曲長(zhǎng)紅,張 寧,曹東華,郝冬梅
解放軍第202醫(yī)院 優(yōu)生優(yōu)育計(jì)劃生育研究所,遼寧沈陽(yáng) 110003
240例耳聾患者常見耳聾基因篩查分析
曲長(zhǎng)紅,張 寧,曹東華,郝冬梅
解放軍第202醫(yī)院 優(yōu)生優(yōu)育計(jì)劃生育研究所,遼寧沈陽(yáng) 110003
目的 分析非綜合征型耳聾患者常見耳聾基因突變情況,探討遺傳性耳聾基因芯片檢測(cè)的臨床意義。方法 2013年3 - 8月來(lái)自沈陽(yáng)市和平區(qū)殘聯(lián)的非綜合征型耳聾患者240例,患者或監(jiān)護(hù)人簽署知情同意后提取被檢者外周靜脈血基因組DNA,采用晶芯?遺傳性耳聾基因檢測(cè)試劑盒對(duì)常見的4個(gè)耳聾基因(GJB2、GJB3、SLC26A4以及線粒體12S rRNA)的9個(gè)突變位點(diǎn)進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果 240例受檢者中,102例存在被檢測(cè)基因突變,其中GJB2基因突變44例(18.33%,44/240),SLC26A4基因突變38例(15.83%,38/240),線粒體12S rRNA基因突變17例(7.08%,17/240),GJB3 538 C>T 1例(0.39%,1/240)。明確診斷為遺傳性耳聾60例,提示遺傳性耳聾42例,占全部耳聾患者的42.5%(102/240)。結(jié)論 非綜合征型耳聾患者耳聾基因攜帶率較高,對(duì)高危人群進(jìn)行耳聾基因突變的篩查和遺傳咨詢是防止和控制遺傳性耳聾、優(yōu)生優(yōu)育的重要步驟。
遺傳性耳聾;基因芯片;耳聾基因
新生兒耳聾的發(fā)病率為0.1% ~ 0.3%,一半以上的先天性耳聾是由于遺傳因素造成的。遺傳性耳聾按表型特征不同分為綜合征型耳聾和非綜合征型耳聾。綜合征型耳聾除聽力損傷外還伴有耳外組織的異常或病變,約占30%;非綜合征型耳聾只有聽力損害,不伴有耳外組織的異常和病變,約占70%[1]。隨著耳聾基因研究的深入,耳聾基因檢測(cè)已成為防控遺傳性耳聾的重要舉措[2-4]。國(guó)內(nèi)分子流行病學(xué)研究表明,我國(guó)大部分遺傳性耳聾主要由為數(shù)不多的幾個(gè)基因突變引起,如GJB2、GJB3、SLC26A4以及線粒體12S rRNA等[5-6]。為此,本研究應(yīng)用北京博奧生物有限公司的晶芯?九項(xiàng)遺傳性耳聾基因芯片檢測(cè)試劑盒,檢測(cè)了沈陽(yáng)市和平區(qū)240例非綜合征型耳聾患者,探討常見遺傳性耳聾基因檢測(cè)的臨床應(yīng)用價(jià)值。
1 研究對(duì)象 2013年3 - 8月來(lái)自沈陽(yáng)市和平區(qū)殘聯(lián)的耳聾患者240例,其中男117例,女123例,年齡5 ~ 59歲。經(jīng)患者或監(jiān)護(hù)人知情同意后,收集病史資料,包括患者的一般信息、出生史、耳聾發(fā)病年齡、家族史、個(gè)人史(耳聾性藥物應(yīng)用史、頭部外傷史等)及母孕期情況等,排除綜合征型耳聾。
2 DNA提取 采集受檢者外周靜脈血2 ml,置于EDTA抗凝的真空采血管中,應(yīng)用天根公司全血核酸提取試劑盒提取基因組DNA,并檢測(cè)濃度和純度。3 耳聾基因篩查 PCR擴(kuò)增、芯片雜交、芯片洗滌與甩干、芯片掃描與判讀,應(yīng)用博奧生物有限公司提供的晶芯?遺傳性耳聾基因檢測(cè)試劑盒(微陣列芯片法),具體步驟參照說(shuō)明書。
1 常見耳聾基因突變情況 240例受檢者中,102例存在被檢測(cè)基因突變。同時(shí)攜帶兩個(gè)突變基因的2例,其中1例同時(shí)檢出GJB3 538C>T雜合突變和SLC26A4 IVS7-2A>G雜合突變;另1例同時(shí)檢出GJB2 235del C雜合突變和SLC26A4 2168 A>G雜合突變。見表1。
2 受檢者耳聾病因分析 240例中,明確診斷為遺傳性耳聾60例,提示遺傳性耳聾42例,原因不明耳聾138例。60例明確遺傳性耳聾患者中,GJB2基因突變27例,其中純合突變型12例,復(fù)合雜合突變型15例; SLC26A4基因突變16例,其中純合突變型13例,復(fù)合雜合突變型3例;線粒體12S rRNA均質(zhì)突變型17例。42例提示遺傳性耳聾患者中,GJB2基因單雜合突變17例,SLC26A4基因單雜合突變22例,GJB3基因單雜合突變1例,無(wú)線粒體12S rRNA基因異質(zhì)突變型,2例存在兩個(gè)基因的單雜合突變。102例耳聾患者攜帶遺傳性耳聾致病基因(102/240,42.5%),138例未提供致病基因信息(138/240,57.5%)。見表2。
耳聾是臨床上常見的遺傳性疾病,嚴(yán)重影響人類的生活質(zhì)量。由遺傳因素導(dǎo)致的耳聾約占60%[7-8]。遺傳性耳聾臨床上根據(jù)不同表現(xiàn)分為綜合征型耳聾和非綜合征型耳聾。非綜合征型耳聾是以聽力損失為唯一癥狀的遺傳性疾病。耳聾具有很強(qiáng)的遺傳異質(zhì)性,其遺傳學(xué)基礎(chǔ)比較復(fù)雜。根據(jù)遺傳方式不同,遺傳性耳聾可分為常染色體顯性遺傳、常染色體隱性遺傳、X連鎖遺傳、Y連鎖遺傳及線粒體遺傳。遺傳性耳聾的致病基因及同一基因的突變位點(diǎn)在不同種族、不同地區(qū)的人群中不全相同。GJB2、SLC26A4及線粒體12SrRNA基因是導(dǎo)致中國(guó)大部分遺傳性耳聾發(fā)生的最常見的3個(gè)基因,其中GJB2、SLC26A4屬常染色體隱性遺傳,線粒體12S rRNA屬母系遺傳[9-10]。
我國(guó)流行病學(xué)調(diào)查顯示,21%的耳聾患者攜帶GJB2基因突變,18.5%的患者攜帶SLC26A4基因突變,3.8%和0.6%的患者分別攜帶線粒體12SrRNA 1555 A>G和線粒體12SrRNA 1494 C>T突變,提示GJB2、SLC26A4、線粒體基因是導(dǎo)致中國(guó)人大部分遺傳性耳聾發(fā)生的3個(gè)基因[11]。本研究中檢出攜帶有遺傳性耳聾相關(guān)突變基因的患者102例(42.5%,102/240),其中45例GJB2基因突變(18.75%,45/240),GJB2 235del C占該基因全部突變檢出位點(diǎn)的88.89%(40/45),是沈陽(yáng)市和平區(qū)最常見的耳聾基因突變位點(diǎn)。其次,檢出39例SLC26A4突變(16.25%,39/240),其中IVS7-2 A>G占該基因全部突變的87.18(34/39),在SLC26A4基因突變中最常見。攜帶線粒體12SrRNA突變基因檢出率7.08%(17/240),通過(guò)對(duì)所有母系成員進(jìn)行用藥宣教,終生禁用氨基糖苷類抗生素,可有效避免藥物性耳聾的發(fā)生。
表1 受檢者中基因序列改變方式及例數(shù)Tab. 1 Deafness gene mutations of patients included in this study (n)
表2 受檢者耳聾病因分析Tab. 2 Characteristics of deaf patients included in this study (n)
本文檢測(cè)的240例耳聾患者中,60例證實(shí)為遺傳性耳聾,占耳聾患者的25%(60/240),其中27例為GJB2基因突變,16例為SLC26A4基因突變,17例為線粒體12S rRNA均質(zhì)突變。另外,有42例為雜合突變,占耳聾患者的17.5%(42/240),其中GJB2基因17例,SLC26A4基因22例,GJB3基因1例,2例存在兩個(gè)基因的單雜合突變。我們將對(duì)相應(yīng)基因進(jìn)行全基因測(cè)序,提示可能存在其他突變位點(diǎn)。應(yīng)用遺傳性耳聾基因芯片檢測(cè)試劑盒,我們篩出102例遺傳性耳聾患者,占耳聾患者的42.5%(102/240),我們將對(duì)這些患者進(jìn)行優(yōu)生優(yōu)育指導(dǎo),結(jié)合產(chǎn)前診斷技術(shù)有效預(yù)防下一代耳聾患者的出生。
綜上所述,通過(guò)對(duì)沈陽(yáng)市和平區(qū)240例非綜合征型耳聾患者進(jìn)行常見4個(gè)耳聾相關(guān)基因的9個(gè)致病突變位點(diǎn)檢測(cè),了解到沈陽(yáng)市和平區(qū)非綜合征型耳聾基因突變攜帶率較高,GJB2基因突變中235del C最為常見,IVS7-2 A>G在SLC26A4基因突變中最為常見,與國(guó)內(nèi)文獻(xiàn)報(bào)道基本相符[12-16]。對(duì)該地區(qū)耳聾患者及高危人群進(jìn)行耳聾基因突變的篩查是防止和控制該地區(qū)遺傳性耳聾的重要步驟,建議遺傳性耳聾基因檢測(cè)試劑盒在臨床推廣應(yīng)用。
1 Walsh T, Pierce SB, Lenz DR, et al. Genomic duplication and overexpression of TJP2/ZO-2 leads to altered expression of apoptosis genes in progressive nonsyndromic hearing loss DFNA51[J]. Am J Hum Genet, 2010, 87(1): 101-109.
2 韓冰,王秋菊.新生兒聽力和基因聯(lián)合篩查研究現(xiàn)狀[J].中華耳科學(xué)雜志,2013,11(2):309-312.
3 陳鑫蘋,徐衛(wèi)華,符生苗,等.遺傳性耳聾基因芯片檢測(cè)的臨床應(yīng)用研究[J].現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué),2012,39(19):5103-5105.
4 王艷麗(綜述),張穎(審校).遺傳性耳聾常見致病基因及篩查方法的研究進(jìn)展[J].國(guó)際生殖健康/計(jì)劃生育雜志,2013,32(4):309-312.
5 李海波,李瓊,李紅,等.非綜合征性聾突變熱點(diǎn)的流行病學(xué)分析[J].臨床耳鼻咽喉頭頸外科雜志,2012,26(13):589-594.
6 張小芳.非綜合征性耳聾的研究進(jìn)展[J].醫(yī)學(xué)綜述,2013,19(1):120-123.
7 江凌曉,凌月仙,蔡桂君,等.遺傳性耳聾基因芯片檢測(cè)的臨床應(yīng)用研究[J].分子診斷與治療雜志,2011,3(3):170-172.
8 胡煜,孫敬武,孫家強(qiáng),等.非綜合征型聾患者常見耳聾基因突變分析[J].中華耳科學(xué)雜志,2013,11(1):121-125.
9 Van Camp G, Smith R. Hereditary Hearing loss Homepage[DB/ OL]. http://hereditaryhearingloss.org
10 代志瑤,戴樸.非綜合征型耳聾的基因型與表型關(guān)系[J].中華耳科學(xué)雜志,2013,11(1):151-155.
11 張東紅,邱海濤,馬秀嵐,等.新生兒聾病基因GJB2、SLC26A4、線粒體12SrRNA的分子流行病學(xué)研究[J].中國(guó)醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào),2010,39(8):649-651.
12 李亮,魯建光,劉穎,等.先天性非綜合征型耳聾相關(guān)基因檢測(cè)及熱點(diǎn)突變分析[J].中華耳科學(xué)雜志,2012,10(2):246-251.
13 張強(qiáng)偉,張芩娜,楊向茹.山西太原129例重度非綜合征型感音神經(jīng)性耳聾基因的篩查[J].中華耳科學(xué)雜志,2012,10(2):224-226.
14 孫捷,韋桂玲,陳俞,等.86例非綜合征型耳聾患者耳聾基因芯片檢測(cè)結(jié)果分析[J].中華耳科學(xué)雜志,2013,11(2):216-219.
15 劉啟珍,陳麗鴻,張應(yīng)龍,等.重慶市永川地區(qū)青少年耳聾患者耳聾基因熱點(diǎn)突變篩查分析[J].中華耳科學(xué)雜志,2013,11(1):126-130.
16 王強(qiáng),尤易文,張啟成.南通地區(qū)150例重度-極重度耳聾患者常見致聾基因突變分析[J].臨床耳鼻咽喉頭頸外科雜志,2013,27(7):366-370.
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《解放軍醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào)》 編輯部
Analysis of common deafness genes screening in 240 deaf patients
QU Chang-hong, ZHANG Ning, CAO Dong-hua, HAO Dong-mei
Institute of Obstetrics and Gynecology, Chinese PLA 202 Hospital, Shenyang 110003, Liaoning Province, China
HAO Dong-mei. Email: bennyhg@aliyun.com
Objective To investigate the incidence of common deafness gene mutations in patients with non-syndromic deafness. Methods The genomic DNA of 240 deafness patients were extracted from their peripheral blood. The hot-spot deafness gene mutations, including GJB2, GJB3, SLC26A4 and mitochondrial 12S rRNA genes, were detected using a nine deafness gene mutations detection kit. Results Various types of gene locus mutations were detected in 102 of the 240 patients, including 44 GJB2 gene mutations (18.33%, 44/240), 38 SLC26A4 gene mutations (15.83%, 38/240), 17 mitochondrial 12S rRNA gene mutations (7.08%, 17/240). The diagnosis results suggested that 60 cases were sure to be hereditary hearing loss and 42 cases were suspected hereditary hearing loss, which accounted for 42.5% (102/240) of the total. Conclusion Non-syndromic deafness patients have a high ratio of carrying deafness gene, and molecular genetic screening for these hot-spot mutations is a pivotal step for the prevention and control of genetic deafness.
hereditary deafness; gene chip; deafness gene
R 714.55
A
2095-5227(2014)10-1019-03
10.3969/j.issn.2095-5227.2014.10.012
時(shí)間:2014-07-15 09:56
http://www.cnki.net/kcms/detail/11.3275.R.20140715.0956.005.html
2014-05-11
曲長(zhǎng)紅,女,在讀碩士。研究方向:優(yōu)生優(yōu)育。Email: quchanghong2014@163.com
郝冬梅,女,博士,副主任醫(yī)師。Email: bennyhg@aliyun. com