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        師范院校研究生生物信息學(xué)教學(xué)改革思考

        2013-12-31 00:00:00李丹丹劉飛
        數(shù)字化用戶 2013年19期

        【摘 要】近年來,隨著人類基因組計劃的實施和測序技術(shù)的飛速發(fā)展,生物信息學(xué)在未來的生命科學(xué)研究中將占有舉足輕重的作用。作為師范院校研究生的生物信息學(xué)教學(xué)工作,也存在著很多方面的問題,本文綜述了教學(xué)中存在的一些問題,并對這些問題提出具體的思考和對策,以期能在未來的教學(xué)工作能改進教學(xué)內(nèi)容和方法,使生物信息學(xué)這門技術(shù)能更好的服務(wù)于研究生的科研工作。

        【關(guān)鍵詞】師范院校 研究生 生物信息學(xué)教學(xué)

        20世紀(jì)80年代末,人類基因組計劃(HGP)正式啟動,隨著該計劃的實施,越來越多物種的基因組被破譯,隨之而來的還有海量的分子生物學(xué)數(shù)據(jù)。對物種基因組的研究并不是為了單純的積累數(shù)據(jù),而是為了揭示大量數(shù)據(jù)中所蘊藏的信息。因此,生物信息學(xué)應(yīng)運而生。目前,幾乎所有生物醫(yī)學(xué)相關(guān)高等院校都開設(shè)了生物信息學(xué)課程,很多農(nóng)業(yè)院校也陸續(xù)開設(shè)此課程,但是在普通師范院校還存在著開設(shè)不足的狀況。目前在師范院校中,很多科研工作者也在從事分子生物學(xué)的研究,特別是最近幾年隨著高通量測序技術(shù)的發(fā)展,越來越多的數(shù)據(jù)涌現(xiàn)出來,對數(shù)據(jù)的收集、整理和分析成為大多數(shù)研究人員不可回避的問題,因此,對生物信息學(xué)專業(yè)人才的需求也越來越大。但是目前大多數(shù)生物信息學(xué)專業(yè)的本科生在學(xué)習(xí)期間只接觸基本的生物學(xué)課程,在生物學(xué)專業(yè)知識的深度上把握不夠,而生物信息學(xué)專業(yè)的研究生一部分直接從來自于生物信息學(xué)專業(yè),另外一部分則是從計算機、數(shù)學(xué)或物理專業(yè)轉(zhuǎn)行而來,在生物學(xué)背景知識方面更是欠缺。因此,如果能夠讓非生物信息學(xué)專業(yè)的研究生能夠掌握基本的數(shù)據(jù)收集、整理和分析的方法,培養(yǎng)復(fù)合型的人才將符合未來人才培養(yǎng)的要求。因此,我們就目前普通師范院校非專業(yè)研究生生物信息學(xué)課程教學(xué)中存在的問題及對于改革存在的思考詳述如下:

        一、師范院校研究生生物信息學(xué)課程教學(xué)中存在的問題

        (一)教材選擇少

        碩士研究生培養(yǎng)有其自身的特點,需要學(xué)生系統(tǒng)掌握某學(xué)科或?qū)I(yè)領(lǐng)域內(nèi)專門知識和基礎(chǔ)理論。這就要求研究生既要擁有廣泛深厚的專業(yè)知識,也應(yīng)具備一定研究與創(chuàng)造能力。對于非生物信息學(xué)專業(yè)的師范院校研究生,我們要求其既掌握基本的生物信息學(xué)知識,同時具備一定的數(shù)據(jù)分析處理能力。目前本科院校生物信息專業(yè)常用的教材講的比較深入,對于非專業(yè)的研究生來說,由于缺乏較好的數(shù)學(xué)和計算機基礎(chǔ),學(xué)習(xí)起來稍顯吃力。但是普通生物信息學(xué)教程大多講的較寬泛,也不適合研究生教學(xué)。如果能夠編纂既能普及學(xué)生的生物信息學(xué)知識,同時又能讓其具備基本的數(shù)據(jù)收集、整理和分析能力的教材將非常有利,但是目前市面上該類教材還比較少。

        (二)師資缺乏

        目前,國內(nèi)大部分師范院校將生物信息學(xué)作為選修課來開設(shè),使得課程在專業(yè)建設(shè)和人才培養(yǎng)方案中的地位偏低,造成對該類教師的師資培養(yǎng)不夠重視。且大部分師范院校未配備專業(yè)的生物信息學(xué)教師,多為其他生物專業(yè)的教師兼職講授,該類教師部分通過自學(xué),部分通過進修,缺乏專業(yè)系統(tǒng)的生物信息學(xué)培訓(xùn),因此在教學(xué)過程中不能很好滿足教學(xué)要求。

        (三)學(xué)生基礎(chǔ)水平參差不齊

        師范院校研究生來源途徑廣,除了本科師范院校外,還有一部分來自農(nóng)林院?;蚓C合院校,學(xué)生本科所學(xué)專業(yè)不同,生物學(xué)基礎(chǔ)和對生物信息學(xué)的認(rèn)知程度差異較大,這些問題都會成為教學(xué)中的影響因素,這就要求授課教師能夠在授課內(nèi)容上不僅做到完成教學(xué)要求,同時要兼顧學(xué)生基礎(chǔ)水平參差不齊的現(xiàn)象,使學(xué)生更好的對該門課程有很好的把握。

        二、教學(xué)改革思考

        (一)選擇合適的教材和教輔資料完善教學(xué)廣度和深度

        不同院校不同的教師研究方向不同,但是大致都離不開動物、植物、微生物、生態(tài)這些大類,生物信息學(xué)作為一門工具學(xué)科,要求研究生在學(xué)習(xí)該門課程后,能夠熟練的運用生物信息學(xué)的知識為自己的科研服務(wù)。作為該門課程的任課教師,要求在上課之前先對學(xué)生的研究對象和研究內(nèi)容進行初步的調(diào)查,選擇能夠更好的服務(wù)于學(xué)生科研的教材和教輔資料,可以不局限于現(xiàn)有教材的內(nèi)容,必要時候可以以專題講座的形式對部分教學(xué)內(nèi)容進行補充。

        (二)根據(jù)學(xué)生基礎(chǔ)調(diào)整教學(xué)內(nèi)容

        針對學(xué)生基礎(chǔ)層次不齊的現(xiàn)狀,授課教師可以在授課前幾章節(jié)補充學(xué)生的遺傳學(xué)和基礎(chǔ)分子生物學(xué)知識,通過兩到三次課的時間完善學(xué)生該方面的不足,部分學(xué)生可能是農(nóng)林院校的本科生,在大學(xué)期間學(xué)習(xí)的多為專業(yè)方向比較強的生物學(xué)知識,那么通過普及基礎(chǔ)生物學(xué)知識,可以讓其對整個生物學(xué)有一個整體的了解。同樣對于師范院校的本科生,通過該段授課,也可以將自己在大學(xué)學(xué)到的各門專業(yè)課有一個整體的脈絡(luò)和認(rèn)識,起到提綱挈領(lǐng)的作用。通過這個過程,學(xué)生對基礎(chǔ)分子生物學(xué)及基本的遺傳學(xué)思想不再陌生,再學(xué)習(xí)后邊的生物信息學(xué)知識的時候就不會顯得很吃力。同時由于學(xué)生研究方向不同,對生物信息學(xué)技術(shù)的需求也不一樣。針對此,授課教師可以在講授過程中,穿插列舉一些學(xué)生科研終于到的一些問題,應(yīng)用所學(xué)的生物信息學(xué)知識進行解決,而不是僅僅局限于教材所舉實例。同時對于前沿技術(shù)的內(nèi)容,也必須做及時補充和更新,使學(xué)生更好的把握生物信息的前沿和技術(shù)。

        (三)利用現(xiàn)有的多媒體資源改進教學(xué)方式

        作為一門實用性很強的課程,生物信息學(xué)教學(xué)有其自身的特點。它不僅要求學(xué)生有較強的理論知識,同時要求其必須有較強的上機操作能力。且大部分課程知識在講授過程中如果只是單純的教師操作演示不能起到好的教學(xué)效果,畢竟觀看和臨摹效果是截然不同的。因此在教學(xué)中,可以將生物信息學(xué)教學(xué)分成理論授課和上機實踐兩部分,有些操作性較強的章節(jié)可以直接選擇在機房講授,讓學(xué)生在聽課過程中通過自己操作增強感性認(rèn)識,以利于更好的對知識進行掌握。

        生物信息學(xué)是一門快速發(fā)展的交叉學(xué)科,在今后的生物學(xué)科研中將占有不可估量的作用,重要的且處于快速更新中的學(xué)科, 其發(fā)展與生物醫(yī)學(xué)發(fā)展是協(xié)同的。授課教師的授課觀念、授課策略既要緊跟國內(nèi)外發(fā)展前沿又立足選課學(xué)生實際,切實做好生物信息學(xué)教學(xué)工作,滿足我國目前研究生教育需要,培養(yǎng)更多的復(fù)合型人才。

        作者簡介:

        李丹丹,女,1982-02,河南南陽,講師,博士研究生,博士,研究方向:昆蟲基因組學(xué)。

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