李小軍(陜西省表面工程與再制造重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,西安文理學(xué)院化學(xué)工程學(xué)院,陜西西安 710065)
單環(huán)單萜化合物與金屬粒子的弱相互作用研究
李小軍(陜西省表面工程與再制造重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,西安文理學(xué)院化學(xué)工程學(xué)院,陜西西安 710065)
采用密度泛函B3LYP方法在贗勢(shì)基組LanL2DZ和全電子基組6-31++G★★級(jí)別上對(duì)銀團(tuán)簇與單環(huán)單萜α-紫羅蘭酮的弱相互作用進(jìn)行了剖析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),此類吸附結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定主要靠配體與分子之間的弱相互作用來支撐,同時(shí)結(jié)構(gòu)內(nèi)部也存在其他的作用力形式。這些研究將對(duì)于此化合物的潛在應(yīng)用有著重要的參考依據(jù)。
單環(huán)單萜,金屬粒子,弱相互作用
在生命活動(dòng)中,原子間的弱相互作用表現(xiàn)了重要的角色,其除了穩(wěn)定結(jié)構(gòu)外,也會(huì)影響電荷轉(zhuǎn)移和電子性質(zhì)。同時(shí),基于各種生物分子,其在各種誘導(dǎo)活動(dòng)中的特征被加強(qiáng),比如,在DNA分子修復(fù)[1]和藥物與機(jī)體的相互作用等方面[2]都有很重要的應(yīng)用。紫羅蘭酮分子是單環(huán)單萜類化合物,其與單環(huán)相連的支鏈結(jié)構(gòu)具有不飽和的雙鍵結(jié)構(gòu),并和過渡金屬具有很強(qiáng)的相互作用力,進(jìn)而可以穩(wěn)定生物分子在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用[3]。
采用密度泛函理論B3LYP方法,并結(jié)合LanL2DZ贗勢(shì)基組(Ag)和6-31++G**全電子基組(C、H、O)對(duì)銀復(fù)合物進(jìn)行了弱相互作用研究。所研究結(jié)構(gòu)都經(jīng)過振動(dòng)頻率分析,進(jìn)而確認(rèn)其為穩(wěn)定結(jié)構(gòu)。全部計(jì)算工作采用GAUSSIAN 09軟件包[4]在I7微機(jī)上完成。
圖1 α-Ag4復(fù)合物的弱相互作用
基于優(yōu)化好的穩(wěn)定結(jié)構(gòu),我們看到在α-紫羅蘭酮結(jié)構(gòu)中,有一個(gè)與αC遠(yuǎn)離的雙鍵,此時(shí)的支鏈結(jié)構(gòu)趨于和六元單環(huán)形成平面,分子結(jié)構(gòu)見圖1上部。同時(shí),圖1也描述了Ag4團(tuán)簇(右下部分)與α-紫羅蘭酮的弱相互作用,不同顏色區(qū)域代表不同的弱相互作用形式。相互作用力主要有三種:氫鍵(H-bond)、范德華力(VDW interaction)和位阻效應(yīng)(Steric effect)。氫鍵:氫原子與電負(fù)性的原子X共價(jià)結(jié)合時(shí),共用的電子對(duì)強(qiáng)烈地偏向X的一邊,使氫原子帶有部分正電荷,能再與另一個(gè)電負(fù)性高而半徑較小的原子Y結(jié)合,形成的X—H┅Y型的鍵;范德華力:分子間作用力又被稱為范德華力;位阻效應(yīng):指分子中某些原子或基團(tuán)彼此接近而引起的空間阻礙和偏離正常鍵角而引起的分子內(nèi)的張力。
從圖1可以看出,銀團(tuán)簇和氧原子間有氫鍵形成,這是因?yàn)殂y團(tuán)簇的電負(fù)性高,對(duì)氧原子有吸附作用,形成了C=O…Ag型的氫鍵。銀團(tuán)簇內(nèi)部也有氫鍵作用,這是由于銀團(tuán)簇表面孤對(duì)電子造成的。銀團(tuán)簇和紫羅蘭酮之間有分子間的相互作用,產(chǎn)生了范德華力,同時(shí)在六元環(huán)的支鏈甲基和支鏈酮基之間也有分子間作用力產(chǎn)生。
本文采用密度泛函B3LYP方法研究表明,銀團(tuán)簇與α-紫羅蘭酮之間存在較強(qiáng)的弱相互作用,而且通過我們理論預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)了其結(jié)構(gòu)內(nèi)部存在不同的作用力形式。這些研究將對(duì)于紫羅蘭酮在生物領(lǐng)域的潛在應(yīng)用提供重要的理論參考。
[1]Cui L,Ren B,and Tian Z Q.Surface-Enhanced Raman Spectroscopic Study on the Co-adsorption of DNA Bases with Per?chlorate[J],Acta Phys Chim Sin,2010,26(2),397-402.
[2]Nabiev I R,Efremov R G,and Chumanov G D.Surface-En?hanced Raman Scattering and Its Application to Study of Biological Molecules[J].Sov Phys Usp,1988,31(3),241-247.
[3]孫青,舒學(xué)軍,陳茹冰,等.香料紫羅蘭酮的合成研究[J].浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(理學(xué)版),2012,39(1):56-60.
[4]Frisch M.J.,Trucks G.W.,Schlegel H.B.,et al.Gaussian,Inc.,Wallingford CT,2009.
陜西省自然科學(xué)基金(2014JM2-2019,2014JM2046);陜西省教育廳基金(14JK2128);西安市文理專項(xiàng)(CXY1352WL20,CXY1443WL03)和博士啟動(dòng)基金
李小軍(1981-),男,陜西華縣人,博士,主要從事理論計(jì)算化學(xué)研究。