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        低水平乙型肝炎病毒表面抗原S區(qū)序列分析

        2013-09-26 09:57:06計(jì)玉仙張志明李建平姜小建肖改娥姜立茹

        計(jì)玉仙,張志明,李建平,姜小建,肖改娥,馬 瑩,舒 放,姜立茹,王 鑫

        (西安市中心醫(yī)院 檢驗(yàn)科,陜西 西安710003)

        乙型病毒性肝炎是一種嚴(yán)重影響人類健康的危害性疾病,目前全球至少約有3億乙型肝炎病毒攜帶者,感染乙型肝炎病毒可引起不同程度的急、慢性肝臟疾?。?],近年來(lái)由于乙型病毒性肝炎疫苗、高效價(jià)免疫球蛋白以及抗病毒藥物的廣泛應(yīng)用,造成部分乙型肝炎病毒表面抗原變異呈低水平表達(dá)[2],臨床上乙型肝炎病毒表面抗原含量大于0.15μg/L而小于5μg/L定義為低水平乙型肝炎病毒表面抗原,其成因較多[3],本文就37例低水平乙型肝炎病毒S區(qū)特征進(jìn)行初步研究和探索,現(xiàn)報(bào)道如下。

        1 資料與方法

        1.1 標(biāo)本來(lái)源

        選取西安市中心醫(yī)院2010年5月-2012年8月間門診及住院37例低水平乙型肝炎病毒表面抗原患者,年齡23-64歲,平均年齡41±19歲,其中男18例,女19例,多次檢測(cè)者只取首次資料,待測(cè)標(biāo)本放置-20℃保存。

        1.2 引物設(shè)計(jì) 根據(jù)美國(guó)GeneBank公布的HBV全基因序列,在S區(qū)設(shè)計(jì)兩條引物,內(nèi)引物Primer Pair1正 向 5’-TGTTTGCTGTACAAA-3’,反 向5’-TGGGAGTGGGCC-3’,外引物Primer Pair2正向 5’-TCACTACCAGCACG-3’, 反 向 5’-TCAGTTTACTAGT-3’引物由寶生物工程(大連)有限公司合成。

        1.3 主要試劑與儀器 PCR Premix、Loading Buffer、Lysis Buffer(寶生物工程大連有限公司)、瓊脂糖(BBI公司)、DL2000DNA Marker(MBI公司)、UNIQ-10核酸純化柱(上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司)、化學(xué)發(fā)光試劑盒(鄭州安圖綠科生物工程有限公司),HBsAg中和確認(rèn)試劑盒(珠海麗珠試劑股份公司)、HBsAg標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)2μg/L購(gòu)自康徹思坦生物公司。鄭州安圖綠科生物工程有限公司LUMO-Autobio化學(xué)發(fā)光儀、美國(guó)應(yīng)用生物公司ABI7300基因擴(kuò)增檢測(cè)儀、北京六一DYY-2C電泳儀、美國(guó)應(yīng)用生物公司ABI3730測(cè)序儀。

        1.4 方法

        1.4.1 低水平HBsAg篩查及確認(rèn) 采用酶聯(lián)免疫ELISA法和化學(xué)發(fā)光法檢測(cè)HBsAg并用HB-sAg中和試驗(yàn)進(jìn)行確認(rèn)[4]。

        1.4.2 HBV-DNA模板的提取 取100μL血清加入等量DNA濃縮液震蕩5s,12 000r/min離心10 min,去上清,沉淀中加入20μl DNA提取液,劇烈震蕩5-10s,瞬間離心數(shù)秒,100℃金屬浴處理10 min后12 000r/min離心5min。上清液2μl作為1st PCR的模板。

        1.4.3 PCR 反應(yīng)條件 (1)1st PCR反應(yīng) 在PCR反應(yīng)管(0.5ml)中加入2×PCR Premix 12.5μl,再向此反應(yīng)管中加入2μl已處理好的標(biāo)本和10.5μl的Primer Pair 1,高速離心數(shù)秒。按以下條件進(jìn)行1st PCR反應(yīng)94℃ 預(yù)變性1min,92℃變性30sec,55℃退火30s,72℃延伸5min共30個(gè)Cycles(2)2nd PCR反應(yīng) 在PCR反應(yīng)管0.5ml中加入2×PCR Premix 12.5μl,再向此反應(yīng)管中加入2μl的1st PCR擴(kuò)增液和10.5μl的Primer Pair 2,高速離心數(shù)秒,按以下條件進(jìn)行2nd PCR反應(yīng)92℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸7min共35個(gè)Cycles。

        2 結(jié)果

        2.1 電泳結(jié)果判定 向2nd PCR擴(kuò)增液中加入5 μL的6×Loading Buffer,混勻后取10-15μL進(jìn)行2%的瓊脂糖凝膠電泳。PCR擴(kuò)增液在230bp附近有DNA亮帶,則此標(biāo)本也可以判定為陽(yáng)性(相當(dāng)于HBsAg陽(yáng)性);如果2nd PCR擴(kuò)增液在230bp附近沒(méi)有DNA亮帶,則此標(biāo)本可判定為陰性。Control實(shí)驗(yàn)時(shí),2nd PCR擴(kuò)增液在350bp附近有DNA亮帶(圖1)。

        圖1 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果

        2.2 HBV血清學(xué)分型判定

        HBV的血清學(xué)分型是由HBsAg第122個(gè)和第166個(gè)氨基酸是賴氨酸(或精氨酸來(lái)決定的。而實(shí)際上是由下述框中的DNA堿基(A或G)來(lái)決定的,決定d/y的堿基:(A--d,G--y);決定r/w 的堿基:(A--w,G--r)。用2nd PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行 DNA序列測(cè)定,測(cè)序結(jié)果(圖2)按照以下標(biāo)準(zhǔn)(圖3)判斷其乙肝病毒的亞型(Adw、Adr、Ayr及Ayw)。

        37例低水平乙型肝炎病毒表面抗原標(biāo)本中,成功擴(kuò)增并測(cè)序32份,其余5份擴(kuò)增產(chǎn)物因不滿足測(cè)序要求(沒(méi)出現(xiàn)目的條帶或條帶質(zhì)量不高)無(wú)法進(jìn)行S區(qū)序列分析,32份成功測(cè)序標(biāo)本經(jīng)經(jīng)美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館中Genotyping在線分析,B型20例(62.5%,20/32),C 型12例(37.5%,12/32),與 Gene-Bank中收錄的AF100309、AB014381參考序列同源性最高;血清學(xué)分型18例為adr,10例為adw,3例為ayw,1例為ayr,并發(fā)現(xiàn)21例S區(qū)核酸序列發(fā)生 點(diǎn) 突 變,突 變 率 為 (65.6%,21/32)分 別 為A514C、T562A 、G587A、A589C各1例,G508A、G509A、A529G、T531C、T581A 各 2 例,3 例G511A、4例G508C。

        3 討論

        圖2 低水平乙型肝炎病毒表面抗原S區(qū)測(cè)序結(jié)果

        圖3 乙肝病毒血清學(xué)分型(Adw、Adr、Ayr及Ayw)判定標(biāo)準(zhǔn)

        乙型肝炎病毒簡(jiǎn)稱乙肝病毒,是一種DNA病毒,主要分為A-H 8個(gè)基因型,由于基因型分布與地域和人群密切相關(guān),國(guó)內(nèi)學(xué)者對(duì)各地HBV基因型分布已進(jìn)行了廣泛研究,2011年王林川[5]等對(duì)西安地區(qū)348例乙肝患者分型表明HBV B基因型87例(24.2%);C型233例(64.7%);B+C混合型2例(0.56%),未檢出 A、D、E、F、G、H 型,與本文32份該地區(qū)低水平乙型肝炎病毒B型20例(62.5%,20/32),C型12例(37.5%,12/32)研究群體有明顯差異(P<0.01)。

        HBsAg是乙肝病毒包膜的主要蛋白,HBsAg有一個(gè)特異的共同抗原決定簇“a”和至少兩個(gè)亞型決定簇“d/y”和“w/r”,根據(jù)其抗原性的不同主要分為4個(gè)血清型(HBsAg的亞型)即Adw、Adr、Ayr、Ayw,最常見(jiàn)的血清型為Adw、Adr和ayw,我國(guó)絕大數(shù)地區(qū)以Adr為主,Adw次之,新疆、西藏、內(nèi)蒙古[6-8]等自治區(qū)的本地民族幾乎全為Ayw。32例低水平乙型肝炎經(jīng)血清學(xué)分型18例為Adr,10例為Adw,3例為Ayw,1例為 Ayr,血清型分布與一般乙型肝炎病毒血清型分布無(wú)差異。

        HBV DNA聚合酶因缺乏矯正功能,乙肝病毒是突變頻率很高的DNA病毒,尤其在目前抗病毒藥物廣泛應(yīng)用的情況下[9],本研究中共有21例低水平乙型肝炎病毒表面抗原S區(qū)發(fā)生突變,突變率為65.6%,其中15例突變不會(huì)引起編碼抗原決定簇氨基酸突變,為無(wú)義突變,突變點(diǎn)分別是A514C、T562A各1例,G508A、G509A、A529G各2例,3例G511A、4例 G508C,而其他6例如 T531C、T581A各2例,G587A、A591C各1例核苷酸點(diǎn)突變均可引起抗原決定族編碼的氨基酸的改變?nèi)鏘126T、S143T、G145R、N146T,從而導(dǎo)致表面抗原結(jié)構(gòu)改變。

        乙型肝炎病毒表面抗原S區(qū)核苷酸編碼的變異可能導(dǎo)致臨床上常規(guī)檢測(cè)方法無(wú)法準(zhǔn)確檢測(cè)而導(dǎo)致漏檢、誤診,也可能因?yàn)镾區(qū)核苷酸編碼的變異導(dǎo)致臨床常規(guī)治療無(wú)效,總之,對(duì)低水平乙型肝炎病毒表面抗原患者S區(qū)序列的研究將為低水平乙型肝炎發(fā)病機(jī)制、流行病學(xué)以及個(gè)體化治療奠定基礎(chǔ)。

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