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        肺癌患者外周血AKAP12基因甲基化水平的檢測及意義

        2014-02-09 07:31:36廖和和張云鋒吳樹強李寒春
        重慶醫(yī)學 2014年15期
        關(guān)鍵詞:肺癌檢測

        廖和和,張云鋒,吳樹強,李寒春,金 磊,任 宏

        (1.陜西省核工業(yè)215醫(yī)院腫瘤外科,陜西咸陽712000;2.西安交通大學第一附屬醫(yī)院胸外科,西安710061;3.西安醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院胸外腫瘤科,西安710077)

        A激酶錨定蛋白12(A-kinase anchoring protein 12,AKAP12),在1992年由Gordon等[1]從重癥肌無力患者的血清中分離得到。AKAP12能夠錨定一些重要信號蛋白,參與了信號轉(zhuǎn)導、G蛋白偶聯(lián)受體蛋白信號轉(zhuǎn)導、蛋白定向以及細胞凋亡等過程[2-3]。國內(nèi)外研究發(fā)現(xiàn),AKAP12在多種腫瘤中表達下降或缺失[4-5],能夠抑制腫瘤發(fā)生與轉(zhuǎn)移[6-7]。目前,研究發(fā)現(xiàn),外周血中存在高水平的游離DNA,其中很大一部分來源于凋亡或者壞死的腫瘤細胞,因此,檢測血液標本中異常甲基化的DNA,能對疾病的診斷、預后及復發(fā)等提供新思路[8]。本研究采用甲基化特異-高分辨融解曲線法(MS-HRM)檢測肺癌外周血細胞游離DNA中AKAP12基因甲基化程度,并結(jié)合患者病理參數(shù)進行分析研究,現(xiàn)報道如下。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 收集2009年1月至2011年12月在陜西省核工業(yè)215醫(yī)院和西安醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院就診的60例肺癌患者,其中男32例,女28例,年齡28~76歲,平均(48.0±12.6)歲;均經(jīng)病理確診,Ⅰ期9例,Ⅱ期19例,Ⅲ期29例,Ⅳ3例;分化好及中等34例,分化差26例。收集患者外周血2~3 mL,分離去血清,-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2 試劑與材料 QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit、Hot Star Taq Master Mix(Qiagen 公 司),EZ DNA Methylation-Gold Kit(ZYMO 公司),SYTO 9Green Fuorescent Nucleic Acid Stain(Invitrogen公司),CpGenome Universal Methylated DNA(Millipore公司)。PCR基因擴增儀(Bio-Rad公司),Rotor-Gene 6000熒光定量 PCR 儀(Corbett公司),NanoDrop ND-2000分光光度計(Thermo公司)。

        1.3 方法

        1.3.1 DNA提取 分離血清,用QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit提取細胞游離DNA,NanoDrop ND-2000(超微量紫外分光光度儀上)檢測DNA濃度及質(zhì)量,要求光密度(OD)值(A260/A280)約為1.80~2.00,調(diào)整DNA濃度至10ng/μL。1.3.2 甲基化修飾 取上述DNA樣本1ng,使用EZ DNA Methylation Gold Kit,按照說明書進行甲基化修飾。

        1.3.3 引物設計 使用軟件MethyPrimer設計引物,引物由上海吉瑪制藥技術(shù)有限公司合成。上游引物序列:5′-GGC GGT TGT TTG GAT TTG GGT T-3′,長度83bp,下游引物序列:5′-AAC ACG CCC TAC AAC AAC ATC TA-3′),長度83bp。

        1.3.4 構(gòu)建標準品 以 CpGenome Universal Methylated DNA(Millipore公司)作為100%甲基化的標準品,以100%非甲基化的健康人外周血DNA作為稀釋劑,按不同比例搭配制成100% 、80%、60%、40%、20% 、10%、5%、1% 和 0 甲 基 化 程度的標準品,進行下一步的HRM曲線分析后得到標準曲線圖。

        1.3.5 MS-HRM測定 AKAP12啟動子區(qū)甲基化擴增條件:預變性95℃5min,1個循環(huán);94℃30s,56℃30s,72℃30s,35個循環(huán),72℃5min延伸。使用PCR基因擴增儀擴增后,使用Rotor-Gene 6000進行高分辨率熔解曲線分析:樣本經(jīng)95℃2min,40℃2min預處理后,溶解時溫度由76℃逐漸升高到88℃,每升高0.1℃需記錄數(shù)值。獲得 MS-HRM曲線圖。待測標本需按照標準曲線上來測定其甲基化程度。

        1.3.6 重復性檢測 HRM方法檢測重復性,采用取100%~0系列濃度的甲基化標準品重復檢測2次,觀察HRM曲線的相符程度。

        1.4 統(tǒng)計學處理 采用SPSS13.0統(tǒng)計軟件進行分析。計數(shù)資料以率(%)表示,AKAP12甲基化與病理參數(shù)比較,采用χ2檢驗分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結(jié) 果

        2.1 MS-HRM標準曲線和重復性試驗結(jié)果 分別將100%~0甲基化標準品基因擴增后進行HRM曲線檢測,得到標準曲線圖(圖1)。待測標本的甲基化程度可參照100%~0系列濃度曲線中的相應曲線得出。同時,取100%~0甲基化標準品重復檢測2次,得到的HRM曲線形狀基本一致。

        圖1 MS-HRM法檢測AKAP12基因甲基化程度的標準曲線圖

        2.2 MS-HRM檢測AKAP12基因甲基化結(jié)果 從60例肺癌患者標本中檢出34例(56.7%)AKAP12基因甲基化,其中,18例(52.9%)甲基化程度為1%~20%,14例(41.2%)為20%~60%,2例(5.88%)為60%~100%。

        2.3 外周血AKAP 12基因甲基化與患者病理參數(shù)相關(guān)性檢測 外周血中AKAP12基因甲基化水平在不同患者年齡和性別中比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05);而與肺癌的病理分期和分化程度比較,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),見表2。

        表2 外周血AKAP12基因甲基化與肺癌患者關(guān)系

        續(xù)表2 外周血AKAP12基因甲基化與肺癌患者關(guān)系

        3 討 論

        近年來,關(guān)于體液中(血液、尿液、唾液及痰液等)細胞游離DNA的研究得到越來越多的關(guān)注。目前,認為腫瘤患者血液游離DNA主要來自凋亡細胞、腫瘤細胞以及淋巴細胞等,其中來源于凋亡細胞或壞死腫瘤細胞占較大比例(可高達93%)[8]。目前,國內(nèi)外研究發(fā)現(xiàn),體液游離DNA抑癌基因啟動子CpG島的異常高甲基化常常與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、預后以及復發(fā)等密切相關(guān)[9-11]。因此,體液標本中游離DNA甲基化水平可以為腫瘤早期篩查、早期診斷、轉(zhuǎn)移及復發(fā)監(jiān)測的一項重要指標,并能有助于早期發(fā)現(xiàn)有癌變傾向的細胞[12]。

        AKAP12能夠錨定一些重要信號蛋白,主要參與蛋白激酶A(protein kinase A,PKA)、蛋白激酶 C(protein kinase C,PKC)復合物的形成,細胞骨架的重塑,β2腎上腺素受體復合物的調(diào)節(jié)及細胞凋亡等過程[2-3]。國內(nèi)外研究發(fā)現(xiàn),AKAP12在多種腫瘤中表達下降或缺失,可見于黑色素瘤、乳腺癌、視網(wǎng)膜母細胞瘤、食管腺癌、骨肉瘤、前列腺癌、胃癌、血液系統(tǒng)惡性腫瘤等[4-5],提示 AKAP12可能為一種潛在的抑癌基因。此外,研究還發(fā)現(xiàn)AKAP12具有抑制腫瘤發(fā)生與轉(zhuǎn)移,阻滯細胞周期以及促進細胞凋亡等作用[13-14]。目前,已經(jīng)在多種腫瘤中發(fā)現(xiàn)AKAP12的高甲基化現(xiàn)象,Choi等[15]在胃癌組織和細胞株中發(fā)現(xiàn)高甲基化(56%)的存在,且與AKAP12表達缺失相對應。

        本研究通過建立MS-HRM,檢測50例肺癌患者外周血游離DNA中AKAP12啟動子的甲基化狀況,以此探討肺癌患者外周血AKAP12高甲基化與腫瘤發(fā)生的關(guān)系。MS-HRM作為一種先進的技術(shù)手段,具有較高的靈敏度、特異性和重復性,利用此方法可以檢測出最低1%的基因甲基化,這大大提高了肺癌的檢出率,有利于進行高危人群的篩選,早期診斷,轉(zhuǎn)移和復發(fā)的監(jiān)測。本研究結(jié)果顯示,34例(56.7%)肺癌患者標本中檢出AKAP12基因甲基化,其中,18例(52.9%)甲基化程度為1%~20%,14例(41.2%)為20%~60%,2例(5.88%)為60%~100%。隨后,筆者研究了肺癌患者外周血AKAP12基因甲基化水平與病理參數(shù)的相關(guān)性,研究表明患者年齡、性別與AKAP12甲基化水平比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05);而肺癌的病理分期和分化程度與AKAP12甲基化水平比較,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05),提示AKAP12的甲基化與肺癌的進展有關(guān),可以用來評估肺癌的分期和惡性程度。

        綜上所述,腫瘤中抑癌基因的高甲基化現(xiàn)象普遍存在,單個基因的甲基化往往不能完整反映腫瘤的基本情況,而進一步研究表明每種抑癌基因都存在不同的啟動子甲基化模式,因此,對于AKAP12基因啟動子甲基化研究為臨床上多方面、多角度監(jiān)測腫瘤提供了一個重要指標。

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