崔 婧 ,時(shí)東方,王 強(qiáng),陳麗娜,陳 珊
(1.長春師范大學(xué)中心實(shí)驗(yàn)室,吉林長春 130032;2.東北師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,吉林長春 130024)
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一株聚乳酸降解菌的鑒定
崔 婧1,2,時(shí)東方1,王 強(qiáng)1,陳麗娜1,陳 珊2
(1.長春師范大學(xué)中心實(shí)驗(yàn)室,吉林長春 130032;2.東北師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,吉林長春 130024)
本文從活性污泥中篩選到一株可以降解PLA的細(xì)菌DS04—W,通過形態(tài)學(xué)、生理生化性質(zhì)以及16SrDNA序列分析進(jìn)行菌種鑒定,初步鑒定該菌為Bacillus megaterium(巨大芽孢桿菌),并且具有降解PLA的能力,這為進(jìn)一步研究酶解PLA的機(jī)理奠定了基礎(chǔ)。
聚乳酸 ;巨大芽孢桿菌;鑒定
全球經(jīng)濟(jì)高速發(fā)展的今天,對(duì)塑料制品的需求在不斷增加,但是一般塑料制品在自然界中很難被降解,所以造成現(xiàn)在“白色污染”越來越嚴(yán)重,破壞了生態(tài)平衡,嚴(yán)重威脅人類的健康[1]。近年來人們開始關(guān)注可降解塑料,目前已開發(fā)的生物可降解塑料主要是聚酯類材料,其中聚乳酸(PLA)以良好的物理化學(xué)性能、機(jī)械性能及生物相容性受到廣泛關(guān)注[2]。雖然PLA在很多物理性能和機(jī)械性能上優(yōu)于其他聚酯類材料,但是自然界中發(fā)現(xiàn)的能夠降解PLA的微生物數(shù)量很少,不到0.04%[3-5]。目前為止,人們分離得到能夠降解PLA的菌株只有幾十種,絕大部分都屬于放線菌,包括Amycolatopsis屬[6-8]、Saccharothrixwaywayandensis屬[9]和Kibdelosporangiumaridum屬[10]等,只有少量細(xì)菌和真菌可以降解PLA。本實(shí)驗(yàn)是從自然界中篩選出一株可以降解PLA的細(xì)菌,通過形態(tài)學(xué)、生理生化性質(zhì)以及16SrDNA序列分析進(jìn)行菌種鑒定,并研究其降解PLA的能力,這為進(jìn)一步研究細(xì)菌降解PLA的機(jī)理奠定了基礎(chǔ)。
1.1 材料
1.1.1 聚乳酸(PLA)材料
PLA膜和PLA粉末由中國科學(xué)院長春應(yīng)用化學(xué)研究所提供,相對(duì)分子量2.074 105。
1.1.2 培養(yǎng)基
(1)基本培養(yǎng)基 NaCl 0.1g·L-1,CaCl2·2H2O 0.02g·L-1,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.01g·L-1,酵母提取物 0.25g·L-1,(NH4)2SO41g·L-1, MgSO4·7H2O 0.2g·L-1,MnSO40.5mg·L-1, Na2WO40.5mg·L-1, Na2MoO4·2H2O 0.5mg·L-1, pH=8.0。
(2)PLA培養(yǎng)基 10ml氯仿中加入0.1gPLA粉末,溶解后,加入0.01g Plysurf A210G和 100ml基本培養(yǎng)基?;靹蚝笥贸暡?xì)胞破碎儀處理,工作時(shí)間7s,間隔時(shí)間6s,處理50次。處理后,將乳化液放在磁力攪拌器上,60℃加熱90分鐘,蒸去氯仿,最后用基本培養(yǎng)基定容到100ml,得到PLA培養(yǎng)基[12]。
1.2 方法
1.2.1 菌種的分離純化
取10g活性污泥,接入到以PLA為唯一C源的100ml富集培養(yǎng)基中,在37℃下?lián)u床培養(yǎng),取1ml的培養(yǎng)液稀釋涂布于PLA固體培養(yǎng)基平板上進(jìn)行分離純化。
1.2.2 降解PLA膜實(shí)驗(yàn)
將PLA膜(1.0cm×1.0cm)滅菌,再放入滅菌的100ml基本培養(yǎng)基中;接入一定量的菌液,在37℃,150r·min-1條件下培養(yǎng)3d。
1.2.3 菌種鑒定
根據(jù)《常見細(xì)菌鑒定手冊(cè)》進(jìn)行形態(tài)學(xué)和生理生化特性的鑒定[11]。
菌株16S rDNA鑒定及系統(tǒng)發(fā)育分析:將細(xì)菌的基因組DNA提取,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,純化,測序工作由上海生物工程有限公司完成。將菌株的16S rDNA序列在NCBI數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行Blast比對(duì),使用MEGA 3.1軟件來構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
1.2.4 PLA降解酶活力的測定
取0.1g·ml-1的PLA乳化液1m,與等體積粗酶液混合,37℃保溫24h,然后用L—乳酸試劑盒(南京建成)測定上清中乳酸含量。PLA降解生成乳酸,所以通過計(jì)算乳酸生成量來說明PLA降解酶的活力。同時(shí)與滅活的酶液做對(duì)照[12]。
2.1 菌種分離純化與PLA膜降解能力的測定
從活性污泥中篩選到一株能降解PLA的菌株,命名為DS04—W。該菌對(duì)PLA膜具有降解作用,通過掃描電鏡觀察PLA膜,發(fā)現(xiàn)在降解前后PLA膜有顯著不同,降解后PLA膜表面凹凸不平,膜上有裂紋出現(xiàn),透明度下降,并且可以觀察到膜的表面有菌生長。
A.PLA膜降解前1000× B.PLA膜降解后2000×
2.2 PLA降解菌的鑒定
2.2.1 形態(tài)學(xué)鑒定
顯微鏡下觀察菌體成短桿狀、有芽孢、革蘭氏染色為陰性,菌落成透明、圓形、表面光滑隆起狀(圖2)。
圖2 DS04-W菌株的形態(tài)觀察
2.2.2 生理生化特征
參照《常見細(xì)菌鑒定手冊(cè)》結(jié)果,如表1所示。
表1 DS04-W的生理生化性質(zhì)
注:“-”表示結(jié)果為陰性;“+”表示結(jié)果為陽性。
2.2.3 16S rDNA 基因序列分析
對(duì)菌株的16S rDNA序列進(jìn)行擴(kuò)增和測定,得到1514bp核苷酸序列。進(jìn)行Blast比對(duì),發(fā)現(xiàn)與Bacillus sp. 19497和BacillusmegateriumTS IW36 的16S rDNA的同源性為99%。對(duì)其進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,構(gòu)建以16S rDNA序列為基礎(chǔ)的系統(tǒng)發(fā)育樹,如圖3所示。
圖3 DS04-W 的系統(tǒng)發(fā)育樹
從活性污泥中篩選到一株可以降解PLA的菌株DS04-W,用掃描電鏡觀察其降解PLA膜的能力,發(fā)現(xiàn)降解前后PLA膜有顯著變化,證實(shí)菌株確實(shí)對(duì)PLA具有降解能力。
根據(jù)《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》,從形態(tài)學(xué)和生理生化性質(zhì)上進(jìn)行鑒定,發(fā)現(xiàn)菌株屬于芽孢桿菌屬,結(jié)合16S rDNA序列分析,發(fā)現(xiàn)與Bacillus sp. 19497和Bacillus megaterium TS IW36的同源性為99%,因此鑒定菌株DS04-W是Bacillus megaterium(巨大芽孢桿菌)。
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Identification of Poly (L-lactic acid) Degrading Microorganism
CUI Jing1,2, SHI Dong-fang1, WANG Qiang1, CHEN Li-na1,CHEN Shan2
(1.Changchun Normal University, Changchun Jilin 130032,China;2.Life Sciences of Northeast University, Changchun Jilin 130024, China)
A strain possessing activity to degrade poly-L-lactic acid (PLA) DS04-W was screened from sludge.It was identified by the analyses of morphological, physiological and biochemical properties, 16SrDNA comparison. It was identified as Bacillus megaterium.Strains DS04′ - W has the ability of degradation PLA. It established the foundation for the further research on enzymic hydrolysis PLA.
Poly (L-lactic acid); Bacillus megaterium;identification
2015-06-27
崔 婧(1986- ),女,吉林長春人,長春師范大學(xué)中心實(shí)驗(yàn)室助理實(shí)驗(yàn)師,碩士,從事生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究。
Q93-331
A
2095-7602(2015)10-0062-04