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        鴨源新城疫病毒、鴨瘟病毒和鴨圓環(huán)病毒三重PCR 檢測(cè)方法的建立

        2013-08-14 08:01:48許宗麗謝芝勛謝麗基劉加波鄧顯文謝志勤龐耀珊羅思思
        關(guān)鍵詞:新城疫圓環(huán)病原

        許宗麗,謝芝勛,謝麗基,劉加波,鄧顯文,謝志勤,龐耀珊,范 晴,羅思思

        (1.廣西大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,廣西南寧530004;2.廣西壯族自治區(qū)獸醫(yī)研究所,廣西畜禽疫苗新技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣西南寧530001)

        鴨新城疫(Duck Newcastle disease)是由鴨源新城疫病毒(Duck Newcastle disease virus,DuNDV)引起的以消化道病變?yōu)橹饕卣鳌⒕哂懈叨劝l(fā)病率和致死率的烈性傳染病。鴨群中流行的新城疫會(huì)給養(yǎng)鴨業(yè)造成較大損失[1],同時(shí)也嚴(yán)重威脅著我國(guó)養(yǎng)雞業(yè)的安全。鴨瘟(Duck plague,DP)是由鴨瘟病毒(DPV)引起的一種急性、高度接觸性傳染?。?]。鴨瘟流行廣泛,傳播迅速,發(fā)病率和病死率都很高,是危害養(yǎng)鴨業(yè)較為嚴(yán)重的傳染?。?]。鴨新城疫和鴨瘟都有相同的臨床癥狀,精神沉郁,兩腿無(wú)力,呼吸困難,角弓反張,下?。?-5],在臨床上較難做出診斷。鴨圓環(huán)病毒?。―uck circovirus disease)是由鴨圓環(huán)病毒(DuCV)引起的一種主要侵害免疫系統(tǒng)的病毒?。?],致免疫功能的下降或免疫抑制的疾?。?]。圓環(huán)病毒感染的鴨群機(jī)體免疫力受抑制,造成鴨群與其他病原菌或病毒的混合感染情形非常復(fù)雜[8-9]??梢?jiàn),這三種傳染病嚴(yán)重地影響著養(yǎng)鴨業(yè)的發(fā)展。因此,建立同時(shí)快速鑒別檢測(cè)鴨源新城疫病毒、鴨瘟病毒和鴨圓環(huán)病毒的方法對(duì)這三種傳染病的防控有著重要的意義。

        目前對(duì)于病毒性疫病的診斷一般采用病原分離鑒定和血清學(xué)方法,但這些方法存在操作復(fù)雜,費(fèi)時(shí)費(fèi)力敏感性較差等缺點(diǎn),特別是當(dāng)鴨群混合感染多種病原時(shí),應(yīng)用常規(guī)方法難以進(jìn)行早期快速檢測(cè)和鑒別診斷。多重PCR是在PCR基礎(chǔ)上發(fā)展的,即在同一反應(yīng)體系中加入多對(duì)引物,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)多個(gè)目的基因同時(shí)進(jìn)行擴(kuò)增的方法,具有可同時(shí)檢測(cè)、鑒別多種病原體的突出特點(diǎn),在臨床多種病原混合感染的鑒別診斷上具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)和很高的實(shí)用價(jià)值[10-11]。本研究設(shè)計(jì)了3對(duì)特異引物,建立了鴨源新城疫病毒、鴨瘟病毒和鴨圓環(huán)病毒的三重PCR檢測(cè)方法。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 主要試劑 2×Taq PCR Mix購(gòu)自北京天根生物技術(shù)公司;TIANamp血液/細(xì)胞/組織 基因DNA提取試劑盒購(gòu)自天根公司;RNA提取試劑TRIzol LS Reagent購(gòu)自Invitrogen公司。

        1.1.2 病毒株 鴨瘟病毒(DPV)購(gòu)自中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所;鴨源新城疫病毒(DuNDV)、鴨圓環(huán)病毒(DuCV)、番鴨細(xì)小病毒(MDPV)、鴨源小鵝瘟病毒(鴨源GPV)、番鴨呼腸病毒、鴨源H9亞型流感病毒、H5亞型流感病毒核酸、鴨疫里默桿菌、大腸埃希菌(E.coli)、禽多殺性巴氏桿菌等由本實(shí)驗(yàn)室保存。

        1.2 方法

        1.2.1 引物設(shè)計(jì)和合成 從GenBank中下載鴨源新城疫病毒、鴨瘟病毒和鴨圓環(huán)病毒的基因序列,利用Lasergene軟件進(jìn)行多序列比對(duì),在保守區(qū)運(yùn)用軟件Primer Premier 5.0設(shè)計(jì)引物。引物由上海Invitrogen公司合成,引物序列見(jiàn)表1。

        表1 研究用PCR引物Table 1 PCR primers used in this study

        1.2.2 核酸的提取 參照TIANamp血液/細(xì)胞/組織 基因DNA提取試劑盒說(shuō)書(shū),提取DuCV、MDPV、DPV、鴨源GPV、鴨疫里默桿菌、E.coli、禽多殺性巴氏桿菌的DNA;參照Trizol LS Reagent使用說(shuō)明書(shū)抽提DuNDV、番鴨呼腸病毒、鴨源H9亞型流感病毒的RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA,置-70℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.3 三重PCR反應(yīng)條件的優(yōu)化 對(duì)反應(yīng)體系進(jìn)行優(yōu)化:對(duì)DuNDV引物、DPV引物、DuCV引物、模板等用量進(jìn)行優(yōu)化,多次重復(fù)試驗(yàn)后確定最佳反應(yīng)用量。將溫度按50℃~65℃依次遞增,多次重復(fù)試驗(yàn)后確定最佳退火溫度。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用15 g/L瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳鑒定。

        1.2.4 三重PCR的特異性試驗(yàn) 利用優(yōu)化好的三重PCR反應(yīng)體系,以 DuNDV、DPV、DuCV、MDPV、番鴨呼腸病毒、鴨源GPV、H5亞型流感、鴨源H9亞型流感病毒、鴨疫里默桿菌、E.coli、禽多殺性巴氏桿菌的核酸為待檢樣品進(jìn)行檢測(cè),檢驗(yàn)三重PCR方法的特異性。

        1.2.5 三重PCR的靈敏性試驗(yàn) 使用Beckman UV-800紫外分光光度計(jì)測(cè)定DuNDV、DPV和DuCV的核酸濃度,并按10倍遞增稀釋。從第二稀釋度開(kāi)始進(jìn)行三重PCR擴(kuò)增。同時(shí)設(shè)陰性對(duì)照,評(píng)估該三重PCR檢測(cè)方法的敏感性。

        1.2.6 三重PCR的應(yīng)用 應(yīng)用建立的三重PCR方法對(duì)廣西地區(qū)送檢的180份病料進(jìn)行檢測(cè),評(píng)價(jià)該方法的臨床實(shí)用性。

        2 結(jié)果

        2.1 三重PCR反應(yīng)體系的構(gòu)建和優(yōu)化結(jié)果

        通過(guò)對(duì)各反應(yīng)條件的優(yōu)化,最終確定三重PCR反應(yīng)體系為25μL:2×TaqPCR Mix 12.5μL,引物DuCV140、DuCV477、 DPV47、 DPV622 (50 μmol/mL)各 0.2 μL,引 物 DuNDV424、DuNDV1247(50μmol/mL)各0.3μL,模板各1 μL,加水至25μL。反應(yīng)退火溫度的優(yōu)化(圖1),確定最佳的反應(yīng)條件:94℃5min;94℃1min,55℃0.45min,72℃1min,35個(gè)循環(huán);72℃10min(圖2)。

        圖1 三重PCR退火溫度優(yōu)化結(jié)果Fig.1 Optimized results of the annealing temperature for triplex PCR

        圖2 三重PCR的最佳反應(yīng)結(jié)果Fig.2 The results of optimal reaction for the triplex PCR

        2.2 三重PCR特異性試驗(yàn)結(jié)果

        特異性試驗(yàn)結(jié)果顯示,從DuNDV擴(kuò)增出823 bp的特異性條帶,DPV擴(kuò)增出576bp的特異性條帶,DuCV擴(kuò)增出338bp的特異性條帶;而其他病原均未擴(kuò)增出特異條帶(圖3)。

        圖3 三重PCR特異性試驗(yàn)Fig.3 The specificity test of the triplex PCR

        2.3 三重PCR靈敏性試驗(yàn)結(jié)果

        用DU 800紫外分光光度計(jì)測(cè)得DuNDV、DPV、DuCV核酸濃度分別為2.59×107、1.12×107、4.67×106拷貝/μL,并按10倍稀釋梯度進(jìn)行稀釋。從第2個(gè)稀釋梯度開(kāi)始應(yīng)用建立的三重PCR方法進(jìn)行核酸模板檢測(cè),結(jié)果顯示,建立的三重PCR方法對(duì)DuNDV、DPV和DuCV的核酸最低檢出限分別為2.59×103、1.12×103、4.67×102拷貝/μL(圖4)。

        2.4 三重PCR的臨床應(yīng)用

        對(duì)廣西地區(qū)的180份病料進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果檢出10份鴨圓環(huán)病毒,陽(yáng)性率為5.6%;檢出1份鴨源新城疫病毒,陽(yáng)性率為0.56%;未檢出鴨瘟病毒;無(wú)混合感染。

        3 討論

        多重PCR是一種特殊的PCR技術(shù),具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。能在同一PCR反應(yīng)管內(nèi)同時(shí)檢測(cè)出多種病原或?qū)τ卸嗷蛐偷牟≡M(jìn)行分型[12-13];適用于成組病原體的檢測(cè),如腸道致病性細(xì)菌和病毒等;經(jīng)濟(jì)便捷,多種病原在同一反應(yīng)管內(nèi)同時(shí)檢出,大大縮短檢測(cè)時(shí)間,節(jié)約試劑和經(jīng)費(fèi),為臨床提供更多診斷信息。但由于一個(gè)體系中有多種引物和模板,容易相互干擾而引起非特異擴(kuò)增。因此,引物特異、各引物濃度適宜、各引物退火條件相近以及合適大小梯度的目的片段是建立多重PCR的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。本研究設(shè)計(jì)了一套特異性的引物,通過(guò)優(yōu)化反應(yīng)體系,建立了一個(gè)反應(yīng)管能同時(shí)檢測(cè)鴨源新城疫病毒、鴨瘟病毒和鴨圓環(huán)病毒的多重PCR檢測(cè)方法。

        目前,由于DuCV尚沒(méi)有一個(gè)合適的體外培養(yǎng)方法,鴨圓環(huán)病毒病的診斷往往借助于分子生物學(xué)方法如PCR,熒光定量PCR等[14]。鴨圓環(huán)病毒感染導(dǎo)致鴨免疫力下降而容易感染其他病毒。劉少寧等[15]對(duì)我國(guó)山東省742只櫻桃谷鴨(Cherry Valley ducks)中DuCV及混合感染的情況進(jìn)行了流行病學(xué)調(diào)查,結(jié)果顯示,單純感染DuCV的樣品只占被調(diào)查樣品總數(shù)的18.10%,15.19%為DuCV和其他病原的混合感染。張坤等[16]曾報(bào)道山東省濰坊市某鴨場(chǎng)暴發(fā)鴨瘟與鴨源新城疫病毒的混合感染。鴨瘟和鴨新城疫都是烈性傳染病,一旦暴發(fā)兩者混合感染的疫情,就會(huì)給我國(guó)養(yǎng)鴨業(yè)造成重大損失。本研究建立的PCR方法快速準(zhǔn)確,適于鴨圓環(huán)病毒、鴨源新城疫病毒與鴨瘟病毒的混合感染檢測(cè),為鴨圓環(huán)病毒病、鴨瘟和鴨新城疫等重大動(dòng)物疫病監(jiān)測(cè)提供可靠的技術(shù)服務(wù)。

        用本研究建立的三重PCR方法對(duì)廣西地區(qū)180份病料進(jìn)行檢測(cè),檢測(cè)出鴨圓環(huán)病毒的感染率為5.6%,表明廣西地區(qū)存在鴨圓環(huán)病毒的感染;檢出鴨源新城疫病毒的感染率為0.56%;未檢出鴨瘟病毒,可能該種病毒在該地區(qū)已得到較好的防控,同時(shí)也提示需要進(jìn)行更多的臨床樣品的檢測(cè)。

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