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        aFGF特異性結(jié)合噬菌體的篩選與鑒定

        2013-10-12 06:19:36謝瑞敏
        關(guān)鍵詞:包被噬菌體靶標

        黃 霞,謝瑞敏,嚴 峰

        (海南大學 海洋學院,海南 海口 570228)

        自從于1940年發(fā)現(xiàn)成纖維細胞生長因子(fibroblast growth factors,F(xiàn)GFs)后,經(jīng)過半個多世紀的不斷認識和探究,現(xiàn)已初步了解其作用機制.FGFs是由23個成員組成的蛋白質(zhì)家族(FGFl~FGF23[1]).酸性成纖維細胞生長因子(acid fibroblast growth factor,aFGF),即FGF1,大量存在于腎臟和腦組織中[2].aFGF的生理功能和生物學效應(yīng)豐富多樣,尤其在促進機體的生長發(fā)育、修復(fù)組織的損傷等方面發(fā)揮重要作用.研究表明,aFGF具有促進腫瘤細胞增殖的作用,在腫瘤組織的細胞表面表達豐富,和腫瘤的發(fā)生和發(fā)展具有密切關(guān)系[3-9].所以,我們可以從篩選aFGF拮抗肽入手,為腫瘤治療提供新的途徑.

        噬菌體展示技術(shù)(phage display technology,PDT)是在1985年由Smith[10]創(chuàng)建,在逐步完善的基礎(chǔ)上,因為其高效、簡便的優(yōu)勢而被廣泛運用于生物醫(yī)藥領(lǐng)域.它是通過將靶標蛋白包被固相載體后,從噬菌體肽庫中篩選出特異性結(jié)合的短肽,并通過測序和合成用于新藥研究.由于FGFs具有廣闊的應(yīng)用前景,為了得到其有效的抑制短肽,噬菌體展示技術(shù)提供了新的途徑.其中,F(xiàn)an等[11]用噬菌體15肽庫,以固相包被的aFGF為靶標,篩選得到的15肽,其中的SSG和VPS基序與FGFR1相同.經(jīng)一系列實驗證明,其能夠有效的抑制aFGF促進細胞的增殖.而用噬菌體7肽庫篩選,與15肽庫篩選相比較,具有:特異性更高、空間位阻更小、體內(nèi)穩(wěn)定性高、穿透腫瘤組織的能力強以及免疫源性低的優(yōu)點.因此,我們用噬菌體7肽庫,以固相包被的aFGF為靶標,篩選aFGF的結(jié)合肽,并進行了初步的研究鑒定,可為抗腫瘤新藥提供重要基礎(chǔ).

        1 材料與方法

        1.1 實驗材料

        噬菌體七肽庫(Ph.D.-7TMPhage Display Peptide Library)、E.coli ER2738均購自New England BioLabs公司.噬菌體篩選和擴增以及滴度測定、基因組的抽提參考NEB使用手冊.HRP-抗M13抗體為Amersham Pharmacia公司產(chǎn)品.輔助噬菌體vcsM13購自Biovector.人aFGF購自Sigma公司,Balb/c 3T3細胞株由本研究室保存.

        1.2 實驗方法

        1.2.1 aFGF結(jié)合肽的篩選

        將aFGF用0.1 mol/L pH 8.6的NaHCO3溶液稀釋后,包被96孔酶標板,4℃輕微震蕩,孵育過夜.次日,倒掉板中的包被液,加滿封阻液,4℃作用2 h.再用TBST(TBS+0.1%[v/v]Tween-20)緩沖液快速洗板6次.加入用TBST稀釋的原始噬菌體肽庫結(jié)合2 h后用TBST洗板10次.再用非特異性緩沖液Glycine-HCl洗脫 10 min,用 1 mol/L Tris-HCl(pH 9.1)中和洗脫液.取1 μL測滴度,剩的洗脫液全部擴增用于下一輪篩選.每輪逐步減少aFGF的包被量和結(jié)合時間、提高吐溫濃度以及洗板時間,重復(fù)4輪淘選.

        1.2.2 鑒定aFGF特異性結(jié)合噬菌體克隆及測序

        將aFGF用NaHCO3溶液稀釋后,包被96孔酶標板過夜.次日,倒去包被液,封閉液封閉2 h.用1×TBS/Tween洗板6次,Tween濃度與第四輪篩選步驟中所用濃度相同.加入噬菌體孵育,TBST洗脫后加入HRP-抗M13抗體,孵育1 h,TMB避光顯色,H2SO4終止反應(yīng),酶標儀(318-MC型,上海高科技儀器有限公司)450 nm測OD值,空白對照.挑取陽性克隆,按照NEB使用手冊進行擴增.以5'-CCCTCATAGTTAGCGTAACG-3'為測序引物,送華大基因公司測序.

        1.2.3 aFGF競爭抑制實驗

        用aFGF稀釋液包被96孔酶標板,4℃過夜.次日去包被液加封閉液,4℃靜置封閉l h后TBST洗脫.將aFGF依次稀釋為40、20、10、5、2.5、1.25 μg·mL-1,然后與陽性噬菌體克隆室溫孵育.再將二者結(jié)合液加到96孔板中競爭結(jié)合.每個濃度設(shè)3個復(fù)孔,以野生型vcsM13噬菌體做對照.TBST洗脫后加入HRP-抗M13抗體,孵育1 h,TMB避光顯色,H2SO4終止反應(yīng),酶標儀450 nm測OD值.

        1.2.4 先導(dǎo)肽對aFGF誘導(dǎo)的Balb/c 3T3細胞增值的影響

        在96孔酶標板中按每孔6000個細胞的密度加入Balb/c 3T3細胞,24 h后加入150 μL含0.4%血清的DMEM培養(yǎng)液,37℃5%CO2饑餓培養(yǎng)24 h.將稀釋的陽性噬菌體與aFGF混合物加入,每種樣品設(shè)4個稀釋度各3個復(fù)孔.以vcsM13噬菌體做對照.繼續(xù)培養(yǎng)48 h后加入20 μl MTT,再培養(yǎng)4 h.加入DMSO終止反應(yīng),30 min后,570 nm測OD值.

        2 結(jié)果

        2.1 特異性噬菌體的篩選與富集

        通過四輪篩選,與aFGF結(jié)合的噬菌體每一輪的回收率都在逐步提高,P/N值第四輪達到了93,表明四輪篩選的特異性都非常高.通過四輪篩選,特異性的噬菌體已經(jīng)得到了有效的富集(見表1).

        表1 四輪親和淘選中噬菌體的富集Tab.1 The enrichment of phages in four rounds of biopanning

        2.2 aFGF特異性結(jié)合噬菌體的初步鑒定

        根據(jù)Takayasu[12]等在2010年發(fā)表于BBB雜志上的文獻作參考,將四輪篩選出的噬菌體做ELISA對照實驗,結(jié)果見圖1.

        可以看出,每一輪篩選的特異性都在逐步提高,說明特異性噬菌體的富集效果很好.從少于~100個藍斑的平皿上隨機挑選24個分隔良好的單克隆做ELISA實驗,可以得出2、7、8、20、21號的OD值與對照組相比有顯著差異,其中8號噬菌體(P8)的特異性最顯著.見圖2.

        2.3 aFGF結(jié)合肽的測序

        將挑取的24個噬菌體單克隆擴增提DNA后,送華大基因公司測序,其中得出P8的展示短肽序列為AHVPSRS,與FGFR1中“—V220PSdkgnyt C229—”含有相同的基序.

        圖1 四輪篩選的噬菌體液ELISAFig.1 ELISA of phage mixture after fourth round

        2.4 aFGF的競爭抑制實驗

        將P8噬菌體預(yù)先與aFGF充分結(jié)合,然后將混合物加到aFGF包被的96孔酶標板中.以兩種不同作用形式的aFGF來競爭結(jié)合P8噬菌體,以此檢測P8噬菌體與aFGF結(jié)合的特異性(見圖3).可以看出,隨著游離aFGF濃度的逐步降低,對固相包被的aFGF與P8噬菌體結(jié)合的抑制作用亦隨之降低,而野生型vcsM13噬菌體的抑制作用無明顯變化.可以得出,篩選得到的P8噬菌體具有與aFGF高度結(jié)合的能力.

        2.5 P8先導(dǎo)肽對aFGF誘導(dǎo)的Balb/c 3T3細胞增殖的影響

        通過MTT實驗,可看出p8噬菌體對aFGF誘導(dǎo)的Balb/c 3T3細胞增殖有明顯的抑制作用(見圖4).隨著噬菌體的濃度增高,細胞增殖的抑制效果也隨之增高,抑制率高達73%,而野生型vcsM13噬菌體的影響作用卻無明顯變化.

        圖2 ELISA分析噬菌體陽性克隆與aFGF的結(jié)合能力Fig.2 The binding ability of the positive phage clones to aFGF analyzed by ELISA

        圖3 游離aFGF對P8噬菌體與固定化aFGF結(jié)合的競爭抑制作用Fig.3 Competitive inhibition of P8 phage binding to the immobilized aFGF by free aFGF

        圖4 P8噬菌體對aFGF誘導(dǎo)的Balb/c 3T3細胞增殖的影響Fig.4 Efects of P8 phage on Balb/c 3T3 cell proliferation induced by aFGF

        3 討論

        噬菌體展示技術(shù)是一項篩選技術(shù),將外源多肽或蛋白與噬菌體的衣殼蛋白融合表達,融合蛋白展示在病毒顆粒的表面,而編碼該融合子的DNA則位于病毒粒子內(nèi).使大量多肽與其DNA編碼序列之間建立了直接聯(lián)系,從而使各種靶分子(抗體、酶、細胞表面受體等)的多肽配體通過淘選得以快速鑒定[13].而噬菌體7肽庫的特點是將外源7肽表達于pⅢ蛋白的N末端,而C端連接G-G-G-S多肽.以pⅢ融合子方式表達的多肽是低價的,而以pⅧ融合子方式表達的多肽則是高價的.這種高價pⅧ展示所增加的親和力有利于篩選得到親和力非常低的配體,而低價pⅢ展示則將篩選限制在具有較高親和力的配體上.

        用噬菌體肽庫進行篩選時,篩選的嚴謹性和產(chǎn)量的關(guān)系很重要.篩選嚴謹性的提高,能提高噬菌體的特異性,但產(chǎn)量會因此而降低;如果產(chǎn)量太高,則會得到許多特異性低的噬菌體.因此,本實驗通過改變不同的篩選條件來達到嚴謹性與產(chǎn)量的平衡:即減少每輪靶標蛋白包被量(15.0、10.0、5.0、2.5 μg)、減少每輪噬菌體與靶標蛋白的結(jié)合時間(2.0、1.5、1.0、0.5 h)、提高TBST中Tween-20的濃度(0.05%、0.10%、0.20%、0.40%),延長洗滌時間(1min/次、2min/次、3min/次、4min/次).經(jīng)過嚴謹性逐步提高的四輪篩選,高特異性的噬菌體得到了有效的富集.

        aFGF的作用方式是先結(jié)合肝素,再通過HSPG與受體FGFR的胞外結(jié)合域相連,通過激活受體胞質(zhì)部的酪氨酸自身磷酸化而引發(fā)信號通路發(fā)揮作用的,其中主要是與FGFR1相結(jié)合.本實驗所使用的Balb/c 3T3細胞則從Balb/c小鼠的胚胎成纖維細胞獲得,其細胞表面的受體FGFR1和FGFR2表達豐富.從實驗數(shù)據(jù)可以看出,與野生型噬菌體vcsM13相比,P8噬菌體能夠明顯的抑制aFGF對Balb/c 3T3細胞的增殖作用.這可以說明,篩選得到的P8噬菌體與aFGF結(jié)合后,抑制了其與受體FGFR1的結(jié)合.P8噬菌體不是通過其他表面蛋白與aFGF結(jié)合的,而是競爭性結(jié)合了aFGF與FGFR1結(jié)合的位點,阻斷了aFGF與受體FGFR1的結(jié)合,阻斷了FGFR1的信號通路,從而有效地抑制了aFGF對Balb/c 3T3細胞的促分裂作用.本實驗通過噬菌體展示技術(shù),獲得了與aFGF具有高度特異性結(jié)合能力的7肽.在此基礎(chǔ)上,可對其具體的作用機制進一步研究,為下一步開發(fā)抗腫瘤新藥打下基礎(chǔ).

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