周 潔,付 強(qiáng),玉延華
(廣西大學(xué) 亞熱帶農(nóng)業(yè)生物資源保護(hù)與利用國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣西 南寧530004)
生物大分子之間或生物大分子與外源物質(zhì)之間的反應(yīng)熱極其微弱,需要用高度敏感的熱分析技術(shù)才能測(cè)定。目前常用的研究生物分子反應(yīng)的方法,如表面等離子共振技術(shù)(Surface plasmon resonance,SPR)[1]和超速離心分析技術(shù)[2]等,均要求蛋白質(zhì)固定于表面,這就會(huì)干擾蛋白質(zhì)間的結(jié)合,或耗費(fèi)很長時(shí)間。等溫滴定微量熱法(Isothermal titration calorimetry,ITC)是近年來發(fā)展起來的一種研究生物分子相互作用的重要方法[3],其優(yōu)勢(shì)在于其非特異性、樣品用量小、方法靈敏度和精確度高、實(shí)驗(yàn)時(shí)間較短、操作簡單等。ITC的非特異性有助于新現(xiàn)象和新規(guī)律的發(fā)現(xiàn),特別適用于研究生物體系中的各種特異過程;但也會(huì)導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)中產(chǎn)生由反應(yīng)環(huán)境造成的“背景”,干擾性大,難以獲得目標(biāo)反應(yīng)的理想檢測(cè)數(shù)據(jù)。要排除ITC的非特異性產(chǎn)生的不利影響,有必要對(duì)檢測(cè)樣品的預(yù)處理進(jìn)行優(yōu)化,創(chuàng)造一個(gè)“相對(duì)零背景”的反應(yīng)系統(tǒng)。
作者以人血清白蛋白(Human serum albumin,HSA)[4]與鋅離子的相互作用為研究對(duì)象,對(duì)ITC檢測(cè)樣品預(yù)處理進(jìn)行了優(yōu)化研究,以期獲得更高效、更理想的檢測(cè)數(shù)據(jù)。
人血清白蛋白(HSA),Sigma公司;硫酸鋅(分析純),華大;實(shí)驗(yàn)用水為去離子水。將Tris-HCl(Solarbio,1×103mmol·L-1,pH=7.4)配制成5mmol·L-1緩沖溶液,4℃儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?/p>
iTC200型等溫滴定微量熱儀,GE;Lambda 35型紫外分光光度計(jì),Perkin Elmer。
A組:用5mmol·L-1Tris-HCl緩沖溶液配制0.05mmol·L-1HSA溶液200μL、2.5mmol·L-1硫酸鋅溶液40μL,直接用于反應(yīng)。
B組:(1)用5mmol·L-1Tris-HCl緩沖溶液配制0.2mmol·L-1HSA溶液2mL,用透析卡(Thermo,Slide-A-Lyzer○RDialysis Cassette,3500MWCO,0.5~3mL Capacity)進(jìn)行3次透析,透析緩沖溶液為5mmol·L-1Tris-HCl,每次使用體積600mL,透析條件為:第1次,4℃,2h,更換緩沖溶液;第2次,4℃,2h,更換緩沖溶液;第3次,4℃過夜,透析完成后的Tris-HCl緩沖溶液于4℃儲(chǔ)存?zhèn)溆?。用專用注射器從透析卡中吸出HSA溶液,采用Bradford法測(cè)定HSA實(shí)際濃度。以第3次透析后存儲(chǔ)的Tris-HCl緩沖溶液為溶劑,將經(jīng)過3次透析的HSA溶液稀釋至濃度0.05mmol·L-1。(2)同法用此 Tris-HCl緩沖溶液配制濃度為2.5mmol·L-1的硫酸鋅溶液。(3)測(cè)定配制好的HSA溶液和硫酸鋅溶液的pH值,若兩者不一致,則調(diào)節(jié)pH值至相差不超過0.05。
A組:在iTC 200軟件中的 Advance Experimental Design設(shè)置ITC實(shí)驗(yàn)參數(shù):0.05mmol·L-1HSA溶液200μL,2.5mmol·L-1硫酸鋅40μL;反應(yīng)溫度25℃;總注射次數(shù)19次;參照功率5μcal·s-1;攪拌器轉(zhuǎn)速1000r·min-1。結(jié)果用 Origin(MicroCal,LLC ITC200)軟件進(jìn)行分析,得到結(jié)合常數(shù)(Kb)、反應(yīng)的化學(xué)計(jì)量數(shù)(N)、熵(ΔS)和焓(ΔH)。
圖1 HAS-Zn2+相互作用的ITC檢測(cè)結(jié)果Fig.1 The ITC determination results for HSA-Zn2+interaction
B組:首先,利用iTC 200軟件的Experimental Design模塊進(jìn)行實(shí)驗(yàn)預(yù)測(cè)。Experimental Mode選擇Highest Quality,在 Estimate Kd中的 Cell Compound選擇 Protein,Syringe Compound 選擇 Small Molecule,預(yù)估 ΔH 為1kcal·mol-1。鍵入不同的Cell、Syringe濃度值可得到不同實(shí)驗(yàn)預(yù)測(cè)反應(yīng)曲線,根據(jù)預(yù)測(cè)曲線選擇適合的濃度值。進(jìn)行實(shí)驗(yàn)預(yù)測(cè)后,選擇HSA 0.05mmol·L-1、硫酸鋅2.5mmol·L-1作為反應(yīng)濃度。然后根據(jù)預(yù)估結(jié)果,在Advance Experimental Design中設(shè)置ITC實(shí)驗(yàn)參數(shù):0.05mmol·L-1HSA溶液200μL,2.5mmol·L-1硫酸鋅40μL;反應(yīng)溫度25℃;總注射次數(shù)19次;參照功率5μcal·s-1;攪拌器轉(zhuǎn)速1000r·min-1。結(jié) 果 用 Origin(MicroCal,LLC ITC200)軟件進(jìn)行分析,得到結(jié)合常數(shù)(Kb)、反應(yīng)的化學(xué)計(jì)量數(shù)(N)、熵(ΔS)和焓(ΔH)。
將HSA與硫酸鋅分別按A、B組方案進(jìn)行樣品預(yù)處理和ITC檢測(cè),結(jié)果見圖1,獲得的結(jié)合參數(shù)見表1。
由圖1可知,A組HSA-Zn2+相互作用過程中反應(yīng)峰值始終較大,表現(xiàn)出反應(yīng)一直沒有達(dá)到平衡狀態(tài),難以從滴定曲線判斷結(jié)合類型,同時(shí)沒有獲得有效的數(shù)據(jù)(表1),無法對(duì)分子間相互作用力進(jìn)行推斷,因此認(rèn)為A組檢測(cè)結(jié)果不可用。
由圖1還可知,B組 HSA-Zn2+相互作用的特征性的峰序列表現(xiàn)出良好的臺(tái)階,并最終顯示滴定接近平衡,反應(yīng)飽和,殘余的熱效應(yīng)符合稀釋峰的特征,可以通過Origin軟件的非線性回歸分析減掉。表1數(shù)據(jù)表明,B組 HSA-Zn2+為放熱反應(yīng)[5],只有一個(gè)結(jié)合位點(diǎn),是一個(gè)焓驅(qū)動(dòng)的過程(ΔH<0),同時(shí)根據(jù)公式ΔG=ΔH-TΔS[6],Gibbs結(jié)合能ΔG<0主要由ΔH<0貢獻(xiàn),因而推斷,在本實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的濃度和比例下,HSA與Zn2+之間主要的作用力為氫鍵和范德華力[7]。
表1 HSA-Zn2+相互作用的結(jié)合參數(shù)Tab.1 The binding parameters for HSA-Zn2+interaction
在ITC檢測(cè)實(shí)驗(yàn)中,良好的反應(yīng)系統(tǒng)是得到理想結(jié)果的關(guān)鍵,但要實(shí)現(xiàn)“絕對(duì)零背景”很難,而創(chuàng)造“相對(duì)零背景”的系統(tǒng)則可以通過對(duì)樣品預(yù)處理的優(yōu)化來實(shí)現(xiàn)。經(jīng)過透析、濃度測(cè)定、pH值調(diào)節(jié)等一系列預(yù)處理的B組HSA-Zn2+獲得了良好的ITC檢測(cè)結(jié)果。
(1)HSA粉劑中的甘油、防凍劑等輔分可能對(duì)另一反應(yīng)物產(chǎn)生作用或?qū)φ麄€(gè)反應(yīng)體系產(chǎn)生影響,從而產(chǎn)生額外的熱量,成為不屬于特異性反應(yīng)的背景熱。而其它通過提取及純化的蛋白樣品由于提取試劑的影響,同樣存在背景熱。本研究中蛋白經(jīng)過3次透析后,不僅被Tris-HCl緩沖溶液充分溶解且與緩沖溶液體系達(dá)到了很好的平衡。利用第3次透析的緩沖溶液作為另一反應(yīng)物的溶劑保證了兩種反應(yīng)物在體系上達(dá)到了更好的一致性,是實(shí)現(xiàn)“相對(duì)零背景”系統(tǒng)的關(guān)鍵。
(2)由于ITC檢測(cè)的是活性蛋白與小分子作用所產(chǎn)生的反應(yīng)熱,需要提供給分析軟件的數(shù)據(jù)只有兩個(gè)反應(yīng)物的濃度值,因此,透析后對(duì)蛋白濃度再次進(jìn)行定量以得到準(zhǔn)確的濃度非常必要。
(3)由于不能排除反應(yīng)物在被緩沖溶液溶解或稀釋后是否會(huì)發(fā)生pH值變化,相對(duì)于生物分子間相互作用的微量結(jié)合熱,酸堿中和熱無法忽略,會(huì)成為干擾,因此在ITC實(shí)驗(yàn)中,嚴(yán)格調(diào)控pH差值在0.05之內(nèi)很重要。
(4)透析可以選擇透析袋或透析卡,透析袋價(jià)格便宜,但使用前需要進(jìn)行預(yù)處理,導(dǎo)致透析步驟增加,影響樣品質(zhì)量和實(shí)驗(yàn)重復(fù)性的因素增多。透析卡價(jià)格較貴,但人為影響小,便于進(jìn)行質(zhì)量控制,提高實(shí)驗(yàn)重復(fù)性,對(duì)于重要樣品,建議使用透析卡等預(yù)制品。
等溫滴定微量熱法(ITC)是近年來發(fā)展起來的一種研究生物分子相互作用的重要方法。在研究蛋白質(zhì)與外源小分子的相互作用時(shí),優(yōu)化樣品的預(yù)處理,通過將蛋白質(zhì)進(jìn)行3次透析、準(zhǔn)確定量蛋白質(zhì)實(shí)際濃度、調(diào)控pH值和使用第3次透析緩沖溶液作為溶劑,實(shí)現(xiàn)了“相對(duì)零背景”的反應(yīng)系統(tǒng)。將未優(yōu)化組和優(yōu)化處理組樣品所進(jìn)行的ITC檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行比較,表明進(jìn)行樣品預(yù)處理的優(yōu)化對(duì)獲得有效的檢測(cè)結(jié)果十分必要。
(致謝:感謝何容博士、任薇薇博士對(duì)本研究的理論指導(dǎo)和技術(shù)支持。)
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