黃柏勝,彭志宏,韓 仰,舒坤賢,劉發(fā)益,鄔力祥*
(1.中南大學(xué)湘雅醫(yī)學(xué)院生理學(xué)系,湖南 長沙410078;2.重慶郵電大學(xué)生物信息學(xué)研究所,重慶400065)
甲基轉(zhuǎn)移酶樣基因9(methyltransferase like9,Mettl9)定位于大鼠染色體1q36,該基因是一種類甲基化轉(zhuǎn)移酶,屬于DREVl轉(zhuǎn)甲基酶基因家族,與DREVl基因的相似性很高[1],它是一個(gè)新發(fā)現(xiàn)的p53下游基因,在人和小鼠的同源基因?yàn)镸ETTL9/PAP1基因,有關(guān)該基因的研究報(bào)道也非常少。研究發(fā)現(xiàn),METTL9/PAP1基因在肺癌、小鼠胎肺的發(fā)育過程中特異性表達(dá),且其表達(dá)信號的強(qiáng)弱與凋亡細(xì)胞的強(qiáng)弱成正相關(guān)[2-5],其在胚胎發(fā)育過程中的作用很可能是通過參與細(xì)胞凋亡來實(shí)現(xiàn)的[3];在胃癌和結(jié)腸癌的癌組織,METTL9基因表達(dá)上調(diào),抑制細(xì)胞凋亡[6-7]。為進(jìn)一步揭示Mettl9基因的功能,我們克隆了大鼠Mettl9基因,構(gòu)建了含該基因的慢病毒載體,并在293T細(xì)胞進(jìn)行慢病毒包裝,為研究該基因的功能奠定實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。
DMEM培養(yǎng)基(Hyclone公司),新生牛血清(杭州四季青公司),Trizol(Invitrogen公司),PCR TaqMix(廣州東盛生物公司),瓊脂糖(Spanish公司),E.Z.N.A.Gel Extraction Kit(OMEGA公司),pGEM-T Vector System(Promega公司),大腸桿菌DH5α菌株為本室保存,慢病毒載體pLenti6.3-MCSIRES-EGFP(Invitrogen公司),核酸分子量標(biāo)準(zhǔn)(TaKaRa公司),酵母浸出粉、精解蛋白胨(Oxoid公司),小量質(zhì)粒快速提取試劑盒(北京博大泰克公司),PacI、AscI、BamHI、XhoI和T4連接酶以及逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(Fermentas公司)。
1.2.1 目的基因的體外擴(kuò)增與克隆 從原代培養(yǎng)的大鼠星形膠質(zhì)細(xì)胞中,按照Trizol說明書提取該細(xì)胞的總RNA,逆轉(zhuǎn)錄成cDNA。根據(jù)GenBank中的Mettl9基因序列(NM_001163164),設(shè)計(jì)一對RT-PCR引物,覆蓋完整的閱讀框,引物序列如下:上游5'-CCTCGAGATAGACTGTTGGCGGGCTGGCTGTGCC-3',下游5'-GGATCCCGTTACACTGGTCTGAGAACAAAG ACAGC-3',分別在上、下游引物加XhoI和BamHI酶切位點(diǎn)(下劃線部分),引物由上海博尚生物技術(shù)公司合成。通過T-A克隆,將DNA凝膠回收純化后的PCR產(chǎn)物與pGEM?-T Vector通過T4連接酶連接構(gòu)建重組質(zhì)粒pGEM?-T-Mettl9。
1.2.2 陽性克隆的酶切鑒定與測序 采用XhoI和BamHI雙酶切鑒定上述重組質(zhì)粒,取雙酶切初步認(rèn)定正確的重組質(zhì)粒進(jìn)行DNA序列測定(由上海博尚生物技術(shù)公司完成)。
1.2.3 含Mettl9基因的慢病毒表達(dá)載體的構(gòu)建根據(jù)目的基因設(shè)計(jì)合成亞克隆PCR引物,上游、下游引物5'端分別加入PacI、AscI酶切位點(diǎn)序列(下劃線部分),引物序列如下:上游5'-ATCATGTTAATTAAGCCACCATGAGACTGTTGGCGGGCTG-3',下游5'-ATTATTGGCGCGCCTTACACTGGTCTGAGAACAA AGACAGC-3';用以上引物從質(zhì)粒pGEM?-T-Mettl9中擴(kuò)增目的基因片段,將PCR產(chǎn)物電泳用DNA凝膠回收試劑盒回收,再用PacI和AscI對目的基因片段和pLenti6.3-MCS-IRES-EGFP空載體同時(shí)進(jìn)行酶切2 h,將酶切產(chǎn)物電泳并回收酶切后的目的基因片段和pLenti6.3-MCS-IRES-EGFP,T4連接酶連接回收的目的基因片段和載體,室溫連接2 h,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,挑取陽性克隆,搖菌,提取小量質(zhì)粒雙酶切及測序鑒定。
1.2.4 慢病毒表達(dá)載體的病毒上清包裝 取細(xì)胞狀態(tài)良好,處于對數(shù)生長期的293T細(xì)胞,采用lipofectamine2000轉(zhuǎn)染所構(gòu)建的慢病毒載體至293T細(xì)胞,37℃,5%CO2的培養(yǎng)箱中孵育24 h后,更換完全培養(yǎng)液DMEM+10%FBS。轉(zhuǎn)染換液24 h后,收集培養(yǎng)上清,為慢病毒液第一次收集,再加入10 mL新鮮的完全培養(yǎng)基。轉(zhuǎn)染換液48 h后,再次收集培養(yǎng)上清,為慢病毒液第二次收集。將兩次收集到的病毒原液混合均勻后,4℃,3 000 r/min離心30 min,去除細(xì)胞和碎片,上清用0.45μm的濾器過濾。最后進(jìn)行慢病毒液的濃縮和分裝,將慢病毒原液50,000 g,4℃超速離心2 h,去除上清,沉淀溶解在含有2%FBS的DMEM中。根據(jù)實(shí)驗(yàn)具體要求進(jìn)行分裝,并留樣進(jìn)行滴度測定。
1.2.5 慢病毒活性滴度測定 慢病毒滴度測定前一天細(xì)胞鋪板,293T細(xì)胞經(jīng)胰酶消化后輕輕吹打成單細(xì)胞懸液,細(xì)胞計(jì)數(shù)后鋪96孔板,約8 000個(gè)細(xì)胞每孔。72 h后,在熒光顯微鏡下觀察各孔中熒光細(xì)胞數(shù)量,病毒滴度為各孔中表達(dá)熒光的細(xì)胞數(shù)平均數(shù)除以每孔中含有的慢病毒液體積。
1.2.6 包裝后的慢病毒表達(dá)載體在U251細(xì)胞的表達(dá) 用包裝后含有目的基因的慢病毒表達(dá)載體感染培養(yǎng)的U251細(xì)胞,48 h后倒置熒光顯微鏡下觀察綠色熒光的表達(dá)情況。
2.1.1Mettl9基因的RT-PCR擴(kuò)增 提取大鼠星形膠質(zhì)細(xì)胞的總RNA,逆轉(zhuǎn)錄為cDNA后行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.2%瓊脂糖凝膠電泳,得到大小約為954 bp的片段,與目的基因片段大小一致(圖1)。
2.1.2 重組質(zhì)粒pGEM?-T-Mettl9的雙酶切鑒定結(jié)果 將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)DNA凝膠回收純化后與pGEM?-T Vector連接,經(jīng)XhoI和BamHI雙酶切鑒定,得到兩條分別約3 000 bp的pGEM?-T空載體和954 bp的插入片段(圖2)。
2.1.3 重組質(zhì)粒pGEM?-T-Mettl9的序列測定取酶切正確的重組質(zhì)粒進(jìn)行序列測定,由上海博尚生物技術(shù)公司測序,測得序列全長為954 bp(圖3),將序列向GenBank遞交獲收錄號HQ898855。
2.2.1 慢病毒載體pLenti6.3-Mettl9-IRES-EGFP的雙酶切鑒定 取陽性克隆的質(zhì)粒,用PacI和AscI雙酶切鑒定,得到約9 387 bp的慢病毒載體片段和954 bp的插入片段(圖4)。
圖1 大鼠Mettl9基因的PCR擴(kuò)增Fig.1 PCR amplification of rat Mettl9 gene
圖2 重組質(zhì)粒酶切鑒定Fig.2 Enzyme digestion of the recombinant plasmid
圖3 重組質(zhì)粒pGEM?-T-Mettl9的序列測定圖Fig.3 The sequencing map of pGEM?-T-Mettl9
圖4 慢病毒表達(dá)載體pLenti6.3-Mettl9-IRES-EGFP的雙酶切鑒定Fig.4 Double-enzyme digestion of lentiviral vector pLenti6.3-Mettl9-IRES-EGFP
2.2.2 慢病毒載體的包裝結(jié)果 慢病毒載體在293T細(xì)胞包裝24 h后,由于表達(dá)載體帶有GFP報(bào)告基因,在熒光顯微鏡下可以看到外源基因大量表達(dá)后所發(fā)生的綠色熒光(圖5)。
圖5 慢病毒載體在293T細(xì)胞包裝24 h后的熒光和可見光結(jié)果Fig.5 The image of lentiviral vector pLenti6.3-Mettl9-IRES-EGFP packaged in 293T cells for 24 h under microscopy
2.2.3 慢病毒載體活性滴度測定結(jié)果 慢病毒對293T細(xì)胞系具有感染能力,并且與不同的稀釋倍數(shù)相關(guān),慢病毒對細(xì)胞的感染力直接反映在帶綠色熒光的細(xì)胞數(shù)量上(圖6)。從圖6可以明確地看到,病毒液稀釋的倍數(shù)越高,感染的細(xì)胞越少。對GFP計(jì)數(shù)后可知,本實(shí)驗(yàn)中該慢病毒載體的生產(chǎn)體系所獲得的病毒滴度約為1.825×108TU/mL。
圖6 包裝后的慢病毒載體滴度測定(100×)Fig.6 Measurement of viral titer(100×)
2.2.4 包裝后的慢病毒載體感染體外培養(yǎng)的U251細(xì)胞 用慢病毒載體感染膠質(zhì)瘤U251細(xì)胞,48 h后在倒置熒光顯微鏡下可見綠色熒光(圖7),說明所構(gòu)建的慢病毒表達(dá)載體在293T細(xì)胞包裝后能將目的基因?qū)爰?xì)胞內(nèi)。
圖7 包裝后的慢病毒載體pLenti6.3-Mettl9-IRESEGFP在U251細(xì)胞的表達(dá)Fig.7 The expression of lentiviral vector pLenti6.3-Mettl9-IRES-EGF in U251 cells
p53基因生物學(xué)效應(yīng)主要是通過激活或抑制大量下游基因表達(dá)來完成的,p53及其下游基因所組成的p53基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)才是調(diào)節(jié)細(xì)胞生命活動(dòng)的根本,而p53基因處于這個(gè)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)。P53蛋白主要功能包括誘導(dǎo)細(xì)胞周期阻滯、DNA的修復(fù)和促進(jìn)細(xì)胞凋亡,從而避免受損DNA的堆積、維持基因組的穩(wěn)定性,以及調(diào)節(jié)細(xì)胞的分化與衰老、抑制腫瘤血管增生等。大量研究證明p53下游基因主要包括:p21、CD95/fas、p53AIP1、pag608、gadd45、mdm2、bax、pig3、Cyclin G等[8],正是這些受p53基因調(diào)控的下游基因直接實(shí)現(xiàn)p53基因的眾多生物學(xué)功能。Mettl9基因是一個(gè)新發(fā)現(xiàn)的p53下游基因,與小鼠、人的序列同源性分別為98%、93%,該基因的激活可能主要是通過P53蛋白與其特異性序列結(jié)合,從而促使或抑制該基因的轉(zhuǎn)錄和翻譯;該基因與野生的p53結(jié)合,DNA上的多個(gè)基因位點(diǎn)發(fā)生高度甲基化,導(dǎo)致腫瘤抑制因子等重要基因失活。研究發(fā)現(xiàn),在胃癌、結(jié)腸癌組織中METTL9基因的表達(dá)與p53基因表達(dá)呈負(fù)相關(guān)[6,7]。在小鼠胚胎發(fā)育的不同時(shí)期Mettl9基因表達(dá)信號的強(qiáng)弱與凋亡信號幾乎成正相關(guān)。在腦損傷中,p53基因的表達(dá)上調(diào),抑制p53基因的表達(dá)則對腦缺血性損傷組織具有一定的保護(hù)作用。在大鼠腦缺血再灌注損傷過程中誘導(dǎo)的p53基因表達(dá)的上調(diào)與細(xì)胞凋亡信號的強(qiáng)度一致。在腦缺血后海馬CA1區(qū)p53的表達(dá)增多。由制滴菌素A誘導(dǎo)的C6細(xì)胞凋亡中,p53的表達(dá)特異性的增高[9]。在大鼠視網(wǎng)膜缺血性再灌注損傷中,p53基因的表達(dá)與細(xì)胞凋亡有密切的關(guān)系,可能起促進(jìn)細(xì)胞凋亡的作用。
從UniGene數(shù)據(jù)庫中檢索可知Mettl9、METTL9與PAP1屬于不同物種的同源基因。我們克隆了大鼠Mettl9基因,并向GenBank遞交獲得收錄號HQ898855。在本研究中我們提取了原代培養(yǎng)的大鼠星形膠質(zhì)細(xì)胞的總RNA,逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,擴(kuò)增出Mettl9基因。首先構(gòu)建了重組質(zhì)粒pGEM?-T-Mettl9,便于大量擴(kuò)增獲取目的基因,在構(gòu)建慢病毒載體時(shí)采取直接擴(kuò)增上述重組質(zhì)粒的目的基因,連接到慢病毒載體上進(jìn)行包裝。慢病毒載體基于HIV改造產(chǎn)生的,相對于以往使用的腺病毒、腺相關(guān)病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒載體等,具有容納外源性目的基因片段大,在體內(nèi)表達(dá)穩(wěn)定,免疫反應(yīng)小以及安全性較好等優(yōu)點(diǎn)[10-13],目前,慢病毒載體經(jīng)過不斷改造優(yōu)化,在生物安全性、病毒滴度及靶細(xì)胞嗜性范圍方面均有提高,不會引起導(dǎo)致靶細(xì)胞死亡的免疫反應(yīng),并能夠提供高效的基因轉(zhuǎn)移和長期穩(wěn)定的蛋白表達(dá)。包裝細(xì)胞系的建立是獲得完整病毒顆粒并得以轉(zhuǎn)染靶細(xì)胞的關(guān)鍵步驟,所獲病毒滴度的高低對基因治療成功與否尤其重要。本研究中選用來源于人胚腎細(xì)胞系的293T包裝細(xì)胞完成對慢病毒載體的包裝,我們獲得用于轉(zhuǎn)染真核靶細(xì)胞的完整病毒顆粒,測得病毒滴度為1.825×108TU/mL。腦膠質(zhì)瘤是臨床上顱內(nèi)腫瘤中最常見的一種,起源于神經(jīng)外胚層細(xì)胞,其發(fā)生發(fā)展是一個(gè)多步驟、多階段及多基因參與的遺傳性疾病,p53抑癌基因失活在膠質(zhì)瘤向癌的轉(zhuǎn)變過程中起著重要作用。本研究我們用含Mettl9基因的慢病毒載體的包裝系統(tǒng)感染腦膠質(zhì)瘤U251細(xì)胞,48 h后熒光顯微鏡下可見綠色熒光蛋白的表達(dá),說明含目的基因的慢病毒表達(dá)載體包裝成功并能感染體外培養(yǎng)的細(xì)胞,慢病毒載體的成功構(gòu)建為進(jìn)一步研究Mettl9基因的功能奠定了實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。
[1] TANNAPFEL A,SCHMELZER S,BENICKE M,et al.Expression of the p53 homologues p63 and p73 in multiple simultanous gastric cancer[J].JPathol,2001,195(2):163-170.
[2] SHU K X,LI B,WU L X,et al.Effects of Exogenous p53 Transfection on the Gene Expression in the Human Brain Glioma cell Line U251[J].Colloids and Surfaces B:Biointerfaces,2006,47(2):156-161.
[3] SHU K X,WU L X,LIANGY L,et al.Characterization of the Human PAP1 Gene and its Homologue Possible Involvement in Mouse Embryonic Development[J].Colloids and Surfaces B:Biointerfaces,2006,52(2):22-30.
[4] 舒坤賢,夏燕,冉啟煤.PAP1/METTL9基因在肺癌細(xì)胞中表達(dá)譜的生物信息學(xué)分析[J].中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志,2011,21(33):4141-4144.SHU Kunxian,XIA Yan,RAN Qimei.Analysis of gene expression pattern of PAP1/METTL9 in lung cancer cells[J].China Journal of Modern Medicine,2011,21(33):4141-4144.
[5] SHU K X,LIANG Y L,XIE Y F,et al.Directcloning of p53 down-stream genes using Tet-OnTM gene expression system[J].China Journal of Modern Medicine,2004,14(1):7-11.
[6] 馬鵬,閏軍,王春芳,等.P53及其下游基因MEITL9在結(jié)腸癌中表達(dá)的研究[J].中國醫(yī)師雜志,2011,3(13):337-339.MA Peng,YAN Jun,WANG Chunfang,et al.P53 and its downstream gene METTL-9 expression in colon cancer[J].Journal of Chinese Physician,2011,3(13):337-339.
[7] 李明,閆軍,王春芳,等.胃癌標(biāo)本和正常胃組織中P53基因及其下游基因METTL9表達(dá)研究[J].中國醫(yī)療前沿,2010,5(23):37-38.LIMing,YAN Jun,WANG Chunfang,et al.Stomach specimens and normal in stomach tissue P53 genes andMETTL9 of their downstream gene expression study[J].National Medical Frontiers of China,2010,5(23):37-38.
[8] CLEGG H,ITAHANA K,ZHANG Y.Unlocking the Mdm2-p53 loop:ubiquitin is the key[J].Cell Cycle,2008,7(3):287-292.
[9] HSU Y F,SHEU JR,GEORGE H,et al.p53 in trichostatin A induced C6 glioma cell death[J].Biochimica et Biophysica Acta,2011,1810(5):504-513.
[10] NALDINI L,BLOMER U,GALLAY P,et al.In vivogene delivery and stable transduction of nondividing cells by a lentiviral vector[J].Science,1996,272(5259):263-267.
[11] NALDINI L,BLOMER U,GAGE F H,et al.Efficient transfer,intergration,and sustained longterm expression of the transgene in adult rat brains injected with a lentiviral vector[J].Proc Natl Acad Sci USA,1996,93(21):11382-11388.
[12] KAFRI T,BLOMER U,PETERSON D A,et al.Sustained expression of genes delivered directly into liver and muscle by lentiviral vectors[J].Nat Genet,1997,17(3):314-317.
[13] KAFRIT,VAN PH,OUYANGL,et al.A packaging cell line for lentivirus vectors[J].JVirol,1999,73(1):576-584.