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        AmpF?STRIdentifilerPlus試劑盒快速直接PCR擴增初探

        2014-04-20 03:39:52郝曉明趙興春
        中國司法鑒定 2014年1期
        關鍵詞:鑒定中心熱循環(huán)法醫(yī)

        劉 琳,郝曉明,董 會,歐 元,趙興春,葉 健

        (1.中國人民公安大學,北京100038;2.重慶市公安局巴南區(qū)分局,重慶401320;3.法庭科學生物芯片工程實驗室,北京 100038;4.公安部物證鑒定中心,北京 100038)

        自20世紀90年代以來,以PCR-STR技術為代表的第二代法醫(yī)DNA分型技術在司法實踐中的應用日益廣泛,整個DNA分型過程包括DNA提取、定量、PCR擴增和電泳檢測與分析,其中DNA提取與PCR擴增是兩個重要的限速步驟,常規(guī)方法難以滿足DNA數據庫規(guī)模不斷擴大和緊急案件檢驗的需求。本文選用AmpF?STRIdentifilerPlus試劑盒與TaKaRa公司的快速PCR試劑盒聯(lián)合建立快速直接PCR(Rapid Direct PCR[1])反應體系,采用免提取的方式,以FTA血卡為模板,采用經優(yōu)化的熱循環(huán)參數在快速PCR儀上完成擴增,對如何縮短DNA分型檢測的時間進行了初步探討。

        1 材料與方法

        1.1 樣本

        FTA血卡樣本(公安部物證鑒定中心提供)

        1.2 主要儀器及試劑

        1.3 PCR擴增方法

        1.3.1 快速直接PCR擴增

        實驗分為四組,第一組:10 μL反應體系,直徑0.5 mm FTA血卡為模板;第二組:10 μL反應體系,直徑1.0mm FTA血卡為模板;第三組:20 μL反應體系,直徑0.5 mm FTA血卡為模板;第四組:20 μL反應體系,直徑1.0mm FTA血卡為模板。

        四組所用熱循環(huán)參數:95℃ 3 min;95℃ 10 s,59℃ 15 s,72℃ 20 s,29 個循環(huán);72℃ 3 min;25℃保存。擴增總用時55min。

        1.3.2 常規(guī)直接PCR擴增

        1.4 電泳及數據分析

        取上述各PCR擴增產物1μL分別與10μL上樣混合物(20μL GeneScan LIZ500內標 +1000μL去離子甲酰胺)混合,用3130XL遺傳分析儀,按標準流程進行電泳分離,采用GeneMapper ID V 3.2軟件進行基因分型。

        圖1 10μL反應體系,直徑0.5mm FTA血卡為模板

        2 結果與討論

        如何縮短DNA分型檢測時間一直是法醫(yī)界學者們研究的焦點之一,例如,Verheij[2]等在 2012年將Thermo快速PCR試劑盒與AmpF?STRSGM PlusTM、AmpF?STRIdentifiler、AmpF?STRSEfilerPlusTM、AmpF?STRNGMTM分別組合,探索快速直接PCR擴增在法庭科學領域的應用。

        圖2 10μL反應體系,直徑1.0mm FTA血卡為模板

        圖3 20μL反應體系,直徑0.5mm FTA血卡為模板

        3 結論

        參考文獻:

        [1]Aboud M,Oh HH,McCord B.Rapid Direct PCR for Forensic genotyping in under 25 minutes[J].Electrophoresis,2013,34(11):1539-1547.

        [2]Verheij S, Harteveld J, Sijen T.A protocol for direct and rapid multiplex PCR amplification on forensically relevant samples[J].Forensic Science International: Genetics, 2012,6(2):167-75.

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