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        泛耐藥銅綠假單胞菌的毒力基因檢測(cè)和同源性分析

        2013-08-23 03:01:36陳惠玲葉惠芬楊英為楊一言黃小媛楊銀梅
        中國(guó)感染與化療雜志 2013年6期
        關(guān)鍵詞:銅綠毒力單胞菌

        陳惠玲,盛 慧,葉惠芬,楊英為,楊一言,黃小媛,楊銀梅

        銅綠假單胞菌是醫(yī)院感染的重要病原菌,其致感染機(jī)制是通過(guò)Ⅲ型分泌系統(tǒng)(typeⅢsecretion system,T3SS),以其效應(yīng)蛋白ExoU為主的毒力蛋白表達(dá),可導(dǎo)致肺泡上皮細(xì)胞、巨噬細(xì)胞和成纖維細(xì)胞的凋亡,加重炎性反應(yīng),增高感染病死率[1]。攜帶毒力基因的泛耐藥銅綠假單胞菌,給臨床銅綠假單胞菌感染的治療帶來(lái)了極大挑戰(zhàn)。因此,本研究對(duì)53株臨床分離的泛耐藥銅綠假單胞菌進(jìn)行毒力基因exoU和exoS檢測(cè),并采用BOX-PCR指紋圖譜分析技術(shù)對(duì)醫(yī)院感染的泛耐藥銅綠假單胞菌進(jìn)行同源性分析,為醫(yī)院感染的控制與管理提供基因分型的病原學(xué)資料,為臨床抗感染治療提供依據(jù)。

        材料與方法

        一、材料

        (一)菌株來(lái)源及分布 53株泛耐藥銅綠假單胞菌分離自2008年9月—2012年6月廣州市第一民醫(yī)院醫(yī)院感染患者的各種臨床標(biāo)本,剔除同一患者相同部位在1周內(nèi)檢出的重復(fù)菌株。其中纖維支氣管鏡吸痰標(biāo)本42株,傷口分泌物和中段尿標(biāo)本各3株,靜脈血標(biāo)本2株,腹水、膿液和膽汁各1株。菌株主要分布于重癥監(jiān)護(hù)病房27株,呼吸內(nèi)科11株,綜合病科7株,急診留觀病區(qū)和腦系外科各2株,血液內(nèi)科、燒傷外科、胃腸外科和鶴洞分院內(nèi)科各1株。

        (二)儀器與試劑 VITEK2系統(tǒng)及API20E試劑均為法國(guó)生物梅里埃公司產(chǎn)品;PCR儀為美國(guó)PE公司產(chǎn)品;電泳儀為美國(guó)BIO-RAD公司產(chǎn)品;成像系統(tǒng)為英國(guó)UVI凝膠成像系統(tǒng);引物由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成;Premix Taq酶(Code No.:D334A)體系及 DNA Marker DL2000購(gòu)自大連寶生物工程有限公司。

        二、方法

        (一)細(xì)菌鑒定及藥物敏感試驗(yàn) 采用常規(guī)方法分離細(xì)菌,用API 20NE或法國(guó)生物梅里埃公司VITEK2系統(tǒng)進(jìn)行菌種鑒定且進(jìn)行藥物敏感試驗(yàn),結(jié)果參照CLSI 2009年版標(biāo)準(zhǔn)判讀[2]。質(zhì)控菌株為大腸埃希菌 ATCC 25922、銅綠假單胞菌 ATCC 27853。

        (二)統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 數(shù)據(jù)采用WHONET5.6軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。

        (三)細(xì)菌DNA的提取 采用煮沸法提取細(xì)菌總DNA,挑取一定量純培養(yǎng)菌落加入含適量蒸餾水的 EP管中,混勻后加熱煮沸,10 000 r/min冷凍離心2 min。另取1.5 mL的EP管,將離心后的上清液吸入新的EP管中,上清液即為細(xì)菌總DNA溶液,保存于-20℃冰箱中備用。

        (四)PCR檢測(cè) 毒力基因exoS和exoU采用PCR法檢測(cè),Premix Taq酶體系25μL,上下游引物各10 pmol,模板DNA4μL,用ddH2O補(bǔ)足至50μL。循環(huán)參數(shù)為,94℃預(yù)變性5 min,94℃變性30 s,62℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共35個(gè)循環(huán),最后于72℃延伸10 min。取8μL PCR產(chǎn)物在2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳分析,采用凝膠成像系統(tǒng)觀察并記錄結(jié)果。毒力基因引物序列和目的產(chǎn)物長(zhǎng)度見(jiàn)表1。

        (五)BOX-PCR檢測(cè)攜帶相關(guān)毒力基因菌株同源性 BOX-PCR引物BoxAR1序列為5′-CTACGGCAAGGCGACGCTGACG-3′[3]。BOX-PCR 反應(yīng)體系總體積為25μL,包括 Premix Taq 12.5μL、DNA模板1μL、引物1μL、滅菌蒸餾水補(bǔ)足至25μL。反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性3 min,94℃變性45 s,50℃退火45 s,72 ℃延伸1 min,共35個(gè)循環(huán),最后于72℃延伸7 min。取8μL PCR產(chǎn)物,加2μL溴酚藍(lán)于80V電壓,2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳1 h后,0.5 mg/L溴乙錠溶液染色成像,采用凝膠成像系統(tǒng)觀察并記錄結(jié)果。應(yīng)用Quantity one軟件中的非加權(quán)配對(duì)算數(shù)平均法(UPGMA)構(gòu)建聚類(lèi)分析圖,把相似度大于80%菌株劃分為同一個(gè)基因型,代表同一克隆株,相似度小于80%菌株為不同的基因型,代表不同的克隆株。

        表1 檢測(cè)銅綠假單胞菌毒力基因exo U和exo S的引物Table 1 Sequence of the primers used for PCR amplification of virulence genes exoUand exoSin Pseudomonas aeruginosa

        結(jié) 果

        一、藥敏試驗(yàn)

        53株銅綠假單胞菌對(duì)抗菌藥物阿米卡星、頭孢他啶、頭孢曲松、環(huán)丙沙星、慶大霉素、亞胺培南、妥布霉素、頭孢吡肟、左氧氟沙星、甲氧芐啶-磺胺甲口惡唑、哌拉西林-他唑巴坦、氨曲南均耐藥。

        二、菌株毒力基因exoS和exoU檢測(cè)

        電泳結(jié)果顯示,53株泛耐藥銅綠假單胞菌中,41株菌毒力基因exo S陽(yáng)性,11株菌毒力基因exo U陽(yáng)性。根據(jù)檢測(cè)結(jié)果統(tǒng)計(jì),其中40株為exo S+/exo U-表型,占75.5%;10株為exo U+/exo S-表型,占18.9%;1株為exo S+/exo U+表型,占1.9%;2株為exo S-/exo U-表型,占3.8%。exo S+/exo U-和exo U+/exo S-型主要分布在重癥監(jiān)護(hù)病房,分別為16株(16/40,40%)和8株(8/10,80%)。

        三、攜帶相關(guān)毒力基因菌株同源性比較

        部分BOX-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖譜見(jiàn)圖1。BOX-PCR和聚類(lèi)圖軟件分析顯示,11株exoU+的菌株可劃分為7個(gè)基因型,分別命名為U1~U7,41株exoS+的菌株可劃分為24個(gè)基因型,分別命名為S1~S24。其中主要的基因型有U7、S12、S14、S22和S24型,見(jiàn)表2。U7型克隆3株,來(lái)源于2個(gè)不同的科室;S12和S14型克隆各3株,S22型克隆4株,均分別來(lái)源于3個(gè)不同的科室;S24型克隆4株,來(lái)源于呼吸內(nèi)科,其余均為獨(dú)立的基因型。

        圖1 泛耐藥銅綠假單胞菌部分?jǐn)U增產(chǎn)物電泳圖Figure 1 Electrophoretic result of BOX-PCR in some pandrug-resistant Pseudomonas aeruginose strains

        表2 泛耐藥銅綠假單胞菌BOX-PCR主要基因型的科室及毒力基因分布Table 2 Distribution of the BOX-PCR-based virulence genotypes of pandrug-resistant Pseudomonas aeruginosain different wards

        討 論

        銅綠假單胞菌是醫(yī)院感染的重要病原菌,常呈多重耐藥或泛耐藥,治療棘手,病死率高,可造成一定程度的醫(yī)院感染流行[4-5],因此泛耐藥銅綠假單胞菌為醫(yī)院感染的主要監(jiān)控對(duì)象。自1996年我國(guó)臺(tái)灣地區(qū)分離到第1株泛耐藥銅綠假單胞菌以來(lái),世界上多個(gè)地區(qū)陸續(xù)有泛耐藥銅綠假單胞菌的報(bào)道[5],我院3年多分離到53株泛耐藥銅綠假單胞菌,主要分布在重癥監(jiān)護(hù)病房和呼吸內(nèi)科,與這2個(gè)科室常年收治大量需機(jī)械通氣的危重患者,且大部分患者有嚴(yán)重的基礎(chǔ)疾病,免疫功能低下,頻繁使用留置導(dǎo)管等侵襲性操作有關(guān)。

        T3SS是銅綠假單胞菌致病性的重要毒力系統(tǒng),其中exoS和exoU的臨床意義尤為重要,Hauser等[6]研究顯示,exoU+為細(xì)胞毒型基因,表達(dá)蛋白ExoU引起細(xì)胞壞死、凋亡,危害最大;exo S+為侵襲型基因,表達(dá)蛋白exoS能抑制宿主細(xì)胞吞噬作用、破壞肌動(dòng)蛋白細(xì)胞骨架重排、導(dǎo)致細(xì)胞凋亡和抑制細(xì)胞分裂等,感染相對(duì)較輕;exoU+基因型的銅綠假單胞菌毒力更強(qiáng),感染后癥狀更嚴(yán)重,患者病死率更高;T3SS陽(yáng)性銅綠假單胞菌常以exo S+/exo U-和exo U+/exo S-基因型存在。本研究結(jié)果顯示,53株泛耐藥銅綠假單胞菌中,exo S+/exo U-基因型菌40株,占75.5%;exo U+/exo S-基因型菌10株,占18.9%,與卓超等[7]報(bào)道相似。另有1株為exo S+/exo U+表型,2株為exo S-/exo U-表型。攜帶毒力基因的銅綠假單胞菌主要分布在重癥監(jiān)護(hù)病房,以exo S+/exo U-和exo U+/exo S-基因型為主,且在重癥監(jiān)護(hù)病房exo U+/exo S-基因型菌株的分離株為8株(8/10),明顯高于分離率為40%(16/40)的exo S+/exo U-基因型。因此,對(duì)于攜帶毒力基因的泛耐藥銅綠假單胞菌,更應(yīng)加強(qiáng)監(jiān)控,防止醫(yī)院感染暴發(fā)流行。

        BOX插入因子為細(xì)菌基因組重復(fù)序列,大小為154 bp,由保守性不同的box A、box B和boxC等亞單位組成,其中只有box A存在細(xì)菌菌株、種、屬水平的分布差異及進(jìn)化過(guò)程中表現(xiàn)出多拷貝和高保守性,BOX-PCR技術(shù)則根據(jù)box A亞單位設(shè)計(jì)引物,使重復(fù)序列之間的不同基因區(qū)域得以選擇性擴(kuò)增,得到大小不等的DNA擴(kuò)增片段,最后經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)其多態(tài)性[3,8]。

        BOX-PCR結(jié)果顯示,exoU+菌株中,3株U7型克隆株來(lái)源于2個(gè)不同的科室,結(jié)合臨床資料,3株菌分離的時(shí)間相差較遠(yuǎn),可排除該克隆株的院內(nèi)暴發(fā)流行。exoS+菌株中,4株S24型克隆株均來(lái)源于呼吸內(nèi)科,雖是同年不同月份分離,仍提示S24型克隆株在呼吸內(nèi)科存在流行。因此,應(yīng)嚴(yán)格進(jìn)行消毒隔離,以避免該克隆株在科室,甚至醫(yī)院發(fā)生暴發(fā)流行。S12、S14型克隆各3株,S22型克隆4株,均來(lái)源于3個(gè)不同科室,且S14和S22型克隆株分離的時(shí)間相隔較遠(yuǎn),故不存在這2型克隆株的院內(nèi)暴發(fā)流行,而S12型克隆株在同1個(gè)月發(fā)現(xiàn),說(shuō)明其在醫(yī)院內(nèi)存在小規(guī)模的流行??咕幬锏拇罅渴褂檬菍?dǎo)致泛耐藥銅綠假單胞菌形成的主要原因,機(jī)械通氣等頻繁應(yīng)用的侵襲性治療手段容易因消毒不嚴(yán)格而導(dǎo)致泛耐藥銅綠假單胞菌的傳播,入住重癥監(jiān)護(hù)病房時(shí)間過(guò)長(zhǎng)患者因病情嚴(yán)重,需接受更多的抗菌藥物及侵襲性治療措施,也易受泛耐藥銅綠假單胞菌感染[5,9]。3株S12型克隆株分別來(lái)源于重癥監(jiān)護(hù)病房、綜合病科和呼吸內(nèi)科,提示這些科室應(yīng)加強(qiáng)醫(yī)院感染的控制,合理應(yīng)用抗菌藥物,隔離感染的患者,加強(qiáng)醫(yī)護(hù)人員手衛(wèi)生和其他消毒隔離措施,并用BOX-PCR技術(shù)對(duì)泛耐藥銅綠假單胞菌感染進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè),以防止暴發(fā)流行。

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