張曉燕,古麗娜孜,庫米拉,陳衛(wèi)林,王小標(biāo),楊 靜,王雪薇,韓艷鵬,武 運(yùn)
(新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與藥學(xué)學(xué)院,新疆烏魯木齊830052)
生活在低溫環(huán)境下的微生物稱為低溫微生物,主要分為嗜冷菌(psychrophiles)和耐冷菌(psychrotrophs)兩類,前者是指在0℃可生長繁殖,最適溫度不超過15℃,最高溫度不超過20℃的細(xì)菌、真菌和藻類等微生物[1];后者是指在0~5℃可生長繁殖,最適生長溫度可達(dá)20℃以上的微生物。低溫微生物能夠在低溫條件下產(chǎn)生一些具有較高催化效率的低溫酶,來維持細(xì)胞新陳代謝的正常運(yùn)行[2]。
目前,對(duì)低溫蛋白酶的研究主要集中在從極地、冰川、雪山、深海等長年極冷環(huán)境選育產(chǎn)酶的冷適微生物、通過化學(xué)誘變和物理誘變篩選高產(chǎn)低溫蛋白酶菌株[3]、冷適蛋白酶提純及酶學(xué)特性研究[4]、從分子水平解析適冷機(jī)制并進(jìn)行化學(xué)修飾保護(hù)酶的熱穩(wěn)定性[5]。低溫蛋白酶具有低溫易反應(yīng),高效活力,熱損失少等優(yōu)點(diǎn),因此,在食品、環(huán)境修復(fù)、化妝用品、醫(yī)藥等領(lǐng)域有著中溫蛋白酶無法比擬的優(yōu)越性[6-7]。對(duì)于陸地常冷環(huán)境凍土、高海拔地區(qū)產(chǎn)冷適蛋白酶菌株鮮有報(bào)道。本文基于新疆凍土資源充裕,以新疆阿勒泰進(jìn)山口植物根際凍土為材料,旨在應(yīng)用微生物發(fā)酵法篩選產(chǎn)低溫蛋白酶菌株,篩選出一株產(chǎn)冷適蛋白酶的菌株,16S rDNA鑒定為沙雷氏菌(Serratia sp.),這為冷適蛋白酶的進(jìn)一步提取純化、研究酶學(xué)特性奠定基礎(chǔ),為開發(fā)新疆特色果蔬加工低溫酶制劑提供理論與技術(shù)支持,為新疆豐富的果蔬加工工業(yè)提供方便、高效、快捷的非熱加工方式,來保持果蔬及果蔬制品特有的風(fēng)味,色澤,營養(yǎng)。
土樣采自新疆阿勒泰進(jìn)山口,采集時(shí)間是2012年3月,采集時(shí)環(huán)境溫度為0~10℃。將土樣置于無菌鋁盒中,做好標(biāo)記,放置保溫箱中當(dāng)天運(yùn)回,-20℃保存?zhèn)溆?ZP301細(xì)菌基因組 DNA提取試劑盒、DL2000 PlusDNAMarker、ZT2012 × TaqPCR MasterMix(含染料)、10mg/mL EB染色液 北京莊盟國際生物基因科技有限公司;primer1:(5'-AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG-3')primer2:(5'-AAG GAG GTG ATC CAG CCG CA-3')華大基因;革蘭氏染色液[8]、1mol/L pH8.0 Tris-HCl、20mg/L 蛋白酶K 上海百祥生物科技有限公司;10mg/mL溶菌酶北京百泰克生物技術(shù)有限公司;50×TAE(Tris-乙酸)、1%溴酚藍(lán)指示劑 北京索萊寶科技有限公司;0.5μg/mL EB 染色液[9];液體富集培養(yǎng)基 葡萄糖1.00%,蛋白胨0.50%,酵母浸粉0.50%,MgSO4·7H2O 0.02%,K2HPO40.10%,NaCl 1.00%,Na2CO31.00%,pH 7.2;LB培養(yǎng)基 蛋白胨1.0%,酵母浸粉0.5%,NaCl 1.0%,(固體加2%的瓊脂),pH 7.2;選擇培養(yǎng)基 酵母浸粉0.1%,NaCl 1.0%,酪蛋白2.0%,瓊脂2.0%,pH 7.2。培養(yǎng)基均在 121℃滅菌 20min后,待用。
LD2X-30KA立式電熱壓力蒸汽滅菌鍋 上海申安醫(yī)療器械廠;HR40-ⅡA2生物安全柜 青島海爾特種電器有限公司;DHP-9162電熱恒溫培養(yǎng)箱上海一恒科技有限公司;DZKW-D-2電熱恒溫水浴鍋 北京市永光明醫(yī)療儀器廠;XSP-2CA生物顯微鏡 Motic實(shí)業(yè)集團(tuán)有限公司;FA2104N分析天平 上海民橋精密科學(xué)儀器有限公司;THZ-98A恒溫振蕩箱 上海一恒科學(xué)儀器有限公司;050-810Tgradient48 PCR擴(kuò)增儀 德國Biometra公司;DYY-7B電泳儀 北京六一儀器廠;JY04S凝膠成像儀 北京君意東方電泳設(shè)備有限公司;MiniSpin離心機(jī) 德國Eppendorf公司。
1.2.1 菌株馴化 在容積100mL的三角瓶內(nèi)裝50mL生理鹽水,放幾顆玻璃珠,121℃滅菌20min,冷卻后在無菌操作臺(tái)上,將土樣加到無菌生理鹽水中,制成 1%土壤懸浮液,搖勻,待用。(注意:每隔20min震蕩一次,震蕩數(shù)次充分混勻后,在無菌操作臺(tái)上,靜置30min)
在500mL三角燒瓶內(nèi)裝50mL液體富集培養(yǎng)基,在121℃滅菌20min后冷卻,在超凈工作臺(tái)上準(zhǔn)確移取5mL上述1%的土壤懸浮液,加入到三角燒瓶中,在20℃ 200r/min培養(yǎng)1天,待用。
1.2.2 產(chǎn)低溫蛋白酶菌株的初篩 在無菌操作臺(tái)上,分別取馴化好的菌懸液0.5mL,加入到4.5mL無菌生理鹽水中,用梯度稀釋法得到不同稀釋度的稀釋液,即 10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6、10-7。每個(gè)稀釋度做兩個(gè)平皿,分別移取0.1mL的菌液,移入凝固干燥后的固體初篩培養(yǎng)基平皿中,用涂布棒涂勻,在20℃的培養(yǎng)箱中恒溫培養(yǎng)24~48h,觀察有無透明圈出現(xiàn),將初篩得到的產(chǎn)酶菌株,挑單個(gè)菌落,在選擇培養(yǎng)基上點(diǎn)樣,20℃培養(yǎng)24~48h后,加入10%的TCA終止反應(yīng),測量菌落直徑以及透明圈直徑。每個(gè)菌株做三個(gè)平皿,平行測量三次,取平均值。在菌落邊緣可看到透明圈的菌株即為要篩選的菌株。
1.2.3 產(chǎn)低溫蛋白酶菌株的復(fù)篩 蛋白酶活力的測定:按照國標(biāo)GB/T23527-2009規(guī)定的福林酚顯色法(Folin)測酶活進(jìn)行菌株的復(fù)篩,蛋白酶活性定義:在pH7.0和40℃溫度條件下,每分鐘水解酪蛋白產(chǎn)生1μg酪氨酸,定義為一個(gè)蛋白酶活力單位。同一個(gè)樣品測三次,取平均值。
1.2.4 產(chǎn)低溫蛋白酶菌株鑒定 用肉眼觀察平板上單個(gè)菌落的顏色、大小、形狀等特征,記錄;再用革蘭氏染色法觀察菌株的顯微鏡形態(tài),按照文獻(xiàn)[10]對(duì)菌株進(jìn)行初步鑒定。按照文獻(xiàn)[11-12]進(jìn)行菌株生理生化鑒定,通過李遠(yuǎn)[13]等的方法擴(kuò)增菌株的16S rDNA,擴(kuò)增成功的PCR產(chǎn)物,送至北京六合華大公司測序,獲得的測序結(jié)果遞交GenBank數(shù)據(jù)庫中Blast,進(jìn)行相似同源性分析,Maximum likelihood法繪制系統(tǒng)發(fā)育樹,BOOTSTRAP分析法,選取重復(fù)1000評(píng)估樹的準(zhǔn)確性。
1.2.5 菌株生長曲線及產(chǎn)酶曲線的繪制 將菌株接入液體培養(yǎng)基中,在22℃的搖床中150r/min進(jìn)行培養(yǎng),通過連續(xù)測定(每隔2h)液體培養(yǎng)基中細(xì)菌的OD600nm吸光值及酶活力,確定菌株生長狀況及產(chǎn)酶情況,繪制生長曲線和產(chǎn)酶曲線。
1.2.6 菌株A29-2生長特性的初步研究 將活化好的種子液以1%的接種量接入液體培養(yǎng)基中,通過連續(xù)測定液體 OD600nm吸光值,研究菌株在 4、18、20、22、25、28、30、37℃下的生長情況。測定菌株在初始pH為4.0、5.0、6.0、7.0、8.0、9.0、10.0 及質(zhì)量分?jǐn)?shù) 0.00%、0.25%、0.50%、1.00%、2.00%、4.00%、8.00%的 NaCl中22℃培養(yǎng)24h后的生長量。
通過平板分離初篩及復(fù)篩方法,在20℃培養(yǎng)條件下恒溫孵育48h后加入10%的TCA溶液終止反應(yīng),從植物根際土壤中篩選出9株產(chǎn)低溫蛋白酶菌株,表1是水解透明圈d1與菌落直徑d2測量結(jié)果。
從圖中可以看出,菌株A29-2和A29-3透明圈與菌落直徑之比d1/d2的值均大于3.00[14],后續(xù)工作中測得菌株A29-2和A29-3的酶活力依次是31.88U/mL和7.04U/mL,說明透明圈的大小與酶活力的大小成正相關(guān),故此方法可用于篩選產(chǎn)低溫蛋白酶菌株[15]。菌株A29-2的酶活力較大,作為后續(xù)工作的研究對(duì)象。
表1 菌株篩選的結(jié)果Table 1 Results of strains screening
2.2.1 菌株形態(tài)學(xué)鑒定 菌株A29-2在酪蛋白分離培養(yǎng)基上形態(tài)特征如圖1所示:單個(gè)菌落表面圓滑濕潤,凸起,規(guī)則圓形,呈乳白色,邊緣整齊,不透明。顯微鏡下的形態(tài)如圖2所示為單細(xì)胞呈短桿狀,不規(guī)則排列,革蘭氏陰性,無芽孢,有莢膜。
圖1 菌株A29-2的平板特征Fig.1 Plate characteristics of strain A29-2
圖2 菌株A29-2的鏡檢特征Fig.2 Microscopic characteristics of strain A29-2
2.2.2 生理生化鑒定 研究結(jié)果見表2:菌株A29-2可分解葡萄糖、果糖、蔗糖、麥芽糖、L-阿拉伯糖、D-半乳糖、D-棉籽糖、D-木糖、甘露醇、甘露糖、密二糖、海藻糖產(chǎn)酸產(chǎn)氣,不能分解乳糖、水楊苷產(chǎn)酸。M-R實(shí)驗(yàn)、H2S實(shí)驗(yàn)、吲哚實(shí)驗(yàn)為陰性;接觸酶實(shí)驗(yàn)、V-P實(shí)驗(yàn)、硝酸鹽還原實(shí)驗(yàn)、明膠液化實(shí)驗(yàn)、檸檬酸鹽實(shí)驗(yàn)為陽性;石蕊牛乳實(shí)驗(yàn)結(jié)果為牛奶結(jié)塊凝固,不變色或藍(lán)色,即酶凝。說明菌株A29-2具有產(chǎn)低溫蛋白酶的能力。
2.2.3 菌株A29-2的16S rDNA鑒定 由圖3可知,菌株A29-2 PCR擴(kuò)增出的條帶在1500bp左右,說明成功的擴(kuò)增出菌株A29-2的16S rDNA片段;將菌株A29-2的測序結(jié)果,通過NCBI進(jìn)行16S rDNA數(shù)據(jù)庫BLAST,選取序列相似度達(dá)99%的部分菌種,采用軟件DNAman和 Mega5.05,Maximum likelihood法制作系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果見圖4,菌株 A29-2與標(biāo)準(zhǔn)菌株NR_042356.1在同一支系,相似率達(dá)到99%,故菌株A29-2鑒定為沙雷氏菌(Serratia ureilytica strain_NiVa 51)。
表2 菌株A29-2生理生化鑒定結(jié)果Table 2 Physiological and biochemical identification results of strain A29-2
圖3 菌株A29-2 PCR電泳膠圖Fig.3 PCR electrophoresis gel figure of strain A29-2
圖4 菌株A29-2的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.4 The phylogenetic tree of strain A29-2
2.3.1 菌株A29-2的生長和產(chǎn)酶曲線 通過連續(xù)測定液體培養(yǎng)基中菌株A29-2的OD600nm吸光值,由圖5可知,菌株A29-2在22℃環(huán)境中能較快生長,4~18h為對(duì)數(shù)生長期,培養(yǎng)18h后基本達(dá)到穩(wěn)定期;在最初的8h內(nèi)酶活力幾乎沒有;20h后才漸漸開始產(chǎn)酶,此時(shí)菌株處于穩(wěn)定期;隨著菌株逐漸衰亡,產(chǎn)酶能力也越來越強(qiáng),說明酶的產(chǎn)生發(fā)生在菌株生長的中后期。
圖5 菌株A29-2的生長和產(chǎn)酶曲線Fig.5 The growth curve and enzyme production curve of strain A29-2
2.3.2 溫度對(duì)菌株A29-2生長的影響 溫度對(duì)菌株A29-2生長的影響如圖6所示,菌株A29-2在4~30℃均能生長,且最適生長溫度為22℃,37℃不生長,表明該菌是低溫菌。在不同溫度下,培養(yǎng)18h后均陸續(xù)進(jìn)入穩(wěn)定期,且18h的生長量最大;隨著溫度的升高,菌株到達(dá)生長高峰的時(shí)間提前,加速了菌株的死亡。
圖6 溫度對(duì)菌株A29-2生長的影響Fig.6 The effect of temperature on the growth of strain A29-2
2.3.3 初始pH對(duì)菌株A29-2生長的影響 初始pH對(duì)菌株A29-2生長的影響如圖7所示,菌株A29-2在初始pH為6.0~8.0生長較快,最適初始pH為7.0。
圖7 初始pH對(duì)菌株A29-2生長的影響Fig.7 The effect of initial pH on the growth of strain A29-2
2.3.4 NaCl質(zhì)量分?jǐn)?shù)對(duì)菌株A29-2生長的影響NaCl質(zhì)量分?jǐn)?shù)對(duì)菌株A29-2生長的影響如圖8所示,NaCl質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.00%~1.00%時(shí),菌株A29-2生長最快,且最適NaCl質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1.00%。
圖8 NaCl質(zhì)量分?jǐn)?shù)對(duì)菌株A29-2生長的影響Fig.8 The effect of mass fraction of NaCl on the growth of strain A29-2
本研究通過微生物發(fā)酵法分離篩選出9株產(chǎn)低溫蛋白酶菌株,其中菌株A29-2所產(chǎn)低溫蛋白酶活性最高,為31.88U/mL。通過微生物學(xué)鑒定方法對(duì)菌株A29-2進(jìn)行形態(tài)學(xué)、生理生化及16S rDNA鑒定,經(jīng)序列同源性分析,鑒定該菌屬于沙雷氏菌(Serratia sp.),該研究與遲乃玉等[15]、劉靜等[16]、全桂靜等[17]學(xué)者分離篩選所得的菌種有所不同,本研究得到一株新菌種,并對(duì)新菌種的生長特性進(jìn)行初步探討,菌株A29-2生長最適溫度為22℃,且在4℃可以生長,37℃不生長。根據(jù)耐冷菌能夠在0~5℃左右生長,最適生長溫度約20℃左右的特性,可以確定該菌為耐冷菌。且最適初始pH為7.0,在pH10.0時(shí)生長最緩慢,pH4.0時(shí)生長較緩慢,因此,該菌耐堿性差,但具有一定的耐酸性。該菌最適NaCl質(zhì)量分?jǐn)?shù)為1.00%,超過1.00%時(shí),菌株生長加速死亡,所以,該菌具有一定的耐鹽性。本研究篩選的菌株A29-2為進(jìn)一步提取純化低溫蛋白酶和研究酶學(xué)特性奠定了基礎(chǔ)。
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