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        吉富羅非魚核DNA含量的測定

        2014-07-16 13:41:05鄒芝英等
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年3期
        關(guān)鍵詞:流式細(xì)胞術(shù)

        鄒芝英等

        摘要:以吉富羅非魚的外周血細(xì)胞為樣本、小鼠淋巴細(xì)胞DNA為標(biāo)準(zhǔn)(7.0 pg/2C),采用流式細(xì)胞術(shù)結(jié)合內(nèi)標(biāo)法測定血細(xì)胞的核DNA含量。結(jié)果顯示:吉富羅非魚的核DNA含量為小鼠淋巴細(xì)胞的0.339 2±0.009 0倍,絕對含量為(2.374 5±0.063 0) pg/2C。

        關(guān)鍵詞:吉富羅非魚;流式細(xì)胞術(shù);DNA含量

        中圖分類號: S917.4 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A 文章編號:1002-1302(2014)03-0036-03

        羅非魚(Tilapia),俗稱非洲鯽魚,以其生長快、食性雜和適應(yīng)性強(qiáng)等優(yōu)勢成為國際上養(yǎng)殖最廣泛的品種之一,是國際貿(mào)易第三大水產(chǎn)品。中國的羅非魚產(chǎn)量占全球總產(chǎn)量的一半,其出口量高居世界第一位[1]。吉富品系尼羅羅非魚(genetically improved farmed Tilapia Oreochromis niloticus,GIFT,簡稱吉富羅非魚)是中國主要養(yǎng)殖的羅非魚品種(系)之一,也是中國養(yǎng)殖的羅非魚品種中生長最快的品種(系)之一。吉富羅非魚是由國際水生生物資源管理中心、挪威水產(chǎn)養(yǎng)殖研究所和菲律賓的一些國家級研究機(jī)構(gòu)通過對4個(gè)非洲原產(chǎn)地(埃及、加納、肯尼亞、塞內(nèi)加爾)直接引進(jìn)的尼羅羅非魚品系和4個(gè)在亞洲地區(qū)(以色列、新加坡、泰國、中國臺灣)廣泛養(yǎng)殖的尼羅羅非魚品系進(jìn)行混合選育進(jìn)而獲得的優(yōu)良品系[2]。經(jīng)過近20年的種內(nèi)群體間雜交和選育,該品系已經(jīng)顯示出優(yōu)越的生長優(yōu)勢和潛能[3-4],引起了亞太地區(qū)的廣泛興趣和關(guān)注,多個(gè)國家進(jìn)行了引種并啟動(dòng)了對其進(jìn)一步改良和推廣的國家育種計(jì)劃[5]。為了促進(jìn)中國羅非魚養(yǎng)殖持續(xù)穩(wěn)定的發(fā)展,2006年8月世界漁業(yè)中心向中國水產(chǎn)科學(xué)研究院淡水漁業(yè)研究中心輸送了60個(gè)家系的吉富羅非魚,以期在中國進(jìn)行吉富羅非魚的選育和推廣工作,這是中國第一次引進(jìn)如此多家系的吉富羅非魚。目前研究人員已經(jīng)對該群體進(jìn)行了連續(xù)3代的家系選育,同時(shí)開展了對不同家系的生長性能[6-7]、遺傳多樣性[8-9]等方面的評估工作。

        脫氧核糖核酸(DNA)是絕大多數(shù)生物體內(nèi)的遺傳物質(zhì),一個(gè)細(xì)胞核中所含的DNA總量對于某物種是一定的。生物DNA含量的研究不但是研究物種間差別的重要方法,而且對分類和系統(tǒng)演化的探討、物種進(jìn)化研究等具有參考意義,同時(shí)也是種質(zhì)資源和種質(zhì)質(zhì)量的主要指標(biāo)之一。本試驗(yàn)對我國新引進(jìn)的吉富羅非魚群體中的DNA含量進(jìn)行測定,以期為吉富羅非魚的人工選育和種質(zhì)資源評價(jià)等提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        1.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物 試驗(yàn)用吉富羅非魚取自中國水產(chǎn)科學(xué)研究院淡水漁業(yè)研究中心宜興養(yǎng)殖基地,為同一批繁殖的苗種。將所有的魚在重量為20 g左右時(shí)進(jìn)行PIT(passive tntegrated transponder)標(biāo)記,然后在同一池塘內(nèi)養(yǎng)殖300 d,再測定每尾魚的體質(zhì)量、體長、體高、體厚等,并計(jì)算300 d的增重。從試驗(yàn)用羅非魚中隨機(jī)抽取其3個(gè)家系(A、B、C),A家系13尾,B、C家系各15尾,共43尾,分別記為A1~A13、B1~B15、C1~C15;其中雌魚20尾,雄魚23尾。試驗(yàn)用昆明種小白鼠由衛(wèi)生部核醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室江蘇省原子醫(yī)學(xué)研究所惠贈。

        1.1.2 儀器與試劑 FACSCalibur流式細(xì)胞儀,BD公司。碘化丙啶(propidiamiodide,PI)購自 Sigma 公司;RNase購自 Sigma 公司;其他試劑均為國產(chǎn)分析純。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 單細(xì)胞懸液的制備及固定 取4周齡的昆明種小白鼠,斷頸處死后剖腹,剪開胸骨,可見心臟上方灰白色柔軟的組織塊,即胸腺。分離周圍組織,取下胸腺并用PBS清洗。輕壓組織塊得渾濁的液體,用200 μm細(xì)胞篩過濾,即得單細(xì)胞懸液。1 000 r/min離心15 min后棄上清,加PBS緩沖液重懸沉淀物并計(jì)數(shù)。調(diào)整細(xì)胞濃度,使加入的預(yù)冷100%乙醇變?yōu)?0%濃度時(shí),淋巴細(xì)胞濃度調(diào)整為106個(gè)/mL。-20 ℃ 固定過夜或者冷藏待用。

        從試驗(yàn)魚尾靜脈取約0.5 mL血(用ACD抗凝劑濕潤注射器,以防凝固),嚴(yán)防溶血。4 ℃靜置過夜后用PBS緩沖液將魚血稀釋,清洗1次后重懸于PBS溶液中并用血細(xì)胞計(jì)數(shù)板計(jì)數(shù)。加入預(yù)冷的70%乙醇-PBS混合液,并調(diào)整細(xì)胞濃度至106個(gè)/mL,-20 ℃固定過夜或者冷藏待用。

        1.2.2 PI染色 分別取0.5 mL小鼠淋巴細(xì)胞固定液和魚血固定液,混合、離心去除固定液后用PBS緩沖液清洗1次,重懸于1 mL的PI-PBS(PI濃度為50 μg/mL)染色液中,加入2 μL 100 mg/μL RNase,避光孵育 0.5 h后過200 μm細(xì)胞篩,上機(jī)檢測。

        1.2.3 樣品檢測 采用 FACSCalibur 流式細(xì)胞儀測定各樣品的熒光密度值(PI fluorescence),流速控制在低速(12 μL/min),每次檢測10 000個(gè)細(xì)胞。由流式細(xì)胞儀自帶的數(shù)據(jù)處理軟件CELLQuest Pro自動(dòng)計(jì)算每次檢測樣品的平均熒光密度值。

        1.2.4 數(shù)據(jù)處理 每次檢測樣品的細(xì)胞核DNA含量依照以下公式計(jì)算:P1=E2/E1×P2。式中:P1表示魚血細(xì)胞的DNA含量,pg;P2表示對照小鼠細(xì)胞的DNA含量,pg;E1表示魚血細(xì)胞的平均熒光密度值;E2表示雞血細(xì)胞的平均熒光密度值。小鼠淋巴細(xì)胞的DNA絕對含量以7.0 pg/2C為標(biāo)準(zhǔn)[10]。用流式細(xì)胞儀自帶的數(shù)據(jù)處理軟件ModFit軟件分析細(xì)胞周期。所有試驗(yàn)數(shù)據(jù)均用 SPSS 10.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果表示為“平均值±標(biāo)準(zhǔn)差”。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 吉富羅非魚的細(xì)胞周期

        吉富羅非魚細(xì)胞與小鼠淋巴細(xì)胞的熒光密度峰的相對位置見圖1。ModFit軟件分析表明,小鼠淋巴細(xì)胞的熒光密度峰(M2)只有1個(gè)G0/G1峰,不表現(xiàn)出細(xì)胞周期現(xiàn)象;吉富羅非魚的紅細(xì)胞存在2個(gè)熒光密度峰,第1個(gè)峰值(M1)約占95%左右,為G0/G1期細(xì)胞;G0/G1峰值后是1段比例很小的峰谷,約占3.5%左右,為S期;緊接著又有1段峰值約為25%的G2期和M期。

        2.2 吉富羅非魚的細(xì)胞核DNA含量

        采用流式細(xì)胞儀對吉富羅非魚的血細(xì)胞DNA含量進(jìn)行了測定,詳見圖1、表1??梢钥闯黾涣_非魚血細(xì)胞的平均熒光密度值為200.33±11.260 2,小鼠淋巴細(xì)胞的平均熒光密度值為590.50±28.302 9,兩者比值0.339 2±0.009 0。以小鼠淋巴細(xì)胞DNA的絕對含量值7.0 pg/2C作為標(biāo)準(zhǔn),可以算出吉富羅非魚的血細(xì)胞DNA絕對含量為(2.374 5±0.063 0) pg/2C。

        3 討論

        研究魚類的種質(zhì)參數(shù)、掌握該魚的種質(zhì)特征對于人工育種都具有一定的指導(dǎo)意義。DNA含量分析是種質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)中不可缺少的參數(shù)之一。近年來測定魚類細(xì)胞DNA含量的方法主要是采用顯微分光光度計(jì)和流式細(xì)胞儀2種方法[11],從目前的技術(shù)水平來看,采用流式細(xì)胞儀測定魚類DNA含量要比采用顯微分光光度計(jì)法更準(zhǔn)確些。流式細(xì)胞儀是70年代發(fā)展起來的一種利用流式細(xì)胞儀對細(xì)胞等生物粒子的理化及生物學(xué)特性(細(xì)胞大小、DNA/RNA、細(xì)胞表面抗原表達(dá)等)進(jìn)行相關(guān)檢測分析的高技術(shù)儀器,具有快速、準(zhǔn)確、采集數(shù)據(jù)量大(速度可達(dá)1 000~10 000個(gè)/s)、分析全面和操作簡單等優(yōu)點(diǎn),目前已廣泛運(yùn)用于魚類、蝦類等DNA含量和倍性的檢測中[12-14]。到目前為止,用流式細(xì)胞儀測定魚類細(xì)胞含量的方法已比較完善和普遍。此外,流式細(xì)胞儀對樣品需求量少,只需要微量魚血即可,使得對試驗(yàn)魚的傷害減至最低。

        對于同一種生物而言,體細(xì)胞的DNA含量是恒定的,具有種的特征,在親緣關(guān)系相近的類群中可以作為探討其演化地位和親緣關(guān)系的依據(jù)[13]。吳洪喜等測定得毛蚶(Scapharca subcrenata Lischke)與魁蚶(Scapharca broughtonii Schrenck)的DNA含量高度一致,表明兩者之間的親緣關(guān)系接近,但泥蚶(Arca granosa)的DNA含量則稍高于毛蚶和魁蚶,因此認(rèn)為泥蚶在進(jìn)化程度上與毛蚶和魁蚶相近且比它們要高級[14]。方旅平等研究發(fā)現(xiàn),日本囊對蝦(Marsupenaeus japonicus)與刀額新對蝦(Metapenaeus ensis)DNA含量的絕對值相差不大,因而推知這2種蝦在系統(tǒng)發(fā)生上具有相近的親緣關(guān)系,這與形態(tài)學(xué)上的分類系統(tǒng)是一致的[15]。顧若波等研究發(fā)現(xiàn),似刺鳊(Paracanthobrama guichenoti Bleeker)的細(xì)胞核DNA含量與同亞科的花(Hemibarbus maculatus Bleeker)接近[16]。本試驗(yàn)利用流式細(xì)胞術(shù)測得吉富羅非魚血細(xì)胞核DNA含量為(2.374 5±0.063 0)pg/2C,與已報(bào)道的尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus)的(2.27±0.07)pg/2C、奧利亞羅非魚(O. aureus)的(2.22±0.08)pg/2C[17]和星洲紅魚(Red Tilapia)的(2.46±0.09)pg/2C[18]相近,這與4種羅非魚親緣關(guān)系接近是一致的。

        常見的參照標(biāo)準(zhǔn)有雞血細(xì)胞、人淋巴細(xì)胞、小鼠淋巴細(xì)胞、鱉血細(xì)胞、鱒魚紅細(xì)胞及鮭魚紅細(xì)胞等[11]。雞血細(xì)胞具有來源豐富、著色性好、大小均勻等優(yōu)點(diǎn),并且在大量研究中被廣泛應(yīng)用,而且雞血細(xì)胞與羅非魚的DNA含量相近,比值接近[17]。采用內(nèi)標(biāo)法檢測發(fā)現(xiàn),吉富羅非魚細(xì)胞與小鼠淋巴細(xì)胞的熒光密度峰值相近,不易區(qū)分,如果對照品和測試樣品分別上機(jī)檢測即采用外標(biāo)法檢測時(shí),有可能出現(xiàn)一定的誤差。許曉軍等報(bào)道采用內(nèi)標(biāo)法獲得的檢測結(jié)果變異系數(shù)小于外標(biāo)法,并建議選取DNA含量相差較大的物種作為參照標(biāo)準(zhǔn)[19],因此本試驗(yàn)選取小鼠淋巴細(xì)胞作為對照標(biāo)準(zhǔn),以內(nèi)標(biāo)法測定吉富羅非魚的細(xì)胞核DNA含量。

        參考文獻(xiàn):

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        2.2 吉富羅非魚的細(xì)胞核DNA含量

        采用流式細(xì)胞儀對吉富羅非魚的血細(xì)胞DNA含量進(jìn)行了測定,詳見圖1、表1。可以看出吉富羅非魚血細(xì)胞的平均熒光密度值為200.33±11.260 2,小鼠淋巴細(xì)胞的平均熒光密度值為590.50±28.302 9,兩者比值0.339 2±0.009 0。以小鼠淋巴細(xì)胞DNA的絕對含量值7.0 pg/2C作為標(biāo)準(zhǔn),可以算出吉富羅非魚的血細(xì)胞DNA絕對含量為(2.374 5±0.063 0) pg/2C。

        3 討論

        研究魚類的種質(zhì)參數(shù)、掌握該魚的種質(zhì)特征對于人工育種都具有一定的指導(dǎo)意義。DNA含量分析是種質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)中不可缺少的參數(shù)之一。近年來測定魚類細(xì)胞DNA含量的方法主要是采用顯微分光光度計(jì)和流式細(xì)胞儀2種方法[11],從目前的技術(shù)水平來看,采用流式細(xì)胞儀測定魚類DNA含量要比采用顯微分光光度計(jì)法更準(zhǔn)確些。流式細(xì)胞儀是70年代發(fā)展起來的一種利用流式細(xì)胞儀對細(xì)胞等生物粒子的理化及生物學(xué)特性(細(xì)胞大小、DNA/RNA、細(xì)胞表面抗原表達(dá)等)進(jìn)行相關(guān)檢測分析的高技術(shù)儀器,具有快速、準(zhǔn)確、采集數(shù)據(jù)量大(速度可達(dá)1 000~10 000個(gè)/s)、分析全面和操作簡單等優(yōu)點(diǎn),目前已廣泛運(yùn)用于魚類、蝦類等DNA含量和倍性的檢測中[12-14]。到目前為止,用流式細(xì)胞儀測定魚類細(xì)胞含量的方法已比較完善和普遍。此外,流式細(xì)胞儀對樣品需求量少,只需要微量魚血即可,使得對試驗(yàn)魚的傷害減至最低。

        對于同一種生物而言,體細(xì)胞的DNA含量是恒定的,具有種的特征,在親緣關(guān)系相近的類群中可以作為探討其演化地位和親緣關(guān)系的依據(jù)[13]。吳洪喜等測定得毛蚶(Scapharca subcrenata Lischke)與魁蚶(Scapharca broughtonii Schrenck)的DNA含量高度一致,表明兩者之間的親緣關(guān)系接近,但泥蚶(Arca granosa)的DNA含量則稍高于毛蚶和魁蚶,因此認(rèn)為泥蚶在進(jìn)化程度上與毛蚶和魁蚶相近且比它們要高級[14]。方旅平等研究發(fā)現(xiàn),日本囊對蝦(Marsupenaeus japonicus)與刀額新對蝦(Metapenaeus ensis)DNA含量的絕對值相差不大,因而推知這2種蝦在系統(tǒng)發(fā)生上具有相近的親緣關(guān)系,這與形態(tài)學(xué)上的分類系統(tǒng)是一致的[15]。顧若波等研究發(fā)現(xiàn),似刺鳊(Paracanthobrama guichenoti Bleeker)的細(xì)胞核DNA含量與同亞科的花(Hemibarbus maculatus Bleeker)接近[16]。本試驗(yàn)利用流式細(xì)胞術(shù)測得吉富羅非魚血細(xì)胞核DNA含量為(2.374 5±0.063 0)pg/2C,與已報(bào)道的尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus)的(2.27±0.07)pg/2C、奧利亞羅非魚(O. aureus)的(2.22±0.08)pg/2C[17]和星洲紅魚(Red Tilapia)的(2.46±0.09)pg/2C[18]相近,這與4種羅非魚親緣關(guān)系接近是一致的。

        常見的參照標(biāo)準(zhǔn)有雞血細(xì)胞、人淋巴細(xì)胞、小鼠淋巴細(xì)胞、鱉血細(xì)胞、鱒魚紅細(xì)胞及鮭魚紅細(xì)胞等[11]。雞血細(xì)胞具有來源豐富、著色性好、大小均勻等優(yōu)點(diǎn),并且在大量研究中被廣泛應(yīng)用,而且雞血細(xì)胞與羅非魚的DNA含量相近,比值接近[17]。采用內(nèi)標(biāo)法檢測發(fā)現(xiàn),吉富羅非魚細(xì)胞與小鼠淋巴細(xì)胞的熒光密度峰值相近,不易區(qū)分,如果對照品和測試樣品分別上機(jī)檢測即采用外標(biāo)法檢測時(shí),有可能出現(xiàn)一定的誤差。許曉軍等報(bào)道采用內(nèi)標(biāo)法獲得的檢測結(jié)果變異系數(shù)小于外標(biāo)法,并建議選取DNA含量相差較大的物種作為參照標(biāo)準(zhǔn)[19],因此本試驗(yàn)選取小鼠淋巴細(xì)胞作為對照標(biāo)準(zhǔn),以內(nèi)標(biāo)法測定吉富羅非魚的細(xì)胞核DNA含量。

        參考文獻(xiàn):

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        2.2 吉富羅非魚的細(xì)胞核DNA含量

        采用流式細(xì)胞儀對吉富羅非魚的血細(xì)胞DNA含量進(jìn)行了測定,詳見圖1、表1??梢钥闯黾涣_非魚血細(xì)胞的平均熒光密度值為200.33±11.260 2,小鼠淋巴細(xì)胞的平均熒光密度值為590.50±28.302 9,兩者比值0.339 2±0.009 0。以小鼠淋巴細(xì)胞DNA的絕對含量值7.0 pg/2C作為標(biāo)準(zhǔn),可以算出吉富羅非魚的血細(xì)胞DNA絕對含量為(2.374 5±0.063 0) pg/2C。

        3 討論

        研究魚類的種質(zhì)參數(shù)、掌握該魚的種質(zhì)特征對于人工育種都具有一定的指導(dǎo)意義。DNA含量分析是種質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)中不可缺少的參數(shù)之一。近年來測定魚類細(xì)胞DNA含量的方法主要是采用顯微分光光度計(jì)和流式細(xì)胞儀2種方法[11],從目前的技術(shù)水平來看,采用流式細(xì)胞儀測定魚類DNA含量要比采用顯微分光光度計(jì)法更準(zhǔn)確些。流式細(xì)胞儀是70年代發(fā)展起來的一種利用流式細(xì)胞儀對細(xì)胞等生物粒子的理化及生物學(xué)特性(細(xì)胞大小、DNA/RNA、細(xì)胞表面抗原表達(dá)等)進(jìn)行相關(guān)檢測分析的高技術(shù)儀器,具有快速、準(zhǔn)確、采集數(shù)據(jù)量大(速度可達(dá)1 000~10 000個(gè)/s)、分析全面和操作簡單等優(yōu)點(diǎn),目前已廣泛運(yùn)用于魚類、蝦類等DNA含量和倍性的檢測中[12-14]。到目前為止,用流式細(xì)胞儀測定魚類細(xì)胞含量的方法已比較完善和普遍。此外,流式細(xì)胞儀對樣品需求量少,只需要微量魚血即可,使得對試驗(yàn)魚的傷害減至最低。

        對于同一種生物而言,體細(xì)胞的DNA含量是恒定的,具有種的特征,在親緣關(guān)系相近的類群中可以作為探討其演化地位和親緣關(guān)系的依據(jù)[13]。吳洪喜等測定得毛蚶(Scapharca subcrenata Lischke)與魁蚶(Scapharca broughtonii Schrenck)的DNA含量高度一致,表明兩者之間的親緣關(guān)系接近,但泥蚶(Arca granosa)的DNA含量則稍高于毛蚶和魁蚶,因此認(rèn)為泥蚶在進(jìn)化程度上與毛蚶和魁蚶相近且比它們要高級[14]。方旅平等研究發(fā)現(xiàn),日本囊對蝦(Marsupenaeus japonicus)與刀額新對蝦(Metapenaeus ensis)DNA含量的絕對值相差不大,因而推知這2種蝦在系統(tǒng)發(fā)生上具有相近的親緣關(guān)系,這與形態(tài)學(xué)上的分類系統(tǒng)是一致的[15]。顧若波等研究發(fā)現(xiàn),似刺鳊(Paracanthobrama guichenoti Bleeker)的細(xì)胞核DNA含量與同亞科的花(Hemibarbus maculatus Bleeker)接近[16]。本試驗(yàn)利用流式細(xì)胞術(shù)測得吉富羅非魚血細(xì)胞核DNA含量為(2.374 5±0.063 0)pg/2C,與已報(bào)道的尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus)的(2.27±0.07)pg/2C、奧利亞羅非魚(O. aureus)的(2.22±0.08)pg/2C[17]和星洲紅魚(Red Tilapia)的(2.46±0.09)pg/2C[18]相近,這與4種羅非魚親緣關(guān)系接近是一致的。

        常見的參照標(biāo)準(zhǔn)有雞血細(xì)胞、人淋巴細(xì)胞、小鼠淋巴細(xì)胞、鱉血細(xì)胞、鱒魚紅細(xì)胞及鮭魚紅細(xì)胞等[11]。雞血細(xì)胞具有來源豐富、著色性好、大小均勻等優(yōu)點(diǎn),并且在大量研究中被廣泛應(yīng)用,而且雞血細(xì)胞與羅非魚的DNA含量相近,比值接近[17]。采用內(nèi)標(biāo)法檢測發(fā)現(xiàn),吉富羅非魚細(xì)胞與小鼠淋巴細(xì)胞的熒光密度峰值相近,不易區(qū)分,如果對照品和測試樣品分別上機(jī)檢測即采用外標(biāo)法檢測時(shí),有可能出現(xiàn)一定的誤差。許曉軍等報(bào)道采用內(nèi)標(biāo)法獲得的檢測結(jié)果變異系數(shù)小于外標(biāo)法,并建議選取DNA含量相差較大的物種作為參照標(biāo)準(zhǔn)[19],因此本試驗(yàn)選取小鼠淋巴細(xì)胞作為對照標(biāo)準(zhǔn),以內(nèi)標(biāo)法測定吉富羅非魚的細(xì)胞核DNA含量。

        參考文獻(xiàn):

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