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        miR-455慢病毒表達(dá)載體的構(gòu)建與鑒定

        2013-10-29 09:37:00張康梅倩李祥趙亞力韓為東孟元光
        生物技術(shù)通訊 2013年1期
        關(guān)鍵詞:質(zhì)粒試劑盒測序

        張康 ,梅倩 ,李祥 ,趙亞力 ,韓為東 ,孟元光

        解放軍總醫(yī)院 a.婦產(chǎn)科;b.基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)所分子生物室;北京 100853

        微小RNA(microRNA,miRNA)是近年研究較為廣泛的一類小分子非編碼調(diào)控的內(nèi)源性單鏈RNA,由19~25個核苷酸組成,通過與mRNA的3'非翻譯區(qū)結(jié)合,降解mRNA或抑制其翻譯,使基因在轉(zhuǎn)錄后水平產(chǎn)生沉默,調(diào)控基因表達(dá)[1]。目前,人類基因組中已確認(rèn)數(shù)以千計的miRNA,可能參與人類30%的蛋白質(zhì)的表達(dá)調(diào)控,對細(xì)胞周期調(diào)節(jié)、細(xì)胞生長、發(fā)育、凋亡、代謝、應(yīng)激反應(yīng)及腫瘤發(fā)生發(fā)展等過程都有重要的作用[2-5]。隨著越來越多新的miRNA及其功能的不斷發(fā)現(xiàn),miRNA作為生物體重要的基因調(diào)控分子,與疾病的關(guān)系尤其是與腫瘤的關(guān)系成為生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域研究的熱點。

        目前,研究miRNA功能多采用人工合成miRNA擬似物或拮抗物,但其作用時間短,難以適應(yīng)腫瘤等漸進(jìn)性疾病的研究。作為真核生物細(xì)胞基因轉(zhuǎn)移的載體系統(tǒng)之一,人類免疫缺陷病毒1(HIV-1)來源的慢病毒載體越來越受到重視[6]。本研究旨在針對miRNA-455(miR-455)開展慢病毒質(zhì)粒載體的構(gòu)建研究,以探討miR-455在宮頸癌中的作用機(jī)制和利用慢病毒進(jìn)行基因治療的可能性。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        人宮頸癌細(xì)胞株SiHa、病毒包裝細(xì)胞293T(本實驗室保存,為貼壁細(xì)胞);大腸桿菌TOP10(天根生化公司);MEM培養(yǎng)基、胎牛血清(Gibco公司);慢病毒表達(dá)載體pWPT-GFP、輔助包裝原件載體pMD2G和 pSPAX2(本實驗室保存)(圖 1);TRIzol試劑、Li?pofetAMINE2000(Invitrogen公 司);SYBR Realtime PCR Master Mix(TOYOBO公司);限制性核酸內(nèi)切酶BamHⅠ、MluⅠ及T4DNA連接酶(NEB公司);D2000 DNA marker(大連寶生物工程公司);小量質(zhì)粒提取試劑盒、DNA純化試劑盒(SBS公司);質(zhì)粒大提試劑盒(QIAGEN公司)。

        1.2 PCR擴(kuò)增pri-miR-455

        通過EMBL數(shù)據(jù)庫獲得has-miR-455初始形式(pri-miR-455)的序列,應(yīng)用Primer 5.0軟件設(shè)計引物并由Invitrogen公司合成(引物F:5'CGGGATCCT GGCACAATGTTGGCAC3';引 物 R:5'CGACGCGTG AAGCAAACTTACTCGT3',上下游引物分別含有BamHⅠ和MluⅠ酶切位點);以正常人基因組DNA為模板擴(kuò)增,反應(yīng)程序:94℃ 5 min,94℃ 30 s,55℃ 30 s,72℃ 30 s,35個循環(huán),每管 20 μL體系;純化并回收PCR產(chǎn)物。

        1.3 miR-455慢病毒質(zhì)粒的構(gòu)建

        圖1 pWPT-GFP質(zhì)粒圖譜

        PCR擴(kuò)增pri-miR-455,載體質(zhì)粒為pWPTGFP,酶切位點為BamHⅠ和MluⅠ,酶切4 h使其線性化后,以1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定比例,確定連接比例,進(jìn)行連接。酶切回收載體DNA(100 ng/μL)1 μL,退火雙鏈 DNA(100 ng/μL)6 μL,10×T4噬菌體DNA 連接酶緩沖 液 2 μL,T4DNA 連 接 酶 1 μL,ddH2O 10 μL,16℃連接過夜,轉(zhuǎn)化細(xì)菌。陽性克隆PCR鑒定:上、下游引物各0.5 μL,2×Tap PCR Mas?ter Mix 10 μL,菌落裂解液 1 μL(陽性對照組不加,陰性對照組加水),由ddH2O配置反應(yīng)體系為20 μL。PCR反應(yīng)條件:94℃熱啟動30 s;94℃變性30 s,55℃復(fù)性30 s,72℃延伸30 s,30個循環(huán),72℃聚合6 min。分別挑選3個序列的陽性克隆送華大基因公司測序鑒定。

        1.4 質(zhì)粒抽提

        用QIAGEN公司試劑盒抽提3種質(zhì)粒,參照試劑盒說明書進(jìn)行。

        1.5 慢病毒重組體的包裝、感染

        胰蛋白酶消化對數(shù)生長期的293T細(xì)胞,以5×105接種于細(xì)胞培養(yǎng)皿中,于37℃、5%CO2培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng),細(xì)胞密度達(dá)70%~80%時進(jìn)行轉(zhuǎn)染。測序鑒定正確的重組質(zhì)粒pWPT-GFP-pri-miR-455及2種輔助包裝原件載體質(zhì)粒 pSPAX2、pMD2G,按照 4∶2∶1的比例混合,用LipofetAMINE2000共轉(zhuǎn)染到293T細(xì)胞,轉(zhuǎn)染5 h后更換正常培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng),48、72 h后分別收集培養(yǎng)上清,感染未轉(zhuǎn)染的SiHa細(xì)胞。

        1.6 Real-time定量PCR檢測慢病毒感染后miR-455的表達(dá)

        小量包裝獲得的慢病毒轉(zhuǎn)染宮頸癌SiHa細(xì)胞,感染3 d后在熒光顯微鏡下觀察GFP的表達(dá),若感染率低于50%則重新轉(zhuǎn)染;若感染率超過50%,待感染5 d后,選擇3~5個視野/孔,在熒光顯微鏡下觀察發(fā)綠色熒光細(xì)胞的平均數(shù)與總細(xì)胞平均數(shù)的比值,估計質(zhì)粒的轉(zhuǎn)染效率。收集細(xì)胞,用Real-time定量PCR方法檢測miR-455的表達(dá),進(jìn)而判斷病毒的感染效率。PCR方法同上。定量數(shù)值采用2-ΔΔCt方法計算。每組重復(fù)3次實驗。

        1.7 統(tǒng)計學(xué)方法

        所有實驗結(jié)果用SPSS 13.0進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,采用配對t檢驗,P<0.05示差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 pri-miR-455的擴(kuò)增

        以基因組DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到大小為550 bp的片段(圖2),DNA測序證明擴(kuò)增片段的核苷酸序列與GenBank中的pri-miR-455序列完全一致(序列未示)。

        2.2 pWPT-GFP-pri-miR-455重組質(zhì)粒的陽性克隆鑒定

        pWPT-GFP-pri-miR-455重組質(zhì)粒陽性克隆的PCR產(chǎn)物1%瓊脂糖凝膠電泳見圖3,經(jīng)測序,1~8號均正確。

        2.3 質(zhì)粒pWPT-GFP-pri-miR-455對293T細(xì)胞的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率

        圖2 pri-miR-455 PCR產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳分析

        先鑒定構(gòu)建的質(zhì)粒對293T細(xì)胞的轉(zhuǎn)染效率,轉(zhuǎn)染效率在90%以上(圖4A);以2-ΔΔCt分析法計算,轉(zhuǎn)染48 h后miR-455的表達(dá)量提高了37.1倍(圖4B)。

        2.4 慢病毒對SiHa細(xì)胞的感染效率

        先鑒定構(gòu)建的慢病毒上清對SiHa細(xì)胞的轉(zhuǎn)導(dǎo)效率,感染效率在90%以上(圖5A);以2-ΔΔCt分析法計算,病毒感染后miR-455的表達(dá)量上調(diào)近40倍(圖5B)。

        3 討論

        miRNA作為一類具有基因表達(dá)調(diào)節(jié)作用的小分子,參與各種生物體的生理和病理功能[7],約30%的蛋白編碼基因受其調(diào)控[8],其功能研究是近年來人們一直關(guān)注的話題。

        圖3 載體pWPT-GFP-pri-miR-455的測序結(jié)果

        圖4 質(zhì)粒pWPT-GFP-pri-miR-455對293T細(xì)胞的轉(zhuǎn)染效率

        圖5 慢病毒上清對SiHa細(xì)胞的感染效率

        目前研究miRNA功能及機(jī)制的方法較多,但大致分為過表達(dá)或抑制表達(dá)兩種方式。過表達(dá)研究又常選用瞬時轉(zhuǎn)染或構(gòu)建表達(dá)載體方法。瞬時轉(zhuǎn)染可將人工合成的miRNA或其靶基因擬似物(mimics)[9]這些短序列,通過轉(zhuǎn)染方式使其在體內(nèi)發(fā)揮作用。此類方法實施起來方便快捷,但所建立的miRNA功能獲得或缺失的動物模型無法適應(yīng)長期研究,更無法進(jìn)行傳代。通過慢病毒包裝技術(shù)可解決這一問題,尤其是miRNA在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用等研究中,模式動物的建立將會發(fā)揮更大作用。

        慢病毒載體是以HIV-1為基礎(chǔ)發(fā)展起來的新興載體,可以高效感染分裂期及非分裂期細(xì)胞,具有方法簡單、目的基因整合率高并長期表達(dá)、免疫原性低等優(yōu)點。此外,慢病毒為“自殺”性病毒,感染目的細(xì)胞后不會再感染其他細(xì)胞及產(chǎn)生新的病毒顆粒,安全性高,因而是一種強有力的基因運輸工具,已成為當(dāng)前基因治療中載體研究的熱點。

        我們采用分子克隆技術(shù)構(gòu)建了miR-455慢病毒表達(dá)載體,并建立了基于SiHa細(xì)胞的高效轉(zhuǎn)染系統(tǒng),為進(jìn)一步鑒定miR-455在宮頸癌中的作用靶點及對其進(jìn)行功能研究提供了有力支持。

        [1]BartelD P.MicroRNAs:genomics,biogenesis,mechanism,and function[J].Cell,2004,116(2):281-297.

        [2]AmbrosV.ThefunctionsofanimalmicroRNAs[J].Nature,2004,431(7006):350-355.

        [3]Mendell J T.MicroRNAs:critical regulators of development,cellular physiology and malignancy[J].Cell Cycle,2005,4(9):1179-1184.

        [4]Bushati N,Cohen S M.microRNA functions[J].Annu Rev Cell Dev Biol,2007,23:175-205.

        [5]Ambros V.MicroRNA pathways in flies and worms:growth,death,fat,stress,and timing[J].Cell,2003,113(6):673-676.

        [6]Naldini L,Blomer U,Gallay P.In vivo gene delivery and sta?ble transduction of nondividing cells by a lentiviral vector[J].Science,1996,272(5259):263-267.

        [7]Williams A E.Functional aspects of animal microRNAs[J].Cell Mol Life Sci,2008,65(4):545-562.

        [8]Lewis B P,Burge C B,Bartel D P.Conserved seed pairing,often flanked by adenosines,indicates that thousands of hu?man genes are microRNA targets[J].Cell,2005,120(1):15-20.

        [9]Chitwood D H,Timmermans M C.Target mimics modulate miRNAs[J].Nat Genet,2007,39(8):935-936.

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