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        家族性皮質(zhì)肌陣攣震顫性癲癇一家系8q23.3-24.1 連鎖分析

        2015-03-10 09:03:24劉彩霞胡國(guó)華史寶和居乃新陳秋惠
        關(guān)鍵詞:肌陣家系區(qū)段

        劉彩霞 ,孫 維,孫 凱,李 佳,胡國(guó)華,史寶和,居乃新,陳秋惠

        家族性皮質(zhì)肌陣攣震顫性癲癇(Familial cortical myoclonic tremor with epilepsy,F(xiàn)CMTE)又稱良性成人家族性肌陣攣性癲癇(Benigh adult familial myoclonic epilepsy,BAFME),是一種常染色體顯性遺傳疾病。早些年,日本家系和意大利家系研究將FCTME 致病基因分別粗略的定位8q23.3-24.1、2q11.1-q12.2,國(guó)外遺傳分析顯示相關(guān)致病基因與上述兩個(gè)基因位點(diǎn)不連鎖。我們對(duì)該家系的基因位點(diǎn)分析從篩查8q23.3-24.1 開(kāi)始著手。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料

        我們已報(bào)道的臨床擬診為家族性皮質(zhì)肌陣攣震顫性癲癇一家系患者[1]。臨床特點(diǎn)符合以下診斷標(biāo)準(zhǔn)[2]:(1)連續(xù)3 代發(fā)病,均成年起病,男女均受累,呈常染色體顯性遺傳;(2)表現(xiàn)為肢體遠(yuǎn)端震顫、癲癇發(fā)作,部分患者于光刺激、驚嚇、情緒刺激時(shí)誘發(fā)全面強(qiáng)直發(fā)作;(3)服β 受體阻滯劑無(wú)效,口服苯巴比妥等抗癲癇藥物有效,為非進(jìn)展病程。(4)體感覺(jué)誘發(fā)電位支持震顫來(lái)源于皮質(zhì)。

        1.2 研究方法與試劑

        1.2.1 樣品采集與DNA 提取 在獲得患者(7例)和對(duì)照者(患者的直系親屬及配偶13 例,其中1例為可疑病例)知情同意后取外周血5 ml,用家系編號(hào),詳細(xì)標(biāo)記血樣。利用血液基因組DNA 提取試劑盒(天根)提取各樣本基因組DNA 。

        1.2.2 選擇與設(shè)計(jì)微衛(wèi)星引物 我們根據(jù)已報(bào)道的8q23.3-24.1 染色體位點(diǎn),在NCBImapview圖譜中找到這些區(qū)域中合適遺傳距離的STR(見(jiàn)表1)。

        1.2.3 PCR 反應(yīng)、產(chǎn)物處理、毛細(xì)管電泳及結(jié)果收集 對(duì)選擇的STR 位點(diǎn)分別合成普通引物及5'標(biāo)記FAM 的熒光引物,然后進(jìn)行熒光引物標(biāo)記的PCR 反應(yīng)。在ABI PRISM 3730 DNA Analyzer 上用PE 公司的POP-4 分離膠,60 ℃、15KV 下,電泳30 min,選用ABI PRISM GeneMapper Software(Ver3.5)收集實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),進(jìn)行分子量?jī)?nèi)標(biāo)校正和擴(kuò)增片段大小分析,并讀取全部微衛(wèi)星標(biāo)記物等位基因片段的大小。

        1.2.4 基因型分析及連鎖分析 利用Gene-MapperV3.5 進(jìn)行基因分型,確定家系中各個(gè)樣本在每個(gè)STR 標(biāo)記處的分型情況。在Linkage5.1 軟件中設(shè)定疾病基因頻率、疾病外顯率及擬表型頻率,θ=0~0.5 進(jìn)行連鎖分析,記錄LOD 值。

        2 結(jié)果

        我們?cè)?q23.3-q24.1 染色體區(qū)段選取的5 個(gè)STR 位點(diǎn),在θ=0.0 時(shí)這5 個(gè)STR 位點(diǎn)與致病基因的兩點(diǎn)LOD 值均<-2(見(jiàn)表2)。

        表1 已報(bào)道致病位點(diǎn)所選擇的STR 信息及引物序列

        表2 8q23.3-q24.1 染色體區(qū)段STR 位點(diǎn)與該家系致病基因兩點(diǎn)連鎖分析

        3 討論

        家族性皮質(zhì)肌陣攣震顫性癲癇(FCMTE)又稱良性成人家族性肌陣攣性癲癇(BAFME)、家族性成人肌陣攣癲癇(familial adult myoclonic epilepsy,F(xiàn)AME)等,是一種少見(jiàn)的遺傳性癲癇綜合征,為常染色體顯性遺傳疾病。近年來(lái),隨著遺傳學(xué)研究工作的不斷深入,該病逐漸被人們重視起來(lái)。迄今,世界已報(bào)道了100 多個(gè)該病家系,中國(guó)、日本、荷蘭、意大利、土耳其等國(guó)家均有報(bào)道,其中主要分布于日本和意大利兩國(guó),日本發(fā)現(xiàn)的家系已經(jīng)超過(guò)60 例。目前,我國(guó)也陸續(xù)報(bào)道了多個(gè)該病的家系,我們對(duì)研究的這個(gè)FCMTE 家系的臨床特點(diǎn)也做了相應(yīng)報(bào)道[1]。

        早些年,日本家系和意大利家系研究將致病基因分別粗略的定位于8q23.3-24.1,2p11.1-q12.2[2,3],近年來(lái)在法國(guó)、泰國(guó)和中國(guó)又陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了5p15.31-p15、3q26.32-3q28 和10p15 等多個(gè)基因位點(diǎn)[4~6]。參考已報(bào)道的文獻(xiàn),我們?cè)?q23.3-q24.1染色體區(qū)段選取了5 個(gè)STR 位點(diǎn),如果選擇的5 個(gè)STR 標(biāo)記與致病基因的兩點(diǎn)連鎖參數(shù)LOD 值<-2,否定該家系的致病基因在此區(qū)段;LOD 值>1,那么本家系致病基因在此區(qū)段;如果LOD 值>3 就能夠肯定該家系的致病基因在此區(qū)段。結(jié)果在θ=0.0時(shí),我們分析的5 個(gè)STR 位點(diǎn)與致病基因的兩點(diǎn)LOD 值均<-2。根據(jù)此數(shù)據(jù)我們推斷此家系的致病基因位點(diǎn)不在8q23.3-q24.1。但還存在以下可能:(1)我們研究的該家系致病基因不在8q23.3-q24.1。(2)STR 具有人種和地域性,NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)的STR Marks 是以歐洲人群為模板的,而雜合度受遺傳背景的影響比較大,對(duì)我國(guó)人群針對(duì)性不夠強(qiáng),以致造成STR 位點(diǎn)的等位基因變化范圍、重復(fù)單元、雜合度等數(shù)據(jù)與數(shù)據(jù)庫(kù)報(bào)道有一定出入。另外,也可能我們的家系樣本量不足夠大,或是我們選擇的STR 位點(diǎn)在本家系的雜合率相對(duì)較低或由于STR 標(biāo)記在染色體區(qū)段密度相對(duì)小。在以后的研究工作中我們將繼續(xù)增加本病的其他家系或在相應(yīng)的區(qū)域增加樣本量,以累加LOD 值;也可嘗試使用不同的連鎖分析方法對(duì)分型結(jié)果進(jìn)行分析,綜合各種計(jì)算結(jié)果判斷。總之,盡管本報(bào)道的實(shí)驗(yàn)結(jié)果為陰性,但為FCMTE 的遺傳學(xué)研究提供了一份良好的研究資料。

        [1]劉彩霞,陳秋惠,居乃新,等.家族性皮質(zhì)肌陣攣震顫性癲癇一家系[J].中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志,2014,31(6):807-808.

        [2]Van Rootselaar AF,Van Schaik IN,Van den Maagdenberg AM,et al.Familial cortical myoclonic tremor with epilepsy:a single syndromic classification for a group of pedigrees bearing common features[J].Mov Disord,2005,20(6):665-673.

        [3]Striano P,Chifari R,Strino S,et al.A new benign adult familial myoclonic epilepsy(BAFME)pedigree suggesting linkage to chromosome 2p11.1-q12.2[J].Epilepsia,2004,45:190-192.

        [4]Licchetta L,Pippucci T,Bisulli F,et al.A novel pedigree with familial cortical myoclonic tremor and epilepsy (FCMTE):clinical characterization,refinement of the FCMTE2 locus,and confirmation of a founder haplotype[J].Epilepsia,2013,54(7):1298-1306.

        [5]Depienne C,Magnin E,Bouteiller D,et al.Familial cortical myoclonic tremor with epilepsy:the third locus (FCMTE3)maps to 5p[J].Neurology,2010,74(24):2000-2003.

        [6]Yeetong P,Ausavarat S,Bhidayasiri R.et al.A newly identified locus for benign adult familial myoclonic epilepsy on chromosome 3q26.32-3q28[J].Eur J Hum Genet,2013,21(2):225-228.

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