亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        鵝細小病毒PCR-DHPLC檢測方法的建立

        2014-01-21 01:17:06饒桂波邵洪澤胡桂學吳健敏
        家畜生態(tài)學報 2014年5期
        關鍵詞:電泳敏感性引物

        饒桂波,邵洪澤,胡桂學*,吳健敏

        (1.廣西獸醫(yī)研究所,廣西南寧530001;2.吉林省獸醫(yī)科學研究所,吉林長春130062;3.吉林農業(yè)大學,吉林長春130118)

        目前診斷鵝細小病毒(GPV)的主要方法有瓊脂擴散試驗、免疫熒光抗體試驗、黃牛精子抑制試驗、ELISA 和PCR 等[1-4]。近年來將變性高效液相色譜法(DHPLC)與PCR 方法結合用于微生物的檢測,使PCR 方法的敏感度提高了100倍,大大提高了樣品的檢出率[5-6]。為了解決鵝群中因GPV 排毒量低而難以檢出的問題,本研究擬建立一種敏感性更高的GPV PCR-DHPLC 檢測方法,用于鵝群中GPV 的檢測,為臨床GPV 感染的檢測,提供一種特異、敏感、快速、高通量的檢測手段。

        1 材料與方法

        1.1 毒株

        GPV JLDA 株,由吉林省畜牧獸醫(yī)科學研究院贈送;GPV JLTP株,由本實驗室分離保存。

        1.2 試劑

        Taq DNA Polymerase、dNTPs、100 bp DNA Ladder、T4DNA 連接試劑盒、pMD18-T 載體等,購自寶生物工程有限公司(大連)。

        1.3 引物設計

        根據GenBank中VP3 的基因序列,用Primer Premier 5.0軟件設計引物,序列如下:P1:5'-ATA AGCGCC TTTCACAGC-3',P2:5'-AACGCAGGATCAGACGAA-3',由寶生物工程有限公司(大連)合成。

        1.4 PCR 體系建立

        采用50μL 反應體系,在0.5 mL 反應管中依次加Buffer 5μL、2.5mmol/L dNTPs 2μL、滅菌二餾水35μL、2U/μL Taq酶1μL、20pmol/μL上游引物、下游引物各1μL、模板5μL?;靹蚝笊噪x心,通過梯度PCR 確定反應條件。

        1.5 DHPLC條件選擇

        根據變性高效液相色譜儀Aglient 1100 色譜柱:PS.DVB&C18DNASep色譜柱(4.6mm ×50 mm,粒度3mm)。利用儀器軟件,根據目的基因序列的大小,堿基比率等預測柱溫。在柱溫確定后,摸索流動液體配比及流速,確定最佳條件。

        1.6 PCR-DHPLC特異性分析

        提取鵝副粘病毒、鴨瘟病毒及正常番鴨胚尿囊液的核酸進行PCR,按照1.4 的體系條件對PCR產物,進行PCR-DHPLC檢測,鑒定其特異性。

        1.7 PCR-DHPLC敏感性分析

        將GPV JLTP株病毒接種番鴨胚,提取尿囊液中的病毒核酸作為模板,利用上述引物擴增目的片段,擴增產物連接到pMD18-T 載體上克隆。提取質粒后測濃度,然后進行10倍系列稀釋,使每管含有106、105、104、103、102、101/μL 個拷貝數,并以此為模板進行PCR 擴增,檢測PCR 擴增產物。

        1.8 PCR-DHPLC初步應用

        對吉林省畜牧獸醫(yī)科學研究院保存的采自吉林省不同地區(qū)的100份病料,分別應用PCR 電泳法[7]和PCR-DHPLC方法進行檢測,對比并分析其檢測結果。

        2 結果

        2.1 GPV PCR 擴增退火溫度的優(yōu)化

        按1.4PCR 的反應條件,選擇不同的退火溫度對GPV 陽性樣品進行PCR 擴增,將PCR 產物在紫外燈下觀察,結果在430bp處均出現預計的目的條帶(圖1),以退火溫度為63 ℃非特異擴增帶最少,故選擇63 ℃為PCR 擴增的退火溫度。

        圖1 不同退火溫度下PCR 產物電泳結果Fig.1 The results of PCR products electrophoresis by different annealing temperatures

        2.2 DHPLC法檢測結果

        摸索好的條件為:色譜柱:PS.DVB& C18 DNASep色譜柱(4.6 mm ×50 mm,粒度3 mm);柱溫:50 ℃;流動相:體積分數為50%緩沖溶液A,體積分數為50%緩沖溶液B;流速:1mL/min。上樣量:上述GPV PCR 產物5μL,檢測結果如圖2所示,出現預計目的峰值。

        2.3 PCR-DHPLC 的特異性檢測

        取GPV、鵝副粘病毒、鴨瘟病毒、正常番鴨胚液用同樣的方法制備核酸后,進行PCR-DHPLC 檢測。試驗結果如圖3所示。由圖3知,除GPV 出現特征性吸收峰外,而鵝副粘病毒、鴨瘟病毒、正常番鴨胚尿囊液在DHPLC分析圖譜中未出現與上述一致的特征峰圖,說明該方法具有較高的特異性。

        圖2 DHPLC鑒定結果Fig.2 The result of DHPLC identification

        2.4 PCR-DHPLC的敏感性檢測

        試驗結果如圖4、5所示,使用建立的PCR-DHPLC方法檢測不同濃度的陽性標準品,檢測到的最低濃度為102/μL 個拷貝數。而PCR 方法檢測到的最低濃度為104/μL 個拷貝數。由此說明本研究建立的PCR-DHPLC方法敏感性比PCR電泳法高100倍。

        2.5 PCR-DHPLC 臨床樣品檢測結果

        對保存的100份臨床疑似樣品進行檢測,結果表明PCR-DHPLC檢測方法與常規(guī)PCR 方法陽性符合率100%。

        3 討論

        PCR-DHPLC檢測方法靈敏度高,耗時短,可以進行批量操作,并且不會出現假陽性結果。本研究建立的GPV PCR-DHPLC檢測方法,敏感性較高:最低能檢測到102/μL 拷貝數,比常規(guī)PCR 電泳檢測法高100倍、特異性強、僅對GPV 陽性樣品有目的波峰、重復性和準確性較好,在100 份樣品檢測中,陽性樣品檢測結果與常規(guī)PCR 電泳法一致。本研究中該方法在初步應用中沒顯示出明顯的敏感性優(yōu)勢,可能是以下原因:所檢測樣品容量較?。粯悠繁旧硎顷栃园l(fā)病的或陰性未感染的;采用的病毒核酸提取方法敏感性不夠等。

        試驗中根據GenBank 上VP3 設計的引物[8],在較大的溫度跨度范圍內,均能夠擴增出目的片段,表明本試驗設計的檢測引物序列在病毒基因組上是很保守的序列,適合用于GPV 的檢測。將GPV PCR 檢測方法與DHPLC 進行有機結合,能夠極大地提高GPV 檢測的靈敏度,同時也為臨床上檢測大批量樣品提供了可能。

        相對其他的DNA 檢測技術來說,變性高效液相色譜技術具有下列優(yōu)點:靈敏度高,極少的核酸也能檢測到[9];假陽性很少出現,結果的重復性較好;快捷方便,價格低廉,自動化程度高。一個樣品的檢測在10min內可以完成,花費不高,省去PCR 檢測方法中制膠、跑電泳等過程,這樣節(jié)省了大量的時間和花費。因此,利用變性高效液相色譜技術對突變株的篩選及核酸雙鏈的排查,很容易實現高通量和大規(guī)模的分析;回收的DNA 片段可以直接進行PCR、測序以及克隆到載體中[10]。另外,變性高效液相色譜技術也具有安全可靠的優(yōu)勢,避免一些放射性元素及有害的化學藥物對人體造成的傷害。

        圖5 PCR-DHPLC 敏感性檢測結果Fig.5 The results of PCR-DHPLC sensitivity test 106、105、104、103、102(copies per milliliter)

        [1]劉家森,姜 騫,司昌德,等.番鴨細小病毒與鵝細小病毒PCR鑒別診斷方法的建立[J].中國獸醫(yī)科學,2007,37(6):469-472.

        [2]劉 菲,唐衛(wèi)杰,程安春,等.抗鵝細小病毒卵黃IgG 的制備及其間接ELISA 檢測方法的建立[J].中國獸醫(yī)科學,2011,41(6):601-606.

        [3]Chen Z,Li C,Liu G,et al.Rapid diagnosis of goose viral infections by multiplex PCR[J].Journal of Virological Methods,2013,191(2):101-104.

        [4]Fan J H,Zuo Y Z,Yang Z,et al.The development of an indirect ELISA for the detection of antibodies to goose parvovirus in blood serum[J].Letters in Applied Microbiology,2013,57(1):26-32.

        [5]Aarthi P,Harini R,Sowmiya M,et al.Identification of bacteria in culture negative and polymerase chain reaction(PCR)Positive intraocular specimen from patients with infectious endopthalmitis[J].Journal of Microbiological Methods,2011,85(1):47-52.

        [6]Wu J,Wang D,Song L,et al.A new familial gastric cancerrelated gene polymorphism:T1151Ain the mismatch repair gene hMLH1[J].Molecular Biology Reports,2011,38(5):3 181-3 187.

        [7]胡桂學,逄 博,高鳳山,等.小鵝瘟PCR 診斷方法的建立和初步應用[J].經濟動物學報,2003,7(2):50-53.

        [8]朱海俠,萬春和,黃 瑜.鵝細小病毒基因組結構特征研究進展[J].中國動物傳染病學報,2011,19(1):82-86.

        [9]Telleria O,Ezpeleta G,Herrero O,et al.Validation of the PCR-DHPLC method for rapid identification of Candida glabrata phylogenetically related species in different biological matrices[J].Analytical Technologies in The Biomedical and Life Sciences,2012,893:150-156.

        [10]Epp L S,Stoof-Leichsenring K R,Trauth M H,et al.Mo-lecular profiling of diatom assemblages in tropical lake sediments using taxon-specific PCR and Denaturing High-Performance Liquid Chromatography(PCR-DHPLC)[J].Molecular Ecology Resources,2011,11(5):842-853

        猜你喜歡
        電泳敏感性引物
        DNA引物合成起始的分子基礎
        高中生物學PCR技術中“引物”相關問題歸類分析
        生物學通報(2022年1期)2022-11-22 08:12:18
        SSR-based hybrid identification, genetic analyses and fingerprint development of hybridization progenies from sympodial bamboo (Bambusoideae, Poaceae)
        輔助陽極在輕微型廂式車身電泳涂裝中的應用
        釔對Mg-Zn-Y-Zr合金熱裂敏感性影響
        PPG第四屆電泳涂料研討會在長沙成功舉辦
        上海建材(2017年4期)2017-04-06 07:32:03
        改良的Tricine-SDS-PAGE電泳檢測胸腺肽分子量
        火炬松SSR-PCR反應體系的建立及引物篩選
        AH70DB鋼焊接熱影響區(qū)組織及其冷裂敏感性
        焊接(2016年1期)2016-02-27 12:55:37
        如何培養(yǎng)和提高新聞敏感性
        新聞傳播(2015年8期)2015-07-18 11:08:24
        人妻无码中文专区久久AV| 精品无码人妻一区二区三区不卡 | 欧美性爱一区二区三区无a| 日韩精品极品免费在线视频| 丁香五月缴情在线| a级毛片成人网站免费看| 无码毛片高潮一级一免费| 丝袜美腿诱惑一二三区| 五月激情综合婷婷六月久久| 国产午夜无码片在线观看影院| 高清国产日韩欧美| 在线观看人成网站深夜免费| 中文字幕日韩人妻少妇毛片 | 99精品视频在线观看| 亚洲精品午夜精品国产| 亚洲日本一区二区三区四区| 精品伊人久久大香线蕉综合| 国产免费破外女真实出血视频| 亚洲区精品久久一区二区三区女同 | 日子2020一区二区免费视频| 一区二区三区在线视频爽| 人妻少妇被猛烈进入中文字幕| 亚洲综合久久精品无码色欲| 亚州无线国产2021| 色婷婷久久综合中文久久一本 | 97色伦综合在线欧美视频| 亚洲AV永久青草无码性色av| 久久精品国产亚洲不卡| 精品日韩亚洲av无码| 无码国产激情在线观看| 国产高清黄色在线观看91| 亚洲av手机在线网站| 无码ol丝袜高跟秘书在线观看| 亚洲熟妇AV一区二区三区宅男| 亚洲国产成人久久精品美女av| 国产一精品一av一免费爽爽| 人人妻人人澡av天堂香蕉| 在线观看免费人成视频国产| 激情综合五月婷婷久久| 国产全肉乱妇杂乱视频 | 偷拍一区二区三区黄片|