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        肉雞源致病性大腸埃希菌中β-內(nèi)酰胺類抗生素耐藥基因的檢測(cè)

        2013-08-14 08:01:48伍成奇邱淵皓劉萬(wàn)華王晶鈺
        關(guān)鍵詞:雞源內(nèi)酰胺類抗生素

        金 彪,伍成奇,唐 攀,邱淵皓,劉萬(wàn)華,武 寧,王晶鈺

        (西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,陜西楊凌712100)

        β-內(nèi)酰胺類抗生素包括青霉素及其衍生物、頭孢菌素、單酰胺環(huán)類、碳青霉烯類和青霉烯類酶抑制劑等。頭孢菌素類抗生素是從頭孢菌素的母核7-氨基頭孢烷酸連接不同側(cè)鏈而制成的半合成抗生素。藥物首先發(fā)現(xiàn)于1945年[1],經(jīng)過(guò)一段時(shí)間的實(shí)驗(yàn)室研究,于1963年被正式應(yīng)用于臨床當(dāng)中,并且根據(jù)臨床的應(yīng)用情況不斷改進(jìn)。由于頭孢菌素類抗生素的廣泛應(yīng)用,其耐藥性問(wèn)題日趨嚴(yán)重,給臨床治療帶來(lái)了困難。大腸埃希菌(E.coli)產(chǎn)β-內(nèi)酰胺酶是β-內(nèi)酰胺類抗生素產(chǎn)生耐藥性的主要機(jī)制,由質(zhì)粒介導(dǎo)的超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(ESBLs)是新一代β-內(nèi)酰胺酶類抗生素耐藥的主要原因,使包括第三代頭孢菌素在內(nèi)的多種β-內(nèi)酰胺類抗生素失活,還能水解第四代頭孢菌素以及單環(huán)類抗生素的質(zhì)粒介導(dǎo)的β-內(nèi)酰胺酶(β-lactamases,BLA)[2-3]。ESBLs是由質(zhì)粒介導(dǎo)的,它可以通過(guò)接合、轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)等形式獲得或轉(zhuǎn)移耐藥基因。根據(jù)ESBLs基因和蛋白質(zhì)的同源性將其分為四類,即TEM型、SHV型、CTX-M型、OXA型酶[4],本次研究采用了前三類酶。目前,產(chǎn)β-內(nèi)酰胺酶是E.coli對(duì)β-內(nèi)酰胺類抗生素產(chǎn)生耐藥性的主要機(jī)制,醫(yī)學(xué)研究較多,但國(guó)內(nèi)獸醫(yī)臨床鮮有報(bào)道。因此,本研究目的是了解雞源致病性E.coli對(duì)β-內(nèi)酰胺類抗生素的耐藥情況及耐藥基因與耐藥性的相關(guān)性,旨在為臨床合理用藥以及E.coli耐藥機(jī)制的研究提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌株來(lái)源及其培養(yǎng) 108株雞源致病性E.coli,2012年8月~10月先后分離自陜西省幾個(gè)主要規(guī)?;B(yǎng)雞場(chǎng)的雞群。無(wú)菌操作采集上述規(guī)模化養(yǎng)雞場(chǎng)的雞群疑似感染E.coli的病、死雞肺臟、肝臟樣本,接種麥康凱瓊脂平板培養(yǎng)基初步分離,通過(guò)培養(yǎng)特性觀察、生化試驗(yàn)、動(dòng)物致病性試驗(yàn)共分離鑒定出108株致病性E.coli,由西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院動(dòng)物性食品衛(wèi)生檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室保存。

        1.1.2 培養(yǎng)基及藥敏紙片 麥康凱瓊脂和營(yíng)養(yǎng)瓊脂,購(gòu)自北京奧博星生物技術(shù)有限公司;細(xì)菌微量生化反應(yīng)管,購(gòu)自杭州天和微生物試劑有限公司;7種β-內(nèi)酰胺類藥敏紙片(頭孢派酮、頭孢他啶、頭孢噻肟、頭孢唑啉、頭孢曲松、頭孢呋肟、頭孢噻吩),購(gòu)自杭州天和微生物試劑公司。

        1.1.3 主要試劑 PCR Master Mix(含Taq DNA聚合 酶、dNTP、PCR buffer)、DNA Marker DL 2 000,購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司;NaCl,購(gòu)自四川西隴化工有限公司;酵母提取物和胰蛋白胨,購(gòu)自英國(guó)Oxoid公司;溴化乙錠(100mg),購(gòu)自廣州寶泰克生物科技有限公司;瓊脂糖,西班牙Biowest公司產(chǎn)品;膠回收試劑盒,購(gòu)自天根生化科技有限公司。

        1.1.4 耐藥基因引物設(shè)計(jì) 根據(jù)GenBank中已發(fā)表的β-內(nèi)酰胺酶的耐藥基因序列,用Primer5.0軟件分別設(shè)計(jì)針對(duì)β-內(nèi)酰胺酶tem、ctx-m和shv的3種特異性引物,設(shè)計(jì)的引物序列見表1。引物由南京金斯瑞生物科技有限公司合成。

        表1 PCR擴(kuò)增引物Table 1 The primers for PCR amplification

        1.2 方法

        1.2.1 細(xì)菌的藥物敏感性試驗(yàn) 參照CLSI(clinical and laboratory standards institute)推薦的K-B藥敏紙片法對(duì)108株雞源致病性E.coli進(jìn)行藥物敏感性試驗(yàn),判定結(jié)果參照CLSI手冊(cè)中藥物敏感性標(biāo)準(zhǔn)[5]。

        1.2.2 耐藥基因的PCR擴(kuò)增 將待檢菌株劃線接種麥康凱瓊脂培養(yǎng)基平板,37℃培養(yǎng)24h,挑取菌落溶于500μL無(wú)菌純水的離心管中制成濃菌懸液,100℃煮沸10min,12 000r/min離心5min,取上清作為模板,并保存于-20℃?zhèn)溆谩CR反應(yīng)體系:2×PCR Master Mix(含有2×TaqDNA 聚合酶,2×PCR buffer 和 2×dNTP)10μL,10 pmol/μL上、下游引物各0.5μL,ddH2O 10μL,模板為4μL。PCR反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性5min;94℃50s,50s,72 ℃ 60s,共35個(gè)循環(huán);72 ℃ 10 min;4℃結(jié)束反應(yīng)。取10μL產(chǎn)物用10g/L瓊脂糖凝膠電泳,并用凝膠成像儀成像觀察拍照。

        1.2.3 PCR產(chǎn)物的測(cè)序分析 將耐藥基因的PCR陽(yáng)性產(chǎn)物用膠回收試劑盒回收,送由南京金斯瑞生物科技有限公司進(jìn)行序列測(cè)定,用DNA Star軟件對(duì)測(cè)序獲得的耐藥基因序列與GenBank中的相關(guān)序列進(jìn)行比對(duì)分析。

        2 結(jié)果

        2.1 致病性E.coli分離株的耐藥性

        108株雞源致病E.coli分離株的藥敏試驗(yàn)結(jié)果見表2。

        從表2可以看出,7種β-內(nèi)酰胺類藥物中,致病性E.coli對(duì)頭孢噻吩的耐藥率最高(95.7%),對(duì)頭孢他啶的耐藥率最低(18.5%),其余的耐藥率均超過(guò)70%??偟膩?lái)看,致病性E.coli對(duì)頭孢菌素類藥物的耐藥率均較高。

        表2 分離的致病性E.coli的耐藥情況Table 2 Antimicrobial resistance of pathogenic Escherichia coli isolated from chickens

        2.2 致病性E.coli分離株耐藥基因的PCR檢測(cè)

        采用PCR技術(shù),對(duì)108株雞源致病性E.coli分離株進(jìn)行了3種β-內(nèi)酰胺酶耐藥基因的擴(kuò)增檢測(cè),tem和ctx-m2種耐藥基因被檢出,獲得與預(yù)期目的片段大小相符的擴(kuò)增條帶(圖1,圖2),檢出率分別為98.1%和74.1%,未檢測(cè)到shv基因

        2.3 致病性E.coli耐藥表型與耐藥基因檢出情況比較

        耐藥基因在雞源致病性E.coli耐藥菌株中的檢出情況見表3。從表3可以看出,耐藥基因tem在頭孢他啶和頭孢呋肟耐藥菌株中檢出率最高,達(dá)100%,除了在頭孢曲松耐藥菌株中為79.6%外,其余的檢出率都超過(guò)了95%,與菌株耐藥性有顯著相關(guān)性(P<0.05);耐藥基因ctx-m在頭孢噻吩耐藥菌株中檢出率最高達(dá)86.3%,最低的是在頭孢他啶耐藥菌株也達(dá)到了50%,與菌株耐藥性有顯著相關(guān)性(P<0.05);tem+ctx-m兩種耐藥基因的檢出率除了在頭孢他啶耐藥菌株中與ctx-m的一樣外,其余的都比ctx-m的檢出率略低。耐藥基因shv的檢出率為0。

        圖1 tem陽(yáng)性菌株P(guān)CR產(chǎn)物擴(kuò)增圖Fig.1 PCR products of tem positive isolates

        圖2 ctx-m陽(yáng)性菌株P(guān)CR產(chǎn)物擴(kuò)增圖Fig.2 PCR products of ctx-m positive isolates

        表3 致病性E.coli耐藥株耐藥基因的檢出率Table 3 Detection rates of resistance genes in resistant isolates of pathogenic Escherichia coli

        2.4 耐藥基因測(cè)序分析

        檢出的2種β-內(nèi)酰胺酶耐藥基因的特異性目的條帶,經(jīng)回收測(cè)序后,分別與GenBank中的相應(yīng)序列進(jìn)行比對(duì),結(jié)果顯示,陽(yáng)性菌株攜帶的β-內(nèi)酰胺酶耐藥基因與GenBank中提供的相應(yīng)基因序列相似性均高達(dá)98%以上,其中tem基因?yàn)?9.3%,ctx-m為98.6%。

        3 討 論

        β-內(nèi)酰胺類藥物是醫(yī)學(xué)臨床上應(yīng)用最為廣泛的抗菌藥物之一,在獸醫(yī)臨床上也發(fā)揮著及其重要的作用,隨著該類藥物的大量使用,耐藥性問(wèn)題也越來(lái)越突出,嚴(yán)重影響了該藥物的臨床療效,已成為國(guó)內(nèi)外耐壓性研究關(guān)注的焦點(diǎn)。目前在許多國(guó)家和地區(qū)有大量關(guān)于E.coli耐藥性的研究[6-7],E.coli的耐藥性已經(jīng)成為全球性問(wèn)題。目前,在已發(fā)現(xiàn)的ESBLs基因型中,tem有168種,shv有114種,ctx-m有89種[8]。tem已是ESBLs中最常見的基因型廣譜抗生素,特別是第三代頭孢菌素在臨床上的廣泛使用以來(lái),使得質(zhì)粒介導(dǎo)的產(chǎn)ESBLs細(xì)菌在中國(guó)不同地區(qū)廣泛傳播[9]。本文PCR結(jié)果顯示陜西部分地區(qū)tem基因檢出率最高。

        張利勃等[10]研究發(fā)現(xiàn),遼寧省ESBLs雞源E.coli基因亞型以tem為主,其次為ctx-m型,未發(fā)現(xiàn)shv型基因,與本研究結(jié)果一致。

        國(guó)內(nèi)外對(duì)E.coli中質(zhì)粒介導(dǎo)的耐藥基因已有報(bào)道,但是種類單一,對(duì)于雞源致病性E.coli耐藥基因的全面研究和報(bào)道相對(duì)較少。Meunier D等[11]對(duì)法國(guó)E.coli分離株進(jìn)行β-內(nèi)酰胺酶基因研究,發(fā)現(xiàn)blaTEM和blaCTX-M的檢出率分別為62.5%和100%。

        Li L等[12]研究發(fā)現(xiàn),我國(guó)雞源E.coli中β-內(nèi)酰胺酶基因blaTEM和blaSHV在1970年-2003年檢出率有所下降,2004年-2007年又逐漸上升。Tang X等[13]對(duì)我國(guó)2004年-2007年豬源致病性E.coli耐藥基因檢測(cè)時(shí)發(fā)現(xiàn),β-內(nèi)酰胺類耐藥基因以blaTEM為主,檢出率為87%;楊澍等[14]對(duì)人源E.coliβ-內(nèi)酰胺酶耐藥基因進(jìn)行檢測(cè)發(fā)現(xiàn),耐藥基因以blaTEM為主,本研究結(jié)果與其基本一致,這可能與耐藥基因在細(xì)菌間轉(zhuǎn)移有關(guān)。Jacob S等[15]報(bào)道,ESBLs菌可通過(guò)接合、轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)導(dǎo)等方式使耐藥菌基因在細(xì)菌間快速傳播擴(kuò)散,給臨床治療帶來(lái)困難,進(jìn)一步說(shuō)明加強(qiáng)β-內(nèi)酰胺酶監(jiān)測(cè)的迫切性和必要性。本研究結(jié)果為β-內(nèi)酰胺類抗生素的合理使用和耐藥機(jī)制的研究提供了數(shù)據(jù)支持。

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