歐陽寧(江西省萍鄉(xiāng)婦幼保健院,江西 萍鄉(xiāng) 337000)
單核苷酸多態(tài)性(SNPs)是指不同個體或者物種的基因組DNA序列同一個位置上的單個核苷酸存在明顯差異,其少數(shù)變異與疾病的發(fā)生有關(guān)[1]。單核苷酸多態(tài)微陣列(SNP-array)技術(shù)是一種全新的分子細(xì)胞遺傳學(xué)技術(shù),具有診斷速度快、分辨率高、同時檢測全基因組拷貝數(shù)變異等優(yōu)點,目前已廣泛用于不孕夫婦染色體分子核型篩查、新生兒篩查、孕婦產(chǎn)前診斷等[2]。2012年9月~2013年7月對自然流產(chǎn)孕婦采用SNP-array技術(shù)檢查流產(chǎn)絨毛,取得了顯著效果,現(xiàn)報告如下。
1.1 一般資料:選擇2012年9月~2013年7月我院婦產(chǎn)科自然流產(chǎn)的孕婦100例,均符合世界衛(wèi)生組織關(guān)于流產(chǎn)的標(biāo)準(zhǔn),按照隨機(jī)數(shù)字表法分為A組與B組,每組50例。A組年齡22~34歲,平均(26.93±2.16)歲;孕周7~15周,平均(10.12±2.94)周。B組年齡21~35歲,平均(27.02±2.33)歲;孕周8~13周,平均(9.79±2.83)周。兩組年齡、孕周等一般資料比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),具有可比性。
1.2 方法:A組采用SNP-array技術(shù):無菌操作下取流產(chǎn)胚胎絨毛置于1.5 ml無菌離心管內(nèi),全基因組提取,測定DNA濃度,DNA進(jìn)行純化;選用SNP array平臺,嚴(yán)格按說明操作。采用Illumina公司Iscan掃描系統(tǒng)進(jìn)行數(shù)據(jù)采集,結(jié)果使用Illumina 公司提供的Genomestudio2010軟件進(jìn)行g(shù)enotyping分析,而CNVs則用到cnv Partition V3.1.6軟件進(jìn)行分析。B組采用傳統(tǒng)的流產(chǎn)絨毛染色體培養(yǎng):無菌操作下取流產(chǎn)胚胎絨毛置于1.5 ml無菌離心管內(nèi),立即送檢培養(yǎng)。將絨毛枝剝離、漂洗并充分剪碎,胰酶消化,離心,加入培養(yǎng)液,在37℃、5%二氧化碳培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)。一般于培養(yǎng)7~10 d待細(xì)胞生長旺盛時收獲,制片,常規(guī)G顯帶處理。每個病例在普通光鏡下計數(shù)20個分裂相,并對其中3個分裂期進(jìn)行核型分析。比較兩組早期自然流產(chǎn)妊娠物染色體異常的準(zhǔn)確性及檢出率。
1.3 統(tǒng)計學(xué)方法:使用SPSS 18.0對各項資料進(jìn)行統(tǒng)計、分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
A組50例流產(chǎn)物成功檢測率為100%,其中診斷有35例染色體異常,異常率為70%,B組50例流產(chǎn)物成功檢測率為40%,其中診斷有10例染色體異常,異常率為50%,A組明顯高于B組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。
自上世紀(jì)九十年代初人類基因組計劃啟動之后就得到了迅速發(fā)展。研究顯示,人類基因組平均大概有1000個核苷酸就可能會產(chǎn)生一個單核苷酸多態(tài)性的改變,而部分單核苷酸多態(tài)性和疾病有著極其復(fù)雜的關(guān)系。大量研究證實,SNP-array技術(shù)能夠檢測單親二倍體,不容易受來自異常染色體的限制,不但在藥物基因組學(xué)及疾病病因?qū)W得到廣泛使用,而且對于檢測疾病的新病因等相關(guān)方面所發(fā)揮的作用越來越大[3]。國外學(xué)者通過高通量 SNPs研究63名少精子癥患者的全基因組SNPs,分析指出16個從未報道的和少弱精子癥關(guān)聯(lián)的SNPs變異。另外大多數(shù)并非屬于功能區(qū)變異,在某種程度上說可能是由于影響精子的形成而出現(xiàn)的不育,此外,該技術(shù)也拓寬了不育病因的新思路,對于治療與診斷不育提供新的科學(xué)依據(jù)。
SNPs技術(shù)不但在多基因疾病定位克隆以及關(guān)聯(lián)分析等方面取得了巨大的成就,同時在檢查流產(chǎn)絨毛方面也發(fā)揮了巨大的作用。本研究結(jié)果顯示,SNP-array技術(shù)檢查流產(chǎn)絨毛成功檢測率、染色體異常率明顯高于以往的流產(chǎn)絨毛染色體培養(yǎng)(100%與40%,70%與50%),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),提示SNP-array技術(shù)在自然流產(chǎn)妊娠物檢測中比染色體核型分析更具有應(yīng)用的優(yōu)勢。
綜上所述,在檢查自然流產(chǎn)妊娠物染色體異常的效果上SNP-array技術(shù)明顯優(yōu)于以往的流產(chǎn)絨毛染色體培養(yǎng),值得應(yīng)用推廣。
[1] 李 剛,孫瑩璞,金海霞.應(yīng)用單核苷酸多態(tài)性微陣列技術(shù)進(jìn)行胚胎植入前遺傳學(xué)診斷的價值[J].鄭州大學(xué)學(xué)報,2012,23(1):64.
[2] 趙德鵬.胎兒和母體與胎膜未破自發(fā)早產(chǎn)傾向相關(guān)候選基因的單核苷酸多態(tài)性檢測[J].中國產(chǎn)前診斷雜志,2011,21(1):52.
[3] 王柏賢,鄭立新,田佩玲.廣州地區(qū)235例女性不孕不育患者細(xì)胞遺傳學(xué)分析[J].中國優(yōu)生與遺傳雜志,2013,22(1):117.