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        MICA 基因微衛(wèi)星多態(tài)性與卵巢癌的關(guān)系研究

        2015-03-02 06:44:10郭連英王化麗
        關(guān)鍵詞:微衛(wèi)星外顯子等位基因

        郭連英,齊 崢,王化麗,劉 剛

        (1.大連醫(yī)科大學(xué) 病理生理學(xué)教研室,遼寧 大連116044;2.遼寧師范大學(xué)附屬中學(xué),遼寧 大連116023;3.大連市婦產(chǎn)醫(yī)院 婦科,遼寧 大連116033;4.大連醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院,遼寧 大連116027)

        卵巢癌是病死率最高的婦科生殖道惡性腫瘤。由于缺乏有效的早期診斷技術(shù),75%以上卵巢癌患者確診時(shí)為晚期,5年生存率不到30%。嚴(yán)重地威脅著女性的生命健康[1-2]。卵巢癌的發(fā)病受多種因素影響,其中遺傳易感性是腫瘤發(fā)生、發(fā)展的重要因素。研究表明卵巢癌的發(fā)病是多基因的聯(lián)合作用,篩選卵巢癌相關(guān)基因并對(duì)其作用進(jìn)行研究有助于探討卵巢癌發(fā)生的機(jī)理。已有報(bào)道c - myc、p53、BRCA1 和BRCA2 等基因與卵巢癌的發(fā)病密切相關(guān)[3-5]。

        人類白細(xì)胞抗原(huaman leukocyte antigen,HLA)是人類的主要組織相容性復(fù)合體(MHC),位于6 號(hào)染色體短臂上,包括一系列緊密連鎖的基因座,在免疫識(shí)別及遺傳控制中起到重要的作用[6]。MHC-Ⅰ類鏈相關(guān)基因A(MHC class I chain-related gene A,MICA)位于HLA 復(fù)合體中I 類HLA -B位點(diǎn)上游46 kb,與HLA -B 基因位點(diǎn)緊密連鎖,編碼跨膜區(qū)的第5 外顯子具有(GCT)n 微衛(wèi)星多態(tài)性[7-8]。微衛(wèi)星多態(tài)性主要表現(xiàn)為2 ~6 個(gè)核苷酸的串聯(lián)重復(fù)。國(guó)內(nèi)外資料表明MICA 基因第5 外顯子微衛(wèi)星多態(tài)性與某些腫瘤和自身免疫病相關(guān)[9-12]。本文將首次探討MICA 基因第5 外顯子微衛(wèi)星多態(tài)性與卵巢癌發(fā)病的關(guān)系,從分子水平為卵巢癌的預(yù)防和診治提供實(shí)驗(yàn)依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 對(duì) 象

        實(shí)驗(yàn)組包括95 名于2010年4月至2012年4月大連市婦產(chǎn)醫(yī)院確診的卵巢癌患者,平均年齡(50.25 ±10.92)歲。對(duì)照組包括同期99 名無(wú)血緣關(guān)系的遼寧漢族健康女性,平均年齡(48. 67 ±9.84)歲。

        1.2 方 法

        1.2.1 標(biāo)本DNA 提取:外周靜脈采血3 mL,EDTA抗凝。采用血液基因組DNA 提取試劑盒(北京天根生化科技公司,批號(hào)J8903),按照試劑盒說(shuō)明書(shū)操作提取標(biāo)本基因組DNA。DNA 濃度調(diào)為50 ng/μL 左右,純度A260/A280 比率在1.6 ~1.9。

        1.2.2 PCR 反應(yīng):采用primer 5 軟件設(shè)計(jì)MICA 基因第5 外顯子引物序列,由大連寶生物公司合成。MICA 基因的引物序列為上游:5’-CCTTTTTTTCAGGGAAAGTGC-3’,上游引物5’標(biāo)記熒光FAM,下游:5’-CCTTACCATCTCCAGAAACTGC-3’。20 μL PCR反應(yīng)體系包括:2 μL 10 ×PCR 緩沖液,0.25 mmol/L dNTPs,0.5 μmol/L 引物,100 ng 基因組DNA 和1U Taq DNA 聚合酶。反應(yīng)在PCR 擴(kuò)增儀ABI9700 上進(jìn)行,反應(yīng)條件為95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,60℃復(fù)性30 s,72 ℃延伸30 s,30 個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min,最后置于4 ℃終止反應(yīng)。

        1.2.3 毛細(xì)管電泳:熒光標(biāo)記PCR 產(chǎn)物在ABI 310型遺傳分析儀上進(jìn)行毛細(xì)管電泳。Collection 軟件收集信息,GeneScan Analysis 3.1 軟件進(jìn)行基因分型。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        Hardy-Weinberg 平衡的吻合性檢驗(yàn),等位基因頻率分析均使用Arlequin 3. 11 軟件計(jì)算。使用SPSS15.0 軟件進(jìn)行χ2檢驗(yàn)分析。P <0.05 為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié) 果

        2.1 Hardy-Weinberg 平衡

        實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組基因型分布均符合Hardy -Weinberg 平衡(P >0.05)。

        2.2 實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組MICA 基因第5 外顯子微衛(wèi)星多態(tài)性分布

        兩組均檢測(cè)出5 種等位基因片段,分別為A4(179 bp)、A5(182 bp)、A5.1(183 bp)、A6(185 bp)和A9(194 bp)。兩組MICA 基因第5 外顯子等位基因頻率分布見(jiàn)表1。正常對(duì)照組MICA 第5 外顯子A5.1等位基因的頻率最高,為33.8%。實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組MICA 第5 外顯子A5 等位基因的頻率分別為31.1%和19.2%,差異有顯著性意義(P <0.01),其他等位基因頻率分布差異均無(wú)顯著性意義(P >0.05)。

        表1 實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組MICA 基因第5 外顯子等位基因頻率分布的比較Tab 1 Differences in allelic distributions of MICA gene polymorphism between patients and controls

        3 討 論

        HLA 基因位于人的第6 號(hào)染色體短臂,是人體內(nèi)最復(fù)雜的遺傳多態(tài)性系統(tǒng),也是機(jī)體內(nèi)特異性免疫識(shí)別和免疫應(yīng)答的主要成分[6]。MICA 距HLA -B 位點(diǎn)最近,全長(zhǎng)11.7 kbp,整個(gè)基因包括6 個(gè)外顯子,其中第5 外顯子編碼跨膜區(qū),有1 個(gè)(GCT)三核苷酸重復(fù)序列的微衛(wèi)星多態(tài)位點(diǎn)[7]。微衛(wèi)星是一類廣泛存在于各類真核生物基因組中的由1 ~6 bp串聯(lián)重復(fù)排列而成的DNA 順序,又被稱為短的串聯(lián)重復(fù)順序(STR),其高度多態(tài)性源于串聯(lián)重復(fù)拷貝數(shù)目在同種不同個(gè)體間的差別[13]。由于微衛(wèi)星標(biāo)記多態(tài)性高、重復(fù)性好,因此在基因的定位、人類疾病診斷及預(yù)測(cè)、親權(quán)分析、進(jìn)化研究等領(lǐng)域中都有著重要的應(yīng)用價(jià)值。

        目前,MICA 基因第5 外顯子已發(fā)現(xiàn)A4(179 bp)、A5(182 bp)、A5.1(183 bp)、A6(185 bp)和A9(194 bp)共5 種等位基因片段,其中A5.1 是在A5的基礎(chǔ)上插入一個(gè)堿基G,而導(dǎo)致移碼突變。國(guó)內(nèi)外資料表明MICA 基因第5 外顯子微衛(wèi)星多態(tài)性與頭頸鱗狀細(xì)胞癌、乳腺癌等腫瘤和糖尿病等自身免疫病相關(guān)[9-12]。本研究結(jié)果表明MICA 基因第5 外顯子微衛(wèi)星多態(tài)性與卵巢癌的發(fā)病相關(guān),A5 等位基因增加了卵巢癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。

        研究表明MICA 基因第5 外顯子微衛(wèi)星多態(tài)性分布在不同群體間存在種族差異[14-15]。1997年Ota 等[15]首先對(duì)9 個(gè)群體進(jìn)行了MICA 第5 外顯子微衛(wèi)星多態(tài)性研究,其中中國(guó)回族、哈薩克斯坦和日本群體中最常見(jiàn)的等位基因?yàn)锳5,維吾爾族、伊朗和意大利等群體以A6 最為常見(jiàn)。MICA 基因第5外顯子微衛(wèi)星多態(tài)性分布在中國(guó)漢族人群中存在地區(qū)差異[16-19]。中國(guó)南方上海、湖北、成都和云南地區(qū)漢族人群MICA 第5 外顯子的等位基因均以A5為主,其次為A5.1[16-18]。中國(guó)北方遼寧漢族人群MICA 第5 外顯子的等位基因均以A5.1 為主,其次為A5[19]。本文結(jié)果與范亞欣等[19]結(jié)果相同,遼寧地區(qū)漢族人群A5.1 最為常見(jiàn)(33.8%),其次為A5(19.2%)。人類疾病均直接或間接與遺傳有關(guān)。不同人群的遺傳背景不同,他們對(duì)某些疾病的遺傳易感性也不同。林健[12]報(bào)道I 型糖尿病(T1DM)是一種具有多基因遺傳背景的自身免疫性疾病,MICA基因遺傳多態(tài)性與T1DM 發(fā)病和進(jìn)展緩急相關(guān),但在不同的種族其易感性和保護(hù)性基因型不完全一致,并且這種作用是獨(dú)立于其他T1DM 易感基因如人類白細(xì)胞抗原(HLA)DR/DQ。其他地區(qū)或種族人群MICA 基因第5 外顯子微衛(wèi)星多態(tài)性與卵巢癌的相關(guān)性研究還需進(jìn)一步探索。

        MICA 微衛(wèi)星多態(tài)性與某些腫瘤相關(guān),可能與它們和HLA 經(jīng)典的I、II 類位點(diǎn)的連鎖不平衡有關(guān)[10-11]。文獻(xiàn)報(bào)道西班牙乳腺癌患者M(jìn)ICA -A5.1與HLA-B7 單倍型的頻率顯著高于健康對(duì)照組[11]。MICA 和HLA 其他位點(diǎn)的單倍型與卵巢癌的關(guān)系也需要深入的探討。

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