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        噬菌體展示技術(shù)篩選表皮生長因子受體抗原模擬表位

        2014-01-02 06:28:28賀雪姣師建國李曉霞第四軍醫(yī)大學(xué)基礎(chǔ)部病理生理學(xué)教研室西安710032通訊作者mail2473632607QQcom
        關(guān)鍵詞:西妥包被表位

        賀雪姣,師建國,陳 果,李曉霞 (第四軍醫(yī)大學(xué)基礎(chǔ)部病理生理學(xué)教研室,西安 710032;通訊作者,E-mail:2473632607@QQ.com)

        表皮生長因子受體(epidermal growth factor,EGFR)是原癌基因c-erbB1的表達產(chǎn)物,是表皮生長因子受體(HER)家族成員之一,EGFR的過表達或異常表達與腫瘤細胞的增殖、血管的生成、腫瘤侵襲、轉(zhuǎn)移及細胞凋亡的抑制有關(guān),因此,EGFR是抗腫瘤藥物的一個理想靶點[1]。近年來,噬菌體展示技術(shù)作為新發(fā)展的一項分子生物學(xué)技術(shù),在抗原和抗體研究方面得到了廣泛應(yīng)用。噬菌體隨機肽庫含有大量不同序列結(jié)構(gòu)多肽可作為任意靶抗原表位的模擬肽,運用肽庫篩選時不需要靶蛋白的任何結(jié)構(gòu),只需靶抗原就可以獲得具有免疫原性和抗原性的多肽[2,3],即為模擬表位,其能誘導(dǎo)產(chǎn)生的中和抗體既可以識別原始抗原又可以識別突變體[4]。

        本研究應(yīng)用噬菌體展示技術(shù)對EGFR模擬表位進行研究,以西妥昔單抗及尼妥珠單抗分別作為靶標(biāo)蛋白,擬通過親和篩選獲得與單抗特異性結(jié)合的噬菌體,從而獲得抗原模擬表位,為今后研制靶向EGFR抗體藥物提供導(dǎo)向作用。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        抗EGFR的單抗尼妥珠單抗購自百泰生物藥業(yè)有限公司,西妥昔單抗購自德國MERCK公司,噬菌體12肽庫試劑盒購于NEW ENGLAND Biolabs公司,測序引物及大腸桿菌2738試劑盒自帶。

        1.2 方法

        1.2.1 噬菌體12肽庫的生物淘洗 將濃度為40 μg/ml的西妥昔單抗和尼妥珠單抗150 μl分別包被于96孔酶聯(lián)板中,同時用150 μl包被液包被2孔,4℃,75 r/min搖床過夜;加滿牛血清白蛋白(BSA)緩沖封阻液,4 ℃,90 min;TBST(0.1%Tween-20)洗滌 6 次,每次 1 min,拍干;加 90 μl TBS,100 μl TBST 稀釋10 μl(1.5 ×1011pfu)噬菌體庫液,室溫搖動10 min,吸出噬菌體液,加至包被單抗的孔,室溫搖動10 min,以減少噬菌體非特異性吸附;TBST(0.5%Tween-20)洗滌10 次,每次1 min,拍干,洗去未結(jié)合的噬菌體,再加入100 μl甘氨酸緩沖液(pH 2.2),室溫搖晃15 min,以洗脫結(jié)合的噬菌體,將洗脫液移入微量離心管中,加入15 μl Tris-HCl緩沖液(pH 9.1)中和,此即為噬菌體洗脫液。對洗脫液進行噬菌體計數(shù)及擴增,重復(fù)進行第二、三輪淘洗。在第二、三輪淘洗時,兩處需作改變,一是洗滌液變?yōu)門BST(0.5%Tween-20),二是洗脫時先加入洗脫液30 s后棄去,再加入洗脫液15 min。其余步驟均相同,對每輪洗脫物均進行計數(shù)。

        1.2.2 高滴度單克隆噬菌體的制備 從第三輪洗脫液滴度平板中,選擇<100個藍斑的平板,挑選分隔良好的藍色單克隆噬菌斑,分別接種于1∶100稀釋的大腸桿菌ER 2378過夜培養(yǎng)液中,37℃,250 r/min搖床5 h;4 ℃,10 000 r/min,離心10 min,共 2次;取80%上清液,作為噬菌體儲存液,用于ELISA檢測及DNA提取。

        1.2.3 ELISA檢測噬菌體陽性克隆 取4 ml儲存液,加入1/6體積的 PEG/NaCl,過夜,4℃,10 000 r/min,離心10 min;沉淀用1 ml TBS溶解,4℃,10 000 r/min離心5 min,上清液加入1/6體積的PEG/NaCl,冰上 1 h;4 ℃,10 000 r/min,離心10 min;沉淀用200 μl TBS溶解,測噬菌體滴度。將40 μg/ml的西妥昔單抗和尼妥珠單抗分別包被于96孔酶聯(lián)板中,4℃,75 r/min搖床過夜;棄包被液,加滿 BSA緩沖封阻液,4℃,2 h;TBST(0.5%Tween-20)洗滌8次,每次1 min,用力拍打;每孔中加入100 μl噬菌體液,病毒子量為1×1010個,以噬菌體原庫擴增液為陰性對照,37℃ 1 h;TBST(0.5%Tween-20)洗滌10 次,每次1 min,用力拍打;加100 μl HRP抗M13單抗(1∶4 000緩沖封阻液稀釋)37 ℃,1 h;TBST(0.5%Tween-20)洗滌10次,每次1 min,用力拍打;50 μl顯色液 A 和50 μl顯色液B避光顯色15 min,加入2 mol/L的H2SO4,終止后,經(jīng)酶標(biāo)儀波長450/630 nm讀OD值。

        1.2.4 陽性噬菌體與西妥昔單抗及尼妥珠單抗結(jié)合的劑量依賴性 以5 mg/L西妥昔單抗及尼妥珠單抗分別包被96孔板,每孔100 μl,同時對每個西妥昔單抗及尼妥珠單抗包被孔分別設(shè)立噬菌體原庫擴增液的包被孔作為陰性對照,4℃孵育過夜。加入封閉液(5 mg/L BSA,0.1 mol/L NaHCO3,pH 8.6),4℃封閉2 h,將陽性噬菌體稀釋至5×1014pfu/L后作倍比稀釋(pfu:噬菌斑形成單位),直至其滴度為1.9×1010pfu/L,分別加入西妥昔單抗及尼妥珠單抗及噬菌體原庫擴增液包被孔,100 μl/孔,室溫孵育 2 h,每孔加入100 μl HRP 抗 M13(1∶4 000 緩沖封阻液稀釋),室溫孵育1 h,測定A值。

        1.2.5 單克隆噬菌體測序 取噬菌體儲存液4 ml,加 1.2 ml PEG/NaCl,混勻后室溫10 min;4 ℃,10 000 r/min離心10 min,沉淀用200 μl碘化物緩沖液懸浮,加入 500 μl乙醇,室溫靜置 10 min;4 ℃,10 000r/min離心10 min,沉淀用70%乙醇洗滌后干燥,20 μl雙蒸水溶解,此即為DNA溶液。送生工生物工程上海有限公司進行測序,測序引物為5’-CCCTCATAGTTAGCGTAACG-3’,自備隨機肽庫試劑盒。用Chromas軟件讀取數(shù)據(jù)。

        2 結(jié)果

        2.1 噬菌體肽庫的富集

        以西妥昔單抗及尼妥珠單抗分別作為靶標(biāo)蛋白對噬菌體12肽進行3輪“吸附-洗脫-擴增”的生物淘洗,每輪淘洗結(jié)果均進行噬菌體滴度測定,西妥昔單抗篩選總體回收率從(6.67×10-8)%增加到(2.80×10-5)%,尼妥珠單抗篩選總體回收率從(8.67×10-8)%增加到(1.80 ×10-5)%(見表1),可見通過三輪篩選兩種單抗噬菌體均得到富集,富集度分別達到420倍和208倍。

        表1 西妥昔單抗和尼妥珠單抗篩選特異性噬菌體的富集Table 1 Specificity enrichment of cetuximab and nimotuzumab

        2.2 ELISA檢測結(jié)果及陽性噬菌體特異性分析

        分別隨機挑選30個單克隆噬菌體進行擴增,測噬菌體滴度,以噬菌體原庫做陰性對照,進行ELISA檢測,我們評價陽性結(jié)果為噬菌體單克隆OD值為噬菌體原庫OD值的2倍以上,確定分別有17個和21個陽性噬菌體,陽性率分別為56.67%和70%。挑選陽性噬菌體進行特異性分析,由圖1可見,隨著陽性噬菌體投入量的增大,A450nm值也增大,呈現(xiàn)劑量依賴性。

        2.3 陽性噬菌體測序結(jié)果

        對陽性克隆菌株提取單鏈DNA,對DNA序列測定,推導(dǎo)DNA序列編碼的氨基酸殘基,即為噬菌體遞呈的12肽序列。17個西妥昔單抗陽性噬菌體測序,翻譯成三段氨基酸序列分別為HSFKWLDSPRLR,HTSSLWHLFRST,HLFNHNKNLPKR;對 21個尼妥珠單抗噬菌體測序,翻譯成三段氨基酸序列分別為HSFKWLDSPRLR,HWKSSYVKWHNV,SQHIRT-WNGTRS。其中西妥昔單抗和尼妥珠單抗有一共有序列HSFKWLDSPRLR。

        圖1 陽性噬菌體對西妥西單抗及尼妥珠單抗的結(jié)合依賴性實驗

        3 討論

        EGFR是很多正常的上皮組織(如皮膚和毛囊)組成性表達成分,在許多人類腫瘤中發(fā)現(xiàn)EGFR過量表達,所以有效抑制EGFR的生物活性就有可能抑制腫瘤的發(fā)生、生長和發(fā)展[1,4,5]。西妥昔單抗和尼妥珠單抗都是以EGFR為靶點的嵌合型單克隆抗體,是EGFR拮抗劑。西妥昔單抗及尼妥珠單抗與EGFR的親和力比表皮生長因子高,因此具有阻斷表皮生長因子刺激細胞生長的功能[6,7]。在EGFR過度表達的頭頸癌和結(jié)直腸癌的治療過程中,可專一抑制癌細胞生長,減少了對其他正常細胞的影響,使藥物對癌癥病患產(chǎn)生的副作用相對減少,但其價格昂貴,且需長期重復(fù)使用,對患者及家屬造成了很大的經(jīng)濟負擔(dān)[1,6]。因此,我們采用噬菌體展示技術(shù)篩選與西妥昔單抗及尼妥珠單抗結(jié)合親和性較高的抗原表位肽作為腫瘤蛋白疫苗,以誘導(dǎo)活體發(fā)生主動免疫應(yīng)答,使患者體內(nèi)持續(xù)產(chǎn)生相當(dāng)于西妥昔單及尼妥珠單抗具有生物學(xué)特性的抗體,作為腫瘤主動免疫治療的手段[8,9]。

        本實驗采用西妥昔單抗和尼妥珠單抗對噬菌體隨機12肽庫進行了3輪生物淘洗,在特異性噬菌體得到富集后,隨機挑選30個噬菌體進行克隆,確證其中17個噬菌體克隆與西妥昔單抗具有較高的親和性,21個噬菌體克隆與尼妥珠單抗親和性較高,再提取噬菌體陽性克隆DNA進行序列分析,發(fā)現(xiàn)3段氨基酸序列,這一結(jié)果提示該12肽模擬了EGFR的表位。但同時發(fā)現(xiàn)陽性噬菌體與西妥昔單抗和尼妥珠單抗的結(jié)合力卻有差異,分析原因是噬菌體在擴增后滴度不同,導(dǎo)致噬菌體懸液與西妥昔單抗和尼妥珠單抗的結(jié)合力不同。

        由于采用的西妥昔單抗和尼妥珠單抗對EGFR的生物活性有抑制功能,所以還需要進一步推測篩選到的抗原表位是否具有抑制EGFR活性或在體內(nèi)具有競爭性抑制作用[10,11,12]。

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