王成紅 ,于傳亭,張奇舒,李鵬飛,王曉丹,修冰水,張賀秋
1.煙臺(tái)市煙臺(tái)山醫(yī)院 檢驗(yàn)科,山東 煙臺(tái) 264000;2.軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所,北京 100850
肺炎支原體(Mycoplasma pneumoniae,Mp)是兒童和青少年非典型肺炎的首要病原微生物[1],由其引起的臨床癥狀同其他病原體相似,但臨床用藥并不相同[2],因此,研制靈敏、特異、便捷的快速早期診斷試劑,對(duì)于Mp感染的診斷和治療意義重大[3]。
肺炎支原體M129 株的全基因測(cè)序工作于1996年完成。M129 基因組全長(zhǎng)816 kb,編碼超過(guò)400 個(gè)功能蛋白[4]。其中P30 蛋白是錨定于Mp 細(xì)胞膜上的重要黏附蛋白,包含275 個(gè)氨基酸殘基,相對(duì)分子質(zhì)量約為29.7×103,其基因序列全長(zhǎng)825 bp。研究顯示P30 蛋白可以激起宿主的免疫反應(yīng)[5],是除了黏附蛋白P1 外的另一個(gè)重要的黏附素和免疫原。由于Mp采用的是偏性密碼子,其野生基因不適合在大腸桿菌中進(jìn)行表達(dá)。為此,我們利用生物信息學(xué)方法和密碼子優(yōu)化技術(shù)設(shè)計(jì)并獲得優(yōu)化的Mp 黏附蛋白P30基因序列,實(shí)現(xiàn)了其在大腸桿菌中的高效表達(dá)。
Mp 患者血清樣本來(lái)自煙臺(tái)山醫(yī)院小兒科住院病人,正常人血清樣本來(lái)自煙臺(tái)山醫(yī)院體檢中心。
TaqDNA 聚合酶為北京百泰克生物技術(shù)有限公司產(chǎn)品;T4DNA 連接酶為TaKaRa 公司產(chǎn)品;DNA限制性內(nèi)切酶XhoⅠ和XbaⅠ購(gòu)自Promega 公司;PCR 產(chǎn)物回收試劑盒由北京百泰克生物技術(shù)有限公司生產(chǎn);引物由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成;DNA序列測(cè)定由中美泰和生物技術(shù)有限公司完成。
樣品與未致敏粒子(最終稀釋率1∶20)的反應(yīng)圖像判定為(-),而與致敏粒子(最終稀釋率1∶80)的反應(yīng)圖像判定為(+),則結(jié)果判定為陽(yáng)性。將顯示反應(yīng)圖像為(+)時(shí)的最終稀釋率作為抗體滴度。
從NCBI 網(wǎng)站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/proteins/)下載P30 黏附蛋白的氨基酸序列和核苷酸序列,采用Biosun 生物軟件比對(duì)序列,分析P30 的抗原表位情況,確定克隆表達(dá)的優(yōu)勢(shì)抗原表位區(qū)間。
采用Genscript 軟件在線分析P30 基因的密碼子表達(dá)情況;采用自編軟件,根據(jù)P30 優(yōu)勢(shì)抗原表位的氨基酸序列,設(shè)計(jì)并優(yōu)化由大腸桿菌優(yōu)勢(shì)密碼子組成的P30 基因,分段設(shè)計(jì)并合成引物,采用退火PCR方法合成各基因片段,利用基因片段末端重復(fù)序列將各片段搭橋擴(kuò)增,最終得到完整的P30優(yōu)化基因。
利用分別含XhoⅠ和XbaⅠ酶切位點(diǎn)的上游引物P30F-XhoⅠ(GCCTCGAGGCCCTCATTGTTC)、下游引物P30R-XbaⅠ(GCTCTAGATTAACGCTTCGG T)對(duì)上述基因進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,從而在基因片段兩端引入酶切位點(diǎn),經(jīng)雙酶切回收后插入同樣經(jīng)XhoⅠ、XbaⅠ酶切的原核表達(dá)載體pBVIL1-His,轉(zhuǎn)化大腸桿菌HB101,挑選陽(yáng)性克隆,振蕩培養(yǎng)過(guò)夜后42℃誘導(dǎo)表達(dá),SDS-PAGE鑒定,對(duì)高表達(dá)菌株測(cè)序。
鑒定出的陽(yáng)性克隆于37℃培養(yǎng)過(guò)夜后轉(zhuǎn)至新鮮的LB 培養(yǎng)基,37℃培養(yǎng)2~3 h,至D600nm值為0.4~0.6,42℃水浴誘導(dǎo)表達(dá)5 h,離心收集菌體,用TE 緩沖液沖洗菌體并懸起,超聲波破碎細(xì)胞,離心收集上清,用Ni 柱分離純化融合蛋白IL1-P30,收集洗脫峰,SDS-PAGE鑒定各步分離產(chǎn)物。
以純化的IL1-P30 融合蛋白包被酶聯(lián)板,用間接ELISA 法對(duì)肺炎患者和正常人血清樣本進(jìn)行測(cè)定,根據(jù)D450nm值計(jì)算S/c,評(píng)價(jià)重組抗原的反應(yīng)活性。
運(yùn)用Biosun 生物軟件分析比對(duì)肺炎支原體P30黏附蛋白的氨基酸序列(GenBank:M57245.1),結(jié)果顯示,除75~95 aa區(qū)段抗原性較弱外,整個(gè)P30蛋白具有較強(qiáng)的抗原性(圖1)。
野生型P30 基因全長(zhǎng)825 bp,由275 個(gè)密碼子編碼相應(yīng)的氨基酸序列。采用Genscript軟件對(duì)野生Mp基因進(jìn)行密碼子分析顯示,約13%的密碼子表達(dá)效率低于30%,屬于稀有密碼子,密碼子適應(yīng)指數(shù)(CAI)為0.59(圖2A),屬于Genscript 軟件中定義的難于表達(dá)的基因。采用自編程序?qū)30 密碼子基因優(yōu)化后,稀有密碼子比率僅為3%,CAI 提高到0.84,屬于Genscript軟件中定義的易表達(dá)基因(圖2B)。
采用重疊延伸PCR 方法分4 段分別擴(kuò)增基因片段,而后相鄰片段末端搭橋退火延伸,最終獲得全長(zhǎng)825 bp 的目的基因,測(cè)序結(jié)果顯示獲得的基因序列正確。
圖1 肺炎支原體P30黏附蛋白氨基酸序列抗原表位預(yù)測(cè)
圖2 P30基因密碼子分析
大量誘導(dǎo)表達(dá)測(cè)序正確的表達(dá)菌株,超聲波破碎后SDS-PAGE鑒定,IL1-P30融合蛋白為包涵體表達(dá),相對(duì)分子質(zhì)量為43.5×103,與預(yù)期相符(圖3)。
用純化的IL1-P30 融合蛋白包被酶聯(lián)板,用間接ELISA 法初步檢測(cè)了47 例正常人和85 例肺炎支原體患者的血清。結(jié)果70 份患者血清檢出陽(yáng)性,42例正常人血清反應(yīng)陰性,靈敏度和特異性分別為82.35%和89.36%(圖4A),ROC 分析顯示曲線下面積(AUC)為0.9088(圖4B),證明IL1-P30 融合蛋白有較好的抗原活性和特異性。
Mp 的早期診斷對(duì)疾病的治療具有重要意義。由于Mp采用偏性密碼子,在大腸桿菌中表達(dá)較為困難,因此臨床應(yīng)用較廣的Mp檢測(cè)試劑如日本富士冷凝集法和歐蒙試劑均采用滅活的Mp 全菌體提取的膜抗原,工藝復(fù)雜,且由于含有大量非活性成分導(dǎo)致試劑的靈敏度低、特異性差。因此,克隆表達(dá)的Mp抗原對(duì)肺炎支原體的診斷具有重要意義。
在Mp基因組表達(dá)的數(shù)百種抗原中,研究較多的是黏附蛋白P1,由于其特殊的定位及在致病中的重要作用而成為研究熱點(diǎn)。我們?cè)谘芯恐邪l(fā)現(xiàn),P1 蛋白雖具有很好的抗原性,但僅靠P1 進(jìn)行檢測(cè)不能覆蓋所有患者,提示除了P1 抗原外,還存在其他重要的抗原表位[6]。Varshney 等克隆表達(dá)了P30 抗原,用ELISA 法檢測(cè)融合蛋白與Mp 患者血清的反應(yīng),測(cè)得其靈敏度和特異性分別為78.57%和89.47%[4],但由于其采用的基因?yàn)橐吧突?,表達(dá)量較低,限制了在診斷和疫苗研制中的應(yīng)用。
本研究采用密碼子優(yōu)化結(jié)合退火延伸PCR 技術(shù),獲得了CAI 為0.84 的優(yōu)化的P30 基因,并實(shí)現(xiàn)了P30抗原的高效重組表達(dá),表達(dá)后的P30抗原具有很好的靈敏度和特異性。這為P30 抗原在Mp 檢測(cè)和疫苗中的應(yīng)用奠定了基礎(chǔ)。
圖3 優(yōu)化P30基因的表達(dá)
圖4 P30抗原活性的ELISA鑒定(A)及其特異性分析(B)
[1]Montagnani F,De Paolis F,Beghetto E,et al.Use of recombinant chimeric antigens for the serodiagnosis of Mycoplasma pneumoniae infection[J].Clin Microbiol Infect Dis,2010,29(11):1377-1386.
[2]袁壯.肺炎支原體肺炎的診治[J].中國(guó)實(shí)用兒科雜志,2008,23(8):561-572.
[3]Drasbek M,Nielsen P K,Persson K,et al.Immune response to Mycoplasma pneumoniae P1 and P116 in patients with atypical pneumonia analyzed by ELISA[J].BMC Microbiol,2004,5:4-7.
[4]Himmelreich R,Hilbert H,Plagens H,et al.Complete sequence analysis of the genome of the bacterium Mycoplasma pneumoniae[J].Nucleic Acids Res,1996,24(22):4420-4449.
[5]Varshney A K,Chaudhry R,Kabra S K,et al.Cloning,expression,and immunological characterization of the P30 protein of Mycoplasma pneumonia[J].Clin Vaccine Immunol.2008,15(2):215-220.
[6]張奇舒,修冰水,宋曉國(guó),等.密碼子優(yōu)化的肺炎支原體P1 蛋白在大腸桿菌中的克隆表達(dá)[J].生物技術(shù)通訊,2012,23(3):380-382.