王清,葛瑩,宋廣輝,趙素芝
(1 青島大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科,山東 青島 266100; 2 山東省煤炭泰山療養(yǎng)院內(nèi)二科)
血清胱抑素C(Cys C)作為一種新的反映腎小球?yàn)V過率(GFR)的內(nèi)源性標(biāo)志物,為判斷腫瘤、肝硬化、腎衰竭等疾病中GFR的變化提供了快速、精確而又簡(jiǎn)單的方法。有人已經(jīng)原核表達(dá)了Cys C,由于融合蛋白以包涵體形式存在,包涵體蛋白的復(fù)性和純化過程非常復(fù)雜,而且由于原核生物密碼子的偏性,導(dǎo)致了真核基因在原核表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)率較低[1]。畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)作為一種適宜表達(dá)外源基因的真核表達(dá)系統(tǒng),得到了廣泛的應(yīng)用[2]。本研究利用該表達(dá)系統(tǒng),使Cys C基因在巴斯德畢赤酵母(P.pastoris)中表達(dá),并對(duì)表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行了免疫原性分析。現(xiàn)將結(jié)果報(bào)告如下。
1.1.1 菌種和質(zhì)粒 P.pastoris GS115(His-,Mut+)和質(zhì)粒p PIC9k由本室保存。
1.1.2 主要試劑和儀器 限制性內(nèi)切酶(Takara生物技術(shù)有限公司),蛋白分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)(上海拜力生物科技有限公司),G418、生物素、酵母氮源(YNB)和硝酸纖維素膜(上海生工生物工程有限公司),顆粒增強(qiáng)透射免疫比濁法(PETIA)CysC檢測(cè)試劑盒(北京利德曼生物技術(shù)有限公司),Bio-Rad Gene Pulser電轉(zhuǎn)化儀、CysC蛋白標(biāo)準(zhǔn)品(新城生物科技股份有限公司),鼠抗人CysC單克隆抗體(Abcam公司,英國(guó))。
1.1.3 培養(yǎng)液 YEPD:酵母粉10 g,蛋白胨20 g,葡萄糖20 g,蒸餾水1 000 mL,p H 6.0,115℃濕熱滅菌20 min。MD:13.4 g/L YNB,4×10-4g/L生物素,20 g/L葡萄糖,15 g/L瓊脂。BMGY:2 g/L蛋白胨,1 g/L酵母提取物,100 mmol/L磷酸鉀緩沖液(p H 6.0),13.4 g/L YNB,4×10-4g/L生物素,1 g/L甘油。BMMY:將 BMGY 中的1 g/L甘油替換為5 g/L甲醇。MM:13.4 g/L YNB,4×10-4g/L生物素,5 g/L甲醇。
1.2.1 構(gòu)建攜帶合成Cys C基因的重組表達(dá)載體p PIC9k-Cys C 根據(jù) Cys C的 mRNA 序列(Gen-Bank公布)進(jìn)行分析,按照P.pastoris GS115(His-,Mut+)表達(dá)系統(tǒng)密碼子偏好[3],優(yōu)化基因序列,檢查基因內(nèi)部有無(wú)特別復(fù)雜二級(jí)結(jié)構(gòu)和重復(fù)序列;用P.pastoris GS115(His-,Mut+)偏愛的密碼子替代野生型Cys C基因序列中的酵母稀有密碼子,調(diào)整GC含量,消除富含AT的序列區(qū)段,避免翻譯的提前終止,并且避免可能影響mRNA穩(wěn)定性的連續(xù)5個(gè)或5個(gè)以上的A/T或G/C重復(fù)序列。合成Cys C基因經(jīng)同義密碼子修改以后,所編碼蛋白質(zhì)的氨基酸序列并未發(fā)生變化。根據(jù)基因序列的分析結(jié)果,人工合成Cys C,連接至目的載體p PIC9k,構(gòu)建p PIC9k-Cys C并轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細(xì)胞DH5中,測(cè)序,驗(yàn)證重組克隆中基因序列是否與要求相符。
1.2.2 轉(zhuǎn)化P.pastoris GS115 將5~20μg質(zhì)粒DNA用SalⅠ線性化,電轉(zhuǎn)化GS115細(xì)胞(參數(shù):電壓1.5 k V,電容25μF,電阻200Ω),電擊時(shí)間4~10 ms,His+轉(zhuǎn)化子接種到無(wú)組氨酸的MD平板上,30℃培養(yǎng)3~4 d。然后,PCR分析目的基因是否整合到基因組中。設(shè)計(jì)一對(duì)用于擴(kuò)增插入片段的引 物,引物序列如下:5′AOX1-F,5′-GACTGGTTCCAATTGACAAGC-3′;3′AOX1-R,5′-GCAAATGGCATTCTGACATCC-3′。PCR 反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性5 min;94℃變性1 min,52℃退火1 min,72℃延伸1 min,25個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。
1.2.3 重組酵母陽(yáng)性轉(zhuǎn)化子的多拷貝整合篩選根據(jù)p PIC9k中的表達(dá)手冊(cè)(Invitr ogen公司)篩選多拷貝整合菌株。將轉(zhuǎn)化菌落分別點(diǎn)在G418濃度分別為0.5、1.0、2.0、3.0 g/L的 YEPD培養(yǎng)板上,30℃培養(yǎng)3~4 d,篩選多拷貝整合菌株。然后將高拷貝的重組子分別對(duì)應(yīng)點(diǎn)于MM和MD培養(yǎng)板上,篩選His+Mut+陽(yáng)性克隆。
1.2.4 Cys C的誘導(dǎo)表達(dá) 將G418篩選出的高拷貝轉(zhuǎn)化子3株分別接種于100 mL BMGY增菌培養(yǎng)液中,28~30℃、280 r/min振蕩過夜至A600為3~6。3 000 r/min離心5 min收集細(xì)胞,在4℃下將細(xì)胞沉淀物重新懸浮在500 mL含10 g/L酪氨酸BMMY(p H 6.0)培養(yǎng)液中,使懸浮液A600=1。每24 h加10 g/L甲醇,誘導(dǎo)表達(dá)5 d,收獲的時(shí)間間隔為0、24、48、72、96和120 h,用 PETIA Cys C檢測(cè)試劑盒確定最佳收獲時(shí)間??蛰d體p PIC9k轉(zhuǎn)化子作為陰性對(duì)照,在相同條件下被誘導(dǎo)。
1.2.5 SDS-PAGE和 Wester n blot分析 取30 μL培養(yǎng)物上清液在120 g/L SDS-PAGE上電泳,考馬斯亮藍(lán)R-250染色。通過SDS-PAGE分離的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上,然后用鼠抗人Cys C單克隆抗體(1∶1 000稀釋)孵育,并用小鼠抗兔Ig G(1∶4 000稀釋)與辣根過氧化物酶(HRP)耦聯(lián)。洗膜,用四甲基聯(lián)苯胺(T MB)反應(yīng)10 min。
1.2.6 動(dòng)物免疫及血清抗體檢測(cè) 將Bal b/c小鼠隨機(jī)分為A組和PBS組,每組12只。A組每只小鼠皮下注射50μg純化的酵母表達(dá)重組蛋白和等體積完全弗氏佐劑,PBS組注射PBS和等體積完全弗氏佐劑。首次免疫后14 d加強(qiáng)免疫1次,7 d后再免疫1次,追加免疫用不完全弗氏佐劑,共免疫3次。眶靜脈取血,4℃放置分離血清,-20℃凍存?zhèn)溆?。?yīng)用標(biāo)準(zhǔn)品Cys C蛋白作為抗原間接ELISA檢測(cè)免疫小鼠血清中抗Ig G抗體。
1.2.7 Cys C定量測(cè)定 用PETIA Cys C檢測(cè)試劑盒確定最佳收獲時(shí)間。取各個(gè)時(shí)間間隔少量培養(yǎng)液,離心后用日立全自動(dòng)生化分析儀PETIA Cys C試劑盒測(cè)定Cys C濃度,嚴(yán)格按說明書操作。
120個(gè)氨基酸密碼子中有77個(gè)進(jìn)行了優(yōu)化,消除避免可能影響mRNA穩(wěn)定性的連續(xù)5個(gè)或5個(gè)以上的A/T或G/C重復(fù)序列9處,中止子由TAG轉(zhuǎn)換為TAA。優(yōu)化基因序列后GC含量由原來的60.8%降低到37.7%。合成的基因使用同義的密碼子而氨基酸序列沒有變化。所設(shè)計(jì)的合成Cys C基因與野生型Cys C基因序列對(duì)比見表1。
表1 合成CysC基因與野生型CysC基因序列對(duì)比
以少量堿裂解法快速提取的重組質(zhì)粒p PIC9k-Cys C,經(jīng)Eco RⅠ及NotⅠ雙酶切及DNA序列分析顯示,重組質(zhì)粒p PIC9k-Cys C符合設(shè)計(jì)要求,重組克隆構(gòu)建成功。
電轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化畢赤酵母,能產(chǎn)生足夠數(shù)量的轉(zhuǎn)化體。
陽(yáng)性表達(dá)菌在相對(duì)分子質(zhì)量約19 000處有一條帶,空載體陰性對(duì)照菌未見該條帶。表達(dá)水平與拷貝數(shù)呈正比,即高拷貝高表達(dá),產(chǎn)物約占分泌總蛋白的80%以上(圖1)。
圖1 表達(dá)產(chǎn)物的SDS-PAGE分析
通過SDS-PAGE分離的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上,能與相應(yīng)Cys C抗體形成單一蛋白條帶,證明表達(dá)純化的蛋白是Cys C蛋白(圖2)。
ELISA間接法測(cè)定抗血清效價(jià)為1∶8 000;Wester n blot測(cè)定顯示抗血清能與Cys C標(biāo)準(zhǔn)品發(fā)生免疫反應(yīng)。
Cys C定量測(cè)定結(jié)果顯示,Cys C高拷貝轉(zhuǎn)化子誘導(dǎo)表達(dá)的最佳收獲時(shí)間為120 h,其上清液濃度達(dá)到600~950 mg/L。
圖2 CysC表達(dá)蛋白鑒定
Cys C是一種半胱氨酸蛋白酶抑制劑,在抗病毒、抑制腫瘤的生長(zhǎng)、預(yù)防食品加工過程中蛋白水解方面具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。此外,內(nèi)源性Cys C是一種檢測(cè)GFR的新指標(biāo)。雖然已在大腸埃希菌中表達(dá)了Cys C融合蛋白,但該蛋白多以包涵體形式存在,而且由于原核生物密碼子的偏性,導(dǎo)致了大腸埃希菌為宿主菌的原核表達(dá)產(chǎn)物量低[1-4]。
為了高純度、高產(chǎn)量表達(dá)Cys C蛋白,本研究選擇了p PIC9k作為表達(dá)載體,并在P.pastoris GS115中表達(dá)Cys C。因?yàn)樵S多外源蛋白質(zhì)在酵母中表達(dá),得到類似于在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中產(chǎn)生的、結(jié)構(gòu)和生物活性相似的天然的蛋白質(zhì)[5-6]。此外,p PIC9k中的α因子分泌信號(hào)序列,使得畢赤酵母成為非常有用的蛋白表達(dá)系統(tǒng)。p PIC9k為整合型分泌表達(dá)載體,畢赤酵母His+轉(zhuǎn)化子高拷貝整合事件自發(fā)發(fā)生的概率為1%~10%,p PIC9k含有細(xì)菌kan基因,賦予畢赤酵母遺傳霉素抗性。遺傳霉素抗性水平主要依賴整合的kan基因的數(shù)目。單拷貝p PIC9k整合入畢赤酵母基因組后,賦予P.pastoris約0.25 g/L的遺傳霉素抗性水平。任何載體多拷貝整合可增加遺傳霉素抗性水平,從0.5 g/L(1~2拷貝)到4.0 g/L(7~12拷貝)。由于kan基因與表達(dá)盒(p AOX1及目的基因)之間有遺傳連鎖,可從遺傳霉素高抗性推斷該克隆所包含多拷貝目的基因數(shù)[7]。由于基因的劑量效益,蛋白的表達(dá)可能會(huì)增加,拷貝數(shù)越高表達(dá)量也越高[8]。
外源蛋白可在P.pastoris胞內(nèi)表達(dá)或分泌至胞外。分泌表達(dá)需要蛋白上的信號(hào)肽序列,將外源蛋白靶向分泌至胞外。P.pastoris只分泌很少的自身蛋白,加上P.pastoris最小生長(zhǎng)培養(yǎng)基中只有少量的蛋白,這意味著分泌的外源蛋白是培養(yǎng)基中蛋白的主要組成成分,也可算作蛋白純化的第一步。
在P.pastoris中表達(dá)較高的基因往往是采用P.pastoris本身所偏愛的密碼子,研究也表明在所有61個(gè)密碼子中有25個(gè)是P.pastoris偏愛的。趙翔等[9]通過對(duì)P.pastoris的28個(gè)蛋白編碼同義密碼子的使用情況進(jìn)行分析,確定了P.pastoris的19個(gè)高表達(dá)優(yōu)先密碼子。多位學(xué)者通過對(duì)密碼子進(jìn)行優(yōu)化,改良基因,大大提高了異源基因在P.pastoris中的表達(dá)[10-12]。
在以往的研究中,P.pastoris表達(dá)的Cys C基因均使用野生型基因[13],其密碼子可能不是宿主細(xì)胞進(jìn)行高水平表達(dá)所偏愛的密碼子,因此表達(dá)水平應(yīng)有提升空間。本研究根據(jù)P.pastoris表達(dá)系統(tǒng)的特性,在氨基酸序列不變的條件下,重新設(shè)計(jì)Cys C基因,去除復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu)和重復(fù)序列,調(diào)整GC含量,消除富含AT的序列區(qū)段,避免翻譯的提前終止,并且避免可能影響mRNA穩(wěn)定性的連續(xù)5個(gè)或5個(gè)以上的A/T或G/C重復(fù)序列。在120個(gè)氨基酸密碼子中有77個(gè)進(jìn)行了優(yōu)化,消除避免可能影響mRNA穩(wěn)定性的連續(xù)5個(gè)或5個(gè)以上的A/T或G/C重復(fù)序列9處,終止子由TAG轉(zhuǎn)換為TAA。優(yōu)化基因序列后,GC含量由原來的68.6%降低到43.6%。通過密碼子優(yōu)化,Cys C的表達(dá)水平達(dá)到600~950 mg/L的標(biāo)準(zhǔn),雖然其數(shù)值略低于通常高5~10倍的密碼子優(yōu)化的研究結(jié)果[14],但它仍然高于其他研究結(jié)果[15]。
本研究用P.pastoris表達(dá)重組Cys C的優(yōu)點(diǎn)為:①在酵母真核表達(dá)系統(tǒng)中進(jìn)行重組表達(dá),表達(dá)產(chǎn)物無(wú)需包涵體的變性和復(fù)性處理,也不需融合蛋白的凝血酶切割,誘導(dǎo)表達(dá)后收集培養(yǎng)液上清即可得到活性的Cys C;②表達(dá)量高,雜蛋白很少,表達(dá)量可以達(dá)到克級(jí),即使不純化,蛋白純度也可達(dá)到80%以上;③根據(jù)酵母密碼子偏好,優(yōu)化Cys C序列,可以進(jìn)一步提高Cys C表達(dá)量??梢?,根據(jù)P.pastoris密碼子的偏好,將人Cys C基因進(jìn)行密碼子優(yōu)化和表達(dá),為外源基因的表達(dá)提供了一種理想的方法。
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