煙草電壓依賴陰離子通道NtVDAC1.1的電子克隆及生物信息學(xué)分析
2016-01-11 09:33:15武兆云張小全楊鐵釗王紅
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年11期
武兆云 張小全 楊鐵釗 王紅
摘要：為研究電壓依賴陰離子通道（VDAC）基因在煙草根系分泌有機(jī)酸的作用，進(jìn)而為了解該基因的功能和應(yīng)用提供基礎(chǔ)，以擬南芥AtVDAC1（NM_110994）為搜索序列，應(yīng)用電子克隆技術(shù)得到一條煙草VDAC基因全長(zhǎng)cDNA，命名為AtVDAC1.1。生物信息學(xué)分析表明該基因全長(zhǎng)為1018 bp，有著完整的開(kāi)放閱讀框，編碼276個(gè)氨基酸。進(jìn)化關(guān)系及同源性分析表明，NtVDAc1.1與其他物種的VDAc有著較高的相似性，其中與茄科植物馬鈴薯三個(gè)膜孔蛋白有著很高的一致性（0.768～0.902）。功能分析顯示，NtVDAC1.1為膜孔蛋白，參與了陰離子的轉(zhuǎn)運(yùn)、陰離子轉(zhuǎn)運(yùn)調(diào)節(jié)和跨膜運(yùn)輸。二級(jí)和四級(jí)結(jié)構(gòu)分析均表明，NtVDAC1.1含有a-螺旋和B-折疊。氨基酸位點(diǎn)分析表明，該蛋白具有多種類型的修飾位點(diǎn)，其中的磷酸化位點(diǎn)說(shuō)明該基因與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)有關(guān)，對(duì)陰離子通道活性具有調(diào)節(jié)作用。
關(guān)鍵詞：煙草；電壓依賴陰離子通道；基因克??；生物信息學(xué)分析
中圖分類號(hào)：S572：Q781 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào)：A 文章編號(hào)：1001-4942（2015）11-0005-07endprint
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