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        κ-卡拉膠降解菌Devosia sp.Fjfst-330的篩選與鑒定

        2014-12-24 07:37:10郭娟娟張龍濤曾紹校林美強鄭寶東
        關鍵詞:卡拉膠產(chǎn)酶初篩

        郭娟娟,張龍濤,曾紹校,林美強,張 怡,鄭寶東

        (福建農(nóng)林大學食品科學學院,福建福州350002)

        卡拉膠(Carrageenan,CGN)來源于愛爾蘭苔菜,又叫角叉膠、鹿角膠等,其降解產(chǎn)生的卡拉膠寡糖具有免疫調節(jié)、抗病毒、抗凝血、抗氧化等多種生物活性,在醫(yī)藥、食品等領域具有一定的應用價值,是新功能性食品、新藥品、新化工品的開發(fā)熱點.目前制備卡拉膠寡糖主要依賴于化學法,但化學降解條件不穩(wěn)定,產(chǎn)物雜質不易分離.卡拉膠酶具有專一性,可酶切糖鏈的特定位點[1],從而制得特定的寡糖,并且反應條件溫和,降解過程易于控制,是卡拉膠寡糖研究的熱點.

        微生物是卡拉膠酶開發(fā)的重要來源.目前僅在假單胞菌屬(Pseudomonas carrageenovora)、噬纖維菌屬(Cytophaga)、別單胞菌屬(Alteromonas carrageenovora)、弧菌屬(Vibrio)[2-5]等微生物發(fā)酵產(chǎn)物中檢測到卡拉膠酶,且尚未見卡拉膠酶規(guī)?;a(chǎn)的報道,篩選新的產(chǎn)卡拉膠酶的微生物是該領域的熱點之一.本研究從角叉菜中分離得到1株κ-卡拉膠降解菌,經(jīng)鑒定,確定為德沃斯氏菌屬(Devosia),國內外尚未見報道.

        1 材料與方法

        1.1 實驗材料

        1.1.1 原料 κ-卡拉膠、λ-卡拉膠、ι-卡拉膠(分析純,購自 SIGMA 公司).

        1.1.2 儀器與設備 紫外可見分光光度計(北京譜析通用儀器有限責任公司);DKY-Ⅱ恒溫調速回轉式搖床(上海社科自動化設備有限公司);RXZ-280B型培養(yǎng)箱(新江南儀器有限公司);HC014-11-01滅菌鍋(上海東亞壓力容器制造有限公司);H-1850R離心機(長沙湘儀離心機儀器有限公司);S1000 Thermal Cycler PCR儀;BIO RAD核酸電泳儀.

        1.1.3 培養(yǎng)基 富集培養(yǎng)基:κ-卡拉膠2 g;無機鹽母液100 mL;海水900 mL;pH 7.5.

        初篩培養(yǎng)基:氯化鈉15 g;κ-卡拉膠15 g;無機鹽母液100 mL;水900 mL;pH 7.5.

        復篩培養(yǎng)基:氯化鈉15 g;κ-卡拉膠2 g;酵母膏1 g;無機鹽母液100 mL;水900 mL;pH 7.5.

        傳代培養(yǎng)基(改良2216 E培養(yǎng)基):蛋白胨5 g;酵母膏1 g;κ-卡拉膠15 g;海水800 mL;蒸餾水200 mL;pH 7.5.

        產(chǎn)酶培養(yǎng)基:氯化鈉15 g;κ-卡拉膠2 g;酵母膏1 g;無機鹽母液100 mL;水900 mL;pH 7.5.無機鹽母液:NaNO320 g;MgSO47H2O 5 g;K2HPO410 g;CaCl21 g;蒸餾水1 L.

        1.2 樣品采集與處理

        角叉菜樣品取自福建省綠麒食品膠體有限公司,搗碎后用人工海水(30%海鹽配置)浸泡,常溫靜置3 d,用移液管輕輕吸取上清液,備用.

        1.3 菌株篩選

        1.3.1 富集培養(yǎng) 分別取1 mL樣品上清液加入到盛有25 mL富集培養(yǎng)基的三角瓶中28℃,165 r·min-1搖瓶培養(yǎng)3 d后,用無菌移液管從中吸取5 mL培養(yǎng)液移至另一盛有25 mL新鮮富集培養(yǎng)基的三角瓶中繼續(xù)培養(yǎng).反復操作4次后,對明顯混濁的培養(yǎng)液進行初篩分離.

        1.3.2 初篩 取0.1 mL富集培養(yǎng)液涂布初篩分離培養(yǎng)基平板.28℃倒置培養(yǎng)48 h,觀察菌落形態(tài),挑取周圍形成明顯透明圈和凹坑的菌落劃線初篩培養(yǎng)基,培養(yǎng)48 h后,挑取單菌落移接傳代培養(yǎng)基斜面,獲得卡拉膠降解菌純培養(yǎng).

        1.3.3 復篩 取卡拉膠降解菌純培養(yǎng)物接種到復篩培養(yǎng)基三角瓶中(250 mL三角瓶裝液30 mL),32℃、150 r·min-1振蕩培養(yǎng)24 h后,取1 mL液體種子接種產(chǎn)酶液體培養(yǎng)基中(250 mL三角瓶裝液30 mL),32℃、150 r·min-1振蕩培養(yǎng) 48 h.發(fā)酵液離心(4000 r·min-1,4 ℃,9 min)去除沉淀細胞,取上清液測定卡拉膠降解酶活力.

        1.4 酶活力測定

        取1 mL粗酶液加入到盛有20 mL 0.5%卡拉膠底物的三角瓶中,于32℃振蕩反應1 h,對照組用1 mL滅活酶液和20 mL底物溶液混合.以反應液中還原糖的增加量作為檢測酶活力的指標.還原糖的測定則采用 DNS(3,5-二硝基水楊酸)法[4,6].取1 mL 反應液加1 mL DNS溶液,沸水浴反應5 min后冷卻,定容至25 mL,以滅活反應液為對照,于520 nm下測定吸光值.以半乳糖做標準曲線,根據(jù)反應組和對照組吸光值的差值計算還原糖的產(chǎn)生量[3,7].1個酶活力單位(U)定義為在32℃條件下,1 min產(chǎn)生1 μg還原糖(以半乳糖計)所需要的酶量.

        酶活力公式:酶活力(U·mL-1)=(D+0.011)×180.5 ×2 ×n/0.1420 ×t

        D:吸光度;n:稀釋倍數(shù)21倍;t:反應時間60 min;標準曲線的斜率為0.1420.

        1.5 生長與產(chǎn)酶曲線測定

        在發(fā)酵培養(yǎng)24 h后,取種子液于10個裝有30 mL產(chǎn)酶培養(yǎng)基的錐形瓶中,每隔8 h測定生物量及酶活.

        1.6 菌種鑒定

        1.6.1 生理生化鑒定 將目的菌株在普通電子顯微鏡下觀察其形態(tài)并記錄,按照《伯杰氏細菌鑒定手冊》(第八版)進行生理生化指標鑒定.

        1.6.2 16S rDNA測序鑒定 收集菌體,參照DNA抽提試劑盒提取細菌基因組(由上海生工提供),提取出的細菌基因組為模板進行采用16S細菌通用PCR引物進行PCR擴增得到其16S rDNA[8].將16S rDNA序列在核糖體數(shù)據(jù)庫http://rdp.cme.msu.edu/index.jsp上進行同源性比對,確定該菌株的分類地位.

        2 結果與分析

        2.1 產(chǎn)卡拉膠酶菌株的初篩與復篩

        經(jīng)初篩,一共得到60株能夠降解κ-卡拉膠的菌株,將這60株菌進行復篩,一共有13株菌周圍出現(xiàn)了較為明顯的凹陷水解圈,凹陷內有無色透明液體,水解圈呈規(guī)則的圓形,邊緣整齊光滑(圖1).其中2號菌株的降解圈明顯比其他菌株的降解圈大且透明,經(jīng)革蘭氏染色為陰性,因此選取2號菌進行深入研究.為了了解2號菌對其他類型卡拉膠的降解性,將2號菌株在分別以λ-卡拉膠、ι-卡拉膠為唯一碳源的初篩培養(yǎng)基劃線培養(yǎng),發(fā)現(xiàn)并無明顯生長.將該酶加入分別只含λ-卡拉膠、ι-卡拉膠的底物溶液中進行降解并未顯示活性.因此初步判斷為 κ-卡拉膠降解菌[8-10].

        2.2 拉膠酶的酶活測定

        將經(jīng)過復篩的13株水解圈較明顯的細菌,采用DNS法測定其降解κ-卡拉膠的酶活力,其結果如表1所示,2號菌和9號菌具有較高的酶活性,測定的酶活分別為63.30、49.07 U·mL-1.

        圖1 菌株Fjfst-330降解κ-卡拉膠的凹陷Fig.1 Strain Fjfst-330 with κ-carrageenase activation

        表1 菌株的酶活Table 1 Enzyme activity of the strain

        2.3 卡拉膠酶的生長和產(chǎn)酶曲線

        取活性最高的2號菌株進行生長曲線與產(chǎn)酶曲線的測定(圖2).2號菌株的生物量在8 h達到最高,8-48 h為平穩(wěn)期,48 h后進入衰亡期.當發(fā)酵培養(yǎng)到56 h時,酶活達到最大值,隨后酶活力迅速下降.在微生物產(chǎn)酶動力學中,這種產(chǎn)酶形式屬于滯后合成型[11],即在細胞進入平穩(wěn)期后,酶才開始合成并大量累積,許多水解酶都屬于這一類[5,7,12].

        圖2 生長與產(chǎn)酶曲線Fig.2 The curve of growth and κ-carrageenase-producing

        2.4 菌種鑒定

        2.4.1 生理生化鑒定 2號菌在平板培養(yǎng)基上菌落呈淺黃色,通過電子顯微鏡觀察,其形態(tài)為細小的短桿菌,單生鞭毛.對2號菌株進行生理生化鑒定(表2).參照《伯杰氏細菌鑒定手冊》[13]和《常見細菌系統(tǒng)鑒定手冊》[14],并結合菌株的細胞形態(tài)學觀察,初步將2號菌株歸入德沃斯氏菌屬.

        2.4.2 16S rDNA的克隆及序列測定 進一步確定2號菌的分類學地位,對2號菌株16S rDNA測序分析,其基因序列長度為1473 bp.將測序結果提交至核糖體數(shù)據(jù)庫 http://rdp.cme.msu.edu/index.jsp,進行Blast比對表明,該序列與 Devosia chinhatensis具有 93.4% 的同源性[15],其 NCBI上登錄號為EF433462.初步將該細菌歸屬于德沃斯氏菌屬,并將其命名為Devosia sp.Fjfst-330.

        表2 菌株的生理生化特性1)Table 2 Physiological and biochemical characteristics of the strain

        3 討論

        本研究從角叉菜表面分離到多株能夠水解卡拉膠的菌株,經(jīng)過比較各菌株所產(chǎn)生水解圈的大小判斷其降解卡拉膠的能力,對其中1株水解圈最大的菌Fjfst-330進行重點研究.由于卡拉膠的分類較多,目前工業(yè)生產(chǎn)使用的主要有κ-型、λ-型和ι-型,因此進一步在3種卡拉膠上進行純化,發(fā)現(xiàn)菌株Fjfst-330只在κ-卡拉膠上有生長并有較大水解圈.經(jīng)16S rDNA測序比對,生理生化指標測定,與德沃斯氏菌屬有較高的同源性,因此初步命名為Devosia sp.Fjfst-330.該菌屬為產(chǎn)κ-卡拉膠酶的新屬,目前國內外尚未見相關報道.

        菌株Fjfst-330培養(yǎng)過程中,其生長及產(chǎn)酶曲線并非同步合成.菌株在8 h時生物量最大,而在56 h時,酶合成及積累量最大,從產(chǎn)酶動力學分析屬于滯后合成型,這與牟海津[4]的研究結果不同.從產(chǎn)酶曲線推測,菌株Fjfst-330在利用κ-卡拉膠為碳源降解時,可能受到分解代謝物的阻遏且同時生成不同酶.該菌為產(chǎn)κ-卡拉膠酶的新菌屬,其酶種類與酶活性在國內外也未見報道.

        菌株Fjfst-330在初步篩選過程中,表現(xiàn)出較高的產(chǎn)酶能力,測定其酶活達63.3 U·mL-1.與國內外已有卡拉膠酶活力相比,噬瓊膠菌屬(Tamlana agarivorans)為50·75 U·mL-1[16]、假交替單胞菌屬(Pseudoalteromonas)為 6.788 U·mL-1[17]、黃桿菌屬(Flavobacterium)為 149.8 U·mL-1[3]、施氏假單胞菌(Pseudomonas stutzeri)為26.5 U·mL-1[2],菌株 Fjfst-330的產(chǎn)酶活力具有較好的優(yōu)勢.通過發(fā)酵優(yōu)化,其產(chǎn)酶能力與產(chǎn)酶量將得到進一步提高.目前,我國尚未有工業(yè)化的卡拉膠菌株,所需的卡拉膠酶購自外國公司,價格昂貴.本菌株具有一定的生產(chǎn)潛力,為開發(fā)卡拉膠酶及其工程菌提供良好的基礎材料.

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