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        產(chǎn)木聚糖酶海洋微生物的篩選與誘變育種

        2015-01-03 05:52:56黃小云林娟林小洪王國增葉秀云
        關(guān)鍵詞:株菌產(chǎn)酶致死率

        黃小云,林娟,林小洪,王國增,葉秀云

        (福州大學(xué)生物科學(xué)與工程學(xué)院,福建省海洋酶工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,福建福州 350116)

        0 引言

        木聚糖是植物細(xì)胞壁半纖維素的主要成分,包括由β-1,4糖苷鍵形成主鏈結(jié)構(gòu)和不同的側(cè)鏈取代基,常見的取代基包括4-O-甲基葡萄糖醛酸(4-O-Met-Hylglucuronic)、α-阿拉伯糖(α-arabinofuranose)及O-乙?;?O-Acetyl group)等[1].木聚糖的完全降解需要多種水解酶的協(xié)同作用[2].木聚糖酶(EC 3.2.1.8)通過隨機(jī)切割木聚糖主鏈骨架上的β-1,4糖苷鍵產(chǎn)生不同長度的低聚木糖[3],是木聚糖降解酶系中最為關(guān)鍵的酶.

        木聚糖酶的來源較廣泛,包括陸地植物組織、細(xì)菌、真菌和原生動物等[3],但大部分來源于陸地,對于海洋微生物的研究還比較少.海洋微生物所產(chǎn)的酶具有突出的特點(diǎn)和優(yōu)勢:具有顯著的耐壓、耐堿、耐鹽、耐冷和多物種等特性,這些優(yōu)越的性質(zhì)使得海洋酶資源在工業(yè)應(yīng)用和基礎(chǔ)研究等方面具有價值,從而賦予海洋微生物酶獨(dú)特的應(yīng)用前景[4].木聚糖酶可作為食品添加劑用于改善焙烤食品的風(fēng)味[5],在飼料中添加木聚糖酶可提高動物的生產(chǎn)性能[6],用木聚糖酶對紙漿的預(yù)處理會大大減少化學(xué)漂白劑的用量[7].由于其在各領(lǐng)域的重要作用,選育高產(chǎn)木聚糖酶的菌株成為目前木聚糖降解菌選育研究的熱點(diǎn).

        1 材料與方法

        1.1 樣品

        樣品分別來自北極泥樣,福州市平潭海域的水樣和泥樣,寧德市三都澳海域的泥樣和海藻,以及鮑魚內(nèi)臟等.

        1.2 培養(yǎng)基

        1)初篩培養(yǎng)基:自制甘蔗渣木聚糖15 g,NH4NO35 g,K2HPO42 g,MgSO4·7H2O 0.5 g,瓊脂20 g,人工海水[8]1 000 mL,pH 7.0;

        2)種子培養(yǎng)基:3 g牛肉膏,10 g蛋白胨,5 g NaCl,人工海水1 000 mL,pH 7.0;3)基礎(chǔ)產(chǎn)酶培養(yǎng)基:20 g麩皮,10 g酵母膏,人工海水1 000 mL,pH 7.0.

        1.3 主要儀器設(shè)備

        超凈工作臺(SW-CJ-2FD型,上海博迅實(shí)業(yè)有限公司醫(yī)療設(shè)備廠);生化培養(yǎng)箱(MJX-250S型,寧波海曙賽福實(shí)驗(yàn)儀器廠);恒溫氣浴搖床(DHZ-DA型,太倉市實(shí)驗(yàn)設(shè)備廠);雙光束分光光度計(jì)(U-2910型,日立有限公司);pH計(jì)(PHS-3C型,上海精密科學(xué)儀器有限公司).

        1.4 實(shí)驗(yàn)方法

        1.4.1 自制木聚糖

        取粉碎過的甘蔗渣加入60 g·L-1NaOH溶液中,固液比為1∶15,100℃條件下浸泡2 h.過濾后的濾液用36% ~38%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))HCl調(diào)pH值至7.0,按濾液 ∶乙醇為1∶0.8的比例(體積分?jǐn)?shù)),加入濃度為95%(體積分?jǐn)?shù))的工業(yè)酒精,所得棕褐色或棕黃色沉淀即為木聚糖.4 000 r·min-1下離心10 min得沉淀,置于75℃條件下烘干后研磨至粉末狀即可使用[9].

        1.4.2 樣品處理及木聚糖酶產(chǎn)生菌的篩選

        稱取1.1所示的幾份樣品(海藻和鮑魚內(nèi)臟先用無菌攪拌器研磨)于無菌生理鹽水中進(jìn)行梯度稀釋.將10-1、10-6、10-7和10-8這4個梯度的樣品懸液分別涂布于木聚糖酶篩選平板,將純化后的單菌落點(diǎn)種于初篩培養(yǎng)基上,測定透明圈直徑(H)和菌落直徑(C)的大小,計(jì)算HC值.將初篩獲得的菌株在平板上活化后,轉(zhuǎn)接至種子培養(yǎng)基中,30℃、200 r·min-1培養(yǎng)12 h,取種子液以10%(體積分?jǐn)?shù))的接種量接入基礎(chǔ)產(chǎn)酶培養(yǎng)基中,30℃、200 r·min-1培養(yǎng)72 h,發(fā)酵液離心后取上清進(jìn)行酶活測定.

        1.4.3 木聚糖酶活力測定

        1.4.3.1 木糖標(biāo)準(zhǔn)曲線繪制

        配制1.5 μmol·mL-1木糖標(biāo)準(zhǔn)溶液,分別量取 0、0.20、0.25、0.30、0.35、0.40、0.45、0.50、0.60 mL木糖標(biāo)準(zhǔn)溶液,用pH6.0的檸檬酸-磷酸氫二鈉緩沖液補(bǔ)至1 mL,再加入1 mL DNS,沸水浴10 min,冷卻至室溫后在540 nm測定OD值,繪制木糖標(biāo)準(zhǔn)曲線.

        1.4.3.2 木聚糖酶活力測定

        取0.9 mL含1%(質(zhì)量分?jǐn)?shù))木聚糖的底物,加入0.1 mL適當(dāng)稀釋的酶液,55℃準(zhǔn)確反應(yīng)10 min后加入1 mL DNS溶液終止反應(yīng),煮沸10 min顯色,冷卻至室溫后于540 nm測定OD值.一個酶活力單位(U)定義為每min釋放1μmol還原糖所需的酶量.

        1.4.4 形態(tài)學(xué)觀察及16S rDNA序列分析

        依據(jù)《伯杰細(xì)菌鑒定手冊》進(jìn)行菌落特征和細(xì)胞形態(tài)的鑒定[10].菌株的分子鑒定以16SrDNA作為指標(biāo).以基因組為模板,選用細(xì)菌通用引物27F(AGAGTTTGATCMTGGCTCAG)和1492R(TACGGYTACCTTGTTACGACTT)進(jìn)行16SrDNA擴(kuò)增,擴(kuò)增條件為:94℃ 5 min,94℃ 30 s,48℃ 30 s,72℃ 2 min,30個循環(huán);72℃ 10 min.

        1.4.5 紫外及微波誘變

        吸取5 mL菌懸液(濃度為(107~108)cfu·mL-1)于裝有轉(zhuǎn)子的無菌培養(yǎng)皿內(nèi),紫外誘變是將菌懸液經(jīng)紫外燈(15 W,照射距離30 cm)照射30、60、90、120、150、180、210 s,微波誘變則是將菌懸液在微波爐最小功率下分別輻照0、1、2、3、4、5、6、7 min.對菌懸液進(jìn)行梯度稀釋,分別取10-5、10-6、10-7三個稀釋度涂布于篩選平板,以未誘變的菌懸液作為對照.將上述所有平板(紫外誘變的平板需避光培養(yǎng))在30℃恒溫箱中培養(yǎng)48 h后取出計(jì)算平板上的菌落數(shù),繪制致死率曲線.致死率計(jì)算公式如下:

        致死率(%)=(1-誘變后的菌落數(shù)/對照組的菌落數(shù))×100%.

        1.4.6 遺傳穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)

        將篩選到的木聚糖酶活力提高較多的正突變菌株,連續(xù)傳代5代以上,并通過搖瓶發(fā)酵測定其產(chǎn)酶能力,選擇產(chǎn)酶能力較高且穩(wěn)定遺傳的木聚糖酶正突變株進(jìn)行后續(xù)的實(shí)驗(yàn).

        2 結(jié)果與討論

        2.1 平板初篩結(jié)果

        從采集的各樣品中分離到能降解木聚糖底物產(chǎn)生透明圈且菌落形態(tài)和細(xì)胞形態(tài)有差異的菌株60株(見表1),其中菌株編號為B459~B663的來自福州平潭海域的水樣和泥樣;菌株編號為Y的來自鮑魚內(nèi)臟;菌株編號為Z的來自寧德三都澳海域的海藻;菌株編號為M和N的來自寧德三都澳海域的泥樣;菌株編號為MOR、BOB和BBO的是來自北極的泥樣.

        表1 產(chǎn)木聚糖酶微生物的初篩結(jié)果Tab.1 The primary screening results of xylanase-producing microorganisms

        2.2 發(fā)酵復(fù)篩結(jié)果

        對初篩得到的60株菌進(jìn)行搖瓶發(fā)酵測定木聚糖酶活力,結(jié)果顯示,有22株菌不具有產(chǎn)木聚糖酶的能力,38株菌能產(chǎn)木聚糖酶(見表2).

        表2 產(chǎn)木聚糖酶微生物的復(fù)篩結(jié)果Tab.2 The secondary screening results of xylanase-producing microorganisms

        產(chǎn)酶能力在0~100 U·mL-1的有14株菌,100~200 U·mL-1的有5株菌;200~300 U·mL-1的有7株菌;大于300 U·mL-1的有12株菌,其中B659菌株的木聚糖酶活力最高,達(dá)到525.3 U·mL-1.

        2.3 木聚糖酶的酶學(xué)性質(zhì)初步研究

        選取酶活力相對較高的6株菌(B250、B631、B659、Y6、Z3和MOR7),對其所產(chǎn)的木聚糖酶進(jìn)行酶學(xué)性質(zhì)的初步研究,包括最適反應(yīng)pH值和最適反應(yīng)溫度.實(shí)驗(yàn)結(jié)果見圖1.由圖1可知,這6株菌所產(chǎn)的木聚糖酶的最適反應(yīng)pH值均為6.0,最適反應(yīng)溫度也很相近,分別是55℃和60℃;而且酶的pH值和溫度作用范圍也都相差不大.因此,選擇產(chǎn)酶能力最高的B659菌株作為下一步研究的實(shí)驗(yàn)菌株.

        圖1 反應(yīng)pH值和溫度對木聚糖酶活力的影響Fig.1 Effect of pH and temperature on xylanase activity

        2.4 菌株B659的形態(tài)鑒定及16S r DNA鑒定結(jié)果

        B659菌株在篩選培養(yǎng)基平板上30℃培養(yǎng)48 h,菌落呈乳白色,小而突起,表面濕潤皺褶,邊緣圓整(圖2(a)).顯微鏡下觀察,細(xì)胞呈短桿狀,隨機(jī)分散不成鏈狀,細(xì)胞中有橢圓形芽孢,位置中生(圖2(b)).經(jīng)形態(tài)觀察初步鑒定B659菌株為芽胞桿菌屬.

        圖2 B659菌株的形態(tài)觀察Fig.2 The morphology of strain B659

        基于BLAST分析,菌株B659的部分16S rDNA(1 510 bp)與Bacillus stratosphericus strain MCCC 1A08157(序列號:JX680139)的16SrDNA一致性為99%,構(gòu)建其系統(tǒng)發(fā)育樹(見圖3),發(fā)現(xiàn)與同溫層芽胞桿菌(Bacillus stratosphericus)、嗜氣芽胞桿菌(Bacillus aerophilus)、短小芽胞桿菌(Bacillus pumilus)和沙福芽胞桿菌(Bacillus safensis)的親緣關(guān)系最近,因此鑒定B659菌株屬于Bacillus屬.

        圖3 B659菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.3 The phylogenetic tree of strain B659

        2.5 菌株B659的誘變育種

        2.5.1 紫外誘變

        2.5.1.1 誘變劑量的選擇

        繪制B659菌株的生長曲線.由圖4可知,菌株B659在10~14 h時處于對數(shù)生長期的中期,此時細(xì)胞數(shù)量多且生長速率恒定、細(xì)胞各成分平衡增長、整個菌群的生理特性比較一致[11],因此選擇培養(yǎng)12 h的B659菌株制備菌懸液進(jìn)行誘變.

        不同照射劑量所對應(yīng)的致死率如圖5所示.當(dāng)照射時間為150 s時,致死率達(dá)到了79.4%;照射時間為180 s時,致死率達(dá)到94.1%;210 s時,致死率達(dá)到了100%.致死率在70% ~80%時有利于正突變的產(chǎn)生[12],故實(shí)驗(yàn)選用150 s作為照射劑量對菌株進(jìn)行紫外誘變處理.

        圖4 B659菌株的生長曲線Fig.4 The growth curve of strain B659

        圖5 B659菌株的紫外誘變曲線Fig.5 The UV mutation curves of strain B659

        2.5.1.2 正突變菌株的篩選

        出發(fā)菌株B659在150 s的照射劑量下,經(jīng)過2輪紫外誘變在初篩平板上共得到了236株菌,挑選118株菌通過搖瓶發(fā)酵測定其酶活力.結(jié)果表明,118株突變菌株中有5株菌的產(chǎn)木聚糖酶能力高于出發(fā)菌株,詳見表3.

        表3 出發(fā)菌株與突變菌株的木聚糖酶活力比較Tab.3 The comparison of xylanase activity between the original and the mutant strain

        其中G3-16菌株的產(chǎn)酶能力最高,可達(dá)到698.8 U·mL-1,比出發(fā)菌株B659提高33.0%;其次是G3-17和G3-10菌株,其產(chǎn)酶能力分別是598.5 U·mL-1和577.0 U·mL-1,較出發(fā)菌株分別提高了13.9%和 9.8%.

        2.5.1.3 突變菌株的遺傳穩(wěn)定性

        將酶活提高相對較多的突變菌株G3-10、G3-16和G3-17進(jìn)行5次傳代培養(yǎng),取第1代、第3代和第5代的菌株于產(chǎn)酶培養(yǎng)基中進(jìn)行搖瓶發(fā)酵,72 h后取樣測定各菌株的酶活力,結(jié)果如表4所示.由表可知,G3-16菌株雖然誘變后酶活力提高最多,但很不穩(wěn)定,到第3代時酶活力大幅度下降,甚至低于出發(fā)菌株;G3-10菌株和G3-17菌株具有較好的遺傳穩(wěn)定性,而G3-17菌株的產(chǎn)酶能力高于G3-10菌株,因此最后確定G3-17菌株作為下一輪誘變的出發(fā)菌株.

        表4 突變菌株的遺傳穩(wěn)定性Tab.4 Genetic stability of mutant strain

        2.5.2 微波誘變

        2.5.2.1 誘變劑量的選擇

        本輪誘變以紫外誘變所得突變菌株G3-17作為出發(fā)菌株,對其進(jìn)行微波誘變,不同劑量所對應(yīng)的致死率曲線如圖6所示.由圖6可知,出發(fā)菌株G3-17的致死率隨著誘變時間的延長而增加.在輻射時間為4 min時,致死率達(dá)到83.2%;輻射時間為5 min時,致死率達(dá)到90.1%;輻射6 min以后,致死率達(dá)到100%.本實(shí)驗(yàn)選用4 min作為輻射劑量對G3-17菌株進(jìn)行微波誘變處理.

        2.5.2.2 出發(fā)菌株與正突變菌株的酶活力比較

        出發(fā)菌株G3-17在4 min的輻射劑量下,經(jīng)過2輪的微波輻射后在初篩平板上共得到了183株菌,挑選92株突變菌株全部進(jìn)行搖瓶發(fā)酵測定其產(chǎn)酶能力.結(jié)果表明,92株突變菌株中有6株菌的產(chǎn)木聚糖酶能力高于出發(fā)菌株G3-17,見表5.其中W1-40菌株的產(chǎn)酶能力最高,可達(dá)到662.8 U·mL-1,比出發(fā)菌株G3-17提高了11.6%;W1-28和 W1-41次之,分別達(dá)到了654.3 U·mL-1和646.8 U·mL-1,其余3株菌酶活提高幅度較?。?/p>

        圖6 微波誘變的致死率曲線Fig.6 The lethality rate of microwave mutagenesis

        表5 出發(fā)菌株與突變菌株的木聚糖酶活力比較Tab.5 The comparison of xylanase activity between the original and the mutant strain

        2.5.2.3 突變菌株遺傳穩(wěn)定性分析

        將酶活提高相對較多的突變菌株W1-13、W1-28、W1-40和W1-41進(jìn)行5次傳代培養(yǎng),結(jié)果如表6所示.

        表6 遺傳穩(wěn)定性的測定Tab.6 Genetic stability of mutant strain

        這4株菌中W1-13遺傳不穩(wěn)定,其它3株都具有較好的遺傳穩(wěn)定性.其中W1-40的產(chǎn)酶能力最高,達(dá)到658.2 U·mL-1,且遺傳穩(wěn)定性良好,因此確定W1-40菌株作為后續(xù)實(shí)驗(yàn)的研究對象.

        2.5.3 原始菌株和突變菌株的產(chǎn)酶曲線比較

        把原始菌株B659和突變菌株W1-40分別接入產(chǎn)酶培養(yǎng)基進(jìn)行發(fā)酵試驗(yàn),每隔12 h取樣測定酶活,比較2株菌的產(chǎn)酶變化,繪制產(chǎn)酶進(jìn)程曲線.由圖7可知,B659菌株和W1-40菌株的酶活都是隨著發(fā)酵時間的延長而上升,在12~36 h時上升最快,72 h時產(chǎn)酶量達(dá)到最高(B659菌株和W1-40菌株分別為517.9和645.2 U·mL-1);72 h之后可能由于木聚糖酶失活速率高于產(chǎn)酶速率,酶活力開始下降.

        圖7 B659菌株和W1-40菌株的產(chǎn)酶曲線Fig.7 Effect of incubation time on xylanase production by strain B659 and strain W1-40

        3 結(jié)論

        采用透明圈法從多個海洋來源的樣品中共篩到60株有透明圈的菌株,從中復(fù)篩得到38株具有產(chǎn)木聚糖酶能力的菌株,其中經(jīng)鑒定為芽孢桿菌屬的菌株B659產(chǎn)酶能力最高(酶活力為525.3 U·mL-1).對菌株B659進(jìn)行紫外誘變得到遺傳穩(wěn)定且酶活提高13.9%的突變菌株G3-17,對突變菌株G3-17進(jìn)行微波誘變得到遺傳穩(wěn)定且酶活較菌株G3-17提高11.6%的突變菌株W1-40.發(fā)酵72 h時,突變菌株W1 -40的酶活力(645.2 U·mL-1)比原始菌株 B659(酶活為517.9 U·mL-1)提高24.6%.

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