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        精準(zhǔn)醫(yī)療重構(gòu)醫(yī)療服務(wù)

        2015-12-26 01:39:31
        軟件和集成電路 2015年12期
        關(guān)鍵詞:英特爾個體化靶向

        精準(zhǔn)醫(yī)療重構(gòu)醫(yī)療服務(wù)

        文/俞 毅

        精準(zhǔn)醫(yī)療在改善治療效果方面已嶄露頭角,并在全球范圍內(nèi)迅速成為公眾矚目的焦點(diǎn),許多歐美國家都開始大力投資支持其發(fā)展,中國政府和產(chǎn)業(yè)界也在規(guī)劃精準(zhǔn)醫(yī)療在本地的發(fā)展大計(jì)。

        近年來,以科學(xué)診斷和治療為基礎(chǔ)的現(xiàn)代醫(yī)療技術(shù),與可精確獲取、處理和分析健康數(shù)據(jù)信息的現(xiàn)代信息技術(shù)的融合發(fā)展,催生了人們對于更加個性化、精準(zhǔn)化醫(yī)療診斷的需求,精準(zhǔn)醫(yī)療順勢而生,其目標(biāo)是根據(jù)病患個體基因特征及其他分子級別的信息,為其提供更加個性化、更高效和更為對癥的醫(yī)療診斷、治療及用藥方案。

        事實(shí)上,盡管我國醫(yī)學(xué)水平不斷進(jìn)步、醫(yī)療信息化技術(shù)不斷提升,但臨床診療依然面臨著資源分配不均衡、信息共享不暢通等困擾。因此,構(gòu)建高質(zhì)、高效的現(xiàn)代醫(yī)療服務(wù)體系,已成為我國醫(yī)學(xué)界亟待解決的問題。精準(zhǔn)醫(yī)療無疑是其中重要發(fā)展方向之一。

        精準(zhǔn)醫(yī)療更重視“病人”的深度特征和“藥”的高度精準(zhǔn)性;是在對病人和藥物深度認(rèn)識的基礎(chǔ)上完成的更加個體化的診斷和治療。精準(zhǔn)醫(yī)療的發(fā)展,離不開信息技術(shù)與生命科學(xué)和醫(yī)療技術(shù)的深度融合。驅(qū)動精準(zhǔn)醫(yī)療這一創(chuàng)新模式出現(xiàn)的重要動力,源于計(jì)算為人類基因組測序技術(shù)和生物醫(yī)學(xué)分析技術(shù)所帶來的革新與進(jìn)步。

        更具預(yù)測性的基因檢測

        得益于基因檢測技術(shù)的進(jìn)步,我們現(xiàn)在有這樣的機(jī)會、技術(shù)和能力,可以量化和描述每個人的生命。在應(yīng)用基因檢測技術(shù)中,一方面,可以通過基因檢測,預(yù)知父母遺傳給我們的正面和負(fù)面的身體因素。隨著對這些信息的知曉,我們能把生命掌握于自己手中,選擇更加健康的生存環(huán)境和生活方式,避免發(fā)病的風(fēng)險。另一方面,我們能夠借助基因測序技術(shù)的進(jìn)步,在腫瘤發(fā)生的早期進(jìn)行診斷。

        我們知道,每個人的DNA是由30個堿基對組成的非常長的序列分子,這30個堿基對相當(dāng)于3G的數(shù)據(jù),當(dāng)我們進(jìn)行數(shù)據(jù)分析時,每個人的數(shù)據(jù)都會在TB級別,也就是10到12次方以上級別的信息等級。此外,由于每個人的基因訊息都有唯一性,而要達(dá)到對每個人的精準(zhǔn)醫(yī)療,需要做到對群體患者數(shù)據(jù)的積累與比較,找到其中的差異與規(guī)律,才能做到極其精準(zhǔn)的診療。如果數(shù)據(jù)的發(fā)展向超摩爾定律發(fā)展的話,其中必然會存在新的瓶頸,這對計(jì)算機(jī)行業(yè)也是新的機(jī)遇與挑戰(zhàn)。

        海量、復(fù)雜、多變的數(shù)據(jù)計(jì)算需求,一直是影響基因測序技術(shù)發(fā)展的重要因素。隨著多年來超級計(jì)算機(jī)的不斷發(fā)展,高性能計(jì)算在基因測序發(fā)展上發(fā)揮了重大的助推作用。在這方面,英特爾保持著同產(chǎn)業(yè)伙伴之間的密切協(xié)作。

        以華大基因?yàn)槔?,在尋求更快、更高效的高性能?jì)算基因測序方案的過程中,華大基因一直在嘗試新的技術(shù)和方法,來進(jìn)一步加速基因測序。面對復(fù)雜的基因測序數(shù)據(jù)處理,既要擁有高性能的計(jì)算能力,又要考慮其經(jīng)濟(jì)效益,并結(jié)合未來在相關(guān)研究的發(fā)展,經(jīng)過多番考量和研究,華大基因選擇了與英特爾聯(lián)手啟動,關(guān)于至強(qiáng)融核協(xié)處理器在生命科學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用項(xiàng)目。借助高性能計(jì)算,華大基因在基因測序相關(guān)研究及應(yīng)用上也取得了令人矚目的成績,而其在全新基于英特爾微異構(gòu)架構(gòu)的高性能計(jì)算平臺上的測試,取得了重大的進(jìn)展。

        靶向藥物治療方案

        有了基因測序技術(shù)的支持,我們了解了病源,接下來針對個體化差異極大的病癥,提供個性化治療方案,是精準(zhǔn)醫(yī)療實(shí)現(xiàn)的重要環(huán)節(jié)。對于所有病人,我們應(yīng)根據(jù)其基因的不同,選擇不同的治療方法。

        我們知道,在一個腫瘤組織中,腫瘤細(xì)胞里可能包含上千種突變,但這其中有一些是關(guān)鍵的突變,比如EGFR的突變,是進(jìn)行靶向治療的靶點(diǎn),完全可以用靶向藥物治療。

        那么,我們怎么從不同的突變中找到關(guān)鍵的驅(qū)動基因的突變呢?答案是通過生物學(xué)知識和計(jì)算方法。

        基于全基因組的分析、做出驅(qū)動基因的判斷,然后選擇針對這個病人的驅(qū)動性突變的靶向藥物,使之產(chǎn)生好的療效。

        可以說在未來,腫瘤治療的趨勢是從精確計(jì)算開始,再到精準(zhǔn)診斷,最后為我們帶來精準(zhǔn)的治療效果。在此過程中,計(jì)算方法的進(jìn)步是不可或缺的,只有將計(jì)算方法的進(jìn)步和治療手段的創(chuàng)新結(jié)合在一起,才會為今天的病人帶來更好的治療效果。

        對計(jì)算提出更高要求

        無論是基因檢測、基因分析及找到靶向,都離不開大數(shù)據(jù)和云計(jì)算。技術(shù)改變醫(yī)療服務(wù),英特爾醫(yī)療和生命科學(xué)事業(yè)部的成立,是希望通過技術(shù)創(chuàng)新,使我們的就醫(yī)方式及醫(yī)生提供的醫(yī)療行為能夠有根本性的變化。

        如今,我們的芯片做得越來越小,性能也得到了提升,一個平板電腦已經(jīng)能夠做到以前高性能計(jì)算的服務(wù)。如今醫(yī)療設(shè)備越來越小型化,最基本的基因測序,以前是需要高通量、大型的測序儀,而現(xiàn)在測序儀更小、輕便,能夠進(jìn)入醫(yī)院,這都是信息技術(shù)帶來的可能性。

        沒有量化的數(shù)據(jù)不可能做到精準(zhǔn)。除了基因信息外,我們還擁有各種各樣的數(shù)據(jù):影像數(shù)據(jù)、電子病歷、生化數(shù)據(jù)、基因檢測數(shù)據(jù)等。由于這些數(shù)據(jù)都是非結(jié)構(gòu)化,如果將這些數(shù)據(jù)集中到一起提供給臨床,作為靶向治療方案的依據(jù),則需要大量的新型分析技術(shù)作為支撐。如今做周密的基因測序,可能需要1~4天乃至幾周的時間。如果再將它與影像、電子病歷等各個方面信息進(jìn)行整合,提供個體化的診斷和治療,可能需要幾周至一個月時間。這樣,診斷的周期非常之久,我們則希望診斷結(jié)果越快越好,這對計(jì)算性能、數(shù)據(jù)的處理方式和部署,均提出了很高的要求。

        精準(zhǔn)醫(yī)療不只是改變個體化醫(yī)療的一種手段,對整個醫(yī)療服務(wù)的重構(gòu)也提出了新的要求。精準(zhǔn)醫(yī)療另外一個體現(xiàn)是去中心化。以前的醫(yī)療是在以醫(yī)院為中心的范圍內(nèi)實(shí)施;但隨著社交技術(shù)、云技術(shù)、物聯(lián)網(wǎng)等技術(shù)的發(fā)展,人們可在任何地方就醫(yī)。為了加深在精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域的發(fā)展,實(shí)現(xiàn)新突破,英特爾幾個月提出了癌癥協(xié)作云平臺的項(xiàng)目和方案,包括像癌癥中心和基因?qū)嶒?yàn)室,跨不同區(qū)域進(jìn)行無縫對接的協(xié)作,以確定哪些數(shù)據(jù)需要傳遞或需要保留,哪些計(jì)算需要通過遠(yuǎn)程或在屬地實(shí)施,通過技術(shù)上的創(chuàng)新,最終提供精準(zhǔn)診斷和治療的解決方案。

        我們預(yù)計(jì),到2020年計(jì)算技術(shù)的發(fā)展有望幫助醫(yī)生,在24小時內(nèi)完成精準(zhǔn)醫(yī)療的主要過程,包括基因序列檢測、結(jié)果數(shù)據(jù)分析、基于分析的疾病診斷,和定制個性化的治療方案。

        面向未來,精準(zhǔn)醫(yī)療的發(fā)展將主要體現(xiàn)于逐步去中心化和更加個體化這兩方面。精準(zhǔn)醫(yī)療的實(shí)現(xiàn)離不開廣泛的產(chǎn)業(yè)協(xié)作,未來,英特爾希望攜手更多關(guān)注精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域發(fā)展的伙伴,共同借助信息化技術(shù)的發(fā)展重構(gòu)醫(yī)療服務(wù)。

        責(zé)任編輯:程夢瑤

        chengmy@softic.com.cn

        俞毅

        英特爾醫(yī)療與生命科學(xué)事業(yè)部亞太區(qū)總經(jīng)理

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