高潔,吉兆華,劉義文,郭致文,邵中軍,閆永平
(1.第四軍醫(yī)大學(xué),陜西西安 710032;2.武威市疾病預(yù)防控制中心,甘肅武威 733000)
現(xiàn)代分子流行病學(xué)實驗室建設(shè)與發(fā)展
高潔1,吉兆華1,劉義文2,郭致文2,邵中軍1,閆永平1
(1.第四軍醫(yī)大學(xué),陜西西安 710032;2.武威市疾病預(yù)防控制中心,甘肅武威 733000)
分子流行病學(xué)實驗室作為重大傳染病防治研究的前沿陣地,自2003年SARS暴發(fā)以后逐步受到公共衛(wèi)生部門的重視。分子流行病學(xué)實驗室利用分子生物學(xué)理論、技術(shù)和方法,圍繞重大傳染性疾病、突發(fā)公共衛(wèi)生事件處置、生物武器防護等問題進行研究,著重研究暴露因素與基因及蛋白的關(guān)系、傳染性疾病生物標(biāo)志物的檢測與識別,為國家和軍隊重大傳染病防治和突發(fā)公共衛(wèi)生事件處置提供技術(shù)支撐和科學(xué)依據(jù)。從實踐經(jīng)驗角度出發(fā),以分子流行病學(xué)實驗室建設(shè)的兩大核心要素——管理要素和技術(shù)要素為論述依據(jù),重點闡釋實驗室建設(shè)中的核心問題,為現(xiàn)代分子流行病學(xué)實驗室建設(shè)與發(fā)展提供參考意見。
分子流行病學(xué);實驗室建設(shè);傳染病防治
目前,疾病暴發(fā)和應(yīng)急性公共衛(wèi)生問題日益全球化,分子流行病學(xué)實驗室作為重大傳染病防治研究的前沿陣地,自2003年SARS暴發(fā)以后逐步受到公共衛(wèi)生部門的重視。第四軍醫(yī)大學(xué)分子流行病學(xué)實驗室作為全軍現(xiàn)場流行病學(xué)研究重點實驗室的核心組成單元,承擔(dān)著軍事醫(yī)學(xué)研究、實驗教學(xué)、流行病學(xué)調(diào)查、公共衛(wèi)生事件處置、傳染病防治研究、臨床流行病學(xué)研究等多項任務(wù)。自2009年以來,在“國家傳染病防治科技重大專項”、“全軍重點實驗室建設(shè)”等項目扶持下,本實驗室逐步發(fā)展、完善,在人員配置、儀器管理、科研管理、教學(xué)管理、標(biāo)本庫管理、安全管理等方面積累了豐富的經(jīng)驗,為學(xué)科發(fā)展奠定了堅實的基礎(chǔ)。
1.1 實驗室建設(shè)應(yīng)與學(xué)科發(fā)展相適應(yīng)
分子流行病學(xué)最早由Kilbourne于1973年在其關(guān)于流感的研究中提出[1],此后Schulte和Perera于1993年在論著《分子流行病學(xué):原理和應(yīng)用》中將這一概念進行了明確的定義和闡釋。21世紀(jì)初,隨著分子生物學(xué)和細胞生物學(xué)的爆炸式發(fā)展,分子流行病學(xué)作為探究疾病與細胞分子關(guān)系的應(yīng)用學(xué)科得到了穩(wěn)步發(fā)展,如今每年僅在PubMed上發(fā)表的相關(guān)論文就達到7 000余篇。分子流行病學(xué)實驗室的發(fā)展為各種類型的分子流行病學(xué)研究提供了技術(shù)支撐和研究平臺。
2009年以后,我國在衛(wèi)生部、教育部、CDC的支持下,批準(zhǔn)建立了多家國家級、省級現(xiàn)代化的分子流行病學(xué)實驗室[2]。實驗室裝備精良、人員專業(yè),從不同研究方向彌補了我國在腫瘤分子流行病學(xué)、傳染病流行病學(xué)、臨床流行病學(xué)、院內(nèi)感染預(yù)防控制研究等方面的不足。如今,分子流行病學(xué)實驗室已由單一的傳染病流行規(guī)律、傳播途徑的檢測實驗室發(fā)展成為集空間流行病學(xué)、現(xiàn)場流行病學(xué)、基因組流行病學(xué)、藥物流行病學(xué)、循證醫(yī)學(xué)、分子遺傳學(xué)、醫(yī)學(xué)信息處理與數(shù)據(jù)挖掘等多學(xué)科于一體的綜合實驗室。實驗室發(fā)展與學(xué)科發(fā)展密不可分,應(yīng)整合公共衛(wèi)生資源,緊跟學(xué)科發(fā)展方向,采用分子生物學(xué)、流行病學(xué)、衛(wèi)生統(tǒng)計學(xué)的技術(shù)和方法,提高預(yù)防醫(yī)學(xué)科研轉(zhuǎn)化能力,這也是分子流行病學(xué)實驗室的未來發(fā)展方向。
1.2 實驗室建設(shè)應(yīng)與運行目標(biāo)相適應(yīng)
本校分子流行病學(xué)實驗室是我軍最早的一批軍隊重點實驗室之一,多次參加部隊和地方的突發(fā)公共衛(wèi)生事件的應(yīng)急處置工作,并連續(xù)多年成功舉辦全軍現(xiàn)場流行病學(xué)培訓(xùn)班。在全軍“十一五”、“十二五”課題的資助下,先后開展了部隊流感防控策略、遙感流行病學(xué)、部隊肝炎的流行病學(xué)研究,在部隊疾病控制方面發(fā)揮了重要作用。同時,在國家傳染病防治科技重大專項的連續(xù)資助下,建立了100萬人口的甘肅武威市傳染病流行病學(xué)防控現(xiàn)場。實驗室技術(shù)能力和實力大幅度提高,具備大批量生物標(biāo)本采集、處理、分離、長期儲存能力,完成了30萬份血清標(biāo)本和5萬份細胞組織樣本生物標(biāo)本庫的建立;分子生物學(xué)實驗單元具有核酸全自動抽提和定量、基因克隆和測序、基因多態(tài)檢測和進行各類生物標(biāo)志物檢測的實驗?zāi)芰Α?009年,為了滿足生物安全處置和科研發(fā)展需要,實驗室還配備有高標(biāo)準(zhǔn)的“BSL-2”級生物安全實驗單元、SPF級實驗動物房、臨床級細胞實驗單元。2012年,實驗室在原有計算機分析平臺的基礎(chǔ)上建立了生物信息學(xué)實驗單元,配置IBM高端刀片服務(wù)器,將多節(jié)點協(xié)同運算分析技術(shù)用于基因分析、分子流行病學(xué)統(tǒng)計、時空流行病學(xué)建模和預(yù)測。2014年,實驗室在生物武器防護教學(xué)與研究的基礎(chǔ)上,建立了基于新一代基因芯片技術(shù)的生物戰(zhàn)劑檢測與研發(fā)實驗單元。2015年,實驗室在臨床流行病學(xué)單元(CEU)基礎(chǔ)上,進一步整合實驗室科研和人才資源,與西安市疾病預(yù)防控制中心戰(zhàn)略合作,從循證醫(yī)學(xué)角度重點研究地方性慢性病的分子流行病學(xué)機理。
如今,本校分子流行病學(xué)實驗室隨著教學(xué)、科研、軍事改革的浪潮,不斷調(diào)整運行目標(biāo),升級和改善實驗室基礎(chǔ)環(huán)境,擴展研究領(lǐng)域和方向,為全面提升實驗室研究能力和水平創(chuàng)造可持續(xù)發(fā)展的條件。
1.3 實驗室建設(shè)要素
分子流行病學(xué)實驗室建設(shè)要素通常包括管理要素和技術(shù)要素兩大部分,其核心管理思想來源于CNAS(《醫(yī)學(xué)實驗室質(zhì)量和能力認可準(zhǔn)則》),旨在合理、全面地管理與評估實驗室的運行和發(fā)展。在實際應(yīng)用中,本實驗室根據(jù)學(xué)科發(fā)展特點將管理要素概括為組織與管理結(jié)構(gòu)、實驗室管理制度、運行管理的評估與考核、對外合作與聯(lián)系4個方面;將技術(shù)要素概括為人員管理、實驗室環(huán)境、設(shè)備設(shè)施、生物標(biāo)本庫、技術(shù)能力管理與發(fā)展、業(yè)務(wù)流程管理和控制、信息管理7個方面。
2.1 組織和管理結(jié)構(gòu)
實驗室由管理委員會負責(zé)日常管理,設(shè)主任、副主任和管理秘書,通常由科室主任擔(dān)任實驗室主任,以確保實驗室各項管理措施的落實;設(shè)置實驗室專職安全管理員,由實驗室主任直接領(lǐng)導(dǎo),負責(zé)監(jiān)督、落實實驗室各項安全制度和措施,保障實驗室的安全運行。成立了以我軍著名流行病學(xué)專家徐德忠教授為主席的學(xué)術(shù)委員會,同時聘請了相關(guān)領(lǐng)域權(quán)威專家為成員,如北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部病毒學(xué)專家莊輝院士、浙江大學(xué)傳染病學(xué)專家李蘭娟院士、中國CDC首席流行病學(xué)專家曾光教授等。學(xué)術(shù)委員會定期督導(dǎo)實驗室的運行與發(fā)展,為管理委員會提供專業(yè)的管理和發(fā)展意見。
2.2 運行管理的評估與考核
管理委員會定期組織工作進展匯報、工作成果總結(jié),要求每一個人都走上“講臺”,面對全體工作人員匯報自己近期的工作、掌握的技術(shù)、課題的進展、遇到的問題。由管理委員會公開公正地考核匯報人員的工作績效,并對下一步工作計劃制訂提出指導(dǎo)意見,引導(dǎo)關(guān)鍵問題的解決。管理委員會每年將實驗室運行管理的考核結(jié)果、科技成果匯總,報送實驗室學(xué)術(shù)委員會和主管部門審核,并將審核意見和建議作為下一年度的工作任務(wù)納入工作計劃。
2.3 對外合作與聯(lián)系
充分發(fā)揮實驗室在科研項目、實驗條件和解決國家重大需求等方面的優(yōu)勢,根據(jù)研究方向并依托項目設(shè)置開放基金和課題,吸引國內(nèi)外優(yōu)秀科技人才,積極開展國際和國內(nèi)合作與學(xué)術(shù)交流。近兩年共舉辦高端國際學(xué)術(shù)交流會3場,邀請國內(nèi)外知名專家教授交流訪問十余次。
同時,實驗室注重區(qū)域性科研技術(shù)合作,分別與甘肅省武威市政府、武威市疾控中心、陜西省疾控中心、西安市疾控中心、陜西省大荔縣政府、敦煌市疾控中心簽訂了戰(zhàn)略合作框架協(xié)議,為拓展分子流行病學(xué)實驗室研究領(lǐng)域、加強領(lǐng)域內(nèi)橫向合作奠定了基礎(chǔ)。
2.4 人員管理
現(xiàn)代流行病學(xué)實驗室的功能劃分決定了其復(fù)雜的人員組成結(jié)構(gòu),既包括本實驗室學(xué)術(shù)專家、管理人員、技術(shù)支持人員、維護保障人員等實驗室常駐人員,又包括課題研究人員、進修生、研究生、外來訪問交流人員等短期駐留人員。實驗室根據(jù)人員類別,設(shè)置不同的進入許可、設(shè)備儀器使用權(quán)限、實驗生物安全許可、流行病學(xué)資料(數(shù)據(jù))訪問許可以及實驗室信息系統(tǒng)賬戶訪問權(quán)限。
所有人員均擁有獨立的信息系統(tǒng)賬戶,用于在職或在研期間科研資料、個人研究成果的管理,實現(xiàn)了以電子化方式記錄科研過程、以數(shù)據(jù)庫方式儲存和管理科研成果的目標(biāo)。這種管理模式不但彌補了紙質(zhì)資料記錄不易、耗時過長、查詢不便的缺陷,還將人員管理與科研過程管理直接掛鉤,便于公正、公平地統(tǒng)計績效、評估人員能力,為實驗室人員管理奠定了信息化的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。
2.5 設(shè)備設(shè)施管理
設(shè)備設(shè)施管理是實驗室重要的資產(chǎn)管理項目,也是實驗室保障教、學(xué)、研任務(wù)順利進行的資源前提。分子流行病學(xué)實驗室設(shè)備設(shè)施具有其學(xué)科特點,高端設(shè)備(分析設(shè)備、精密設(shè)備)密集、環(huán)境設(shè)施(通風(fēng)系統(tǒng)、空氣凈化系統(tǒng)等)覆蓋全面,需專人進行技術(shù)支持、定期維護和校正。在實驗室管理實踐中,設(shè)備設(shè)施良好率和故障率是評價管理水平的重要指標(biāo)。運行數(shù)據(jù)顯示,80%以上的設(shè)備設(shè)施故障均由人為因素造成,災(zāi)難、意外(斷電、漏水)或設(shè)備本身問題導(dǎo)致的故障僅占兩成左右。人為操作不當(dāng)為設(shè)備設(shè)施故障的主要因素,其次為維護不當(dāng)或維護不及時。實驗室配備有專職設(shè)備管理員,負責(zé)實驗室設(shè)備設(shè)施的維護和使用培訓(xùn)工作。但是從實際運行來看,對于科研、實驗經(jīng)驗有限的研究生、進修生,短期技術(shù)培訓(xùn)并不能杜絕或有效減少類似事故的發(fā)生,必須采用規(guī)范化的科研流程、公示主要操作步驟、警示關(guān)鍵危險操作及安全責(zé)任、預(yù)約復(fù)雜實驗的技術(shù)輔助并控制獨立實驗頻次,才能有效降低設(shè)備設(shè)施的故障率。
2.6 業(yè)務(wù)流程管理
實驗室承擔(dān)的業(yè)務(wù)包括:教學(xué)任務(wù)、科研任務(wù)、軍事任務(wù)、應(yīng)急任務(wù)。實驗室采用信息化管理模式,將教學(xué)任務(wù)、科研任務(wù)規(guī)范為固定的工作流程,降低了任務(wù)執(zhí)行過程中的差錯率,縮短了任務(wù)完成的時間。對于復(fù)雜的團隊協(xié)作任務(wù),通過信息化管理可以明確每一位成員的職責(zé)和分工,任務(wù)進展全過程透明可控,在遇到困難或障礙時便于協(xié)調(diào)工作,任務(wù)完成時每位成員績效一目了然,便于實驗室管理者實施有效的績效激勵。
2.7 生物標(biāo)本管理
實驗室目前常規(guī)超低溫存儲30萬份血清標(biāo)本和5萬份細胞組織樣本,采用青島海爾自主研發(fā)的生物標(biāo)本庫管理軟件及冷鏈報警系統(tǒng),電子化管理生物樣本庫的樣本出庫申請、入庫登記、查詢登記、取用登記、標(biāo)本狀態(tài)預(yù)警、樣本報廢等流程。電子化管理過程中涉及的統(tǒng)計指標(biāo)包括溫度、濕度、樣本量、取用量、標(biāo)本狀態(tài)抽查異常比率等,作為生物標(biāo)本庫質(zhì)量管理的預(yù)警指標(biāo),設(shè)定波動范圍,并根據(jù)波動情況采用不同的保障措施或應(yīng)急預(yù)案。
2.8 安全管理
分子流行病學(xué)實驗室是安全管理的重點場所,安全管理內(nèi)容主要分為生物安全、意外傷害安全、化學(xué)品安全、消防安全四大類。
生物安全保障是分子流行病學(xué)實驗室的首要任務(wù)。由于實驗樣本大多含有傳染病病原體,實驗室按照國務(wù)院頒布的《病原微生物實驗室生物安全管理條例》和國家標(biāo)準(zhǔn)GB19489-2008《實驗室生物安全通用要求》為基準(zhǔn),制訂了《實驗室生物安全手冊》,并定期組織學(xué)習(xí)、研討應(yīng)急處置預(yù)案,根據(jù)在研課題或項目特點,對實驗室使用人員發(fā)布有針對性的生物安全警示。
對于污染區(qū),實驗室采用預(yù)約登記使用流程,由課題或科研負責(zé)人提出實驗申請并承擔(dān)生物安全責(zé)任,由實驗室專職安全管理員負責(zé)在實驗期間對生物安全條件(負壓、污染控制、設(shè)備狀態(tài)、垃圾處理)進行監(jiān)控,并由實驗室專職實驗師進行實驗技術(shù)輔助,確保實驗在安全條件下順利進行。
實驗室嚴(yán)格控制病原微生物菌種、病毒株、樣本的接收,所有菌種、毒株均做到分類備案登記,制訂相關(guān)安全管理制度,保存場所嚴(yán)格與普通樣本空間隔離,保存冰箱或液氮罐設(shè)置雙鎖,由菌種保管員和生物安全員分別管理鑰匙。對于復(fù)蘇失敗的菌種、毒株及其實驗相關(guān)廢棄物,由生物安全員負責(zé)統(tǒng)一裝入廢棄物專用高壓滅菌鍋,高壓滅菌處理后按感染性廢物處理。
在分子流行病學(xué)實驗室,意外事故傷害主要來自于危險設(shè)備操作,如高速離心機、超低溫設(shè)備、加熱裝置、氣體壓力裝置等。除制訂特殊設(shè)備簡易標(biāo)準(zhǔn)化操作流程(SOP)外,還在設(shè)備明顯位置張貼危險警示標(biāo)識、標(biāo)簽,標(biāo)明緊急聯(lián)系人電話。操作危險設(shè)備前,要求進行操作登記,登記欄在醒目位置提示使用者閱讀設(shè)備使用注意事項、危險類型及應(yīng)急預(yù)案。
第四軍醫(yī)大學(xué)分子流行病學(xué)實驗室作為全軍現(xiàn)場流行病學(xué)重點實驗室的重要組成單元,在西北地區(qū)(陜西、甘肅、寧夏、新疆)軍、地疾病防控領(lǐng)域都發(fā)揮著重要作用。現(xiàn)代化的管理理念、信息化的管理手段、國際化的技術(shù)設(shè)備以及“扎根本土、服務(wù)地方”的流行病學(xué)研究方向,為實驗室的發(fā)展提供了廣闊的發(fā)展空間。
[1]Kilbourne E D.The molecular epidemiology of influenza[J].J Infect Dis,1973,127(4):478-487.
[2]余日安,楊翌,姚振江,等.醫(yī)藥院校建設(shè)分子流行病學(xué)重點實驗室的實踐[J].基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)教育,2011(6):540-543.
G40-03
A
1671-1246(2015)24-0085-03
國家傳染病防治科技重大專項(2012ZX10004907);第四軍醫(yī)大學(xué)軍事醫(yī)學(xué)提升計劃(2014TSB-0502)