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        巨大芽孢桿菌酯酶的克隆、表達(dá)及催化性質(zhì)研究

        2013-12-20 08:38:46謝麗萍應(yīng)向賢王一芳鄭建永
        發(fā)酵科技通訊 2013年3期
        關(guān)鍵詞:酯酶丁酸乙酯

        謝麗萍,應(yīng)向賢,王一芳,鄭建永

        (浙江工業(yè)大學(xué) 生物與環(huán)境工程學(xué)院,浙江 杭州 310014)

        0 引 言

        酯酶(Esterase,EC3.1.1.1,羧基酯水解酶)是普遍存在于自然界的水解酶,被廣泛應(yīng)用于醫(yī)藥、食品、洗滌劑化學(xué)合成及油脂等工業(yè),具有廣泛的用途[1]。酯酶具有選擇性專一、催化效率高、副反應(yīng)少的特點,在手性藥物制備等方面具有廣闊的應(yīng)用前景[2,3]。Nakagawa等[4]從菌株 Rhizobium sp.DS-S-51中克隆和表達(dá)了一個酯酶,該酶用于選擇性拆分4-氯-3-羥基丁酸酯,拆分后4-氯-3-羥基丁酸酯對映體的e.e.值大于99%。源自Enterobacter sp.DS-S-75的重組酯酶能耐受15%(w/v)的4-氯-3-羥基丁酸甲酯,選擇性拆分后R-4-氯-3-羥基丁酸甲酯的e.e.值大于99%[5,6]。作為生物催化劑,酯酶的催化性能往往不能滿足實際應(yīng)用的要求,而商品酶的價格往往較高,阻礙了它的進(jìn)一步應(yīng)用。研究發(fā)現(xiàn)新型的酯酶,采用DNA重組技術(shù)構(gòu)建酯酶的基因工程菌,對酯酶基因進(jìn)行重組表達(dá),可大大降低酯酶生產(chǎn)成本,從而使之得到廣泛應(yīng)用。

        本研究對一個巨大芽孢桿菌酯酶基因進(jìn)行了克隆與表達(dá),利用親和層析實現(xiàn)了酯酶的分離純化,研究了該重組酯酶的酶學(xué)性質(zhì),如pH、溫度、金屬離子、有機溶劑的影響等,為其在生物催化與轉(zhuǎn)化中的應(yīng)用奠定了一定的基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌種及質(zhì)粒載體

        實驗室篩選的Bacillus megaterium strain WZ009(已委托武漢微生物菌種保藏中心保藏菌種,CCTCC M 2011336),表達(dá)載體 pET-30a,大腸桿菌 Escherichia coli DH5α 與 E.coli BL21(DE3)均為本實驗室保藏。

        1.1.2 試劑

        rTaq酶購自上海申能博彩生物科技有限公司。T4連接酶、限制性內(nèi)切酶、DNA marker、質(zhì)粒提取試劑盒、膠回收試劑盒、瓊脂糖電泳試劑均購自大連TaKaRa公司。Ni-NTA Sefinose Kit購自Bio Basic INC公司。其他試劑均為國產(chǎn)分析純。

        1.1.3 培養(yǎng)基及培養(yǎng)條件

        種子培養(yǎng)基:1%胰蛋白胨,0.5%NaCI,0.5%酵母浸出粉,pH 7.5。配制固體培養(yǎng)基時需加入1.5%的瓊脂粉。

        發(fā)酵培養(yǎng)基:0.72%葡萄糖,0.7%酵母膏,0.125%CaCl2,0.1%四氯三羥基丁酸,pH 6.5。

        大腸桿菌E.coli DH5α與E.coli BL21(DE3)采用種子培養(yǎng)基,37℃過夜培養(yǎng)。WZ009菌株采用發(fā)酵培養(yǎng)基,30℃培養(yǎng)24 h。重組克隆菌株用含卡那霉素、異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)、5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷(X-Gal)的種子培養(yǎng)基進(jìn)行藍(lán)白斑篩選,重組表達(dá)菌用含100 μg/mL卡那霉素的種子培養(yǎng)基培養(yǎng),并用終濃度為0.2 mmol/L IPTG誘導(dǎo)培養(yǎng)。

        1.1.4 引物

        根據(jù)已知基因組序列的B.megaterium DSM319的酯酶基因 (GeneBank Accession No.CP001982) 設(shè)計引物,F(xiàn)(5’-ATGCCGTTAGATCCGCA-3’) 和 R(5’-CTAAATAGAATCAAATACTTGACG-3’)。引物由上海澤衡生物技術(shù)有限公司合成。

        1.2 方法

        1.2.1 基因bme的PCR擴增及表達(dá)載體pET30abme的構(gòu)建

        挑取B.megaterium WZ009單菌落,接種于發(fā)酵培養(yǎng)基,30℃培養(yǎng)至菌液OD600約為0.8,參照TaKaRa基因組DNA抽提試劑盒說明書提取基因組DNA。以基因組DNA為模板,寡聚核苷酸F和R為引物進(jìn)行PCR擴增。該PCR擴增反應(yīng)體系總體積為50 μL,模板和引物添加量分別為100 ng和300 ng。擴增反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性3 min;94變性 35 s,57 ℃復(fù)性 30 s,72℃延伸 50 s,35個循環(huán);72℃后延伸10 min。

        電泳檢測PCR擴增產(chǎn)物并回收純化,用相應(yīng)的內(nèi)切酶Kpn I和Xho I進(jìn)行雙酶切,割膠回收,微量核酸蛋白測量儀檢測濃度,控制DNA片段摩爾數(shù)在載體的摩爾數(shù)的3~10倍,將目的片段與同樣酶切處理過的載體pET-30a混合,16℃下T4連接酶連接過夜,并轉(zhuǎn)化入DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,通過卡那霉素抗性篩選和藍(lán)白斑篩選[7],挑取陽性克隆子提取質(zhì)粒,用Kpn I和Xho I對質(zhì)粒進(jìn)行酶切鑒定。取陽性克隆子送至上海生工生物工程有限公司測序,然后用Blast軟件將所得基因序列與GenBank中的基因序列進(jìn)行比對分析。

        1.2.2 基因bme的表達(dá)

        從陽性克隆子DH5α中提取重組質(zhì)粒pET30a-bme,并轉(zhuǎn)化入 E.coli BL21(DE3)中,在含卡那霉素的種子培養(yǎng)基中37℃、200 r/min搖瓶培養(yǎng)12h,作為種子液。然后按1%的比例接種擴大培養(yǎng),37℃振蕩培養(yǎng)至OD600為0.6~0.8時,加入24 mg/L的IPTG至終濃度為0.2 mmol,28℃,200 r/min誘導(dǎo)培養(yǎng)16 h。

        1.2.3 重組酶的純化

        4℃下收集菌體,用50 mmol的Tris-HCl緩沖液(pH 8.0)重懸,經(jīng)超聲破碎后4℃,10 000 r/min離心15min得上清粗酶液。按照Ni-NTA Sefinose試劑盒使用指南,取粗酶液上樣至預(yù)平衡的Ni2+柱中,依次用不同梯度的洗脫液洗脫目的蛋白。收集洗脫液,經(jīng)SDS-PAGE檢測樣品的蛋白質(zhì)純度。蛋白質(zhì)濃度測定采用Bradford法[8],以牛血清蛋白為標(biāo)準(zhǔn)樣。

        1.2.4 重組酶酶活測定

        取兩個試管 (分別是對照管和樣品管),各加0.1 mL溶液A和2.89 mL溶液B慢慢混合。50℃水浴中預(yù)熱5 min,然后在對照管里加入已滅活的酶液0.01 mL,樣品管里加入酶液0.01 mL,立即混勻計時。在水浴中準(zhǔn)確反應(yīng)2 min,并馬上測定410 nm下酶水解產(chǎn)生對硝基苯酚的吸光度值 (OD410 nm值)。溶液A:150 mg底物酯溶于50 mL異丙醇;溶液B:500 mL pH7.5 0.02 mol/L磷酸緩沖液。底物為對硝基苯酚乙酸酯和對硝基苯酚棕櫚酸酯。

        酶活定義:在pH7.5,50℃條件下,每分鐘水解釋放1μmol對硝基苯酚所需的酶量為1個酯酶活力單位(U)。

        1.2.5 重組酶酶學(xué)性質(zhì)

        (1)酯酶的最適反應(yīng)溫度

        標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系下,分別在25~90℃溫度范圍內(nèi)測定酶反應(yīng),410 nm波長下測定各管吸光值并計算酶活力,以酶活最高者作為100%。

        (2)酯酶的最適反應(yīng)pH

        標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系中,變化不同pH值的磷酸鹽緩沖液,410 nm波長下測定各管吸光值并計算酶活力,以酶活最高者作為100%。

        (3)金屬離子對酯酶活力的影響

        在標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系中分別添加不同金屬離子或EDTA,測定酶活力。確定金屬離子與EDTA對酶活的影響。以不加金屬離子時的酶活力作為100%,計算相對酶活力。

        (4)有機溶劑耐受性

        標(biāo)準(zhǔn)體系中按體積比分別為10%-80%加入甲醇作為助溶劑,檢測重組酶在有機溶劑存在條件下的酶活力。以未加甲醇時的酶活作為100%,計算相對酶活。

        1.2.6 5 L發(fā)酵罐的擴大培養(yǎng)

        將種子液按1%的接種量接入5 L發(fā)酵罐(BioStat C,德國 B.Branun)中,裝液量為 3 L,在37℃,200 r/min和通氣1.1 vvm的條件下培養(yǎng)至OD600為0.6~0.8時,加入終濃度為0.2 mmol/L的IPTG,28℃進(jìn)行誘導(dǎo)培養(yǎng)發(fā)酵。每隔一小時取樣,用分光光度計檢測光密度(OD600)并記錄pH、溶氧值。

        1.2.7 酶不對稱水解4-氯-3-羥基丁酸乙酯

        在50 ml反應(yīng)瓶中先后加入20 mL 0.2mol/L磷酸緩沖液 (pH7.0)、0.2 mL 4-氯-3-羥基丁酸乙酯 (CHBE)、1 mL工程菌液,200 r/min,30℃下開始反應(yīng),10 h后取樣分析。水解反應(yīng)液用等體積乙酸乙酯萃取,有機相無水硫酸鈉干燥、過濾后直接進(jìn)行氣相色譜分析。氣相色譜分析條件:進(jìn)樣口溫度250℃,分流比 20:1,載氣N2,載氣流量 1 ml/min;柱溫100℃保持2 min,2℃/min程序升溫至160℃,保持2 min;FID檢測器:檢測器溫度250℃。

        2 結(jié)果與討論

        2.1 重組酶的表達(dá)與SDS-PAGE驗證

        通過Kpn I和Xho I雙切點將酯酶bme基因引入表達(dá)載體pET-30a,構(gòu)建得到重組質(zhì)粒pET30a-bme。將重組質(zhì)粒pET30a-bme轉(zhuǎn)化入宿主菌E.coil BL21(DE3)中,在IPTG誘導(dǎo)下,酯酶在E.coil BL21(DE3)中高效表達(dá),分子量約為41.5kDa,與預(yù)期相符。利用重組質(zhì)粒攜帶的多組氨酸標(biāo)簽,表達(dá)的重組酶經(jīng)Ni2+親和色譜純化后經(jīng)SDS-PAGE檢測,顯示為單一條帶(圖1),實現(xiàn)了重組蛋白的一步純化。經(jīng)過酶活、蛋白質(zhì)濃度測定,計算得酶的比活為200 U/mg。

        圖1 純化前后樣品的SDS-PAGE分析

        2.2 酯酶酶學(xué)性質(zhì)

        2.2.1 酯酶的最適反應(yīng)溫度

        圖2結(jié)果表明,酯酶在70℃表現(xiàn)出最高活力。在25℃活力僅為最高活力的21.4%;隨著溫度的增加,活性有所提高;超過80℃后,活性開始降低,到90℃時活性僅為最高活性的16.7%。

        圖2 溫度對酶活的影響

        2.2.2 酯酶的最適反應(yīng)pH

        圖3結(jié)果表明,該酶在偏酸性條件下(<pH6.5)酶活力相當(dāng)?shù)?,不到最高酶活?0%。當(dāng)pH7.5時酶活達(dá)到最大值,所以該酶的最適pH為7.5。酯酶一般為中性蛋白,其最適pH一般都在中性的6.5~7.5范圍內(nèi),適宜于中性介質(zhì)中應(yīng)用。

        圖3 pH對酶活的影響

        2.2.3 金屬離子對酯酶活力的影響

        由表 1可知較高濃度的 Na+,Zn2+,Ca2+和EDTA對酶活有一定的抑制作用,但該酶能耐受低濃度的Zn2+,Ca2+,Mn2+,EDTA等,表明該重組酶具備良好的金屬離子耐受性。

        表1 金屬離子對酶活的影響

        2.2.4 有機溶劑耐受性

        選用甲醇作為助溶劑,以未加甲醇時的酶活力為100%計算相對酶活力,結(jié)果如圖4所示。不同濃度的甲醇并不抑制酶活力,說明重組酶具有良好的有機溶劑耐受性。

        圖4 有機溶劑耐受性

        2.3 5L發(fā)酵罐擴培——發(fā)酵曲線

        發(fā)酵過程曲線如圖5,pH隨著發(fā)酵的進(jìn)行,其數(shù)值逐漸升高。溶氧曲線一開始下降迅速后又回升,發(fā)酵9 h時又降到最低,之后穩(wěn)定一段時間后又回身至較高值。說明發(fā)酵初期,耗氧量大,菌體攝氧量達(dá)高峰;發(fā)酵中期,耗氧相對較恒定,但此處也有所波動。OD600曲線逐漸升高,說明菌體生長良好正常。細(xì)菌生長進(jìn)入對數(shù)生長期,OD值明顯上升,達(dá)最大值,隨后增長緩慢。

        圖5 BME 5 L發(fā)酵罐發(fā)酵曲線

        2.4 酶不對稱水解4-氯-3-羥基丁酸乙酯

        圖6 手性氣相色譜圖

        經(jīng)檢測得到如下氣相色譜圖6,a為樣品,b為標(biāo)樣。(R)-和(S)-4-氯-3-羥基丁酸乙酯對映體出峰時間分別為:28.2 min和28.5 min。

        以混旋4-氯-3-羥基丁酸乙酯為底物,在30℃下重組酯酶BME催化水解10 h,反應(yīng)轉(zhuǎn)化率為50%,底物e.e.值為70%,表明酯酶對4-氯-3-羥基丁酸乙酯水解具有立體選擇性。

        本研究成功實現(xiàn)了一個巨大芽孢桿菌酯酶基因分子克隆與功能性表達(dá),并對其進(jìn)行了擴大培養(yǎng)。經(jīng)分離純化得到了重組酯酶,該酶亞基分子量為41.5 kDa。重組酯酶的最適反應(yīng)溫度為70℃,最適 pH為7.5,比酶活為 200 U/mg,比活力較高。該酶能耐受低濃度的Zn2+,Ca2+,Mn2+,EDTA等和高濃度的甲醇和Triton X-100。此外,該酯酶在不對稱水解4-氯-3-羥基丁酸乙酯中E值達(dá)到11.7。上述結(jié)果表明,本研究的酯酶在選擇性拆分上具有較好的應(yīng)用潛力,具有進(jìn)一步研究的價值。

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