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        利用文本挖掘探索干燥綜合征證藥特點(diǎn)*

        2013-11-21 08:01:58張志華郭洪濤馮福海李松偉
        中醫(yī)研究 2013年7期
        關(guān)鍵詞:網(wǎng)絡(luò)圖頻數(shù)證型

        張志華,郭洪濤,鄭 光,馮福海,李松偉

        (1.鄭州市中醫(yī)院 河南 鄭州450007; 2 河南中醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院風(fēng)濕科,河南 鄭州450000; 3.蘭州大學(xué)信息學(xué)院,甘肅 蘭州730000)

        干燥綜合征(Sjogren's syndrome,SS)是一種侵犯外分泌腺體,尤其以唾液腺和淚腺為主的慢性自身免疫性疾病,主要病理變化為外分泌腺淋巴細(xì)胞浸潤。本病可同時(shí)累及其他器官造成多種多樣的臨床表現(xiàn)[1],屬中醫(yī)學(xué)“燥證”“痹證”范疇[2]。本研究通過收集1978—2012 年中國生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫收錄的文獻(xiàn),利用課題組逐漸成熟的文本挖掘技術(shù)[3]進(jìn)行挖掘計(jì)算,探索干燥綜合征證、藥相應(yīng)規(guī)律。

        1 數(shù)據(jù)的收集與處理

        1.1 數(shù)據(jù)收集

        方法概述如下:在中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(Chinese BioMedical Literature Database,CBM,http://sinomed.cintcm.a(chǎn)c.cn/index.jsp)中以“缺?。壑悄埽?”狀態(tài)下檢索“干燥綜合征”,共得到文獻(xiàn)3 296篇(檢索日期:2013 年3 月3 日),依次下載所有文獻(xiàn)并保存。

        1.2 文本數(shù)據(jù)處理

        將收集來的數(shù)據(jù)按照下載的先后順序,整合到一個(gè)平面文件(后綴txt)里面,以ANSI 編碼格式保存;然后采用專有的文本提取工具(軟件著作權(quán),軟著登字第0261882 號,登記號2010SR073409)對下載的非結(jié)構(gòu)化txt 文本數(shù)據(jù)進(jìn)行信息提取,保存成格式化的、便于大型關(guān)系型數(shù)據(jù)庫(Microsoft SQL Server,以下簡稱SQL)處理的格式,再導(dǎo)入SQL 中進(jìn)行下一步的挖掘分析。假設(shè)每一篇文獻(xiàn)的貢獻(xiàn)度是相同的,一篇文獻(xiàn)中重復(fù)出現(xiàn)的關(guān)鍵詞只需要計(jì)算1 次,據(jù)此構(gòu)建算法進(jìn)行數(shù)據(jù)清洗工作[3]。清洗完畢后的數(shù)據(jù)既可以提取挖掘?qū)ο蟮囊痪S頻數(shù),也可以得到挖掘?qū)ο蟮亩S關(guān)系,進(jìn)行可視化呈現(xiàn)。抽出不同頻次的關(guān)鍵詞對,用Cytoscape 2.8 軟件進(jìn)行可視化處理,形成可視化的網(wǎng)絡(luò)圖,然后結(jié)合專業(yè)知識進(jìn)行解析。一旦發(fā)現(xiàn)不合理的結(jié)果,即回溯原文獻(xiàn)數(shù)據(jù)集。如果是噪音,仍按算法進(jìn)行噪音清洗,直至噪音降到滿意為止。最后的結(jié)果可視化成圖,結(jié)合專業(yè)知識進(jìn)行解析。

        2 干燥綜合征文本挖掘結(jié)果的評析

        2.1 證型文本挖掘結(jié)果

        在干燥綜合征文獻(xiàn)數(shù)據(jù)集中共提取到中醫(yī)證型57 項(xiàng),為了便于顯示,選取前20 項(xiàng),按證型在數(shù)據(jù)集中出現(xiàn)的頻數(shù)高低列出,見表1。

        表1 文本挖掘干燥綜合征相關(guān)中醫(yī)證型

        以上結(jié)果表明:干燥綜合征文獻(xiàn)頻次最高的證型為氣陰兩虛證,綜合顯示該病多見虛證、熱證,少見實(shí)證、寒證;虛證多見氣陰、肝腎、津液等方面的虛損。

        為了找到干燥綜合征數(shù)據(jù)集中主治證型之間的相互關(guān)系,運(yùn)用基于敏感關(guān)鍵詞頻數(shù)統(tǒng)計(jì)的數(shù)據(jù)分層算法計(jì)算每篇文獻(xiàn)中兩兩出現(xiàn)的相關(guān)證型得到的結(jié)果,使用cytoscape 軟件構(gòu)建證型兩兩之間網(wǎng)絡(luò)圖:圖中圓圈內(nèi)為證型名稱,連線代表證型兩兩之間的聯(lián)系。證型的連線愈多,圓圈就越大,代表該證型與干燥綜合征的關(guān)聯(lián)程度越高,越處于核心的位置。見圖1。

        圖1 干燥綜合征相關(guān)證型網(wǎng)絡(luò)圖

        文本挖掘共提取到130 項(xiàng)證型組合,圖1 為證候挖掘結(jié)果參與構(gòu)建的網(wǎng)絡(luò)圖。由圖可知:氣陰兩虛與其他證型的連線最多,為核心證型;而肝腎陰虛、陰虛津虧、陰虛血瘀等為干燥綜合征常見證型。綜上所述,干燥綜合征的證型中氣陰兩虛證最常見,陰虛、氣虛、津虧、血瘀、燥毒等是本病的基本致病因素。

        2.2 中藥文本挖掘結(jié)果

        在干燥綜合征文獻(xiàn)數(shù)據(jù)集中共提取到相關(guān)中藥名稱123 個(gè),為了方便展示,選取前20 個(gè),按中藥在數(shù)據(jù)集中出現(xiàn)的頻數(shù)高低列出見表2。

        表2 文本挖掘干燥綜合征相關(guān)中藥

        由表1 可知,治療干燥綜合征的中藥中,生地黃出現(xiàn)的頻數(shù)最多,而生地黃性味甘寒,能清熱、生津、潤燥,也與干燥綜合征多“虛、熱”發(fā)病相應(yīng),應(yīng)為其治療的主藥。麥冬、白芍頻次也較高,均能滋陰潤燥,應(yīng)為核心藥物。回溯原文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)雷公藤均與雷公藤多苷有關(guān),因此應(yīng)列為噪音剔除。其他均為治療干燥綜合征的常用中藥。

        文本挖掘共提取到中藥組合289 項(xiàng),為方便成圖,選擇頻次大于等于2 的70 項(xiàng)中藥組合構(gòu)建中藥網(wǎng)絡(luò)圖(圖2)如下:

        圖2 干燥綜合征相關(guān)中藥網(wǎng)絡(luò)圖(PS≥2)

        圖2 可知,麥冬頻次最高,應(yīng)作為主藥。麥冬性甘、微苦、涼,能滋陰生津、潤肺止咳、清心除煩。沙參、天花粉、生地黃等次之,這些中藥應(yīng)為治療干燥綜合征的核心藥物。其他玄參、知母、石斛等為常用中藥。綜上所述,干燥綜合征的中藥治療以滋陰潤燥為主,活瘀解毒為輔。藥物以生地黃、麥冬、沙參、白芍、甘草、當(dāng)歸等為核心藥物。

        3 討 論

        文本挖掘技術(shù)是以統(tǒng)計(jì)數(shù)理分析、計(jì)算語言學(xué)為理論基礎(chǔ),服務(wù)于醫(yī)藥、生物、文獻(xiàn)研究等學(xué)科的新興的交叉學(xué)科[4]。運(yùn)用于中醫(yī)藥領(lǐng)域,文本挖掘能從海量的中醫(yī)藥文獻(xiàn)中發(fā)現(xiàn)知識以促進(jìn)中醫(yī)臨床研究和中藥復(fù)方研發(fā)等。根據(jù)中醫(yī)理論或?qū)I(yè)知識,計(jì)算機(jī)挖掘中醫(yī)藥文獻(xiàn)庫與生物醫(yī)學(xué)信息庫的非關(guān)聯(lián)知識,為中西醫(yī)結(jié)合研究提供新的思路和途徑,并且結(jié)果更加客觀,可重復(fù)性強(qiáng)[5]。

        文本挖掘能夠從具有大量信息的文本材料中抽取知識[4]。近年來,隨著各種信息傳媒和通量的不斷加大,中醫(yī)藥規(guī)律研究呈現(xiàn)多元化的趨勢[6]。應(yīng)用于中醫(yī)藥領(lǐng)域,計(jì)算機(jī)能夠文本挖掘中醫(yī)藥文獻(xiàn)庫與生物醫(yī)學(xué)信息庫的非關(guān)聯(lián)知識,為中醫(yī)藥的現(xiàn)代研究提供新的思路和途徑[7]。文本挖掘計(jì)算的結(jié)果,結(jié)合原文獻(xiàn)回溯,人工閱讀分析降噪等方法,使得結(jié)果更加客觀;最終的結(jié)果,借助cytoscape 軟件作圖,使得結(jié)果更加直觀,可視性強(qiáng)[8]。

        本研究針對從CBM 收集到相關(guān)干燥綜合征的3 296 篇文獻(xiàn),采用課題組逐漸成熟的文本挖掘技術(shù)[3],結(jié)合回溯原文獻(xiàn),人工閱讀降噪,對干燥綜合征從證型、中藥規(guī)律方面進(jìn)行挖掘,挖掘的結(jié)果既看到它們在文獻(xiàn)中的頻數(shù),又可以發(fā)現(xiàn)它們各自在關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)中的分布規(guī)律。從挖掘的結(jié)果來看,干燥綜合征的證型中氣陰兩虛證最常見,陰虛、氣虛、津虧、血瘀、燥毒等是本病的基本致病因素。干燥綜合征的中藥治療以滋陰潤燥為主,活瘀解毒為輔。藥物以生地黃、麥冬、沙參、白芍、甘草等為核心藥物。

        中醫(yī)處方是在辨證論治基礎(chǔ)上,根據(jù)治法,以不同藥物配伍形成的具有復(fù)雜功能的載體,是中醫(yī)治療疾病的重要手段?,F(xiàn)有文獻(xiàn)報(bào)告總結(jié)了臨床工作者治療干燥綜合征的主要經(jīng)驗(yàn)用藥。通過文本挖掘干燥綜合征現(xiàn)有文獻(xiàn)數(shù)據(jù),能夠便捷總結(jié)干燥綜合征證、藥特點(diǎn),為中醫(yī)臨床提供有益的探索與參考;同時(shí),通過挖掘分析,也為疾病的中藥配伍提供了一種新的探索方法。

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