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        應(yīng)用SELDI-TOF MS技術(shù)篩選乳腺癌蛋白標(biāo)志物

        2014-08-28 02:29:10肖代雯楊永長(zhǎng)騰飛鵬黃文芳
        淮海醫(yī)藥 2014年2期
        關(guān)鍵詞:診斷模型質(zhì)譜乳腺

        肖代雯,楊永長(zhǎng),騰飛鵬,劉 華,黃文芳

        乳腺癌是女性最常見(jiàn)的惡性腫瘤,其死亡率僅次于肺癌位于第二位[1]。目前乳腺癌治療的10年生存率尚無(wú)明顯改善,主是是因?yàn)榇蟛糠只颊甙l(fā)現(xiàn)時(shí)已到中晚期。因此,尋找乳腺癌診斷的特異性標(biāo)志物,對(duì)乳腺癌的診斷治療具有重要的意義。表面增強(qiáng)激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(surface enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry, SELDI-TOF MS)是近年發(fā)展起來(lái)的一種蛋白組學(xué)研究方法,利用這一技術(shù)可對(duì)血清、尿液、細(xì)胞裂解液和細(xì)菌等樣品進(jìn)行直接檢測(cè),具有高靈敏性、高通量特點(diǎn)?,F(xiàn)已廣泛應(yīng)用于結(jié)腸癌、肺癌、糖尿病和細(xì)菌感染等疾病的診斷研究[2-5]。美國(guó)食品和藥物管理局(FDA)和美國(guó)國(guó)立癌癥研究所(NCI)已應(yīng)用該技術(shù)建立了卵巢癌的診斷模型,并于2004年在美國(guó)開(kāi)始應(yīng)用于臨床卵巢癌的篩查。本實(shí)驗(yàn)擬應(yīng)用SELDI-TOF MS篩選乳腺癌的蛋白標(biāo)志物,建立診斷模型,為乳腺癌的快速診斷奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1材料 2007年10月-2008年2月我院收治的乳腺癌患者35例,乳腺良性病變患者35例。乳腺癌和乳腺良性病變患者血清都于術(shù)前收集,且均經(jīng)術(shù)后病理確診。另采集正常人血清18例。于清晨采集受試者血清3 ml,30 min內(nèi)放于4℃冰箱中,分出血清后4℃離心5 min,血清轉(zhuǎn)入一干凈EP管中,50 μl/管進(jìn)行分裝,凍存于-80℃冰箱中備用。

        1.2方法 儀器及試劑:無(wú)水醋酸鈉(NaAc)、芥子酸(SPA)、乙腈(ACN)、三氟乙酸(TFA),甲酸和蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn)品購(gòu)自Sigma公司;SELDI-TOF MS、CM10蛋白芯片、Proteinchip Software和Biomarker Pattern分析軟件購(gòu)自美國(guó)Ciphergen Biosystems。

        1.2.1蛋白分子量校準(zhǔn) 采用Sigma蛋白標(biāo)準(zhǔn)品insulin(MW5733.49),Cytochrome C(MW12 230), Myoglobin(16 950)對(duì)SELDI-TOF-MS進(jìn)行分子量校準(zhǔn)。

        1.2.2CM10芯片的活化及標(biāo)本上樣 血清分為2組:乳腺癌組(包括35例乳腺癌)及對(duì)照組(包括35例乳腺良性病變患者及18例正常人)。CM10芯片裝入芯片處理器,每孔加入150 μl,50 mM醋酸鈉,振蕩5 min,甩干,重復(fù)1次;將芯片處理器置于冰上,每孔加入80 μl標(biāo)本,冰上振蕩1個(gè)小時(shí);每孔加入150 μl,50mM醋酸鈉,振蕩5 min,甩干,重復(fù)3次;每孔加入150 μl HPLC水瞬時(shí)洗兩次,甩干;室溫自然干燥約15 min。

        1.2.3血清蛋白質(zhì)譜的檢測(cè) 芯片干燥后,每孔加入1 μl SPA,室溫放置約15 min,自然干燥,重復(fù)1次。SELDI TOF MS測(cè)定血清蛋白,激光強(qiáng)度設(shè)為190,靈敏度為8,優(yōu)化相對(duì)分子質(zhì)量范圍3 000~20 000。采用Ciphergen proteinchip分析軟件自動(dòng)采集數(shù)據(jù)。

        1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用Ciphergen Biomaker Wizard軟件分析癌癥組和對(duì)照組血清蛋白指紋圖譜,設(shè)定有意義的蛋白質(zhì)峰出現(xiàn)頻率閾值為10%,信噪比設(shè)定為7,對(duì)不同組數(shù)據(jù)進(jìn)行t檢驗(yàn),P<0.01的蛋白質(zhì)峰差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。用Biomarker Pattern軟件建立乳腺癌診斷的分類(lèi)樹(shù)模型。

        2 結(jié)果

        2.1血清蛋白質(zhì)圖譜的檢測(cè) 經(jīng)質(zhì)譜檢測(cè)和Ciphergen Proteinchip 3.0軟件分析,在質(zhì)荷比3 000~30 000范圍內(nèi)共檢測(cè)到59個(gè)蛋白質(zhì)峰,其中有19峰表達(dá)具有明顯差異(P<0.01),見(jiàn)表1及圖1。與對(duì)照組相比,有8個(gè)蛋白質(zhì)在乳腺癌中高表達(dá),11個(gè)呈低表達(dá)。

        表1 乳腺癌組與對(duì)照組5個(gè)蛋白質(zhì)峰比較

        注:0對(duì)照組;1乳腺癌組。

        A正常人 B乳腺良性病變 C和D 乳腺癌圖1 乳腺癌組與對(duì)照組部分蛋白質(zhì)峰比較

        2.2乳腺癌診斷模型的建立 采用Biomarker Pattern軟件對(duì)差異蛋白進(jìn)行分析,以質(zhì)荷比為M6636.62,M13889.6建立的分類(lèi)樹(shù)診斷模型,診斷的準(zhǔn)確率達(dá)到94.3%,靈敏度和特異度分別為80.0%(28/35)和71.7%(38/53)。見(jiàn)圖2。

        3 討論

        乳腺癌是女性發(fā)病率最高的惡性腫瘤,據(jù)中國(guó)腫瘤登記處統(tǒng)計(jì),乳腺癌的死亡率排在中國(guó)城市女性腫瘤死亡率的第4位。乳腺癌的自然病程以臨床前期最長(zhǎng),約占總病程的2/3,早期癌中大多無(wú)明顯包塊或腫塊較小,等出現(xiàn)明顯腫塊時(shí),半數(shù)已有淋巴或血行轉(zhuǎn)移。目前乳腺癌的診斷檢查方法主要有:鉬靶攝片、選擇性乳腺導(dǎo)管造影、針吸細(xì)胞學(xué)檢查及分子生物學(xué)檢測(cè)等。這些方法對(duì)有明顯包塊的患者診斷率約為60%左右[6],但對(duì)于腫塊直徑小于0.5 cm,準(zhǔn)確率極低。而乳腺癌血清標(biāo)志物,如CA153和CA27等,均存在表達(dá)水平低,敏感性和特異性差等問(wèn)題。因些,尋找一種高靈敏性、高特異性的診斷方法成為目前臨床的迫切需要。

        圖2 乳腺癌的分類(lèi)樹(shù)診斷模型圖

        目前,蛋白質(zhì)組學(xué)的研究得到了空前的發(fā)展,出現(xiàn)了大量的研究方法并應(yīng)用于臨床,利用這些技術(shù)人們發(fā)現(xiàn)了許多的疾病標(biāo)志物[7-9]。其中,2002年諾貝爾化中學(xué)獎(jiǎng)獲得者田中發(fā)明了表面增強(qiáng)激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(SELDI-TOF-MS),該技術(shù)在吸收傳統(tǒng)質(zhì)譜技術(shù)的基礎(chǔ)上,克服了常規(guī)蛋白組學(xué)檢測(cè)技術(shù)的一些缺點(diǎn),具有檢測(cè)速度快,樣本用量小,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量范圍大,重復(fù)性較好,敏感性,特異性較高等特點(diǎn)。利用這一技術(shù)可對(duì)血清、尿液、細(xì)胞裂解液等生物樣品直接進(jìn)行檢測(cè),能基本反映被檢樣本中蛋白質(zhì)的全貌,進(jìn)而可以發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)的變化,為疾病的早期診斷、復(fù)發(fā)或轉(zhuǎn)移的監(jiān)測(cè)提供了可能。

        本研究利用SELDI-TOF-MS技術(shù),選擇CM10蛋白芯片,對(duì)乳腺癌患者血清及對(duì)照組血清(包括乳腺良性病變及正常人)差異表達(dá)蛋白進(jìn)行分析。研究證明乳腺癌組及對(duì)照組血清蛋白質(zhì)譜圖有19個(gè)蛋白峰表達(dá)具有明顯差異(P<0.01)。以2個(gè)蛋白質(zhì)峰(質(zhì)荷比分別為M6636.62,M13889.6)建立的診斷模型,對(duì)乳腺癌的診斷的準(zhǔn)確率達(dá)到94.3%,靈敏度和特異度分別為80.0%和71.7%。

        應(yīng)用SELDI-TOF-MS技術(shù)可以提供大量完善動(dòng)態(tài)的蛋白指紋圖譜,在各種疾病的診斷和治療方面發(fā)揮一定的作用,隨著技術(shù)的不斷改進(jìn)和標(biāo)準(zhǔn)化,這一技術(shù)有望應(yīng)用于臨床,在人類(lèi)戰(zhàn)勝惡性疾病中發(fā)揮重要作用。

        【 參 考 文 獻(xiàn) 】

        [1] 胡 躍,張?zhí)K展,余捷凱,等.乳腺癌患者血清蛋白質(zhì)指紋圖譜檢測(cè)及其臨床意義[J].中華檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2004,27(10):646-648.

        [2] Zhou ZY,Tao DD,Cao JW,et al.Application of surface enhanced laser desorption ionization time of flight mass spectrometry technology for the diagnosis of colorectal adenoma[J].Oncol Lett,2013,5(6):1935-1938.

        [3] Simsek C,Sonmez O,Keyf AI, et al.Importance of serum SELDI TOF MS analysis in the diagnosis of early lung cancer[J].Asian Pac J Cancer Prev,2013,14(3):2037-2042.

        [4] Sundsten T,Ostenson CG,Bergsten P.Serum protein patterns in newly diagnosed type 2 diabetes mellitus-influence of diabetic environment and family history of diabetes[J].Diabetes Metab Res Rev,2008,2:148-154.

        [5] 肖代雯,楊永長(zhǎng),劉 華,等.用表面增強(qiáng)激光解析/電離飛行時(shí)間質(zhì)譜蛋白指紋快速鑒定4種臨床常見(jiàn)菌[J].中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志,2012,32(6):566-570.

        [6] 張國(guó)強(qiáng),杜 杰,龐 達(dá).表面增強(qiáng)激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)篩查乳腺癌血清特異性蛋白質(zhì)及其臨床意義[J].中華腫瘤雜志,2006,28(3):204-206.

        [7] Monari E,Casali C,Cuoghi A,et al.Enriched sera protein profiling for detection of non-small cell lung cancer biomarkers[J].Proteome Sci,2011,9(1):55.

        [8] Xue A,Gandy RC,Chung L,et al.Discovery of diagnostic biomarkers for pancreatic cancer in immunodepleted serum by SELDI-TOF MS[J].Pancreatology,2012,12(2):124-129.

        [9] Wegdam W,Moerland PD,Meijer D,et al.A critical assessment of SELDI TOF MS for biomarker discovery in serum and tissue of patients with an ovarianmass[J].Proteome Sci,2012,10(1):45.

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