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        淺談酶分子的改造方法

        2014-11-10 03:32:35潘國楷劉明輝夏寧
        企業(yè)文化·中旬刊 2014年10期
        關(guān)鍵詞:基因工程前景蛋白質(zhì)

        潘國楷+劉明輝+夏寧

        摘 要:酶工程的研究現(xiàn)在已經(jīng)發(fā)展到分子水平。通過基因工程、化學(xué)、物理等手段改造酶分子結(jié)構(gòu)與功能,大幅提高了酶分子的進化效率和催化效率,生產(chǎn)有價值的非天然酶。本文對常見的酶分子的改造方法做了一個簡單的介紹,并對酶改造的發(fā)展前景做了描述。

        關(guān)鍵詞:酶分子;基因工程;蛋白質(zhì);前景

        1.酶與酶分子的改造

        1.1 酶

        酶是指以蛋白質(zhì)為主體的生物催化劑,具有在常溫常壓和近中性pH等溫和條件下,高效率地進行區(qū)域或?qū)τ丑w選擇性催化的特點。迄今為止,從生物界已發(fā)現(xiàn)和定性了近3000種酶,分屬氧化還原、轉(zhuǎn)移、水解、裂合、異構(gòu)、連接六大類。由于酶具有反應(yīng)專一性、催化效率高及反應(yīng)條件溫和等優(yōu)點,因此在工業(yè)、農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥和環(huán)保等方面已經(jīng)得到越來越多的應(yīng)用。但總體還沒有達到大規(guī)模應(yīng)用的程度,其主要原因在于酶自身性質(zhì)上的一些不足。因此,人們希望通過各種方法、按照需要定向地改造酶分子,甚至創(chuàng)造出自然界尚未發(fā)現(xiàn)的新酶,從而滿足各行各業(yè)的需要。

        1.2酶分子的改造

        在酶的應(yīng)用過程中,有時會因酶的穩(wěn)定性差、活力不夠理想及具有抗原性等缺點而受到一定的限制,為此常需對酶分子進行適當?shù)母脑旌图庸?,以改善酶的性能。酶分子的改造以提高酶的穩(wěn)定性和活性、增強酶的選擇性、改變酶的表面特性為

        目標。

        2.改造酶分子的方法

        2.1 化學(xué)修飾法

        酶分子的化學(xué)修飾是指通過主鏈的剪接切割和側(cè)鏈的化學(xué)修飾對酶分子進行改造,其目的在于改變酶的一些性質(zhì),創(chuàng)造出天然酶不具備的某些優(yōu)良性狀,擴大酶的應(yīng)用以達到較高的經(jīng)濟效益。

        酶在進行化學(xué)修飾后,大多數(shù)酶的性質(zhì)會發(fā)生一些變化,如熱穩(wěn)定性、抗各類失活因子能力、抗原性、半衰期、最適PH值等。

        酶修飾中存在的問題是,隨著酶與修飾劑結(jié)合率提高,酶活回收率將下降。克服的方法是采取一些保護措施,如添加酶的競爭性抑制劑,保護酶活性部位以及改進現(xiàn)有的修飾工藝,進一步完善酶的化學(xué)修飾法。

        化學(xué)修飾酶的目標是提高酶活力,改進酶的穩(wěn)定性,改變酶的特異性,提高催化過程的反應(yīng)效率。

        2.2 生物酶工程法

        酶的化學(xué)修飾法并非改造酶的惟一手段。隨著人們對酶的深入研究以及氨基酸一級結(jié)構(gòu)的測定、基因重組技術(shù)的應(yīng)用等,可以徹底地改造、合成并且模擬酶。這也就是生物酶工程的主要內(nèi)容。生物酶工程主要包括基因工程技術(shù)和蛋白質(zhì)工程技術(shù)。

        (1)基因工程技術(shù)改造和生產(chǎn)酶

        基因工程改造酶分子主要包括三方面內(nèi)容①用基因工程技術(shù)大量生產(chǎn)酶。②修飾酶基因,產(chǎn)生遺傳修飾。③設(shè)計出新酶基因,合成自然界從未有過的酶。

        自從 20 世紀 70 年代重組DNA技術(shù)的建立,使人們在很大程度上擺脫了對天然酶的依賴。近十年來,基因工程的發(fā)展使得人們可以較容易地克隆各種各樣天然的酶基因,使其在微生物中高效表達,并通過發(fā)酵進行大量生產(chǎn)。目前已有100多種酶基因克隆成功,包括尿激酶基因、凝乳酶基因等。

        (2)蛋白質(zhì)工程改造和生產(chǎn)酶

        蛋白質(zhì)工程改造和生產(chǎn)酶包括合理設(shè)計技術(shù)和定向進化技術(shù)。

        合理設(shè)計技術(shù)是蛋白質(zhì)工程最早使用的技術(shù),現(xiàn)在也在廣泛的使用。合理設(shè)計技術(shù)要做好三個方面的工作,首先要用結(jié)晶學(xué)技術(shù)來獲得蛋白質(zhì)結(jié)晶體,然后利用x射線技術(shù)對晶體進行測量、分析,確定蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。其次,借助計算機對蛋白質(zhì)進行選擇修飾,從氨基酸的化學(xué)結(jié)構(gòu)預(yù)見空間結(jié)構(gòu),或通過人工智能等其它方法來確定蛋白質(zhì)和功能的關(guān)系,找到要修飾的位點。第三,通過對基因序列的了解,運用定點突變技術(shù)來進行堿基替換。通過此法來改變蛋白質(zhì)的功能,要想獲得理想的蛋白質(zhì)工程產(chǎn)物往往要經(jīng)過多次分析,替換才能達到目的。

        定向進化技術(shù)是蛋白質(zhì)工程的新策略,它是在不需要事先了解蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的情況下通過模擬自然進化機制,以改進的誘變技術(shù)結(jié)合確定進化方向的選擇方法。因此它能解決合理設(shè)計所不能解決的問題,在生產(chǎn)中的應(yīng)用越來越受到重視。定向進化是在待進化蛋白質(zhì)基因的PCR擴增反應(yīng)中,利用TaqDNA多聚酶不具有校對功能的性質(zhì),配合適當條件,以很低的比率向目的基因中引入突變,構(gòu)建突變庫,憑借定向選擇方法,選出所需性質(zhì)的蛋白質(zhì)。定向進化實際就是隨機突變加上選擇,它與自然進化不同,整個過程都是在人為控制下進行的,并且還可以模擬真核細胞中DNA隨機拼接這一蛋白質(zhì)進化過程來加速蛋白質(zhì)的優(yōu)化。

        酶的蛋白質(zhì)工程是在基因工程的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的,而且仍需要應(yīng)用基因工程的全套技術(shù)。所不同的是,酶的基因工程主要解決的是酶大量生產(chǎn)的問題,而蛋白質(zhì)工程則致力于天然蛋白質(zhì)的改造,制備各種定做的蛋白質(zhì),但也要用到基因工程的技術(shù)手段。

        2.3 酶分子的定點突變法

        定點突變需要知道酶蛋白的一級結(jié)構(gòu)及編碼序列,并根據(jù)蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)知識來設(shè)計突變位點。定點突變技術(shù)可以隨心所欲地在已知DNA序列中取代、插入或缺失一定長度的核苷酸片段。該方法與使用化學(xué)因素、自然因素導(dǎo)致突變的方法相比,具有突變率高、簡單易行、重復(fù)性好的特點。然而,定點突變技術(shù)只能對天然酶蛋白中少數(shù)的氨基酸殘基進行替換,酶蛋白的高級結(jié)構(gòu)基本維持不變,因而對酶功能的改造較為有限。

        3.酶分子改造展望

        相對于其它各種功能蛋白質(zhì),酶的結(jié)構(gòu)與功能研究還處于幼年期,如何對酶蛋白實施分子改造,使它們的性能得到改善,是具有挑戰(zhàn)性的課題。近年來,隨著抗體酶技術(shù)的發(fā)展,為酶分子設(shè)計提供了一個全新的思路。它打破了化學(xué)酶工程和生物酶工程的界限,結(jié)合了免疫學(xué)、細胞生物學(xué)、分子生物學(xué)、化學(xué)等技術(shù),制備出具有高度專一性及特殊催化活力的新型催化抗體。有資料顯示,隨著新生物工程技術(shù)和噬菌體抗體庫技術(shù)的發(fā)展,將有更先進的重組技術(shù)用來直接從抗體庫中篩選催化抗體。endprint

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