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        與多花黑麥草株高性狀相關(guān)的RAPD標(biāo)記分析

        2013-12-18 10:00:58張曉佩高承芳李文楊董曉寧
        福建畜牧獸醫(yī) 2013年2期

        張曉佩 高承芳 李文楊 劉 遠(yuǎn) 董曉寧

        (福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所 福州 350013)

        多花黑麥草(Lolium multiflorum)又名意大利黑麥草、一年生黑麥草,是一年生或者越年生禾本科植物,原產(chǎn)地中海沿岸[1],是優(yōu)良的牧草和草坪草。作為牧草具有生長快、產(chǎn)草量高、營養(yǎng)價值高、適口性好等優(yōu)點,適用于飼喂各種畜、禽、魚。它也可以作為先鋒草種和保護(hù)草種用于草坪。近年來,多花黑麥草在我國栽培的面積日益擴大,尤其是在我國長江流域及其以南地區(qū)。

        RAPD標(biāo)記技術(shù)已經(jīng)廣泛用于植物的遺傳多樣性、圖譜構(gòu)建、品種鑒定、基因定位、分子標(biāo)記輔助育種等研究[2-3]。目前RAPD標(biāo)記技術(shù)主要用于多花黑麥草遺傳多樣性和品種資源研究[4-6]。本研究初次進(jìn)行與株高性狀相關(guān)的RAPD標(biāo)記分析,旨在為多花黑麥草育種提供分子學(xué)方面的基本資料。

        1 材料與方法

        1.1 材料 選用多花黑麥草品種資源4份:美克斯、??死锼?、劍寶和特高,由百綠公司北京分公司提供。

        1.2 試驗方法

        1.2.1 基因組DNA提取 基因組DNA提取采用改進(jìn)CTAB法[7],最后測基因組DNA濃度,并用0.1×TE稀釋到終濃度100 ng/mL。放在-20℃的冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>

        按照每個品種取25個個體DNA的數(shù)量,經(jīng)過測DNA濃度后,稀釋成等濃度后等量混合,制成品種的混合DNA(池DNA),用隨機引物進(jìn)行擴增分析。

        1.2.2 株高數(shù)據(jù)記錄 黑麥草的株高數(shù)據(jù)來自試驗田記錄(取群體均值)。株高測量方法:測定地面到最高葉片尖端的垂直高度。在出苗后生長第60 d(即營養(yǎng)生長期),每個品種隨機取20株測量垂直高度,植株各垂直高度的算術(shù)平均值為測定植株的高度。1.2.3 RAPD擴增及檢測 從110條隨機引物中篩選出68條,用該68條隨機引物分別對4個黑麥草品種進(jìn)行PCR擴增,最后篩選出23條多態(tài)性高、重復(fù)性好的隨機引物(如表1),對所有的4個黑麥草品種進(jìn)行PCR擴增,PCR反應(yīng)體系為 20μL:10×buffer 2.0 μL,MgC122.0 μL,25 mmo1/L dNTP 2.0 μL,TaqDNA聚合酶1 U,引物1μL,總DNA 100 ng和ddH2O 12μL。擴增反應(yīng)程序為95℃預(yù)變性5 min,然后進(jìn)入循環(huán),每個循環(huán)為95℃變性1 min,36℃退火2 min,72℃延伸1.5 min,共46個循環(huán),最后72℃再延伸10 min。反應(yīng)產(chǎn)物在1.5%瓊脂糖凝膠上檢測,電壓120 V,電泳25 min,用BIO-RAD Ge1 Doc 2000凝膠成像系統(tǒng)記錄拍照。

        1.2.4 數(shù)據(jù)分析 同一引物擴增產(chǎn)物中電泳遷移率一致的條帶被認(rèn)為具有同源性,屬于同一位點的產(chǎn)物按擴增陽性(1)或擴增陰性(2)記錄電泳帶譜,利用SASSystem進(jìn)行多態(tài)性標(biāo)記的t檢驗,以獲得與株高性狀緊密連鎖的分子標(biāo)記,顯著水準(zhǔn)P<0.05。多態(tài)頻率用多態(tài)帶數(shù)目與擴增出所有主帶的比率表示。

        2 結(jié)果分析與討論

        2.1 引物篩選與RAPD擴增結(jié)果 最后用于4種多花黑麥草基因組DNA的RAPD擴增的23條引物擴增結(jié)果重復(fù)率高、擴增條帶多態(tài)性好,擴增結(jié)果見表1、圖1。不同引物和不同多花黑麥草品種基因組DNA引起擴增的條帶數(shù)目不同,數(shù)目變化在4~12個,多態(tài)性位點的比例為75%~100%??傊瑥?10條中篩選出的23條引物,共擴增出174條帶,其中多態(tài)性條帶有166個,因此,多態(tài)性位點占的比例是95.4%。結(jié)果說明,多花黑麥草基因組DNA多態(tài)性非常豐富。

        2.2 與株高性狀相關(guān)性分析 把研究群體按照標(biāo)記基因型的種類不同分成兩種類型,即1型和2型,對不同標(biāo)記基因型的株高性狀進(jìn)行方差分析,得到株高性狀與多個標(biāo)記之間的相關(guān)值。方差分析結(jié)果表明:在23條引物中有6條特異性標(biāo)記條帶,分布在5條引物中,與多花黑麥草的株高性狀呈現(xiàn)出顯著相關(guān)(P <0.05)。從表 2中可以看出:S04-6、S15-3、S50-5、S50-8、S67-2、S99-7 等 6 條特異性標(biāo)記帶與多花黑麥草株高性狀有著顯著的相關(guān)。

        表1 引物序列和擴增結(jié)果

        圖1 部分引物擴增結(jié)果

        由以上結(jié)果可以看出,研究中用23條引物共擴增了166個特異性條帶,但經(jīng)過t檢驗,與目標(biāo)性狀(株高)相關(guān)的標(biāo)記僅有6個,說明166個特異性條帶所代表的位點控制著更多的性狀,并不僅限于株高。

        表2 RAPD標(biāo)記類型與株高的關(guān)聯(lián)分析

        從t檢驗結(jié)果可以看出,6個標(biāo)記中有基因1型大于基因2型的,也有基因2型大于基因1型的,說明對多花黑麥草株高性狀來講,有3個標(biāo)記是增效的,有3個標(biāo)記是減效的。選擇有增效標(biāo)記的個體留種可以增加選種的準(zhǔn)確性,加快黑麥草育種的進(jìn)程,因此,這些分子標(biāo)記輔助選擇育種對于黑麥草的育種十分有意義。

        3 小結(jié)

        1)用基因組DNA作RAPD檢測多花黑麥草株高性狀位點的方法是可行的,本研究篩選出了23個隨機引物對4個多花黑麥草品種的基因組DNA進(jìn)行擴增,共得到174條帶,其中166條帶為多態(tài)性條帶,標(biāo)記率為95.4%。

        2)用RAPD技術(shù)檢測出了4個多花黑麥草品種基因組DNA的6個株高性狀的標(biāo)記(分布在5條引物中),它們是 S04-6、S15-3、S50-5、S50-8、S67-2、S99-7等。

        [1] Ca11ow M,Miche H,et a1.The effect of defo1iation practice in western Ausa1ia on ti11er deve1opment of Annua1 Ryegrass(Lo1ium rigidum)and Ita1ian ryegrass(Lo1ium mu1tif1omm)and its association with forage qua1ity[J].Gass and Frage Science,2000,55:232-241.

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        [7] 邱永福,田志宏,楊曉松.冷季型草坪草基因組DNA的提取方法比較[J].長江大學(xué)學(xué)報:自然科學(xué)版,2005,2(2):28-30.

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