心的,無(wú)疑對(duì)疾病的診斷和防治提供了非常重要的依據(jù)。

        電子顯微鏡成像技術(shù)的發(fā)展,使我們可以看見(jiàn)細(xì)胞內(nèi)部未知的世界。然而還有很多艱難的科學(xué)任務(wù)擺在我們面前,現(xiàn)代生物學(xué)研究對(duì)納米分辨顯微成像技術(shù)也提出了更高的要求。毫無(wú)疑問(wèn),三維成像技術(shù)的實(shí)現(xiàn)是顯微成像技術(shù)發(fā)展的必然趨勢(shì)之一。對(duì)于細(xì)胞而言,三維成像技術(shù)無(wú)論在對(duì)細(xì)胞本身定性定量的分析還是在成果說(shuō)明與知識(shí)傳播中都有重大的意義。如今,各類光學(xué)顯微鏡因?yàn)槭芟抻谘苌錁O限,空間分辨率低,難以看清亞細(xì)胞結(jié)構(gòu);而電子顯微鏡受限于電子的低穿透力,只能對(duì)先對(duì)細(xì)胞進(jìn)行切片,然后每張薄片分別進(jìn)行成像,拼湊出三維圖像。這個(gè)過(guò)程在操作上十分困難,并且切割細(xì)胞無(wú)疑會(huì)對(duì)亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)產(chǎn)生不可挽回的傷害,造成信息的缺失。

        透射X射線顯微鏡(Transmission X-ray Microscope,TXM)的出現(xiàn)為顯微成像開(kāi)辟了一條全新的路徑。由于X射線的波長(zhǎng)遠(yuǎn)小于可見(jiàn)光的波長(zhǎng),X射線成像的空間分辨能力遠(yuǎn)強(qiáng)于可見(jiàn)光成像;同時(shí)X射線具有很強(qiáng)的穿透能力,可以穿透完整的細(xì)胞。TXM成像時(shí),通過(guò)旋轉(zhuǎn)樣品臺(tái),系統(tǒng)采集從0°到180°包含X射線衰減信息的二維投影圖像,最后利用CT重建技術(shù),完成對(duì)完整細(xì)胞的高分辨無(wú)損三維顯微成像,這無(wú)疑對(duì)細(xì)胞生物學(xué)的研究有巨大的推動(dòng)作用。

        圖1 細(xì)胞軟X射線成像三維渲染圖

        其中,能量范圍在284~543 eV之間的軟X射線具有特殊的物理性質(zhì)。此時(shí),蛋白質(zhì)等生物樣品對(duì)X射線的吸收系數(shù)比水對(duì)X射線的吸收系數(shù)高一個(gè)數(shù)量級(jí)。利用這一天然的優(yōu)勢(shì),軟X射線可以對(duì)含水細(xì)胞進(jìn)行成像研究,軟X射線“水窗”成像也因此得名。2004年美國(guó)ALS同步輻射光源C.A.Larabell研究小組,使用軟X射線透射顯微鏡首次對(duì)5微米的完整含水酵母細(xì)胞實(shí)現(xiàn)60納米分辨的三維成像(圖1),獲得了細(xì)胞核、液泡、囊泡等幾種重要的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)信息。為此,著名的成像專家David Attwood在2006年Nature 442,642-643上發(fā)表評(píng)論指出:“納米分辨CT時(shí)代已經(jīng)到來(lái)”。

        圖2 正常肝細(xì)胞和乙肝病毒感染后肝細(xì)胞X射線對(duì)照?qǐng)D

        隨著設(shè)備的改進(jìn)和實(shí)驗(yàn)的創(chuàng)新,軟X射線三維顯微成像在細(xì)胞生物學(xué)研究中的重要性日益顯著,西班牙科學(xué)家利用冷凍軟X射線成像對(duì)乙肝病毒感染細(xì)胞(ACS Nano 2016,10,6597?6611)。這一生物學(xué)問(wèn)題進(jìn)行研究。如圖2所示A、E分別是光學(xué)顯微鏡下的正常肝細(xì)胞和被感染的肝細(xì)胞。B、F是經(jīng)過(guò)重構(gòu)后的一些列軟線三維成像圖中的一張截面圖,C、G分別是B、F區(qū)域位置的三維渲染圖。實(shí)驗(yàn)樣品不需要任何染色和化學(xué)試劑固定處理,即可清晰的觀察細(xì)胞受感染前后亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的變化。

        硬X射線是指能量范圍在1keV到十幾keV的X射線。由于硬X射線穿透能力很強(qiáng),細(xì)胞完全被穿透對(duì)X射線吸收較少,以至于采集的細(xì)胞吸收投影圖像襯度較低,需要對(duì)細(xì)胞進(jìn)行重金屬染色來(lái)增加吸收襯度。圖3是我們?cè)谟瞂射線透射顯微鏡下對(duì)30微米尺寸大小的水稻花粉進(jìn)行內(nèi)部結(jié)構(gòu)解析的三維分割渲染圖,據(jù)此可分辨出花粉線粒體、油滴、液泡、細(xì)胞核等亞細(xì)胞結(jié)構(gòu),分別用藍(lán)色、綠色、黃色和黑色標(biāo)記。

        圖3 水稻花粉細(xì)胞三維渲染圖

        雖然軟X射線和硬X射線顯微成像都可以進(jìn)行細(xì)胞三維成像研究,但是由于其本身的物理性質(zhì),使其各自都有較為明顯的實(shí)驗(yàn)限制。軟X射線透射顯微鏡可以對(duì)自然狀態(tài)細(xì)胞進(jìn)行成像研究,最真實(shí)的解析細(xì)胞內(nèi)的秘密,但是軟X射線成像的焦深比較小,難以對(duì)直徑10微米以上的細(xì)胞實(shí)現(xiàn)完整細(xì)胞的納米分辨三維成像。硬X射線透射顯微鏡具有很大的焦深,可以對(duì)絕大多數(shù)細(xì)胞成像,但是吸收襯度較低,必須對(duì)細(xì)胞進(jìn)行染色等處理以提高襯度,樣品處理的難度較大,且會(huì)在一定程度上破壞細(xì)胞的自然狀態(tài)。迄今為止,對(duì)大多數(shù)含水細(xì)胞內(nèi)部結(jié)構(gòu)進(jìn)行完整的納米分辨三維成像,仍然是一個(gè)懸而未決的世界性難題。我們課題組向著繪制細(xì)胞圖譜的前進(jìn)方向,從X射線成像理論和實(shí)驗(yàn)方法學(xué)兩個(gè)方向努力研究,發(fā)明了中能(2~2.5 keV)X射線澤尼克相襯顯微鏡。

        中能(2~2.5 keV)X射線澤尼克相襯顯微鏡(圖4)是在改變能量適用范圍的前提下,在原來(lái)X射線透射顯微鏡中引入澤尼克相襯,主要是在物鏡波帶片下游放置相移環(huán),用以提取樣品的相位襯度,將相襯信號(hào)轉(zhuǎn)化為光強(qiáng)信號(hào)。中能X射線澤尼克相襯顯微成像方法將在細(xì)胞納米分辨三維成像中發(fā)揮難以替代的作用。

        首先,中能(2~2.5 keV)澤尼克相位襯度與“水窗”范圍內(nèi)的吸收襯度相當(dāng),對(duì)亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)有很高的分辨能力。其次,由于軟X射線的穿透能力很弱,輻射劑量隨細(xì)胞尺寸的增加而急劇上升。對(duì)于520 eV的軟X射線,當(dāng)細(xì)胞大小為5微米時(shí),輻射劑量?jī)H有3.16×107Gy;當(dāng)細(xì)胞大小增加到20微米時(shí),輻射劑量急劇增加到8.77×109Gy,是5微米大小細(xì)胞的277倍!在中能(2~2.5 keV)附近,輻射劑量隨細(xì)胞尺寸的變化非常不敏感。尺寸為5微米的細(xì)胞,輻射劑量?jī)H僅為8.75×106Gy。隨著細(xì)胞尺寸增加到20微米,輻射劑量也只有1.1×107Gy。進(jìn)一步的計(jì)算表明,即使細(xì)胞尺寸增加到40微米,輻射劑量也只有2.5×108Gy,不會(huì)對(duì)冷凍細(xì)胞樣品造成明顯的結(jié)構(gòu)和功能損傷。這是因?yàn)?.5 keV中能X射線在20-40微米尺寸細(xì)胞中具有相當(dāng)高的透過(guò)率。最后,與“水窗”軟X射線顯微鏡相比,中能X射線澤尼克相襯顯微鏡的另一個(gè)優(yōu)勢(shì)是其擴(kuò)展的焦深,在30納米空間分辨率下,中能X射線顯微鏡具有15~25微米的焦深。這么大的焦深能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)更多種類的完整真核細(xì)胞的三維斷層成像,擴(kuò)大了TXM在細(xì)胞成像上的應(yīng)用空間,非常適合于完整真核細(xì)胞的納米分辨三維結(jié)構(gòu)成像。獲得細(xì)胞內(nèi)細(xì)胞器結(jié)構(gòu)的三維空間分布信息,將成為繪制細(xì)胞圖譜的重要利器,對(duì)生物學(xué)研究的意義十分重大。

        探索未知生命世界的腳步永不停歇,顯微技術(shù)的發(fā)展如同科學(xué)巨人的手臂,不可或缺。21世紀(jì)我們的使命嚴(yán)峻且神圣,努力終究會(huì)獲得成就,探索終究會(huì)發(fā)現(xiàn)奇跡。讓我們共同去見(jiàn)證生命世界的神奇,為人類發(fā)展貢獻(xiàn)出一份微薄之力。

        圖4 中能X射線澤尼克相襯顯微鏡

        王大江,博士,中國(guó)科學(xué)技術(shù)大學(xué)國(guó)家同步輻射實(shí)驗(yàn)室職工。主要研究領(lǐng)域:X射線成像理論及應(yīng)用,計(jì)算機(jī)數(shù)值模擬和圖像處理等。

        王大江。

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