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        人多巴胺D2受體基因內(nèi)含子區(qū)51103 T/C多態(tài)性對(duì)基因轉(zhuǎn)錄活性的影響

        2014-03-06 06:01:24段朝霞張潔元陳魁君李曉霞王建民李兵倉(cāng)
        解放軍醫(yī)藥雜志 2014年11期
        關(guān)鍵詞:報(bào)告基因內(nèi)含子熒光素酶

        段朝霞,張潔元,陳魁君,李曉霞,王建民,李兵倉(cāng)

        多巴胺D2受體(DRD2)是多巴胺受體之一,屬于G蛋白偶聯(lián)家族,能通過(guò)與 Gi/Go偶聯(lián)抑制cAMP的形成,在體內(nèi)發(fā)揮重要作用。DRD2主要分布于紋狀體內(nèi),參與認(rèn)知、情緒、運(yùn)動(dòng)及內(nèi)分泌等多種功能活動(dòng)的調(diào)節(jié)[1]。人類DRD2基因位于第11號(hào)染色體,全長(zhǎng)270 kb,共有8個(gè)外顯子。大量研究證實(shí),DRD2基因多態(tài)性與創(chuàng)傷后應(yīng)激障礙(PTSD)、抑郁癥、精神分裂癥、藥物及酒精成癮等精神類疾病發(fā)生的易患性及藥物治療的敏感性相關(guān)[2-5]。本課題組前期的研究通過(guò)HapMap檢索發(fā)現(xiàn)DRD2基因第3內(nèi)含子區(qū)51 103 bp位點(diǎn)的rs2075652多態(tài)性可能與PTSD的易患性相關(guān),然而截至目前該位點(diǎn)的具體生物學(xué)機(jī)制還不十分清楚。鑒于此,本研究擬構(gòu)建含單核苷酸多態(tài)性(SNP)rs2075652位點(diǎn)的DRD2基因熒光素酶表達(dá)載體,為今后探索其生物學(xué)功能奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料 pmirGlo質(zhì)粒、海腎熒光素酶表達(dá)質(zhì)粒pRL-SV40、DNA純化試劑盒和雙熒光素酶報(bào)道基因試劑盒均為Promega公司產(chǎn)品;質(zhì)粒提取試劑盒、基因組DNA提取試劑盒購(gòu)自北京天根生物技術(shù)有限公司;高保真DNA聚合酶、膠回收試劑盒、T4 DNA連接酶購(gòu)于Takara公司(大連);限制性內(nèi)切酶Sac I、Xho I購(gòu)自NEB公司;脂質(zhì)體Lipofectine 2000TM為Invitrogen公司產(chǎn)品;DMEM、胎牛血清購(gòu)自Gibco;人胚腎癌細(xì)胞株HEK293購(gòu)自中國(guó)科學(xué)院細(xì)胞庫(kù),為本研究組保存,培養(yǎng)于含有 10%FBS的DMEM培養(yǎng)基中;感受態(tài)細(xì)胞E.coli DH5α和培養(yǎng)基等其他試劑均由南方中心實(shí)驗(yàn)室提供;PCR引物由上海生物工程有限公司合成;PCR產(chǎn)物和質(zhì)粒測(cè)序均由Takara公司(大連)完成。

        1.2 實(shí)驗(yàn)方法

        1.2.1 含rs2075652多態(tài)位點(diǎn)的第3內(nèi)含子區(qū)序列擴(kuò)增及純化:按照北京天根生物技術(shù)有限公司試劑盒說(shuō)明書(shū)提取人全血基因組DNA,經(jīng)核酸定量?jī)x定量后置于-70℃?zhèn)溆?。根?jù)DRD2基因組序列NC-000011.9 Reference GRCh37.p5 Primary Assembly(GenBank,上下游各延伸 10 kb的序列范圍:113270317~113356001),設(shè)計(jì)4條擴(kuò)增DRD2第3內(nèi)含子區(qū)序列及51 103 bp位點(diǎn)突變的引物。rs2075652-1:5' ctgcactggacactggggactctag 3',rs2075652-2:5'cttggggatccttgccggttact 3';rs2075652-M1:5'atcccaactaccatttgtaaagtgcttac 3';rs2075652-M2:5'gtaagcactttacaaatggtagttgggat 3'。以人全血基因組DNA為模板,先用rs2075652-1與rs2075652-2擴(kuò)增啟動(dòng)子區(qū)序列,并克隆至PTA2載體中,測(cè)序鑒定正確后,再雙酶切(Sac I+Xho I),然后亞克隆至pmir-Glo載體。含突變位點(diǎn)的序列則以PTA2-652質(zhì)粒為模板,以引物rs2075652-1和rs2075652-M1、引物rs2075652-2和rs2075652-M2分別進(jìn)行聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)后,再以兩段 PCR產(chǎn)物為模板,以rs2075652-1和rs2075652-2為引物,進(jìn)行融合PCR反應(yīng)。PCR反應(yīng)均采用25μl反應(yīng)體系進(jìn)行PCR擴(kuò)增,循環(huán)參數(shù)為:98℃ 5 min,98℃ 30 s,57℃ 30 s,72℃ 1 min 30 s,35 個(gè)循環(huán),72℃ 10 min。取 5 μl PCR產(chǎn)物行1.5%瓊脂糖凝膠電泳,并用膠回收試劑盒回收目的條帶。

        1.2.2 熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒的構(gòu)建及鑒定:膠回收的PCR產(chǎn)物與經(jīng)過(guò)改造的報(bào)告基因載體pmirGlo均以Sac I和Xho I雙酶切,對(duì)目的條帶采用膠回收并進(jìn)行純化。純化過(guò)的DNA片段和質(zhì)粒按2︰1的比例,在 T4 DNA連接酶作用下連接2 h,得到重組質(zhì)粒pmirGlo-DRD2-T和pmirGlo-DRD2-C。將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化DH5α細(xì)菌,于含氨芐西林的LB培養(yǎng)基平皿上進(jìn)行選擇培養(yǎng)。挑取其中3個(gè)克隆擴(kuò)增并經(jīng)Sac I和Xho I雙酶切和測(cè)序鑒定。測(cè)序工作由Takara公司(大連)完成。

        1.2.3 細(xì)胞轉(zhuǎn)染及熒光素酶轉(zhuǎn)錄活性測(cè)定:將處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的HEK293細(xì)胞經(jīng)胰酶消化后重懸,細(xì)胞密度為1.5×105個(gè)/ml,各取200 ml/孔接種于48孔板內(nèi),置于37℃、5%CO2孵育箱中培養(yǎng)。細(xì)胞匯合度為80%左右時(shí),將重組質(zhì)粒pmirGlo-DRD2-T和pmirGlo-DRD2-C轉(zhuǎn)染細(xì)胞,為校正孔間轉(zhuǎn)染效率,各組均用表達(dá)海腎熒光素酶報(bào)告基因質(zhì)粒pRLSV40同時(shí)進(jìn)行轉(zhuǎn)染,每個(gè)樣品設(shè)3個(gè)重復(fù)孔。轉(zhuǎn)染采用脂質(zhì)體法:首先形成Lipofectine-DNA復(fù)合物,室溫靜置20 min后,將Lipofectine-DNA復(fù)合物加入細(xì)胞培養(yǎng)液中,培養(yǎng)6 h后更換成含10%血清的培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)48 h后收集細(xì)胞,檢測(cè)熒光強(qiáng)度,實(shí)驗(yàn)結(jié)果取各次平均值。

        1.2.4 雙熒光素酶報(bào)告基因監(jiān)測(cè)系統(tǒng)檢測(cè)熒光素酶活性:取細(xì)胞裂解液20μl,在其中加入100μl的Firefly luciferase檢測(cè)試劑,混勻后立即在化學(xué)發(fā)光儀中檢測(cè)發(fā)光值,記錄10 s時(shí)的值(對(duì)應(yīng)于Firefly的表達(dá)水平);然后再加入100μl的stop&Glo試劑,同樣檢測(cè)10 s時(shí)的化學(xué)發(fā)光值(對(duì)應(yīng)于Renilla熒光素酶的表達(dá)水平),以二者比值(F/R)為校正后的結(jié)果,實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 應(yīng)用SPSS 17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,所有數(shù)據(jù)以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(x±s)表示,采用單因素方差分析,α=0.05為檢驗(yàn)水準(zhǔn)。

        2 結(jié)果

        2.1 含rs2075652多態(tài)位點(diǎn)的第3內(nèi)含子區(qū)序列PCR擴(kuò)增 將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行1.5%瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下可見(jiàn)1條明顯的DNA條帶位于399 bp附近,與所需擴(kuò)增片段大小相符,且無(wú)非特異性擴(kuò)增片段,此條帶即為設(shè)計(jì)擴(kuò)增含rs2075652位點(diǎn)T的目的片段(見(jiàn)圖1A)。將目的片段克隆至PTA2載體中,進(jìn)行測(cè)序鑒定。再以PTA2-652質(zhì)粒為模板,以引物rs2075652-1和rs2075652-M1、引物rs2075652-2和rs2075652-M2分別進(jìn)行PCR擴(kuò)增,分別擴(kuò)出278 bp和189 bp的目的條帶(見(jiàn)圖1B);再以兩段 PCR產(chǎn)物為模板,以 rs2075652-1和rs2075652-2為引物,進(jìn)行融合 PCR反應(yīng),擴(kuò)增出399 bp的含rs2075652突變位點(diǎn)C的目的條帶(見(jiàn)圖1C)。

        圖1 含rs2075652-多態(tài)位點(diǎn)的第3內(nèi)含子區(qū)序列PCR擴(kuò)增產(chǎn)物A.用rs2075652-1和rs2075652-2引物、人基因組DNA為模板擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物;M.DL2000 DNA Marker,1.擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物。B.用rs2075652-1、rs2075652-M1和 rs2075652-M2、rs2075652-2兩對(duì)引物分別擴(kuò)增的 PCR產(chǎn)物;M.DL2000 DNA Marker,1.rs2075652-1、rs2075652-M1擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物,2.rs2075652-M2、rs2075652-2擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物。C.用rs2075652-1和rs2075652-2為引物、B的兩種PCR產(chǎn)物為模板擴(kuò)增的融合PCR產(chǎn)物;M.DL2000 DNA Marker;1.融合擴(kuò)增的PCR產(chǎn)物

        2.2 重組質(zhì)粒的酶切鑒定 重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染大腸桿菌克隆、培養(yǎng),隨機(jī)挑取3個(gè)單菌落中的少許菌體為模板進(jìn)行擴(kuò)增并經(jīng)Sac I和Xho I雙酶切鑒定結(jié)果見(jiàn)圖2,得到大小為7 kb左右的pmirGlo質(zhì)粒片段和含rs2075652 T和rs2075652 C的第3內(nèi)含子區(qū)的目的條帶。1號(hào)克隆送公司進(jìn)行測(cè)序分析,其測(cè)序結(jié)果與GenBank中的DRD2基因啟動(dòng)子序列比對(duì)后完全一致,證實(shí)重組質(zhì)粒載體構(gòu)建成功,測(cè)序結(jié)果(常見(jiàn)多態(tài)位點(diǎn)為反向測(cè)序,突變位點(diǎn)為正向測(cè)序)見(jiàn)圖3。

        圖2 多巴胺D2受體-T和多巴胺D2受體-C重組質(zhì)粒的雙酶切鑒定M.DL15000 DNA Marker;1.pmirGlo-DRD2-T質(zhì)粒雙酶切;2.pmirGlo-DRD2-C質(zhì)粒雙酶切

        2.3 熒光素酶報(bào)告基因轉(zhuǎn)錄活性 轉(zhuǎn)染pmirGlo-DRD2-C質(zhì)粒的細(xì)胞裂解液中熒光素酶活性(0.542±0.004)強(qiáng)于轉(zhuǎn)染pmirGlo-DRD2-T質(zhì)粒的細(xì)胞裂解液(0.474±0.016),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.002),見(jiàn)圖4。

        3 討論

        DRD2是最受關(guān)注、也是研究最多的多巴胺受體之一。既往研究顯示,DRD2是與PTSD關(guān)系最為密切的多巴胺受體,因?yàn)榇蠖鄶?shù)經(jīng)典的抗精神病藥物的藥理學(xué)作用中都有拮抗DRD2的作用,且藥物效價(jià)與拮抗強(qiáng)度有關(guān)。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)證實(shí)邊緣系統(tǒng)中杏仁核等區(qū)域的多巴胺能神經(jīng)元對(duì)創(chuàng)傷應(yīng)激高度敏感[6]。在中樞應(yīng)用DRD2激動(dòng)劑阿撲嗎啡可以降低白鼠實(shí)驗(yàn)性創(chuàng)傷應(yīng)激后的死亡率,而多巴胺受體阻滯劑舒必利則有相反的效果,而PTSD患者的尿中多巴胺及其代謝產(chǎn)物高香草醛酸濃度增高,其水平與癥狀嚴(yán)重程度相關(guān)[7]。PTSD患者中樞神經(jīng)多巴胺系統(tǒng)可能存在缺陷,而無(wú)法適宜地應(yīng)對(duì)創(chuàng)傷應(yīng)激,導(dǎo)致暫時(shí)或持續(xù)性的精神異常癥狀。因此,DRD2基因改變可能是導(dǎo)致各種精神異常行為、精神及神經(jīng)系統(tǒng)疾病發(fā)生的重要原因[8-10]。

        自被發(fā)現(xiàn)以來(lái),內(nèi)含子一直是人們爭(zhēng)論的焦點(diǎn)。因內(nèi)含子屬于非編碼序列,曾一度被認(rèn)為其存在沒(méi)有任何意義,是無(wú)用基因,因此目前對(duì)內(nèi)含子的功能還知之甚少。然而越來(lái)越多的研究發(fā)現(xiàn)內(nèi)含子并不是基因組的“垃圾”,而是在基因表達(dá)調(diào)控中有重要的生物學(xué)功能。另外,在原核生物基因中不存在內(nèi)含子或含有少量的內(nèi)含子,而在真核生物基因中內(nèi)含子的存在是普遍現(xiàn)象,內(nèi)含子的長(zhǎng)度遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于外顯子,甚至在人類基因組中非編碼序列占到95% ~97%[11]。由此可見(jiàn),生物進(jìn)化程度越高,其內(nèi)含子所含比例也越高,這也進(jìn)一步說(shuō)明內(nèi)含子是具有重要生物學(xué)功能的。對(duì)于內(nèi)含子的功能,目前普遍認(rèn)為它們與基因的表達(dá)調(diào)控有關(guān),如內(nèi)含子含有增強(qiáng)子或其他順式作用元件,促進(jìn)轉(zhuǎn)錄的起始或延伸,增加了mRNA在核內(nèi)的穩(wěn)定性,可充當(dāng)啟動(dòng)子等。因含有增強(qiáng)啟動(dòng)子的序列,在一些基因中,內(nèi)含子可增強(qiáng)基因轉(zhuǎn)錄的起始反應(yīng)。內(nèi)含子由于含有增強(qiáng)子的組分,或由于拼接體及多聚腺昔酸化作用保護(hù)mRNA前體,使其免受RNA酶的作用,增強(qiáng)了基因的表達(dá)。在另一些基因中,內(nèi)含子可抑制轉(zhuǎn)錄的延長(zhǎng),轉(zhuǎn)錄衰減位點(diǎn)可能位于內(nèi)含子上,從而導(dǎo)致基因的失活[12]。

        報(bào)告基因是一種編碼可供檢測(cè)的酶或蛋白質(zhì)的基因,是基因表達(dá)調(diào)控研究的一個(gè)重要工具,通過(guò)測(cè)定報(bào)告基因的表達(dá)產(chǎn)物,可以推測(cè)出該DNA片段在基因表達(dá)調(diào)控中的作用[13]。本研究采用高保真PCR法從人全血基因組中擴(kuò)增出了DRD2基因第3內(nèi)含子區(qū)399 bp的含rs2075652多態(tài)位點(diǎn)的序列,并將其分別克隆到pmirGlo-Basic質(zhì)粒的多克隆位點(diǎn)中,成功構(gòu)建了人 pmirGlo-DRD2-T和 pmirGlo-DRD2-C熒光素酶報(bào)告基因,并證實(shí)了rs2075652多態(tài)位點(diǎn)由T突變?yōu)镃后,熒光素酶活性增強(qiáng),說(shuō)明DRD2基因第3內(nèi)含子區(qū)55 103位點(diǎn)可能為轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)位點(diǎn)或具有增強(qiáng)子活性,為研究DRD2基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制提供了基礎(chǔ),但其增強(qiáng)轉(zhuǎn)錄活性的具體分子機(jī)制還有待于進(jìn)一步深入研究證實(shí)。

        圖3 重組質(zhì)粒的pmir Glo-DRD2-T和pmir Glo-DRD2-C的測(cè)序結(jié)果

        圖4 重組質(zhì)粒pmir Glo-DRD2-T和pmir Glo-DRD2-C熒光素酶活性比較結(jié)果b P<0.01

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