石源源,韓璐,舒君,王笑峰,羅兵
(青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)教研室,山東 青島 266021)
?
TLR9-1486和TLR9-2848基因多態(tài)性與胃癌易感性關(guān)系
石源源,韓璐,舒君,王笑峰,羅兵
(青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)教研室,山東 青島 266021)
目的 探討Toll樣受體9 (TLR9)編碼基因TLR9-1486和TLR9-2848位點(diǎn)多態(tài)性以及EB病毒(EBV)感染與胃癌易感性的關(guān)系。方法 選取131例胃癌病人為研究對(duì)象,包括43例EBV相關(guān)胃癌(EBVaGC)和88例EBV陰性胃癌(EBVnGC),同時(shí)隨機(jī)抽取66例健康人外周血標(biāo)本作為對(duì)照。采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)技術(shù)檢測TLR9基因-1486位點(diǎn)T/C和-2848位點(diǎn)G/A多態(tài)性。結(jié)果 TLR9-1486T/C位點(diǎn)多態(tài)性分析顯示,胃癌組和對(duì)照組3種基因型分布和等位基因頻率比較差異無顯著性(P>0.05);EBVaGC組和EBVnGC組中各基因型分布和等位基因頻率差異也無顯著性(P>0.05);與攜帶T等位基因者相比較,C等位基因攜帶者胃癌和EBVaGC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無明顯升高趨勢。TLR9-2848G/A位點(diǎn)多態(tài)性分析顯示,胃癌組和對(duì)照組3種基因型分布和等位基因頻率差異無顯著性(P>0.05);EBVaGC組和EBVnGC組中各基因型分布和等位基因頻率差異也無顯著性(P>0.05);與G等位基因攜帶者比較,A等位基因攜帶者胃癌和EBVaGC易感性無明顯升高。結(jié)論 TLR9-1486和TLR9-2848位點(diǎn)多態(tài)性與胃癌易感性無關(guān),且在EBVaGC發(fā)生中與EBV感染無協(xié)同關(guān)系。
胃腫瘤;Toll樣受體9;多態(tài)性,單核苷酸;皰疹病毒4型,人
EB病毒(EBV)是傳染性單核細(xì)胞增多癥病原體,同時(shí)又與多種人類腫瘤的發(fā)生密切相關(guān),包括伯基特淋巴瘤、霍奇金病、移植后淋巴瘤、鼻咽癌以及部分胃癌[1-2]。Toll樣受體(TLR)是Ⅰ型跨膜蛋白受體,在啟動(dòng)天然免疫和調(diào)節(jié)特異性免疫中起重要作用,TLR信號(hào)調(diào)節(jié)異??蓪?dǎo)致慢性炎癥性疾病和
癌癥的發(fā)病危險(xiǎn)增加[3-4]。相關(guān)研究已表明,TLRs編碼基因多態(tài)性可能增加罹患某些腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)[5]。如TLR9-1486T/C (rs187084)和TLR9-2848G/A (rs352140)位點(diǎn)多態(tài)性可影響TLR9轉(zhuǎn)錄或蛋白質(zhì)編碼,進(jìn)而影響其功能,并參與自身免疫性疾病和癌癥的發(fā)生[6-7]。目前尚未見TLR9上述位點(diǎn)多態(tài)性與EBV相關(guān)胃癌(EBVaGC)相關(guān)性的研究報(bào)道。本研究選取EBVaGC、EBV陰性胃癌(EBVnGC)病人作為研究對(duì)象,探討TLR9編碼基因1486T/C和2848G/A位點(diǎn)多態(tài)性與胃癌發(fā)生的關(guān)系,以及EBV感染與TLR9基因多態(tài)性是否在EBVaGC發(fā)生中具有協(xié)同關(guān)系。
1.1研究對(duì)象
選取青島大學(xué)附屬醫(yī)院收治的經(jīng)病理檢查確診的胃癌病人131例作為胃癌組,采用原位雜交檢測石蠟組織切片中EBV編碼的小分子非多聚腺苷酸EBER1的表達(dá)來篩選EBVaGC,篩選出EBVaGC者43例和EBVnGC者88例。同時(shí),選取青島大學(xué)附屬醫(yī)院健康查體者66例作為對(duì)照組(均為非腫瘤病人,并排除各種感染及自身免疫病),性別和年齡與胃癌組差異無顯著性。采集兩組空腹EDTA抗凝靜脈血5 mL,分離外周血單個(gè)核細(xì)胞。
1.2組織細(xì)胞DNA提取
新鮮的胃癌組織和外周血單個(gè)核細(xì)胞DNA提取采用酚-氯仿-異戊醇法,石蠟包埋的胃癌組織DNA提取采用德國QIAGEN公司的QIAAmp FFPE DNA 提取試劑盒,操作參照試劑盒說明進(jìn)行。
1.3TLR9編碼基因1486T/C和2848G/A位點(diǎn)多態(tài)性檢測
采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)技術(shù)分別分析TLR9基因1486T/C和2848G/A兩個(gè)位點(diǎn)多態(tài)性,所用引物序列和產(chǎn)物大小見表1。
表1 TLR9編碼基因多態(tài)性分析所用引物序列及產(chǎn)物大小
TLR9編碼基因1486T/C和2848G/A位點(diǎn)的PCR擴(kuò)增條件相同,反應(yīng)體系為30 μL,包括10×Buffer 3 μL,dNTPs 0.2 mmol/L,上下游引物各0.3 μmol/L,Taq DNA聚合酶1.0 U,DNA 模板2 μL。循環(huán)條件:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min,共擴(kuò)增35個(gè)循環(huán);最后72 ℃延伸10 min。取6 μL的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物于含溴化乙錠(0.5 mg/L)的20 g/L瓊脂糖凝膠中電泳,凝膠成像系統(tǒng)記錄電泳結(jié)果。每次PCR反應(yīng)均用無菌雙蒸水作陰性對(duì)照。
采用限制性內(nèi)切酶AflⅡ(New England Biola-bs Inc., Ipswich, MA, USA)酶切1486T/C位點(diǎn)長565 bp的PCR產(chǎn)物,酶切體系20 μL,包括10×NEB緩沖液2 μL,PCR產(chǎn)物10 μL, 100×BSA0.2 μL, AflⅡ 0.5 μL,無酶雙蒸水7.3 μL。混勻后瞬時(shí)離心,37 ℃水浴1 h。限制性內(nèi)切酶BstUⅠ酶切2848G/A位點(diǎn)長360 bp的PCR產(chǎn)物,酶切體系為20 μL,包括10×NEB緩沖液 2 μL,BstUⅠ 0.5 μL,DNA 10 μL,無酶雙蒸水7.5 μL?;靹蚝笏矔r(shí)離心,60 ℃水浴1 h。上述酶切產(chǎn)物于含溴化乙錠(0.5 mg/L)的20 g/L瓊脂糖凝膠中電泳,凝膠成像系統(tǒng)記錄實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
1.4PCR產(chǎn)物測序
將上述部分經(jīng)過PCR-RFLP鑒定分型的產(chǎn)物45 μL送北京華大基因有限公司進(jìn)行序列測定,測序后用Chromas軟件查看峰圖文件,DNAStar軟件(Larsergene,version 7.0)進(jìn)行序列剪接和對(duì)比分析,并與相應(yīng)TLRs野生型序列進(jìn)行比對(duì)以驗(yàn)證PCR-RFLP結(jié)果。
1.5統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
采用SPSS軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,組間基因型、等位基因、等位基因攜帶者比較采用pearsonχ2檢驗(yàn),基因多態(tài)性與胃癌相關(guān)性用非條件Logistic回歸分析,計(jì)算比值比(OR),以雙側(cè)a=0.05為檢驗(yàn)水準(zhǔn)。
2.1TLR9編碼基因1486T/C位點(diǎn)多態(tài)性檢測
本文131例胃癌組織DNA和66例對(duì)照組外周血DNA均擴(kuò)增出TLR9基因1486T/C位點(diǎn)565 bp特異性條帶,PCR產(chǎn)物Afl Ⅱ酶切后電泳條帶仍為565 bp者為純合突變CC基因型;酶切后出現(xiàn)416 bp和149 bp兩條帶者為純合野生TT基因型;觀察到416 bp、149 bp和565 bp共3條帶者,則為雜合CT基因型。部分標(biāo)本酶切產(chǎn)物電泳結(jié)果見圖1。
M為DL 2000 DNA Marker;①、、、、為CC基因型;②~④、⑥、⑧~⑩、、、、為CT基因型;⑤、⑦、、、、、、為TT基因型。
隨機(jī)選取不同基因型PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序分析,測序結(jié)果采用DNAStar軟件與GenBank TLR9標(biāo)
準(zhǔn)型(野生型)DNA序列進(jìn)行比較,其結(jié)果與PCR-RFLP鑒定結(jié)果一致。
胃癌組和對(duì)照組3種基因型分布和等位基因頻率比較差異無顯著意義(P>0.05)。EBVaGC組和EBVnGC組各基因型分布和等位基因頻率差異也無顯著性(P>0.05)。單自變量非條件Logistic回歸分析(攜帶C等位基因者賦值為0,攜帶T等位基因者賦值為1)顯示,胃癌組與對(duì)照組中,與攜帶T等位基因者相比較,攜帶C等位基因者有增加胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的趨勢,但差異無顯著意義(OR=1.231,95%CI=0.646~2.346,P>0.05);EBVaGC組與EBVnGC組中差異也無顯著性(OR=0.969,95%CI=0.429~2.188,P>0.05)。見表2。
2.2TLR9編碼基因2848G/A位點(diǎn)多態(tài)性檢測
本文131例胃癌組織DNA和66例對(duì)照組外周血DNA均擴(kuò)增出360 bp特異性條帶,以酶切產(chǎn)物電泳條帶仍為360 bp者為純合突變AA基因型;酶切產(chǎn)物電泳出現(xiàn)227 bp和133 bp兩條帶者為純合野生GG基因型;酶切產(chǎn)物電泳觀察到227 bp、133 bp和565 bp共3條帶者則為雜合GA基因型。部分標(biāo)本PCR產(chǎn)物BstUⅠ酶切后電泳結(jié)果見圖3。同上方法對(duì)3種基因型PCR產(chǎn)物進(jìn)行測序分析,其結(jié)果與PCR-RFLP檢測結(jié)果一致。
M為DL 2000 DNA Marker;①、③、⑥、⑩、、、為GA基因型;②、④、、、、為GG基因型;⑤、⑦~⑨,、、、~為AA基因型。
胃癌組和對(duì)照組3種基因型分布和等位基因頻率比較差異無顯著意義(P>0.05)。EBVaGC組和EBVnGC組各基因型分布和等位基因頻率差異也無顯著性(P>0.05)。單自變量非條件Logistic回歸分析(攜帶G等位基因者賦值為0,攜帶A等位基因者賦值為1)顯示,胃癌組與對(duì)照組中,與攜帶G等位基因者相比,攜帶A等位基因者與胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無相關(guān)性(OR=0.985,95%CI=0.524~1.848,P>0.05);EBVaGC組與EBVnGC組中差異也無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(OR=0.664,95%CI=0.298~1.480,P>0.05)。見表3。
表2 TLR9-1486T/C基因型和等位基因分布
表3 TLR9-2848G/A基因型和等位基因分布
人類TLR家族已發(fā)現(xiàn)有11個(gè)成員,而目前研究最多的則是TLR2、3、4和9,其中TLR9在許多腫瘤組織中高表達(dá),TLR9-1486T/C(rs187084)和TLR9-2848G/A(rs352140)位點(diǎn)多態(tài)性可能會(huì)影響TLR9基因轉(zhuǎn)錄或蛋白質(zhì)編碼。本研究結(jié)果表明,TLR9編碼基因1486T/C和2848G/A位點(diǎn)多態(tài)性與胃癌的發(fā)病易感性無關(guān),而且與EBV感染在胃癌發(fā)病易感性中也無協(xié)同關(guān)系。曾紅梅等[8]自胃癌高發(fā)區(qū)山東臨朐縣選取248例胃癌病人,同時(shí)隨機(jī)抽取496例胃炎病人作為對(duì)照,采用PCR-RFLP技術(shù)證實(shí)TLR2基因rs3804099位點(diǎn)多態(tài)性與胃癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)密切相關(guān),并與幽門螺桿菌感染存在協(xié)同效應(yīng);而TLR9基因rs187084位點(diǎn)多態(tài)性則與胃癌和幽門螺桿菌無相關(guān)性。WANG等[9]從江蘇漢族人群中選取314例胃癌病人和314例健康對(duì)照者,采用PCR-RFLP技術(shù)檢測分析,結(jié)果顯示江蘇省漢族人群中攜帶TLR9-1486T/C基因C等位基因者胃癌的易感性增加,攜帶C等位基因和幽門螺桿菌感染在胃癌發(fā)生發(fā)展中有協(xié)同作用。這些結(jié)果不同的原因仍不清楚,可能是地區(qū)差異造成遺傳背景不同所致,也可能與幽門螺桿菌和EBV是不同的感染因子有關(guān)。LAI等[7]采用PCR-RFLP方法,對(duì)取自四川省華西第二醫(yī)院的120例宮頸癌和100例對(duì)照者進(jìn)行檢測分析,證明宮頸癌患病風(fēng)險(xiǎn)與TLR9-2848G/A位點(diǎn)多態(tài)性有明顯的關(guān)系,但與TLR9-1486T/C位點(diǎn)多態(tài)性無相關(guān)關(guān)系。還有研究表明,TLR9基因多態(tài)性與前列腺癌及子宮內(nèi)膜癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),提示TLR9基因多態(tài)性在不同腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用可能有所不同[10-11]。
有研究表明,TLR9具有識(shí)別EBV以及產(chǎn)生先天免疫反應(yīng)的能力,這可能有助于限制病毒的傳播以及控制EBV潛伏感染B細(xì)胞的增殖;另一方面,EBV可能會(huì)干擾TLR9表達(dá)和功能,從而影響宿主免疫反應(yīng)有助于病毒的長期生存。FATHALLAH等[12]采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測并比較初始B細(xì)胞和淋巴母細(xì)胞系的TLR9表達(dá)水平,證明EBV潛伏膜蛋白(LMP1)可明顯抑制TLR9轉(zhuǎn)錄,降低TLR9 mRNA和蛋白質(zhì)的水平,LMP1通過下調(diào)TLR9的轉(zhuǎn)錄來逃避先天免疫反應(yīng)。由于EBVaGC中EBV屬于 Ⅰ 型潛伏,并不表達(dá)LMP1,所以不存在上述抑制作用。因此,尚需在上述研究基礎(chǔ)上對(duì)TLR9編碼基因其他多態(tài)性位點(diǎn)進(jìn)行檢測,增加胃部慢性炎癥病人作為病例對(duì)照,同時(shí)注意外界環(huán)境和宿主因素對(duì)胃癌形成的影響,進(jìn)一步明確TLR9基因多態(tài)性和EBV感染與胃癌以及EBVaGC易感性的關(guān)系。
[1] 張巖,賈玉平,王云,等. EBVaGC腫瘤差異表達(dá)的基因表達(dá)譜芯片篩選[J]. 青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào), 2013,49(5):381-385.
[2] 王海娟,李慧,王笑峰,等. 鼻型結(jié)外NK/T細(xì)胞淋巴瘤與EB病毒感染的相關(guān)性[J]. 齊魯醫(yī)學(xué)雜志, 2014,29(6):471-474.
[3] AKIRA S, TAKEDA K, KAISHO T. Toll-like receptors: critical proteins linking innate and acquired immunity[J]. Nature Immunology, 2001,2(8):675-680.
[4] ACHYUT B R, GHOSHAL U C, MOORCHUNG N, et al. Association of toll-like receptor-4 (asp299Gly and Thr399Ileu) gene polymorphisms with gastritis and precancerous lesions[J]. Human Immunology, 2007,68(11):901-907.
[5] EL-OMAR E M, NG M T, HOLD G L. Polymorphisms in toll-like receptor genes and risk of cancer[J]. Oncogene, 2008,27(2):244-252.
[6] NOVAK N, YU C F, BUSSMANN C, et al. Putative association of a TLR9 promoter polymorphism with atopic eczema[J]. Allergy, 2007,62(7):766-772.
[7] LAI Z Z, NI N Z, PAN X L, et al. Toll-like receptor 9 (TLR9) gene polymorphisms associated with increased susceptibility of human papillomavirus-16 infection in patients with cervical cancer[J]. Journal of International Medical Research, 2013,41(4):1027-1036.
[8] 曾紅梅,潘凱楓,張陽,等. Toll樣受體2及Toll樣受體9基因多態(tài)性與胃癌易感性的關(guān)系[J]. 中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志, 2011,45(7):588-592.
[9] WANG X Y, XUE L, YANG Y, et al. TLR9 promoter polymorphism is associated with both an increased susceptibility to gastric carcinoma and poor prognosis[J]. PLOS One, 2013,8(6): e65731.
[10]STARK J R, WIKLUND F, GRONBERG H A, et al. Toll-like receptor signaling pathway variants and prostate cancer mortality[J]. Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention, 2009,18(6):1859-1863.
[11]ASHTON K A, PROIETTO A, OTTON G, et al. Toll-like receptor (TLR) and nucleosome-binding oligomerization domain (NOD) gene polymorphisms and endometrial cancer risk[J]. BMC Cancer, 2010,10:382.
[12]FATHALLAH I, PARROCHE P, GRUFFAT H, et al. EBV latent membrane protein 1 is a negative regulator of TLR9[J]. Journal of Immunology, 2010,185(11):6439-6447.
(本文編輯 馬偉平)
RELATIONSHIP BETWEEN GENE TLR9-1486 AND TLR9-2848 POLYMORPHISMS AND EBVAGC SUSCEPTIBILITY
SHIYuanyuan,HANLu,SHUJun,WANGXiaofeng,LUOBing
(Department of Medical Microbiology, Qingdao University Medical College, Qingdao 266021, China)
ObjectiveTo investigate the relationship between toll-like receptor 9 encoding gene TLR9-1486 and TLR9-2848 site polymorphisms and EBV infection and gastric cancer susceptibility.MethodsThis study consisted of 131 patients with gastric cancer including 43 cases of EBV-associated gastric carcinoma (EBVaGC) and 88 cases of EBV-negative gastric carcinoma (EBVnGC), and peripheral blood specimens taken from 66 healthy individuals served as controls. TLR9 gene-1486 site T/C and -2848 site G/A polymorphism were detected by PCR-restriction fragment length polymorphism analysis (RFLP).ResultsTLR9-1486T/C site polymorphism analysis showed there was no significant difference in genotype frequency and allele frequency in gastric cancer group and the control group (P>0.05). There was also no significant difference in each of genotype distribution and allele frequency between EBVaGC group and EBVnGC group (P>0.05). Compared with T allele, the frequency of C allele had no apparently increased risk trend for gastric cancer and EBVaGC. TLR9-2848 site G/A polymorphism analysis showed that there was no significant difference in genotype distribution and allele frequency between gastric cancer group and the control group (P>0.05), and there was also no significant difference in each of genotype distribution and allele frequency between EBVaGC group and EBVnGC group (P>0.05). Compared with G allele, the frequency of A allele showed no obvious risk for gastric cancer and EBVaGC susceptibility.ConclusionTLR9 gene-1486 and-2848 site polymorphism are not associated with gastric cancer, and there is no collaborative relationship with EBV infection in the carcinogenesis of EBVaGC.
stomach neoplasms; toll-like receptor 9; polymorphism, single nucleotide; herpesvirus 4, human
2014-07-20;
2015-01-20
國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(30970157)、青島市科技局資助項(xiàng)目(13-1-3-50-jch)
石源源(1985-),女,碩士研究生。
羅兵(1962-),男,博士,教授,博士生導(dǎo)師。
R735.2
A
1008-0341(2015)03-0260-04