劉應(yīng)喜趙 陽辛 陽

（1 貴州省公安廳刑偵總隊 貴州 貴陽 550005；2 沈陽市公安局皇姑分局 遼寧 沈陽 110036；3 中國刑警學(xué)院 遼寧 沈陽 110035）

貴州苗族人群15個STR基因座遺傳多態(tài)性研究

劉應(yīng)喜1趙 陽2辛 陽3

（1 貴州省公安廳刑偵總隊 貴州 貴陽 550005；2 沈陽市公安局皇姑分局 遼寧 沈陽 110036；3 中國刑警學(xué)院 遼寧 沈陽 110035）

應(yīng)用STR分型技術(shù)研究貴州地區(qū)苗族的D3S1358、TH01、D21S11、D18S51、PentaE、D5S818、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、FGA等15個基因座的遺傳多態(tài)性，探討其在法醫(yī)學(xué)個體識別和親權(quán)鑒定中的應(yīng)用。

苗族 STR 遺傳多態(tài)性 貴州

應(yīng)用PowerPlex16?HS熒光標記復(fù)合擴增系統(tǒng)對207例貴州地區(qū)苗族無關(guān)個體血樣DNA進行15個STR基因座的復(fù)合擴增，用ABI3130遺傳分析儀對擴增產(chǎn)物進行檢測，用Genemapper軟件進行基因分型，并進行統(tǒng)計分析，獲得了群體遺傳學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)，為個人識別和親權(quán)鑒定等法醫(yī)學(xué)應(yīng)用提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

1 對象與方法

1.1 DNA樣本

采集貴州黔東南苗族侗族自治州苗族207例健康無關(guān)個體血樣，采用Chelex-100法[1]提取樣本DNA。

1.2 PCR擴增

用PowerPlex16?HS Kit（Promega，美國），按照操作說明書給出的程序?qū)悠愤M行常染色體STR復(fù)合擴增，檢測Amelogenin及 15個 STR基因座（D3S1358、 TH01、 D21S11、 D18S51、 PentaE、D5S818、 D13S317、 D7S820、 D16S539、 CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、FGA）。PCR反應(yīng)在9700擴增儀（ABI，美國） 上進行。

1.3 擴增產(chǎn)物的電泳及檢測

分型檢測在ABI-3130遺傳分析儀（ABI，美國）上進行。應(yīng)用3130 Data Collection v3.0與GeneMapper ID v3.2分析軟件處理數(shù)據(jù)。

1.4 統(tǒng)計學(xué)分析

用直接計數(shù)法計算各基因座的基因型、基因頻率，采用 Powerstats2.0Software（http：//www.promega. com） 統(tǒng)計分析15個基因座多態(tài)性數(shù)據(jù)，得到多態(tài)信息含量（PIC）、個人識別率（DP）、非父排除率（PE）。按文獻[2]的方法進行Hardy—Weinberg平衡檢驗。

2 結(jié)果與討論

貴州地區(qū)苗族人群無關(guān)個體15個STR基因座等位基因頻率和群體多態(tài)性指標見表1和表2。

表1 貴州地區(qū)苗族人群15個STR基因座等位基因頻率

等位基因 D18S51 Penta E D21S11FGA TH01 TPOX vWA D16S539 5 0.0374 6 0.1525 7 0.2584 8 0.0093 0.0406 0.4703 0.3822 8.3 0.0020 9 0.0140 0.4812 0.0911 0.1228 9.3 0.0337 10 0.0010 0.0467 0.0317 0.0149 0.1376 11 0.0020 0.1542 0.4020 0.2040 12 0.0386 0.0748 0.0218 0.1030 13 0.1564 0.0701 0.0426 14 0.2248 0.0701 0.3465 0.0069 14.20.0010 0.0010 15 0.1762 0.1168 0.0020 0.0149 16 0.1683 0.1729 0.1277 16.2 0.0010 17 0.0584 0.0561 0.1723 17.2 0.0020 18 0.0723 0.0467 0.0158 0.2376 19 0.0436 0.0374 0.0446 0.0851 19.2 0.0010 20 0.0109 0.0514 0.0446 0.0139 21 0.0089 0.0280 0.1059 0.0010 21.2 0.0020 22 0.0139 0.1604 22.2 0.0040 23 0.0079 0.0047 0.1386 0.0010 23.2 0.0040 24 0.0099 0.0093 0.1990 24.2 0.0228 25 0.0020 0.1426 25.2 0.0109 26 0.0802 26.2 0.0030 27 0.0010 0.0168 28 0.0307 0.0020 28.2 0.0040 29 0.2376 30 0.2465 0.0010 30.2 0.0069 30.3 0.0010 31 0.1069 31.2 0.0901 32 0.0287 32.2 0.1545 33 0.0059 33.2 0.0782 34.2 0.0079

表2 貴州地區(qū)苗族人群15個STR基因座群體多態(tài)性指標

遺傳標記的多態(tài)性程度及其應(yīng)用價值可用多態(tài)信息量（PIC）、個體識別力（DP）和非父排除率（PE）來衡量。按文獻介紹的方法對基因型的觀察值和期望值進行卡方檢驗，符合 Hardy-Weinberg平衡定律（P＞0.05），說明了本次調(diào)查資料的可靠性。

聯(lián)合檢測15個STR基因座提高了檢材的利用率，擴大了信息量，簡化了檢驗程序，縮短了檢驗時間?？蔀橛H緣鑒定和個體識別提供非?？煽康姆ㄡt(yī)學(xué)證據(jù)，是具有高識別力的人類遺傳標記系統(tǒng)。本實驗表明這15個STR基因座可適用于法醫(yī)物證學(xué)檢驗，實用價值高，同時也為群體遺傳學(xué)、人類遺傳學(xué)、基因連鎖分析及疾病遺傳學(xué)等的研究提供了一定的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

[1]W alsh P S， Metzger D A， Higuchi R. Chelex-100 asmedium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material[J].Biotechniques，1991，10：506.

[2]Hou Y，Prinz M，Staak M.Comparison of differenttests fordeviation from Hardy-Weinberg equilibrium of AMPFLP population data[A].In：Bar W， Fiori A， Rossi U， eds.Advances in Forensic Haemogenetic 5th Berlin[C].Springer-Verlag，1994：511-514.

（責(zé)任編輯：于 萍）

DF795.2

A

2095-7939(2015)02-0074-02

2014-12-29

劉應(yīng)喜（1977-），男，貴州貴陽人，貴州省公安廳刑偵總隊技術(shù)處主檢法醫(yī)師，學(xué)士，主要從事法醫(yī)物證、法醫(yī)病理與法醫(yī)臨床研究。