呂榮鈺 文飛球 陳小文 張 民 陳仕平 李 劍
Hb病包括地中海貧血(簡稱地貧)和異常Hb病。地貧是由一種或多種珠蛋白肽鏈合成部分或完全抑制,導(dǎo)致Hb含量異常,以α地貧和β地貧最常見[1]。全球229個國家中,71%的國家受Hb病這一重大健康問題困擾[2]。全球近5億人為Hb異?;驍y帶者,每年30~50萬新出生兒童為重型的純合狀態(tài);5歲以下死亡兒童中約3.4%死于Hb?。?]。目前治療Hb病的方法有限,臨床實踐證實通過早期篩查及遺傳咨詢來預(yù)防和減少Hb病患兒出生是最有效的解決方案,因此明確Hb病的致病基因相當(dāng)重要。
地貧數(shù)據(jù)庫(http://globin.bx.psu.edu/)資料統(tǒng)計,迄今已發(fā)現(xiàn)1 600余種Hb基因異常類型,近10年新發(fā)現(xiàn)180余種。臨床上根據(jù)血液學(xué)分析行地貧初篩,確診仍依賴于基因檢測[3]。但在臨床工作中發(fā)現(xiàn),部分患兒雖有地貧樣表現(xiàn),血液學(xué)初篩陽性,而常規(guī)基因檢測卻呈陰性,不能解釋病因,同時臨床常規(guī)基因檢測也可能有一定的漏檢率。為此,本研究針對這部分群體再進(jìn)一步行地貧常規(guī)基因和罕見基因的測序和突變類型分析,能進(jìn)一步明確多少比例的地貧病因,豐富地貧病因?qū)W認(rèn)識,為臨床診斷提供參考。
1.1 倫理 本研究獲得深圳市兒童醫(yī)院(我院)生物倫理委員會審核同意。
1.2 病例納入標(biāo)準(zhǔn) 我院地貧血液學(xué)初篩陽性且常規(guī)基因檢測陰性的疑似地貧的連續(xù)病例,且獲得患者及其家長的書面知情同意再行進(jìn)一步地貧基因檢測。
1.3 地貧血液學(xué)初篩 應(yīng)用CAPILLAPYS2全自動電泳儀(西比亞,法國)進(jìn)行Hb電泳分析,全自動血液分析儀XS-1000i(希森美康,日本)進(jìn)行血液分析,UV-5200紫外可見分光光度計(上海元析儀器有限公司)測定葡萄糖-6-磷酸脫氫酶(G6PD)比值及紅細(xì)胞滲透脆性。①貧血:Hb<該年齡段正常值下限和(或)RBC平均容積(MCV)<80 fl和(或)RBC平均Hb量(MCH)<28 pg;②地貧篩查指標(biāo):HbA2和(或)胎兒Hb(HbF)>該年齡段上限值和(或)RBC滲透脆性<0.6;①或②項指標(biāo)陽性定義為地貧血液學(xué)初篩陽性。
1.4 地貧常規(guī)基因檢測 對于地貧血液學(xué)初篩陽性患者,采集外周靜脈血3mL(EDTA-K3抗凝),使用基因組DNA快速提取試劑盒提取全血DNA。采用跨越斷裂點PCR(Gap-PCR)技術(shù)測定3種缺失型 α地貧(-α3.7、-α4.2和--SEA),PCR 反向探針點雜交(reversedot blot,RDB)技術(shù)檢測3種非缺失型α地貧(Hb Constant Spring、Hb Quong Sze、Hb Westmead),以及17種 β地貧點突變[CD41-42(-TCTT),IVS-2-654(C >T),CD17(A >T),-28(A >G),CD26(G >A),CD71-72(+A),CD43(G >T),-29(A>G),起始密碼子 ATG >AGG,CD14-15(+G),CD27-28(+C),-32(C>A),-30(T>C),IVS-1-1(G >T),IVS-1-5(G >C),CD31(-C),CAP+40-+43(-AAAC)]?;蚪MDNA提取試劑盒以及診斷試劑盒購自深圳益生堂生物公司,由我院兒科研究所專業(yè)人員嚴(yán)格按照說明書操作。
1.5 地貧進(jìn)一步基因檢測 地貧血液學(xué)初篩指標(biāo)陽性且我院常規(guī)基因檢測陰性樣本,送深圳華大基因研究所檢測。檢測除涵蓋了上述的常規(guī)基因以外,還包括地貧的罕見基因。
對于地貧突變類型,設(shè)計3對特異性引物用于檢測HBA1、HBA2和HBB 3個基因的突變。每個反應(yīng)體系為25μL,包含 5μL 基因組 DNA、12.5μL 2 × Gold StarTaq Master Mix(康為世紀(jì))、0.4μmol·L-1引物,在 ABI 9700 PCR 儀(Perkin-Elmer Applied Biosystems,Inc.,F(xiàn)oster City,CA)上完成擴(kuò)增。實驗條件為95℃ 10 min;95℃ 30 s,60℃30 s,72℃ 90 s,35個循環(huán);72℃ 5 min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)純化后在ABI3730xl DNA Analyzer測序儀(Applied BioSystems)上進(jìn)行正反雙向測序,結(jié)果采用Chromas和DNAstar軟件分析。
對于地貧缺失類型,采用文獻(xiàn)報道的Gap-PCR方法檢測 α地貧5種缺失型(--SEA、-α3.7、-α4.2、--FIL、--THAI)[4]。同時采用文獻(xiàn)報道的熒光定量PCR的方法檢測非常見的α和β地貧缺失類型和拷貝數(shù)異常[5,6]。
1.6 資料截取 對地貧血液學(xué)初篩指標(biāo)陽性且常規(guī)基因檢測陰性病例,再進(jìn)一步行基因檢測陽性者,從病歷中截取基因檢測結(jié)果、年齡和血液學(xué)篩查結(jié)果行描述性分析。
2.1 一般情況 2011年1~9月我院地貧血液學(xué)初篩陽性878例,其中常規(guī)基因檢測陰性患者285例(32.5%),年齡10d至34歲;其中0~6月齡18例,~6歲209例,~16歲52例,>16歲6例,平均年齡為(26.5±33.9)個月。
2.2 進(jìn)一步基因檢測結(jié)果 21/285例(7.4%)檢測陽性,其中常規(guī)基因檢測陽性5例(1.8%),罕見基因檢測陽性16例(5.6%)。21例患者的基因檢測結(jié)果和臨床資料如表1所示。
2.2.1 常規(guī)基因突變測序 檢出非缺失型β地貧27/28(+C)和41/42(+C)各2例,IVS-II-654(C>T)1例。
2.2.2 罕見基因突變測序結(jié)果 ①異常Hb病:1例DNA測序證實在CD91處275T>C(CTT>CCT,Leu>Pro),且為雜合子(圖1),查詢地貧數(shù)據(jù)庫為異常Hb Port Phillip型 。該例為新生兒,10日齡,血液分析提示小細(xì)胞低色素性貧血。檢出異常Hb J-Bangkok和Hb Ernz各1例,查詢地貧
數(shù)據(jù)庫,Hb J-Bangkok類型為CD56處170G>A(GGC>GAC,Gly>Asp),血常規(guī):RBC 3.94 ×1012·L-1、Hb 113 g·L-1、MCV 83.3 fl、MCH 28.7 pg,均在正常范圍。Hb Ernz為CD123處371C>A(ACC>AAC,Thr>Asn)(圖2)[7],在亞洲人群中首次發(fā)現(xiàn)。本例Hb Ernz攜帶者為男嬰,9月齡,基因測序提示為雜合子,血液學(xué)檢查結(jié)果示:RBC 4.68 ×1012·L-1,Hb 85 g·L-1,MCV 降低(62.6 fl),MCH降低(18.2 pg),HbF正常(0.36%),HbA2 降低(2.36%),鐵蛋白降低(4.3 ng·μL-1)。②β基因非缺失型:檢出非缺失型β地貧-90(C>T)2例,為罕見β地貧類型。
2.2.3 Gap-PCR和熒光定量PCR分析 ①α基因缺失型:檢出非常見缺失型α地貧5例,其中-α/αα 2例、--/αα 3例。血液學(xué)檢查均呈小細(xì)胞低色素性貧血,且為輕度貧血,僅1例HbA2降低,其余Hb電泳正常。②β基因缺失型:檢出缺失型β地貧(-/β)3例。血液學(xué)檢查示小細(xì)胞低色素性RBC,無貧血,Hb電泳示HbF明顯升高。③α地貧合并β地貧:1例成年女性(例21)檢出地貧基因型為--/αα合并-/β,其中α缺失為非常見類型。④α-三聯(lián)體:2例為α基因三聯(lián)體(ααα/αα),未合并β地貧,未進(jìn)一步分型,2例均無貧血(Hb 121~134 g·L-1),RBC呈小細(xì)胞低色素狀態(tài)(MCV 75.5~77.1 fl、MCH 26.2~27.2 pg),Hb電泳未見異常。
表1 地貧疑似病例再進(jìn)一步行基因檢測陽性21例的基因型和血液學(xué)檢查結(jié)果Tab 1 Genotypes and blood test results of 21 suspected thalassemia cases with negative result in regular genedetection
圖1 Hb Port Phillip雜合型突變Fig 1 Hb Port Phillip mutation
圖2 Hb Ernz雜合型突變Fig 2 Hb Ernz mutation
2.3 進(jìn)一步基因檢測陰性患者的血液學(xué)檢查結(jié)果 99/264例進(jìn)一步基因檢測陰性患者行血液學(xué)檢查,66.7%(60/90)鐵蛋白低于正常值,其中44例Hb和(或)MCV和(或)MCH低于正常值下限;另有3例提示貧血,但鐵蛋白值顯著升高(571~1 557 ng·μL-1);8例提示G6PD降低(0.6~0.8)。
本研究結(jié)果顯示,285例地貧血液學(xué)初篩陽性且常規(guī)基因檢測陰性的患者中,檢出21例(7.4%)基因異常,其中常規(guī)基因漏診5例(1.8%),提示目前的常規(guī)基因檢測方法可能低估了地貧及異常Hb病攜帶者的數(shù)據(jù)。Sanger基因測序檢出常見β珠蛋白點突變[CD27-28(+C)、CD41-42(-TCTT)、IVS-2-654(C>T)]5例,檢出罕見β地貧點突變[-90(C>T)beta+)]2例;熒光定量PCR檢出非常見缺失型 α地貧(-α/αα、--/αα)5例,為除-α3.7、-α4.2、--SEA、--THAI和 --FIL以外的罕見缺失類型(如 -α3.5、--CL、--CI等),需進(jìn)一步分子鑒定以明確分型[7]。因此,對于臨床發(fā)現(xiàn)和血液學(xué)初篩疑似地貧的患兒,即使常規(guī)基因檢測無異常,仍不能除外Hb病,必要時檢測罕見突變類型明確診斷。
本研究首次在亞洲人群發(fā)現(xiàn)異常Hb Ernz類型突變(CD123Thr>Asn),豐富了亞洲及中國Hb異?;蚍N類。文獻(xiàn)報道該突變僅在意大利人中檢出,位于Hb四聚體外部β鏈上,對Hb穩(wěn)定性影響小,可導(dǎo)致RBC增多,機(jī)制尚不清楚,需進(jìn)一步研究[8]。本文檢出的該例患兒RBC正常,Hb、MCV、MCH及鐵蛋白均降低,可能為嬰兒期合并營養(yǎng)性缺鐵性貧血所致。
本文1例Sanger基因測序為異常Hb Port Phillip(CD91處Leu>Pro),血液學(xué)檢查提示為小細(xì)胞低色素性貧血。該突變僅見于1977年新西蘭1例中國裔女性[9],該突變位于α鏈,可導(dǎo)致Hb穩(wěn)定性降低[9]。查詢?nèi)祟愐吧虷b X射線結(jié)構(gòu)(PDB 代碼:1HHO)[10],采用 Swiss-PdbViewer軟件進(jìn)行三維結(jié)構(gòu)分析得知,α肽鏈CD91處氨基酸靠近亞鐵血紅素原卟啉部位,而鐵與原卟啉配位結(jié)合,且鐵可與氧結(jié)合;氨基酸的改變可能引起Hb構(gòu)象改變,影響鐵與氧結(jié)合,導(dǎo)致穩(wěn)定性降低和發(fā)生溶血性貧血。文獻(xiàn)報道中國人群Hb J-Bangkok較常見,且對個體臨床表型影響小[11],本文1例測序為Hb J-Bangkok類型。
本研究還檢測出2例 α-三聯(lián)體(ααα/αα),除 RBC 呈小細(xì)胞低色素狀態(tài),其他篩查指標(biāo)均正常,提示僅存在此種類型拷貝數(shù)增加情況可能對患者Hb功能影響較小。但也有文獻(xiàn)報道拷貝數(shù)增加可能加劇β地貧患者α鏈和β鏈的不平衡趨勢,使臨床表現(xiàn)更顯著[12,13]。
基因測序和PCR結(jié)果陰性的264例患者,44/60例鐵蛋白降低,且Hb和(或)MCV和(或)MCH降低,考慮營養(yǎng)性缺鐵性貧血可能。3例雖有貧血,但鐵蛋白值顯著增加,可能與炎癥等疾病有關(guān),需進(jìn)一步檢測明確病因。8例G6PD比值低于正常值,考慮G6PD缺乏癥可能。
本研究提示,對于常規(guī)基因檢測陰性的疑似地貧患者,仍有1.8%的常規(guī)基因漏檢率和5.6%的罕見基因突變,因此對這部分人群有必要進(jìn)一步行常規(guī)基因的復(fù)檢和罕見基因的檢測。
本研究不足和局限性,檢出的地貧非常規(guī)基因突變的病例數(shù)較少,尚不能建立基因型和表型之間的關(guān)系,待擴(kuò)大樣本后進(jìn)行分析,對于臨床表型有針對性的進(jìn)行相應(yīng)基因的檢測。
[1]胡亞美,江載芳.主編.諸福棠實用兒科學(xué).第7版.北京:人民衛(wèi)生出版社,2002,1763-1774
[2]Thalassemia International Federation.Guidelines for the clinical management of thalassemia.2nd edition.2008:21-27
[3]Zhou YQ(周玉球).Current situation and prospect of hematological phenotypic screening and genotyping of thalagsemia.Chinese Journal of Laboratory Medicine(中華檢驗醫(yī)學(xué)雜志),2012,35:394-398
[4]Chong SS, Boehm CD, Cutting GR, et al.Simplified multiplex-PCRdiagnosis of common southeast asiandeletional determinants of alpha-thalassemia.Clin Chem,2000,46(10):1692-1695
[5]Fallah MS, Mahdian R, Aleyasin SA, et al.Development of a quantitative real-time PCR assay fordetection of unknown alpha-globin genedeletions.Blood Cells Mol Dis, 2010,45(1):58-64
[6]Babashah S, Jamali S, Mahdian R, et al.Detection of unknown deletions in beta-globin gene cluster using relative quantitative PCR methods.Eur J Haematol, 2009,83(3):261-269
[7]曾溢滔.主編.人類血紅蛋白.第1版.北京:科學(xué)出版社,2002,85
[8]Groff P,Kalmes G, Golinska B, et al.Hb Ernz[beta123(H1)Thr> Asn] and Hb Renet[beta133(H1)Val>Ala]:Two new neutral vatiants revealed by reversed phasehigh performance liquid chromatography analysis.Hemoglobin,2000,24(4):287-297
[9]Brennan SO, Tauro GP, Melrose W. Haemoglobin Port Phillip alpha91( FG3) Leu replaced by Pro,a new unstable haemoglobin. FEBS Lett, 1977, 81( 1) : 115-117
[10]Shaanan B.Structure of human oxyhaemoglobin at 2.1 A resolution.J Mol Biol, 1983, 171(1):31-59
[11]Zhao Y(趙穎), Shang X, Xiong F, et al.Analysis of clinical phenotypes of compound heterozygotes of Hb J-Bangkok and βthalassemia.Chinese Journal of Medical Genetics(中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志),2013,30(2):148-151
[12]Giordano PC, Bakker-Verwij M, Harteveld CL.Frequency of a-globin gene triplications and their interaction with bthalassemia mutations.Hemoglobin,2009,33(2):124-131
[13]Panigrahi I, Mahapatra M, Kumar R, et al.Jaundice and alpha gene triplication in beta-thalassemia:association or causation?.Hematology, 2006, 11(2):109-112