土壤生物指標(biāo)、土壤物理指標(biāo)以及土壤化學(xué)指標(biāo)都是土壤質(zhì)量指標(biāo)的重要組成部分。土壤中微生物的作用主要表現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:

1.土壤中微生物可以形成土壤結(jié)構(gòu)。作為土壤中的活躍成分,土壤微生物繁殖過(guò)程中，通過(guò)代謝活動(dòng)的氧氣和二氧化碳的交換，以及分泌的有機(jī)酸等有助于土壤粒子形成大的團(tuán)粒結(jié)構(gòu)，最終形成真正意義上的土壤。

2.土壤中微生物最顯著的成效就是分解有機(jī)質(zhì)。比如作物的殘根敗葉和施入土壤中的有機(jī)肥料等，只有經(jīng)過(guò)土壤微生物的作用才能腐爛分解，釋放營(yíng)養(yǎng)，供作物吸收利用，改善土壤的結(jié)構(gòu)和耕性。

3.土壤中壤微生物還可以分解礦物質(zhì)。土壤微生物的代謝產(chǎn)物能促進(jìn)土壤中難溶性物質(zhì)的溶解。例如磷細(xì)菌能分解出磷礦石中的磷，以供作物吸收利用。另外，尿素的分解也離不開(kāi)土壤微生物。這些土壤微生物就好比土壤中的肥料加工廠，將土壤中礦質(zhì)肥料加工成作物可以吸收利用的形態(tài)。

4.土壤中微生物還有固氮作用。某些微生物可借助其固氮作用將空氣中的氮?dú)廪D(zhuǎn)化為植物能夠利用的固態(tài)氮化物，土壤擁有自己的氮肥生產(chǎn)車間。

5.土壤微生物還可以調(diào)節(jié)植物的生長(zhǎng)。植物共生的微生物能為植物直接提供氮素、磷素和其他礦質(zhì)元素的營(yíng)養(yǎng)。

人們?cè)谶M(jìn)行農(nóng)業(yè)種植過(guò)程中需要有意識(shí)的去培養(yǎng)土壤中的有益微生物。如增加一些礦物質(zhì)為微生物生長(zhǎng)所需的常量和微量元素；施用有機(jī)肥為微生物生長(zhǎng)提供所需的碳源、氮源和能源。土壤有益菌的培養(yǎng)僅僅為其提供營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)和菌種還不夠，還需要改良其生存的環(huán)境。具體措施，建議如下：

1.疏松板結(jié)的土壤，增加土壤透氣性。為需要氧氣的微生物（如固氮菌、根瘤菌等）生長(zhǎng)、繁殖提供氧氣來(lái)源與便利；抑制厭氧微生物（反硝化細(xì)菌）的生長(zhǎng)、繁殖。

2.調(diào)節(jié)土壤pH值（即土壤酸堿度）。不同酸堿度的土壤，微生物的類型各異。土壤偏酸性，病源真菌活動(dòng)旺盛；有害微生物（如巴拿馬病、根腫病等根類病害的病原菌）多生長(zhǎng)于酸性土壤；土壤呈弱堿性，適合放線菌（能長(zhǎng)期分泌定量抗生物質(zhì)，抑制病害）的生長(zhǎng)與繁殖。由于土壤中細(xì)菌數(shù)量最多（占土壤微生物總量的70%-90%），因此只要調(diào)節(jié)土壤酸堿度才能為土壤有益菌的生長(zhǎng)、繁殖提供良好的生存環(huán)境，同時(shí)抑制有害病菌的生長(zhǎng)繁殖，減少作物發(fā)病率，最終減少作物損失。