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        廣西扶綏肝細(xì)胞癌家系XRCC1基因Arg194Trp多態(tài)性與肝細(xì)胞癌遺傳易患性關(guān)系的病例對(duì)照研究

        2014-02-09 03:38:53謝裕安
        中國全科醫(yī)學(xué) 2014年33期
        關(guān)鍵詞:家系等位基因多態(tài)性

        丁 飛,謝裕安

        原發(fā)性肝癌是我國最常見的惡性腫瘤之一,發(fā)病率約為歐美地區(qū)的10倍,病死率位列我國惡性腫瘤第二位。因其起病隱匿,早期可無任何癥狀,發(fā)現(xiàn)時(shí)病情已多為中、晚期,導(dǎo)致治療和預(yù)后均較差。我國原發(fā)性肝癌中,肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)占90%。目前已證實(shí)人群HBV/HCV感染、黃曲霉素毒B1(aflatoxin B1,AFB1)的攝入、飲水污染等與HCC的發(fā)生密切相關(guān),而遺傳易患性導(dǎo)致的個(gè)體HCC發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的不同也日益受到關(guān)注。

        DNA分子作為遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ),其結(jié)構(gòu)和功能的完整性對(duì)于維持機(jī)體的正常生理功能和遺傳穩(wěn)定性至關(guān)重要。如果細(xì)胞DNA損傷反應(yīng)機(jī)制發(fā)生異常,將會(huì)導(dǎo)致個(gè)體的癌癥易患性顯著增加。XRCC1(X-ray cross complementing group 1)是一種重要的DNA修復(fù)基因,其編碼的蛋白質(zhì)在堿基切除修復(fù)(base excision repair,BER)和DNA單鏈斷裂修復(fù)的過程中起重要作用。因此,目前認(rèn)為XRCC1的多態(tài)性可能改變DNA修復(fù)的功能和效率,使環(huán)境因素致癌的風(fēng)險(xiǎn)增加。目前對(duì)XRCC1的單核苷酸多態(tài)性研究最多的3個(gè)位點(diǎn)分別位于第6、9、10外顯子中,依次為C26304T、G27466A和G28152A,分別導(dǎo)致相應(yīng)氨基酸殘基的改變(Arg194Trp、Arg280His和Arg194Trp)[1]。大量的臨床流行病學(xué)資料顯示,上述3個(gè)位點(diǎn)的基因多態(tài)性與個(gè)體發(fā)生某些腫瘤的危險(xiǎn)性有關(guān)。其中,在對(duì)XRCC1基因多態(tài)性與HCC易患性的研究方面,大多集中在399位點(diǎn),而對(duì)194位點(diǎn)的研究較少。因此,為進(jìn)一步探討XRCC1基因Arg194Trp多態(tài)性與HCC遺傳易患性之間的關(guān)系,本研究選取我國HCC高發(fā)地區(qū)之一的廣西扶綏縣HCC家系人群與當(dāng)?shù)卣<蚁等巳哼M(jìn)行病例對(duì)照研究。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料 采用病例對(duì)照研究方法,于2003年1月—2011年5月在廣西扶綏縣采集21個(gè)HCC家系(HCC家系組,76例),于2011年1—5月在與HCC家系相同的自然村采集20個(gè)對(duì)照家系(對(duì)照組,76例)。HCC家系組年齡16~86歲,平均(45.6±14.8)歲;男42例,女34例;HBsAg陽性48例,HBsAg陰性28例;甲胎蛋白(AFP)陽性13例,陰性63例;吸煙(≥1包/d)6例,不吸煙(<1包/d)70例;飲酒(≥250 g/d)6例,不飲酒(<250 g/d)70例。對(duì)照組年齡16~85歲,平均(48.0±16.6)歲;男56例,女20例;HBsAg、AFP均陰性;吸煙34例,不吸煙42例;飲酒34例,不飲酒42例。HCC家系由HCC患者(A組,21例)及與其有血緣關(guān)系的直系親屬(B組,55例)共同組成,其中HCC患者為廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院進(jìn)行外科手術(shù)的扶綏縣患者,術(shù)后經(jīng)組織病理學(xué)診斷為HCC,術(shù)前未經(jīng)放射、化學(xué)或生物治療,且經(jīng)病史采集提示其直系親屬中至少已有1人確診HCC。對(duì)照家系(C組)與HCC家系無血緣關(guān)系,且其家庭結(jié)構(gòu)、成員數(shù)與HCC家系相似,體檢結(jié)果均正常,無肝炎病史、腫瘤病史、腫瘤家族史。

        1.2 方法 本研究采取匹配設(shè)計(jì),通過嚴(yán)格選擇受檢者,經(jīng)不同人員對(duì)具體信息進(jìn)行核實(shí)和檢查以及對(duì)潛在的混淆因素進(jìn)行校正來控制偏倚。然后檢測各組受檢者XRCC1 Arg194Trp基因型。

        1.2.1 DNA提取 按照天根生化科技(北京)有限公司生產(chǎn)的試劑盒說明,從手術(shù)切除的癌組織標(biāo)本或外周血標(biāo)本中提取XRCC1的基因組DNA。

        1.2.2 XRCC1 Arg194Trp基因型分析 以限制性片段長度多態(tài)性聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR-RFLP)方法進(jìn)行XRCC1基因Arg194Trp多態(tài)性分析。參照文獻(xiàn)[2]設(shè)計(jì)引物序列:上游引物5′-GCCCCGTCCCAGGTA-3′,下游引物5′-AGCCCCAAGACCCTTTCACT-3′,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。

        PCR反應(yīng)體系:1 μl模板DNA,2×Taq PCR MasterMix 12.5 μl,上游引物1 μl,下游引物1 μl,加雙蒸水(ddH2O)到反應(yīng)體系為25 μl。反應(yīng)條件:95 ℃預(yù)變性5 min,95 ℃變性30 s、59 ℃復(fù)性30 s、72 ℃延伸30 s(進(jìn)行30個(gè)循環(huán)),72 ℃最后延伸5 min。

        RFLP酶切反應(yīng)體系:10×Buffer 1 μl、PCR產(chǎn)物6.5 μl、10 μg/μl小牛血清(BSA)0.1 μl、10 U/μl PvuⅡ內(nèi)切酶0.8 μl、滅菌去離子水1.6 μl,總反應(yīng)體系為10 μl。放入37 ℃恒溫儀溫育4 h。酶切產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳,于Thermo熒光成像儀下觀察結(jié)果。同時(shí),PCR產(chǎn)物送測序(上海英駿生物技術(shù)有限公司)。

        結(jié)果判斷:XRCC1密碼子194位點(diǎn)存在野生型Arg和突變型Trp兩種等位基因,野生型純合子Arg/Arg(CC基因型)不能被限制性內(nèi)切酶PvuⅡ酶切,只有一個(gè)長491 bp的片段;突變型純合子Trp/Trp(TT基因型)能完全被限制性內(nèi)切酶PvuⅡ酶切,產(chǎn)生分別為197 bp和294 bp的兩個(gè)片段;突變型雜合子Arg/Trp(CT基因型)酶切后則產(chǎn)生分別為197、294、491 bp的3個(gè)片段。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 根據(jù)Hardy-Weinberg遺傳平衡定律進(jìn)行吻合度檢驗(yàn)。采用SPSS 17.0軟件包進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。以比值比(OR)及95%可信區(qū)間(CI)表示各種基因型與發(fā)生HCC風(fēng)險(xiǎn)之間的相關(guān)性。OR值以非條件Logistic回歸法計(jì)算,所有統(tǒng)計(jì)采用雙側(cè)概率檢驗(yàn),以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 酶切結(jié)果 XRCC1基因Arg194Trp多態(tài)性的各基因型通過凝膠電泳分析鑒定并經(jīng)測序證實(shí):圖1為Arg194Trp的PCR擴(kuò)增的目的片段(491 bp);圖2為Arg194Trp的PCR產(chǎn)物的RFLP分析;圖3~5為不同基因型的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的DNA測序分析結(jié)果。

        注:M為Marker 2,1~10為PCR產(chǎn)物(491 bp)
        圖1 XRCC1基因Arg194Trp PCR擴(kuò)增目的片段
        Figure1 PCR amplification of XRCC1 gene C26304T site Arg194Trp

        注:M為Marker DL2000,第2、5、12泳道為CT基因型,第4、6泳道為TT基因型,其他泳道均為CC基因型
        圖2 XRCC1基因Arg194Trp PCR-RFLP分析
        Figure2 Genotyping of XRCC1 gent C26304T site Arg194Trp polymorphism by PCR-RFLP analysis

        圖3 XRCC1基因194位點(diǎn)DNA測序分析(CC基因型)Figure 3 DNA sequencing of XRCC1 gene site 194(CC genotype)

        圖4 XRCC1基因194位點(diǎn)DNA測序分析(TT基因型)Figure 4 DNA sequencing of XRCC1 gene site 194(TT genotype)

        圖5 XRCC1基因194位點(diǎn)DNA測序分析(CT基因型)Figure 5 DNA sequencing of XRCC1 gene site 194(CT genotype)

        2.2 XRCC1基因194位點(diǎn)基因型吻合度檢驗(yàn) 經(jīng)Hardy-Weinberg遺傳平衡定律檢驗(yàn),各組人群中XRCC1 Arg194Trp等位基因型頻率與期望值吻合度較好(A組:χ2=1.80,P=0.18;B組:χ2=1.51,P=0.22;C組:χ2=1.70,P=0.19),符合 Hardy-Weinberg遺傳平衡,表明具有良好的代表性。

        2.3 XRCC1 Arg194Trp基因型分布及等位基因分布 3組受檢者中XRCC1基因194位點(diǎn)基因型分布及等位基因頻率比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);其中A組基因型分布及等位基因頻率與C組比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義〔P<0.012 5(α′),見表1〕。

        2.4 XRCC1基因194位點(diǎn)基因多態(tài)性與HCC的關(guān)系 采用非條件Logistic回歸分析,對(duì)性別、年齡、吸煙和飲酒4個(gè)因素進(jìn)行校正,結(jié)果發(fā)現(xiàn)B組CT、TT基因型個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)分別是CC基因型個(gè)體的0.473倍和0.426倍。C組CT、TT基因型個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)分別是CC基因型個(gè)體的0.206倍和0.240倍??梢?,CT、TT基因型個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)可能較CC基因型個(gè)體減低,但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05,見表2)。

        3 討論

        腫瘤的發(fā)生、發(fā)展是一個(gè)多基因、多細(xì)胞、多階段的過程,與個(gè)體遺傳和外部環(huán)境的作用關(guān)系密切。由于外部環(huán)境損傷機(jī)體主要是通過DNA發(fā)揮作用,因此,DNA損傷后是否能夠得到及時(shí)、準(zhǔn)確的修復(fù)對(duì)于防止細(xì)胞癌變至關(guān)重要。BER是DNA損傷后最主要的修復(fù)機(jī)制之一,涉及切除損傷堿基和核心BER反應(yīng)兩個(gè)重要過程,由多種蛋白參與,其中XRCC1起重要作用[3]。XRCC1自身不具有催化酶的活性,但其編碼的蛋白與DNA聚合酶β、DNA連接酶Ⅲ、多聚ADP核糖聚合酶(PARP)結(jié)合形成復(fù)合體,發(fā)揮重要的支架蛋白作用,參與BER和DNA單鏈斷裂修復(fù)[4-5]。目前研究已發(fā)現(xiàn)XRCC1基因的多態(tài)性與食管癌、胃癌、結(jié)腸癌、肺癌等多種腫瘤的發(fā)生存在相關(guān)性,如Xing等[6]對(duì)XRCC1基因194位點(diǎn)的研究發(fā)現(xiàn)攜帶TT基因型者比攜帶CC、CT基因型者發(fā)生鱗狀細(xì)胞食管癌的危險(xiǎn)性增加;Hung等[7]研究發(fā)現(xiàn),CC基因型個(gè)體與肺癌風(fēng)險(xiǎn)無相關(guān)性。在對(duì)XRCC1基因多態(tài)性與HCC易患性的研究方面,Kiran等[8]在印度人群中進(jìn)行的研究結(jié)果顯示,Arg194Trp、Arg280His基因多態(tài)性會(huì)增加患肝炎相關(guān)HCC的風(fēng)險(xiǎn),當(dāng)Arg280His與Arg194Trp或Arg399Gln聯(lián)合作用時(shí)患肝炎相關(guān)HCC的風(fēng)險(xiǎn)將顯著提高。

        本研究選取我國HCC高發(fā)地區(qū)之一的廣西扶綏縣HCC家系人群為研究對(duì)象。研究結(jié)果顯示,HCC家系中未患HCC者CT基因型個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)是CC基因型個(gè)體的0.473倍〔95%CI(0.117,1.914)〕;TT基因型個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)是CC基因型個(gè)體的0.426倍〔95%CI(0.064,2.858)〕。對(duì)照家系中CT基因型個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)是CC基因型的0.206倍〔95%CI(0.035,1.201)〕;TT基因型個(gè)體發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)是CC基因型個(gè)體的0.240倍〔95%CI(0.027,2.168)〕。無論是對(duì)照家系還是HCC家系人群中,CT基因型和TT基因型的個(gè)體較CC基因型發(fā)生HCC的風(fēng)險(xiǎn)差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,故結(jié)果僅提示T等位基因可能會(huì)減低HCC的發(fā)生。

        HCC的發(fā)生是遺傳因素和環(huán)境因素共同作用的結(jié)果,其中作為分子遺傳學(xué)基礎(chǔ)的遺傳因素可以改變個(gè)體對(duì)環(huán)境中致HCC因素的易患性。對(duì)于XRCC1基因Arg194Trp多態(tài)在不同人群、不同地區(qū)的研究結(jié)果出現(xiàn)的分歧,可能與其遺傳背景、生活地域、習(xí)慣及環(huán)境中接觸的致癌物不同有關(guān)。

        表1 3組受檢者中XRCC1 Arg194Trp基因型分布及等位基因頻率比較〔n(%)〕Table 1 Comparison of genotype distribution and allele frequency of XRCC1 Arg194Trp

        注:C組基因型與A組比較,χ2=12.091,P=0.002;C組等位基因頻率與A組比較,χ2=8.294,P=0.004

        表2 XRCC1 Arg194Trp基因型與HCC患病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系〔n(%)〕Table 2 Association between XRCC1 Arg194Trp genotype and HCC

        注:ref代表參照,即以CC基因型作為參照;-無數(shù)據(jù);*表示B組與A組比較,△表示C組與A組比較

        綜上所述,本研究尚未發(fā)現(xiàn)XRCC1基因Arg194Trp多態(tài)性與HCC發(fā)病具有相關(guān)性,但提示CT基因型和TT基因型的個(gè)體患HCC的風(fēng)險(xiǎn)可能較CC基因型的個(gè)體減低。本研究未得到預(yù)期的陽性結(jié)果的主要原因,可能與收集到的樣本量不夠大有關(guān)。如果在今后的研究中加大HCC家系人群樣本量的收集,繼續(xù)上述研究可能會(huì)得到預(yù)期的陽性結(jié)果。另外,本研究結(jié)果對(duì)于進(jìn)一步研究扶綏縣乃至其他地區(qū)HCC高危人群的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)提供了分子遺傳學(xué)的依據(jù),并對(duì)HCC的預(yù)防具有一定的參考意義。

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