亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        多重PCR方法鑒定牛結(jié)核分枝桿菌的研究

        2013-09-11 02:38:24張喜悅呼西旦杜鵬飛努爾拜合提古努爾吐爾遜孫照剛范偉興
        中國動(dòng)物檢疫 2013年7期
        關(guān)鍵詞:結(jié)核結(jié)核病引物

        張喜悅 ,呼西旦,曹 瑞 ,杜鵬飛 ,努爾拜合提 ,古努爾·吐爾遜 ,孫照剛 ,范偉興

        (1.中國動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心,山東青島 266032;2.新疆牧科院獸醫(yī)研究所,新疆烏魯木齊 830000; 3.北京市胸部腫瘤結(jié)核病醫(yī)院,北京 101149)

        牛結(jié)核病主要是由牛結(jié)核分枝桿菌引起的一種人畜共患病[1],大多數(shù)牛不呈顯性感染或僅到晚期才出現(xiàn)臨床癥狀,故臨床診斷不易獲得準(zhǔn)確結(jié)果。目前常用的牛結(jié)核檢疫方法有變態(tài)反應(yīng)等免疫學(xué)方法,但在發(fā)達(dá)國家,仍然以細(xì)菌的分離和鑒定作為牛結(jié)核診斷方法的金標(biāo)準(zhǔn)[2-5]。我國在牛結(jié)核分枝桿菌的分離和鑒定上研究較少,這也成立制約我國確診牛結(jié)核病例的關(guān)鍵因素。

        傳統(tǒng)的牛結(jié)核分枝桿菌鑒定方法主要包括細(xì)菌形態(tài)、染色特性和生化鑒定等,這些鑒定方法操作較為復(fù)雜且需時(shí)較長。隨著結(jié)核分枝桿菌、牛結(jié)核分枝桿菌和多種非典型分枝桿菌的序列測定完畢,很多科學(xué)家通過比較基因組學(xué)設(shè)計(jì)引物,利用多重PCR方法快速鑒定結(jié)核分枝桿菌。如Wilton等建立了可以鑒定多種分枝桿菌的分枝桿菌多重PCR[6],Richard等建立可以區(qū)分牛結(jié)核分枝桿菌和人結(jié)核分枝桿菌的結(jié)核分枝桿菌群(MTC)PCR方法[7]。我們在檢疫出結(jié)核陽性牛并撲殺后,采集了病料進(jìn)行細(xì)菌分離,然后進(jìn)行多重PCR快速鑒定為牛結(jié)核分枝桿菌感染。

        1 材料與方法

        1.1 酶類、培養(yǎng)基和引物

        Taq DNA聚合酶(5U/μL)、PCR Master等購自大連寶生物公司;DNA Marker 、EB(溴化乙錠)(100kb DNA ladder)等購自Promega公司。Middle brook 7H11培養(yǎng)基,購自美國BD公司。按照表1所示序列,PCR引物由大連寶生物公司合成。

        表1 合成的引物序列

        1.2 標(biāo)準(zhǔn)菌株

        牛分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株M.bovis(ATCC 55235)均由北京市結(jié)核病胸部腫瘤研究所細(xì)菌免疫研究實(shí)驗(yàn)室提供。

        1.3 結(jié)核陽性牛的撲殺

        利用比較變態(tài)反應(yīng)和伽馬干擾素試驗(yàn)檢疫牛群,抽檢在2種方法中均為陽性的牛撲殺,觀察陽性牛的結(jié)核病變。

        1.4 分枝桿菌的培養(yǎng)

        無菌條件下,采集結(jié)核病變,加入適量的滅菌生理鹽水,經(jīng)研磨器勻漿處理后,加入2倍體積的4%硫酸,室溫下處理病料15~20 min。利用生理鹽水再將處理過的病料做10倍稀釋,用移液器分別接種0.2 mL至Middle brook 7H11 培養(yǎng)基。37℃培養(yǎng)6周,觀察結(jié)果。

        1.5 分離菌株的滅活與染色鑒定

        將初次培養(yǎng)的結(jié)核菌落再次接種到Middle brook 7H11 培養(yǎng)基上擴(kuò)大培養(yǎng)。分別將擴(kuò)大培養(yǎng)好的臨床分離菌株和牛結(jié)核分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株轉(zhuǎn)移到密閉的含有生理鹽水的試管中,將試管置于水浴鍋,經(jīng)80℃ 2h滅活。用分枝桿菌特異性Ziehl-Neelsen(Z-N)方法染色,于顯微鏡下觀察結(jié)果。

        1.6 分離菌株的分枝桿菌多重PCR鑒定

        1.6.1 分枝桿菌多重PCR方法 以滅活的分離菌株作為樣品,以牛分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株作為陽性對照,用 Mycgen、 TB1 、Mycav和 Mycint 4對引物進(jìn)行擴(kuò)增。反應(yīng)體系為20μL:樣品2 μL,4對引物(Mycgen、TB1、Mycav和Mycint)的上下游引物各 1 μL,PCR Master 10 μL。反應(yīng)程序?yàn)椋貉h(huán) 1:94℃ 10min,61℃ 2min,72℃ 3min,1個(gè)循環(huán);循環(huán)2:94℃ 1min,61℃ 2min,72℃3min,33個(gè)循環(huán);循環(huán)3,94℃10min,61℃ 2min,72℃ 3min,1個(gè)循環(huán)后置4℃保存。反應(yīng)結(jié)束后取5μL產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖電泳,紫外凝膠成像分析系統(tǒng)上觀察結(jié)果。

        1.6.2 分枝桿菌多重PCR判定標(biāo)準(zhǔn) 引物MYCGEN-F和MYCGEN-R擴(kuò)增出1030bp片段表明為分枝桿菌種;TB1-F和TB1-R擴(kuò)增出372bp片段,表明為MTC群(包括人分枝桿菌和牛分枝桿菌等);MYCA-F和MYCA-R擴(kuò)增出180bp片段,表明為禽分枝桿菌,MYCINT-F和MYCINT-R擴(kuò)增出850bp片斷,表明為胞內(nèi)分枝桿菌。

        1.7 臨床分離株的MTC PCR鑒定

        1.7.1 MTC PCR方法 以滅活的分離菌株作為樣品,分別用16S RNA、Rv0577、IS1561、Rv1510和Rv1970 5對引物進(jìn)行擴(kuò)增。每對引物的反應(yīng)體系為20μL:樣品2 μL,每對引物的上下游引物各1 μL,PCR Master 10μL,不足部分用水補(bǔ)齊。反應(yīng)程序?yàn)椋?4 ℃ 5 min初次變性,然后94℃變性1 min 、60℃ 退火 1 min、72℃ 延伸 1 min,共經(jīng)35個(gè)循環(huán),最后于72℃延伸10 min結(jié)束反應(yīng),并于4℃保存反應(yīng)產(chǎn)物。取5μL產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖電泳,紫外凝膠成像分析系統(tǒng)上觀察結(jié)果。

        1.7.2 MTC PCR判定標(biāo)準(zhǔn) MTC群內(nèi)定型多重PCR中,對于人結(jié)核分枝桿菌,5對引物均有產(chǎn)物擴(kuò)增,而牛結(jié)核分枝桿菌僅有16S RNA、Rv0577和IS1561 3對引物擴(kuò)增,而引物Rv1510和Rv1970則無擴(kuò)增。

        2 結(jié)果

        2.1 病理解剖結(jié)果

        利用比較變態(tài)反應(yīng)和伽馬干擾素試驗(yàn)檢疫牛群,抽檢在2種方法中均為陽性的牛撲殺,結(jié)果發(fā)現(xiàn)了明顯的結(jié)核病變,在肺部形成大小不等的結(jié)核結(jié)節(jié),多數(shù)為珍珠樣大小,但也有呈雞蛋大的結(jié)節(jié)。將結(jié)節(jié)切開后,可見內(nèi)有明顯的干酪樣壞死(圖1)。

        圖1 充滿干酪樣壞死的雞蛋大結(jié)節(jié)

        2.2 細(xì)菌分離結(jié)果

        將結(jié)節(jié)內(nèi)的干酪樣壞死取出,勻漿后經(jīng)酸處理,接種于Middle brook 7H11培養(yǎng)基。37℃培養(yǎng)6周,可見有不透明的顆粒狀菌落生長,表面皺褶粗糙,呈乳白色結(jié)節(jié)狀,證實(shí)分離菌株生長良好。將分離菌株再次接種到Middle brook 7H11培養(yǎng)基上擴(kuò)大培養(yǎng)6周。

        2.3 染色鑒定結(jié)果

        滅活后的臨床分離菌株經(jīng)分枝桿菌特異性Ziehl-Neelsen(Z-N)方法染色后,于高倍顯微鏡下(500倍)觀察,可見有呈紅色的火柴棒樣細(xì)長桿菌,呈排列無序,因此可以高度懷疑其為分枝桿菌(圖2)。

        圖2 分離菌株的Ziehl-Neelsen染色結(jié)果

        2.4 分枝桿菌多重PCR鑒定結(jié)果

        以滅活的分離菌株作為樣品,以牛分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株作為陽性對照,進(jìn)行分枝桿菌多重PCR。反應(yīng)結(jié)束后取5μL產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖電泳,紫外凝膠成像分析系統(tǒng)上觀察。結(jié)果陽性對照成立,而臨床樣品分離菌株同牛分枝桿菌標(biāo)準(zhǔn)株一樣,引物MYCGEN-F和MYCGEN-R有1030bp片段擴(kuò)增,引物TB1-F和TB1-R有372bp片段擴(kuò)增。證實(shí)分離菌株屬于MTC群(圖3)。

        圖3 MTC群多重PCR鑒定結(jié)果

        2.5 MTC PCR

        以滅活的分離菌株作為樣品,用16S RNA、Rv0577、IS1561、Rv1510和Rv1970 5對引物進(jìn)行MTC群內(nèi)多重PCR。擴(kuò)增結(jié)束后取5μL產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖電泳,紫外凝膠成像分析系統(tǒng)上觀察。結(jié)果分離菌株在16S rRNA、 Rv0577和IS1561 3對引物處有擴(kuò)增,片段大小依次為543bp、786bp和943bp,而 Rv1510和Rv1970 2對引物則無擴(kuò)增,因此將分離菌株鑒定為牛結(jié)核分枝桿菌(圖4)。

        3 討論

        3.1 細(xì)菌分離的重要性

        圖4 臨床分離株的MTC群內(nèi)定型多重PCR鑒定結(jié)果

        發(fā)達(dá)國家最后確診牛結(jié)核病的最終依據(jù)仍然是細(xì)菌分離[2-5]。但由于我國沒有結(jié)核陽性牛撲殺后必須進(jìn)行細(xì)菌分離的規(guī)定,而且國內(nèi)缺乏與牛結(jié)核相關(guān)的生物安全實(shí)驗(yàn)室和培養(yǎng)方法不科學(xué)等諸多原因,導(dǎo)致我國在牛結(jié)核分枝桿菌的分離和鑒定上研究較少。我們采集了臨床上的牛結(jié)核結(jié)節(jié),在我國人結(jié)核參比實(shí)驗(yàn)室內(nèi),用營養(yǎng)豐富的Middle brook 7H11培養(yǎng)基,最終大量培養(yǎng)了牛結(jié)核分枝桿菌,這也為我國能夠最終確診牛結(jié)核奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。

        3.2 非特異性分枝桿菌對牛結(jié)核細(xì)菌分離的干擾

        我國的很多變態(tài)反應(yīng)結(jié)核陽性牛,臨床上無任何臨床癥狀,撲殺后也沒有可見的病理變化,這在很大程度上是由于非特異性分枝桿菌的感染引起的[8,9]。牛場中往往存在有大量的沒有致病性的非特異性分枝桿菌。如草分枝桿菌等不會(huì)引起任何動(dòng)物發(fā)?。磺莘种U菌雖然能夠引起禽發(fā)病,但牛感染后并不表現(xiàn)任何癥狀,也不會(huì)傳染給人,而且人類只有在缺乏免疫力如患有艾滋病等的情況下才會(huì)感染禽分枝桿菌,因此發(fā)達(dá)國家并不撲殺禽結(jié)核陽性牛[2-5]。但這些非特異分枝桿菌感染牛后,不僅干擾變態(tài)反應(yīng)檢疫,還會(huì)干擾牛結(jié)核細(xì)菌分離的準(zhǔn)確性。因此臨床菌株分離后,必須要并對其進(jìn)行鑒定,以排除非特異性分枝桿菌的干擾。

        3.3 關(guān)于MTC群內(nèi)定型多重PCR

        牛結(jié)核病在很多情況下也可以由人分枝桿菌引起,而且很難通過生化試驗(yàn)等傳統(tǒng)方法進(jìn)行鑒別。分枝桿菌的比較基因組學(xué)分析顯示,不同分枝桿菌基因組的缺失區(qū)域(RD)有明顯不同,如RD7區(qū)在人結(jié)核分枝桿菌中存在但在牛型分枝桿菌中則缺失,因此可以針對這些區(qū)域建立PCR方法以鑒別牛結(jié)核分枝桿菌和人結(jié)核分枝桿菌[7]。本試驗(yàn)中的臨床分離株的擴(kuò)增結(jié)果與牛結(jié)核分枝桿菌完全一樣,因此將其鑒定為牛結(jié)核分枝桿菌。

        [1]世界動(dòng)物衛(wèi)生組織.哺乳動(dòng)物、禽、蜜蜂A和B類疾病診斷試驗(yàn)和疫苗標(biāo)準(zhǔn)手冊[M].北京:中國農(nóng)業(yè)出版社,2004:399-410.

        [2]羅伯特.澳大利亞根除牛布魯氏菌病和結(jié)核病紀(jì)實(shí)[S].北京:中國農(nóng)業(yè)出版社,2007:87-108.

        [3]Faye S, Moyen J L, Gares H, et al.Determination of decisional cut-off values for the optimal diagnosis of bovine tuberculosis with a modified IFNγ assay (Bovigam?) in a low prevalence area in France[J].Vet Microbiol, 2011,151(1/2):60-67.

        [4]Whelan A O, Clifford D, Upadhyay B, et al.Development of a skin test for bovine tuberculosis for differentiating infected from vaccinated animals[J].J Clin Microbiol, 2010, 48(9):3176-3181.

        [5]Liebana E, Johnson L, Gough J, et al.Pathology of naturally occurring bovine tuberculosis in England and Wales[J].Vet J, 2008, 176(3):354-360.

        [6]Wilton S, Cousins D.Detection and identification of multiple mycobacterial pathogens by DNA amplification in single tube [J].PCR Methods Appl, 1992, 1(4):269-273.

        [7]Huard R C, Lazzarini L C, Butler W R, et al.PCR-based method to differentiate the subspecies of the Mycobacterium tuberculosis complex on the basis of genomic deletions [J].J Clin Microbiol, 2003, 41(4):1637-1650.

        [8]高云航,何昭陽,單曉楓,等.ELISA檢測牛結(jié)核抗體時(shí)假陽性反應(yīng)的消除[J].中國獸醫(yī)學(xué)報(bào), 2004, 24(5):419-420.

        [9]李金嶺,郭宏軍, 高明輝, 等.歐盟皮內(nèi)變態(tài)反應(yīng)比較試驗(yàn)法結(jié)合ELISA檢測牛結(jié)核病的研究 [J].中國動(dòng)物檢疫,2007, 24(7):28-29.

        猜你喜歡
        結(jié)核結(jié)核病引物
        世界防治結(jié)核病日
        DNA引物合成起始的分子基礎(chǔ)
        高中生物學(xué)PCR技術(shù)中“引物”相關(guān)問題歸類分析
        警惕卷土重來的結(jié)核病
        SSR-based hybrid identification, genetic analyses and fingerprint development of hybridization progenies from sympodial bamboo (Bambusoideae, Poaceae)
        一度浪漫的結(jié)核
        特別健康(2018年4期)2018-07-03 00:38:26
        層次分析模型在結(jié)核疾病預(yù)防控制系統(tǒng)中的應(yīng)用
        火炬松SSR-PCR反應(yīng)體系的建立及引物篩選
        算好結(jié)核病防治經(jīng)濟(jì)賬
        中樞神經(jīng)系統(tǒng)結(jié)核感染的中醫(yī)辨治思路
        无码中文字幕人妻在线一区| 欧美 亚洲 国产 日韩 综AⅤ| 亚洲av乱码专区国产乱码| 蜜桃在线一区二区三区| 精品一区二区三区国产av| av影院在线免费观看不卡| 国产肉体xxxx裸体784大胆| 久久人人爽天天玩人人妻精品| 视频一区精品自拍| 日本一区二区三区在线观看免费 | 91产精品无码无套在线| 精品一区二区中文字幕| av在线不卡免费中文网| 日本妇人成熟免费2020| 狠狠综合久久av一区二区| 亚洲av有码在线天堂| 素人激情福利视频| 日本一区二区三区综合视频| 精品国产粉嫩内射白浆内射双马尾 | 深夜黄色刺激影片在线免费观看| 无码国产成人午夜电影在线观看| 国产精品_国产精品_k频道w | 蜜桃网站在线免费观看视频| 99青青草视频在线观看| 少妇被粗大的猛进出69影院| 乱人伦中文无码视频在线观看 | 91九色极品探花内射| 色又黄又爽18禁免费网站现观看| 男女爽爽无遮挡午夜视频| av深夜福利在线| 国产乱子伦精品无码专区| 搡老熟女中国老太| 日韩精品一区二区三区毛片| 国产成人高清视频在线观看免费 | 亚洲av中文字字幕乱码软件| 国产情侣一区二区| 国产精品_国产精品_k频道w | 午夜av福利亚洲写真集| 日韩亚洲无吗av一区二区| 狠狠色综合7777久夜色撩人ⅰ| 妇女性内射冈站hdwwwooo|