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        線性探針技術(shù)和傳統(tǒng)基因檢測技術(shù)在耐藥結(jié)核病診斷中的可靠性和及時性對比

        2015-06-05 08:39:22韓珍林日文駱妙卡
        實驗與檢驗醫(yī)學(xué) 2015年2期
        關(guān)鍵詞:異煙肼利福平探針

        韓珍,林日文,駱妙卡

        (惠州市結(jié)核病防治研究所,廣東 惠州516008)

        結(jié)核病(Tuberculosis,TB)是可造成人類死亡的常見感染性疾病,是全球公共衛(wèi)生面臨的重大威脅[1]。近年來耐藥結(jié)核病的發(fā)病率不斷上升,耐藥結(jié)核病是結(jié)核病控制的難題。TB的早期特異性診斷和及時治療、及時切斷傳播鏈并保護易感人群對結(jié)核病的治療和預(yù)防具有重要意義[2]。細(xì)菌學(xué)早期診斷是結(jié)核病防治的關(guān)鍵,抗酸染色、羅氏固體培養(yǎng)等傳統(tǒng)TB診斷技術(shù)操作簡單、經(jīng)濟、方便,易于推廣,但也存在耗時長、敏感度和特異性差、難以標(biāo)準(zhǔn)化等不足,無法滿足臨床需求[3,4]。隨著醫(yī)療技術(shù)的發(fā)展,分子線性探針雜交技術(shù)檢測結(jié)核病的臨床應(yīng)用得以推廣[5]。然而目前國內(nèi)外關(guān)于分子線性探針技術(shù)和傳統(tǒng)基因檢測技術(shù)在耐藥結(jié)核病診斷中的可靠性和及時性分析比較少。本研究比較MTBDR plus技術(shù)和傳統(tǒng)基因檢測技術(shù)診斷耐藥TB的結(jié)果。準(zhǔn)確性、敏感度、特異度、Kappa值及出報告所需時間,為耐藥TB的早期診斷方法的選擇提供依據(jù),現(xiàn)將結(jié)果報道如下。

        1 資料與方法

        1.1 研究對象 連續(xù)納入2014年1月至10月期間我院收治的246例涂陽肺結(jié)核患者作為研究對象。246例患者中男127例,女119例,年齡19~79歲,平均年齡(42.52±8.78)歲,患者均無其他呼吸系統(tǒng)疾病或嚴(yán)重心肺肝腎功能障礙。

        1.2 檢測方法

        1.2.1 痰標(biāo)本的收集 每例例涂陽肺結(jié)核患者均留取連續(xù)3d共3份痰標(biāo)本,將獲取標(biāo)本置于4℃冰箱中保存并于留取標(biāo)本3d內(nèi)完成耐藥情況的診斷。痰標(biāo)本的分離和培養(yǎng)均嚴(yán)格按照中國防癆協(xié)會《結(jié)核病診斷實驗室檢驗規(guī)程》的要求進(jìn)行。

        1.2.2 傳統(tǒng)藥敏實驗 對分離出的菌株進(jìn)行結(jié)核分枝桿菌菌種進(jìn)行鑒定并進(jìn)行異煙肼和利福平藥敏實驗,菌株鑒定采用對硝基苯甲酸和噻吩-2-羧酸肼鑒別培養(yǎng)基進(jìn)行生長實驗。藥敏實驗參照WHO/IUATLD標(biāo)準(zhǔn),菌株培養(yǎng)采用中和離心法,使用接種環(huán)取一環(huán)培養(yǎng)基上的菌落制成1mg/ml的懸液并梯度稀釋為10-2和10-4mg/ml,分別接種于含40μg/ml利福平和0.2μg/ml異煙肼的羅氏固體培養(yǎng)集中。將標(biāo)本置于37℃恒溫箱中培養(yǎng),培養(yǎng)時間為6周。培養(yǎng)完成后讀取菌落數(shù)并計算耐藥百分比,耐藥百分比低于1%為敏感,耐藥百分比高于1%為耐藥,同時出現(xiàn)異煙肼和利福平耐藥為耐多藥。實驗操作均嚴(yán)格按照中國防癆協(xié)會 《結(jié)核病診斷實驗室檢驗規(guī)程》要求進(jìn)行,所用培養(yǎng)基均由Basco公司提供。

        1.2.3 MTBDR plus線性探針技術(shù)檢測 每例患者均取1份陽性級別最高的痰標(biāo)本進(jìn)行檢測,檢測試劑盒為德國Hain Life Sciences公司的GenotypeRMTBDR plus試劑盒,具體操作步驟如下:將標(biāo)本進(jìn)行消化后制成重懸液,將500μl重懸液加入離心管內(nèi)5000r/min離心10min后去掉上清液并加入100μl的裂解緩沖液,將重懸液進(jìn)行渦旋震蕩后于95℃水中水浴5min,5000r/min離心 1min后去掉上清液再次加入100μl的裂解緩沖液,將重懸液進(jìn)行渦旋震蕩5s,再次5000r/min離心5min。取上清液5μl加入預(yù)先配置好的PCR擴增體系中,擴增循環(huán)為95℃擴增15min、95℃擴增30min、56℃擴增 3min,共 10個循環(huán);然后 95℃擴增 25s、53℃擴增 40s、70℃擴增 40s,共20個循環(huán);最后 70℃擴增8min。擴增完成后將產(chǎn)物與探針試紙條進(jìn)行雜交,根據(jù)顯色結(jié)果進(jìn)行耐藥性的判讀。

        1.2.4 傳統(tǒng)核酸擴增技術(shù)檢測 檢測方法參照參考文獻(xiàn)[6],將痰標(biāo)本進(jìn)行去污處理,取0.5μl痰標(biāo)本提取DNA模版進(jìn)行擴增加后進(jìn)行耐藥性分析。

        1.3 線性雜交技術(shù)結(jié)果判讀 試紙條共27個反應(yīng)條帶和4各區(qū)域,第1區(qū)為對照質(zhì)控帶,其他區(qū)為耐藥相關(guān)基因探針區(qū),其中第2區(qū)是利福平耐藥相關(guān)rpoB基因探針區(qū),第3、4區(qū)分別為與異煙肼耐藥相關(guān)的KatG、inhA基因探針區(qū),野生條帶均顯色而突變條帶無顯色時為敏感,野生條帶缺失和突變條帶顯色或不顯色均為耐藥。

        1.4 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS19.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)數(shù)據(jù)處理,計數(shù)資料比較采用卡方檢驗,計量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,采用t檢驗,采用敏感度和特異度對檢測結(jié)果的真實性進(jìn)行評價,采用準(zhǔn)確性對檢測方法的應(yīng)用價值進(jìn)行評價,采用Kappa值分析MTBDR plus技術(shù)、核酸擴增檢測技術(shù)與傳統(tǒng)藥敏實驗方法檢測結(jié)果的一致性,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 MTBDR plus技術(shù)、核酸擴增檢測技術(shù)檢測結(jié)果比較 MTBDR plus技術(shù)與傳統(tǒng)藥敏實驗檢測所得利福平耐藥結(jié)核病發(fā)生率、異煙肼耐藥結(jié)核病發(fā)生率和耐多藥結(jié)核病發(fā)生率比較差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)。核酸擴增檢測技術(shù)檢測所得利福平耐藥結(jié)核病發(fā)生率、異煙肼耐藥結(jié)核病發(fā)生率和耐多藥結(jié)核病發(fā)生率則均低于傳統(tǒng)藥敏實驗檢測所得結(jié)果,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),見表1。

        表1 MTBDR plus技術(shù)、核酸擴增檢測技術(shù)檢測結(jié)果比較[n(%)]

        2.2 MTBDR plus技術(shù)、核酸擴增檢測技術(shù)診斷耐藥結(jié)核病的準(zhǔn)確性比較 與核酸擴增檢測技術(shù)比較,MTBDR plus技術(shù)檢測利福平耐藥、異煙肼耐藥和耐多藥的敏感度、Kappa值均較高,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),見表2、表3和表4。

        表2 MTBDR plus技術(shù)、核酸擴增檢測技術(shù)診斷利福平耐藥的準(zhǔn)確性比較

        表3 MTBDR plus技術(shù)、核酸擴增檢測技術(shù)診斷異煙肼耐藥的準(zhǔn)確性比較

        表4 MTBDR plus技術(shù)、核酸擴增檢測技術(shù)診斷耐多藥的準(zhǔn)確性比較

        2.3 MTBDR plus技術(shù)、核酸擴增檢測技術(shù)出報告時間比較 MTBDR plus技術(shù)出報告時間0.5~2d,平均出報告時間為(1.26±0.58)d,核酸擴增出報告時間 4~15d,平均出報告時間為(8.89±1.08)d,MTBDR plus技術(shù)出報告時間顯著短于核酸擴增檢測技術(shù)出報告時間,差異有統(tǒng)計學(xué)意義 (t=13.82,P<0.01)。

        3 討論

        近年來我國耐藥結(jié)核病的發(fā)病率不斷上升,作為全球27個耐藥結(jié)核病高發(fā)國家之一,我國初診結(jié)核病患者中約5%的患者為耐藥結(jié)核病患者,而復(fù)發(fā)結(jié)核病患者中約1/4的患者為耐藥結(jié)核病患者[7,8]。目前地市級醫(yī)院由于實驗室診斷能力落后,結(jié)核耐藥診斷報告往往需數(shù)月時間,耐藥診斷結(jié)果的滯后性可明顯影響治療效果,耐藥結(jié)核患者無法得到及時有效的治療且耐藥結(jié)核病的傳播無法得以控制[9,10]。傳統(tǒng)耐藥檢測耗時長且靈敏性和特異性均較低,無法滿足耐藥結(jié)核病早期準(zhǔn)確診斷的需求[11]。線性探針技術(shù)可通過對耐藥相關(guān)基因的PCR擴增和反向雜交確定結(jié)核分枝桿菌對利福平和異煙肼的耐藥性,報告可于24h內(nèi)獲得,具有快速準(zhǔn)確的特點[12,13]。國外研究表明,線性探針技術(shù)用于涂陽痰標(biāo)本檢測的敏感度和特異度均較高[14]。2008年世界衛(wèi)生組織亦推薦線性探針技術(shù)可應(yīng)用于低收入國家耐藥結(jié)核病的診斷[15]。然而目前國內(nèi)關(guān)于線性探針技術(shù)診斷結(jié)合耐藥性的可靠性和及時性的研究報道甚少。明確線性探針雜交技術(shù)和傳統(tǒng)基因檢測技術(shù)檢測耐藥結(jié)核病的準(zhǔn)確度和所需時間可為耐藥結(jié)核病的早期診斷和疾病的控制提供指導(dǎo)。

        本研究結(jié)果顯示,分子線性探針雜交技術(shù)檢測所得利福平耐藥結(jié)核病、異煙肼耐藥結(jié)核病及耐多藥結(jié)核病的發(fā)病率與傳統(tǒng)藥敏檢測結(jié)果相近,而傳統(tǒng)基因檢測技術(shù)檢測所得分子利福平耐藥結(jié)核病、異煙肼耐藥結(jié)核病及耐多藥結(jié)核病的發(fā)病率低于分子線性探針雜交技術(shù)和傳統(tǒng)藥敏實驗檢測結(jié)果。傳統(tǒng)基因檢測診斷利福平耐藥結(jié)核病、異煙肼耐藥結(jié)核病及耐多藥結(jié)核病的特異性和準(zhǔn)確性均較高,說明傳統(tǒng)基因檢測在耐藥結(jié)核病的診斷中具有一定價值,然而其敏感度和Kappa值均較低,傳統(tǒng)基因檢測在耐藥結(jié)核病檢測中的準(zhǔn)確性有待提高。而分子線性探針雜交技術(shù)檢測診斷耐藥結(jié)核病的敏感度、特異性、準(zhǔn)確性及Kappa值均較高,分子線性探針雜交技術(shù)檢測診斷耐藥結(jié)核病具有較好的可靠性。分子線性探針雜交技術(shù)檢測診斷耐藥結(jié)核病出報告的時間短,可于2d內(nèi)給出耐藥結(jié)核病診斷報告,而傳統(tǒng)基因檢測耗時長,出報告時間需約10d,分子線性探針雜交技術(shù)檢測診斷耐藥結(jié)核病具有較高的及時性。線性探針雜交技術(shù)可通過異煙肼和利福平等耐藥相關(guān)基因的檢測來完成耐藥結(jié)核分枝桿菌的檢測,有助于耐藥TB的早期診斷和及時治療。由于實驗室檢測受操作人員水平、環(huán)境等多方面因素的影響,因此明確線性探針技術(shù)和傳統(tǒng)基因檢測技術(shù)在結(jié)核病診斷中的可靠性和及時性需進(jìn)一步全面深入研究。

        綜上所述,分子線性探針技術(shù)較傳統(tǒng)基因檢測技術(shù)可更及時、準(zhǔn)確地診斷耐藥結(jié)核病,同時具有較高的可靠性,是耐藥結(jié)核病診斷的有效方法。

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