付德來,種 鐵,李和程,張 鵬,劉洪濤,王子明
(西安交通大學醫(yī)學院第二附屬醫(yī)院:1.泌尿外科,2.麻醉科,陜西西安 710004)
腎癌是泌尿系統(tǒng)常見惡性腫瘤,其發(fā)病率逐年上升。早期腎癌缺乏特異性表現(xiàn),多由健康查體偶然發(fā)現(xiàn),約1/3的腎癌患者首次就診時已處于晚期。目前晚期腎癌缺乏有效的治療手段,預后較差。尋找腎癌標志物對于提高腎癌的早期診斷水平、研究腎癌發(fā)病機制、改善腎癌預后具有重要意義。本課題以腎癌患者尿液作為研究對象,采用磁珠聯(lián)合 MALDI-TOFMS技術(shù),探索尿液中可能存在的腎癌多肽標志物。
1.1 研究對象實驗方案經(jīng)西安交通大學醫(yī)學院第二附屬醫(yī)院倫理委員會討論通過,按照知情同意的原則篩選2009年3~12月期間西安交通大學醫(yī)學院第二附屬醫(yī)院泌尿外科住院的患者,包括腎患者、非腎癌腎臟病變患者(腎積水、腎錯構(gòu)瘤、腎盂癌、腎囊腫、腎結(jié)核、腎結(jié)石),以及另外3名健康志愿者。入組腎癌患者均為行根治性手術(shù)治療的早期腎癌(AJCC腎癌TNM分期T1~2N0M0期)患者,且病理類型為腎透明細胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)。
1.2 主要儀器及試劑MALDI-TOF-MS質(zhì)譜分析儀購自德國Bruker公司,銅螯合納米磁珠試劑盒購自北京國家生物醫(yī)學分析中心。
1.3 方法
1.3.1 尿液的收集與處理 收集患者及志愿者晨起空腹第二次排尿中段尿液標本約10mL,分為術(shù)前組(腎癌患者入院第7天尿液)、術(shù)后組(腎癌患者術(shù)后第7天尿液)和對照組(非腎癌腎臟病變患者入院第2天和同期健康志愿者尿液)。尿液標本經(jīng)低溫離心機4 000r/min離心10min,獲得的上清液2mL/管分裝,-80℃保存。尿液標本從收集到離心完畢分裝凍存需在1h內(nèi)完成。
1.3.2 MALDI-TOF-MS分析尿液多肽組 參考銅螯合納米磁珠試劑盒使用說明書及吳杰等[1]的報道提取尿液中多肽。獲得的多肽提取液1μL和等體積飽和α-羥基肉桂酸(CCA)基質(zhì)溶液混勻,點在 MALDI不銹鋼靶面上,室溫下自然干燥,放入UltraflexⅢ MALDI-TOF-MS質(zhì)譜儀進行檢測。檢測條件設(shè)置如下:N2激光源,波長337nm,正離子線性模式,掃描相對分子質(zhì)量范圍800~10 000Du,激光能量36%,每個樣疊加2 000張譜圖。
1.3.3 質(zhì)譜數(shù)據(jù)的處理與分析 參考鐘立業(yè)等[2]的報道,質(zhì)譜采集獲得的原始數(shù)據(jù)應(yīng)用 MALDI-TOF-MS專門的分析軟件ClinProTools2.2進行分析。首先調(diào)入各組樣品的數(shù)據(jù),對采集圖像進行歸一化處理,經(jīng)過基線的平滑、去背景、標峰后,產(chǎn)生一張所有樣品的平均譜圖,篩選此譜圖上信噪比≥7的譜峰作為高可信譜峰。調(diào)入各個樣品數(shù)據(jù),查高可信譜峰在各組不同樣品內(nèi)表達情況,采用SPSS 17.0統(tǒng)計軟件分析各高可信譜峰在各組表達情況,組間差異P<0.05認為有統(tǒng)計學意義。
1.3.4 差異多肽的數(shù)據(jù)庫搜索初步鑒定 有意義多肽采用Tagldent檢索程序搜索 UniProtKB/Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫進行鑒定。在Tagldent檢索頁面(http://us.expasy.org/tools/tagldent.html),在“Mw”一欄輸入目的多肽的分子質(zhì)量,在“Organism name”一欄輸入篩選條件“homo sapiens”,點擊“Start Tagldent”進行搜索。
2.1 基本信息共收集得到167份尿液標本,經(jīng)篩選獲得符合入組條件的腎癌患者術(shù)前組、術(shù)后組尿液標本各32份,對照組尿液標本34份,入組患者基本信息無明顯差異(表1)。
表1 研究對象基本資料
2.2 各組尿多肽表達譜術(shù)前組、術(shù)后組、對照組分別共檢測到115、105、128個多肽信號峰,分析發(fā)現(xiàn)84.48%的信號峰集中分布于 [1 000~6 000Du]之間,僅有13.51%的信號峰分布于 [6 001~10 000Du]之間(圖1)。ClinProTools 2.2對所有樣品譜圖歸一化處理后獲得平均譜圖,在相對分子質(zhì)量800~10 000Du范圍內(nèi),共鑒定出信噪比≥7的高可信多肽峰12個,其m/z分別為854、1 025、1 116、1 315、2 790、3 176、3 297、4 750、5 557、8 817、9 730、9 923。各組之間信號峰集合分布既相互獨立又有交集(圖2)。
2.3 差異多肽峰篩選以峰面積代表多肽的表達量,比較信噪比≥7的高可信多肽在各組表達情況。結(jié)果發(fā)現(xiàn)m/z=1 025、1 116的多肽在術(shù)前組高表達,同時在術(shù)后組、對照組低表達。m/z=9 730的多肽在術(shù)后組、對照組高表達,在術(shù)前組低表達。m/z=2 790、4 750的多肽在三組表達無差異(表2、圖3)。其余7個高可信多肽峰表達不穩(wěn)定,僅出現(xiàn)于個別樣品中。
圖1 各組尿液多肽表達譜
表2 不同質(zhì)荷比多肽在各組中相對表達量
2.4 差異多肽峰的檢索鑒定采用Tagldent檢索程序檢索UniProtKB/Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫對相關(guān)多肽進行初步鑒定,結(jié)果發(fā)現(xiàn)m/z=1 025、1 116、9 730的信號峰與多個多肽或蛋白相匹配(表3)。
表3 差異多肽的初步鑒定
圖2 各組多肽信號峰集合分布
圖3 術(shù)前組高表達(m/z=1 025、1 116)、低表達(m/z=9 730)的多肽
腫瘤標志物(tumor marker)是反映腫瘤存在的化學類物質(zhì)。腎癌標志物一方面可以經(jīng)血液循環(huán)、由腎小球過濾進入尿液,另一方面可經(jīng)腎小管分泌直接進入尿液[3]。尿液采集方便,其蛋白質(zhì)組的組成較血漿簡單,是篩選腎癌標志物的理想標本。磁珠聯(lián)合MALDI-TOF-MS技術(shù)檢測尿液多肽組具有簡便快速、標本用量少的優(yōu)點[1],已用于腎小球疾病尿液多肽組研究[4]。
尿液多肽組表達譜受到尿液留存時間、飲食、藥物、疾病、遺傳背景等各種因素的影響。本課題通過選用合理的尿液標本和設(shè)計雙重對照篩選尿液中腎癌特異性多肽標志物。首先,為減少尿液留存時間、飲食、藥物對尿液多肽表達譜多肽表達譜的影響,本課題采用晨起空腹第二次排尿中段尿液標本。同時,本課題對照組包含了健康志愿者和非腎癌腎臟病變(腎積水、腎囊腫、腎血管平滑肌脂肪瘤、腎盂癌、腎結(jié)核、腎結(jié)石),這樣不僅將腎癌患者和健康人尿液多肽譜區(qū)別開來,同時還將腎癌患者和各種非腎癌腎臟病變者尿液多肽譜區(qū)別。另外,本課題還采用腎癌患者術(shù)前術(shù)后自身對照,這樣就減少了基因組差異對尿多肽組的影響。我們期望根治性腎切除術(shù)后尿液中腎癌標志分子會減少或消失,所以在患者選擇上僅采用了行根治性腎切除術(shù)的早期腎癌(Ⅰ、Ⅱ期)患者。至于術(shù)后標本收集時間點的選擇,目前有限的文獻并沒有明確答案,原則上術(shù)后時間越長尿液中腎癌特異性標志物代謝完全的幾率越大。考慮到實驗的易實施性,我們收集了患者術(shù)后第7天的尿液標本。
3.1 尿液中腎癌多肽標志物目前已有多篇文獻通過組學技術(shù)尋找尿液中腎癌特異性多肽(表4)。分析既往數(shù)據(jù)不難發(fā)現(xiàn),各研究中篩選出的腎癌相關(guān)分子缺乏一致性,這可能與尿液多肽組表達譜受眾多因素影響有關(guān)。結(jié)合既往研究進一步分析本實驗結(jié)果我們驚喜發(fā)現(xiàn),本研究中m/z為1 116的多肽在腎癌組及對照組中的表達規(guī)律與CHINELLO等[5]的研究一致,這充分說明尿液中m/z為1 116的多肽與腎癌關(guān)系密切,可能是尿液中潛在的腎癌特異性標志分子。
表4 腎癌尿液多肽標志物研究一覽表
3.2 m/z=1025多肽初步鑒定分析通過Tagldent檢索程序在UniProtKB/Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫中進行初步鑒定,發(fā)現(xiàn)m/z=1025的多肽與urotensin-ⅡB、little LEN相吻合。Urotensin-ⅡB屬于urotensinⅡ家族,是一個含有8個氨基酸的分泌多肽。UrotensinⅡ最初從蝦虎魚(Goby fish)尾部下垂體中獲得,具有強烈的絲裂原作用。YOSHIMOTO等[10]發(fā)現(xiàn)腎癌VMRC-RCW細胞系培養(yǎng)液中可檢測到urotensinⅡ表達,提示腎癌細胞可分泌urotensinⅡ。外源性給予urotensinⅡ24h后,腎癌VMRC-RCW細胞密度明顯增加。王文營等[11]通過免疫組化和RTPCR技術(shù)研究發(fā)現(xiàn),urotensinⅡ在腎透明細胞癌和正常腎組織中均有表達,腎透明細胞癌中urotensinⅡ及其受體mRNA的表達明顯高于正常腎組織。
Little LEN是Pro-SAAS(proprotein convertase 1inhibitor)剪切產(chǎn)生的7個片段之一,由10個氨基酸組成。Pro-SAAS參與神經(jīng)內(nèi)分泌通路,可能是內(nèi)源性、特異性PCSK1抑制劑。Little LEN的詳細功能尚不得而知。
3.3 m/z=1 116多肽初步鑒定分析Tagldent程序在UniProtKB/Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫中檢索發(fā)現(xiàn)m/z=1 116的多肽與胃泌素釋放肽(gastine-releasing peptide,GRP)吻合。GRP是胃泌素釋放肽前體(proGRP1-125)羧基端的10個肽。HEUSER 等[12]研究發(fā)現(xiàn)GRP受體(GRPR)在RCC細胞及腫瘤血管高表達。PANSKY等[13]研究發(fā)現(xiàn)GRPR在腎癌組織中表達,在正常腎組織中不表達。最近ISCHIA等[14]通過ELISA、放免法定量檢測腎癌細胞系GRP表達及功能,結(jié)果發(fā)現(xiàn)腎癌細胞系A(chǔ)CHN、Caki-1、Caki-2均高表達GRP,外源性GRP可促進體外培養(yǎng)的人腎癌ACHN、Caki-2細胞增殖,可增強ACHN細胞的遷移能力。GPR可誘導ACHN、Caki-2細胞分裂關(guān)鍵酶ERK1/2快速磷酸化,可上調(diào)ACHN腎癌細胞 HIF1-α、VEGF的表達。
本研究及CHINELLOC等[5]的研究均提示m/z為1 116的多肽在腎患者尿液中高表達,Tagldent程序提示此多肽極有可能為GRP。結(jié)合上述研究,我們有理由相信GRP與腎癌關(guān)系密切,GRP在腎癌發(fā)生、發(fā)展中的作用值得深入研究,GRP及其代謝產(chǎn)物在腎癌患者尿液中的檢測價值亦值得進一步探討。
3.4 m/z=9 730多肽初步鑒定分析Tagldent程序檢索發(fā)現(xiàn)m/z=9 730的多肽與EA-92、Late cornified envelope protein 3C(LCE3C)、Heparin-binding EGF-like growth factor(HB-EGF)相吻合。
EA-92是chromogranin-A剪切產(chǎn)生的13個片段之一。chromogranin-A最早在腎上腺髓質(zhì)嗜鉻顆粒中被發(fā)現(xiàn),具有穩(wěn)定嗜鉻顆粒的作用,chromogranin-A與兒茶酚胺一起分泌。chromogranin-A在大約90%的腸源性神經(jīng)內(nèi)分泌癌表達上調(diào),并且與腫瘤負荷及復發(fā)相關(guān),有效治療后chromogranin-A水平往往下降[15]。chromogranin-A在腎癌中的表達與腸源性神經(jīng)內(nèi)分泌腫瘤存在差異。RASMUSON等[16]早在1999年就對比分析了200例腎癌患者和15例腎囊腫患者chromogranin-A水平,結(jié)果發(fā)現(xiàn)28例(14%)腎癌患者血清chromogranin-A水平升高,但與對照組比較缺乏顯著性差異。多因素分析發(fā)現(xiàn)chromogranin-A不是腎癌預后影響因子。2010年RONKAINEN等[17]通過免疫組化分析chromogranin-A在152例原發(fā)性腎癌中表達情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)chromogranin-A免疫組化染色全為陰性。
LCE3C又稱富含脯氨酸的表皮分化小復合蛋白3A(Small proline-rich-like epidermal differentiation complex protein 3A),主要見于某些皮膚疾?。?8-19],其在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的意義尚不明確。
HB-EGF是EGF家族成員之一,可參與胚囊著床、骨骼肌發(fā)育、心肌分化、腎小管形成、傷口修復和腫瘤發(fā)生。TAKEMURA 等[20]發(fā)現(xiàn)膜結(jié)合 HBEGF可保護體外培養(yǎng)的腎小管上皮細胞耐受H2O2及足葉乙甙(etoposide)的殺傷,膜結(jié)合 HB-EGF可增加腎小管上皮細胞細胞存活率,降低細胞凋亡。在無血清培養(yǎng)下,膜結(jié)合HB-EGF可促進腎小管上皮細胞粘附并形成上皮細胞克隆。無血清培養(yǎng)3d后膜結(jié)合HB-EGF組細胞存活率84%,對照組存活率0%。大鼠正常腎小管細胞轉(zhuǎn)染HB-EGF后可誘導細胞惡性轉(zhuǎn)化[21]。SCHAFER 等[22]研究發(fā)現(xiàn) HBEGF可特異性地誘導腎癌Caki2、ACHN、A498細胞系EGFR的過度轉(zhuǎn)錄激活。
本研究中m/z=9 730的多肽在腎癌術(shù)前組低表達,在腎癌術(shù)后組、對照組高表達,結(jié)合目前EA-92、LCE3C、HB-EGF有關(guān)研究結(jié)果,本研究中 m/z=9 730的多肽與EA-92有關(guān)研究相吻合。EA-92及其前體chromogranin-A在腎癌中低表達,EA-92及chromogranin-A與腎癌發(fā)生、發(fā)展的關(guān)系值得進一步研究。
本研究通過磁珠聯(lián)合 MALDI-TOF-MS技術(shù)分析腎癌術(shù)前組、腎癌術(shù)后組及對照組尿液中多肽標志物,結(jié)果發(fā)現(xiàn)三個多肽差異表達(m/z=1 025、1 116的多肽在腎癌術(shù)前組高表達,m/z=9 730的多肽在腎癌術(shù)前組低表達)。通過Tagldent檢索程序在UniProtKB/Swiss-Prot數(shù)據(jù)庫中對這些多肽進行初步鑒定發(fā)現(xiàn)了多個匹配分子。這些多肽或其對應(yīng)的蛋白在腎癌和/或腎癌患者尿液中的表達需進一步明確,其作為尿液中腎癌標志分子的意義值得深入研究。
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