張志遠(yuǎn) 劉凱△ 綜述 張劍 審校
MicroRNA183家族與聽力損失
張志遠(yuǎn)1劉凱1△綜述 張劍1審校
microRNA(miRNA)183家族由3個(gè)同源miRNA組成(miR-183,miR-96和miR-182),長(zhǎng)約4 kb,在眼、鼻及內(nèi)耳的特定感覺細(xì)胞中有充分的表達(dá),對(duì)內(nèi)耳的發(fā)展過(guò)程有著重要的影響[1,2]。因此,miRNA183家族在聽覺及聽力損失中的作用開始被關(guān)注,有觀點(diǎn)認(rèn)為其成員特定區(qū)域的突變可能為聽力損失的重要因素之一[3],但仍存在爭(zhēng)議。本文擬通過(guò)對(duì)miRNA183家族成員與聽力損失之間的關(guān)系進(jìn)行綜述,期望為聽力損失的早期預(yù)防和診治開辟新的途徑提供參考。
miRNA是1993年在研究線蟲突變體時(shí)發(fā)現(xiàn)的一類長(zhǎng)約21~25個(gè)核苷酸的小分子非編碼RNA,廣泛存在于哺乳動(dòng)物基因組中,具有高度的保守性[4]。在人和大鼠,約一半miRNA基因存在于內(nèi)含子中,并與已知的蛋白編碼基因一起表達(dá)。約三分之一與其他的miRNA基因串聯(lián)在一起,顯示一種協(xié)調(diào)性的表達(dá)[5]。miRNA是一類非常重要的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控因子,研究發(fā)現(xiàn),為數(shù)不多的miRNA可以決定約30%的蛋白編碼基因的表達(dá),同時(shí)miRNA與惡性腫瘤、心血管疾病以及正常的細(xì)胞增殖、分化、凋亡、應(yīng)激、脂肪代謝、生長(zhǎng)發(fā)育等密切相關(guān)[6]。miR-183家族很可能是多順?lè)醋踊?,在脊椎?dòng)物的單個(gè)基因座上共表達(dá)[7]。
Lagos-Quintana等[8]應(yīng)用克隆和排序的方法研究miRNA的表達(dá)發(fā)現(xiàn),在不同的細(xì)胞類型與組織中存在大量獨(dú)特的miRNA,而且許多是有區(qū)別的表達(dá)。miRNA在生物的發(fā)展過(guò)程中起著重要作用,包括脊椎動(dòng)物的發(fā)展以及各種組織類型的細(xì)胞系分化過(guò)程。在脊椎動(dòng)物中,miRNA以一種高組織特異性的方式表達(dá),miR-183家族成員表達(dá)在不同器官的感覺細(xì)胞中,包括斑馬魚的嗅覺上皮組織、眼、耳和神經(jīng)丘,小鼠的感覺神經(jīng)以及眼、耳的感覺細(xì)胞[9]。
Wienholds等[9]研究發(fā)現(xiàn),在斑馬魚的機(jī)械感覺器官中有一定的miRNA表達(dá),miR-183家族在斑馬魚的內(nèi)耳毛細(xì)胞以及神經(jīng)丘上表達(dá),并認(rèn)為miRNA的表達(dá)有細(xì)胞特異性,可能對(duì)脊椎動(dòng)物的內(nèi)耳發(fā)育起著重要作用。Weston等[10]研究發(fā)現(xiàn),在已知的miRNA中,約三分之一在大鼠的內(nèi)耳表達(dá),而且這種表達(dá)貫穿了從出生到成熟的整個(gè)過(guò)程,miRNA在內(nèi)耳毛細(xì)胞中表達(dá)相當(dāng)穩(wěn)定,提示其在細(xì)胞發(fā)育和分化的胚胎期就已經(jīng)存在。該實(shí)驗(yàn)也證實(shí)并補(bǔ)充了Wienholds等的研究結(jié)果,認(rèn)為miR-183家族在整個(gè)哺乳類動(dòng)物的聽覺和前庭器官的毛細(xì)胞中廣泛表達(dá)。miRNA在斑馬魚和哺乳動(dòng)物的機(jī)械感覺毛細(xì)胞中表達(dá)的進(jìn)化保守性,提示在不同生物體中其功能也具有同樣的保守性。正是因?yàn)檫@些miRNA序列的高度保守性,使得其在內(nèi)耳毛細(xì)胞等功能感覺細(xì)胞的發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮重要作用[11]。
Sacheli等[12]應(yīng)用LNA探針詳細(xì)研究從胚胎到成熟期的小鼠內(nèi)耳中miR-183家族成員的表達(dá),發(fā)現(xiàn)在耳蝸結(jié)構(gòu)成形和分化的頂峰期,miR-183家族成員呈現(xiàn)了一種受限并動(dòng)態(tài)的表達(dá),證實(shí)并補(bǔ)充了Weston等的研究結(jié)果,認(rèn)為miR-183家族具有感覺組織特異性。更重要的是,其不同時(shí)間與空間的表達(dá)與內(nèi)耳的功能成熟相關(guān),起初在整個(gè)上皮細(xì)胞中都有表達(dá),隨后在前庭和聽覺器官的高分化毛細(xì)胞中其表達(dá)受到限制。miRNA在多細(xì)胞生物中的表達(dá)呈現(xiàn)出時(shí)空及組織細(xì)胞特異性,其參與了組織的形態(tài)發(fā)生和細(xì)胞的分化[8]。因此,研究者認(rèn)為miR-183家族成員的表達(dá)在管理前庭和內(nèi)耳聽覺部分的細(xì)胞分化和規(guī)范方面起到了重要作用。
盡管有上百種miRNA存在于斑馬魚和其他的脊椎動(dòng)物的胚胎中,但目前對(duì)個(gè)別miRNA在發(fā)育過(guò)程中所起的作用仍不甚了解。Li等[2]通過(guò)研究斑馬魚胚胎發(fā)育,證實(shí)miR-183家族成員在內(nèi)耳毛細(xì)胞和神經(jīng)元的發(fā)育過(guò)程中起到了重要的作用,認(rèn)為在排除轉(zhuǎn)錄因子(例如Atoh1)和Delta-Notch信號(hào)破壞等因素后,miRNA的錯(cuò)誤表達(dá)能產(chǎn)生過(guò)多的毛細(xì)胞;而在miRNA沉默基因的過(guò)度表達(dá)時(shí),會(huì)引起毛細(xì)胞數(shù)量明顯減少。該研究結(jié)果顯示了miRNA在確保感覺上皮細(xì)胞發(fā)育過(guò)程中,特別是對(duì)調(diào)節(jié)感覺細(xì)胞精確數(shù)量的必要性。因此,對(duì)毛細(xì)胞而言,miRNA的功能是調(diào)節(jié)靶基因的精確水平。
在斑馬魚的內(nèi)耳中有神經(jīng)細(xì)胞和毛細(xì)胞,研究發(fā)現(xiàn)[2],兩種細(xì)胞分化后表達(dá)的miR-183家族成員水平不同,神經(jīng)細(xì)胞miR-183的表達(dá)水平低于毛細(xì)胞,而且在miRNA的超表達(dá)過(guò)程中呈現(xiàn)一種消極的影響,然而毛細(xì)胞在相同處理下體現(xiàn)了積極的影響,提示miRNA的許多靶向轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物在初始的毛細(xì)胞中受抑制,但又可能是必需的。迄今為止,對(duì)于神經(jīng)源性基因(包括特定的聽平衡神經(jīng)節(jié)神經(jīng)元),在其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物上沒有預(yù)測(cè)到miR-183家族成員的結(jié)合位點(diǎn)[2]。因?yàn)閙iRNA的功能是通過(guò)抑制其靶基因在轉(zhuǎn)錄后的水平來(lái)發(fā)揮作用,所以miRNA和靶基因是起決定性的作用。研究證實(shí)[2],miR-183家族靶基因在其基因突變體中仍表達(dá)穩(wěn)定,盡管如此,突變引起的功能喪失提示在毛細(xì)胞和神經(jīng)細(xì)胞,三種miRNA的功能有重疊,它們可能至少擁有一些共同的靶基因。這也支持過(guò)量的miR-182能夠部分緩和由miR-96基因沉默而引起的毛細(xì)胞缺失這一結(jié)果。另外,個(gè)別miR-183家族成員的超表達(dá)結(jié)果也顯示了其在增加毛細(xì)胞數(shù)量和前感覺細(xì)胞形態(tài)大小上的不同能力,同時(shí)也暗示它們各自也結(jié)合了一些獨(dú)特的靶基因[2]。Xu等[13]通過(guò)應(yīng)用生物信息學(xué)為基礎(chǔ)的靶基因預(yù)測(cè)也支持以上結(jié)論。靶基因的發(fā)現(xiàn)揭示了miR-183家族成員形態(tài)紊亂的潛在分子基礎(chǔ)。
目前關(guān)于miR-183家族成員如何影響毛細(xì)胞的命運(yùn)尚不清楚,可能是通過(guò)間接刺激毛細(xì)胞基因或抑制支持細(xì)胞基因,也可能是通過(guò)下調(diào)增殖所需蛋白質(zhì)的轉(zhuǎn)錄過(guò)程等方式來(lái)起作用的[2]。哺乳動(dòng)物內(nèi)耳毛細(xì)胞的再生仍是一個(gè)很大的難題,鳥類和魚的毛細(xì)胞是可以再生的[14]。盡管有研究者將Atoh1基因在體外可以成功地誘導(dǎo)生后大鼠和豚鼠的內(nèi)耳毛細(xì)胞異位發(fā)育,但是許多毛細(xì)胞仍是不成熟的或者仍有形態(tài)學(xué)的缺陷[15]。因此,一個(gè)源于潛在支持細(xì)胞的毛細(xì)胞要想完整再生需要正反兩面的細(xì)胞分化調(diào)控者,可能包括miRNA。miR-183家族在毛細(xì)胞上的大量表達(dá)與miRNA能誘導(dǎo)額外毛細(xì)胞的能力相符,同時(shí)也支持該家族在促使毛細(xì)胞再生方面潛在的治療作用。此作用可能是通過(guò)促進(jìn)毛細(xì)胞基因的表達(dá)或者抑制原始感覺和支持細(xì)胞基因來(lái)實(shí)現(xiàn)的[2]。在內(nèi)耳毛細(xì)胞的發(fā)育、分化等過(guò)程中,單個(gè)miRNA的功能和機(jī)制一旦明確必定會(huì)加速人們對(duì)其作用途徑和因子的了解,而且為miRNA參與基因治療提供了設(shè)想,例如在干細(xì)胞向毛細(xì)胞再生的過(guò)程中影響細(xì)胞特性或細(xì)胞分化[16]。
Friedman等[1]通過(guò)阻礙小鼠內(nèi)耳miRNA的功能發(fā)現(xiàn)內(nèi)耳毛細(xì)胞中的miRNA具有調(diào)節(jié)聽覺功能的作用,這些miRNA一旦出現(xiàn)異常就會(huì)導(dǎo)致耳聾,表明miRNA相當(dāng)于內(nèi)耳毛細(xì)胞正常發(fā)育、存活的調(diào)節(jié)器,任何原因引起miRNA異常都可造成漸進(jìn)性聽力損失。
單核苷酸多態(tài)性(SNP)即在基因組上單個(gè)核苷酸的變異會(huì)引起DNA序列多態(tài)性,在人類基因組中大概每1 000個(gè)堿基就有一個(gè)SNP。有研究發(fā)現(xiàn),編碼合成人類miRNA的基因及miRNA的靶基因結(jié)合序列內(nèi)也存在SNP,并通過(guò)影響miRNA的合成和成熟,導(dǎo)致新的miRNA形成以及影響靶序列識(shí)別,從而影響相關(guān)疾病的易感性[17]。Mencia等[3]發(fā)現(xiàn)miR-96種子區(qū)域SNP與家族遺傳性聽力損失密切相關(guān);在研究?jī)蓚€(gè)常染色體顯性遺傳導(dǎo)致的進(jìn)行性非綜合征型聽力損失(NSHL)的西班牙家族時(shí)發(fā)現(xiàn),在miR-96種子區(qū)域有兩處突變(+ 13G>A和+14C>A)影響了脊椎動(dòng)物(從魚到人)中呈完全保守性的核苷酸,同時(shí)也將突變引起的聽力損失與其他原因引起的聽力下降相區(qū)別。在He-La和NIH-3T3細(xì)胞中,通過(guò)分析這些突變對(duì)miR -96的加工及靶基因識(shí)別等的影響,顯示這兩處突變導(dǎo)致了成熟miRNA水平降低并隱藏了基因沉默的能力。Lewis等[18]在建立小鼠耳聾模型對(duì)該SNP位點(diǎn)進(jìn)行了功能驗(yàn)證,進(jìn)一步闡明了miR-96種子區(qū)域SNP在遺傳性聾中的作用。
近期有研究發(fā)現(xiàn)了與Mencia等不同的結(jié)果,Hildebrand等[19]對(duì)150個(gè)有常染色體顯性NSHL的美國(guó)家庭進(jìn)行了重復(fù)性的研究,未發(fā)現(xiàn)miR-96種子區(qū)域的突變存在,因此認(rèn)為miRNA的突變并不是耳聾的常見原因。Soldà等[20]通過(guò)對(duì)大量意大利人群的篩選,確認(rèn)在miR-96基因中存在一個(gè)異常的可引起NSHL的突變(+57T>C),與以前所報(bào)道的突變不同的是,此突變并未影響到miR-96的種子區(qū)域,但卻改變了miR-96的同伴基因(miR -96*)的序列;而且,此研究證實(shí)該突變通過(guò)改變前體miRNA(pre-miRNA)的二級(jí)結(jié)構(gòu)來(lái)?yè)p害成熟miR-96的產(chǎn)物,同時(shí)間接影響miR-96目的基因的正常調(diào)節(jié),結(jié)果提示,miR-96的一個(gè)定量缺陷足以引起聽力下降[20]。
最近有學(xué)者在新生及成熟的動(dòng)物內(nèi)耳中發(fā)現(xiàn)了毛細(xì)胞的原始細(xì)胞,即干細(xì)胞[21,22],通過(guò)促進(jìn)原始細(xì)胞向毛細(xì)胞分化將有助于恢復(fù)聽覺功能[23]。當(dāng)前學(xué)者們認(rèn)為許多感覺上皮細(xì)胞是從相同的祖細(xì)胞發(fā)展而來(lái),祖細(xì)胞經(jīng)歷了一系列起始到成熟的過(guò)程,最后成為功能性的毛細(xì)胞。通過(guò)對(duì)候補(bǔ)基因的敲入敲除實(shí)驗(yàn),在起始或早期的耳基板和聽泡上發(fā)現(xiàn)了少量的分泌蛋白,例如骨形成蛋白4(BMP4)、T-box1(Tbx1)和Notch1[24]。通過(guò)在斑馬魚中抑制或超表達(dá)miR-183家族成員,Li等[2]發(fā)現(xiàn)miR-182的超表達(dá)擴(kuò)大了聽平衡神經(jīng)節(jié)聽覺區(qū)域的缺陷,同時(shí)miR-96擾亂了前感覺及聽平衡神經(jīng)節(jié)的結(jié)構(gòu)。miR-183家族的成員同時(shí)沉默將引起半規(guī)管和內(nèi)耳的缺陷。Wang等[25]通過(guò)培養(yǎng)胚胎小鼠的內(nèi)耳干細(xì)胞發(fā)現(xiàn),在內(nèi)耳干細(xì)胞向毛細(xì)胞樣胞體分化過(guò)程中有miR-182的表達(dá),異位的miR-182能促使內(nèi)耳干細(xì)胞向毛細(xì)胞樣胞體分化。其功能可能與公認(rèn)的目的基因T-box1相關(guān),提示miR-182和T-box1能促使內(nèi)耳干細(xì)胞分化成毛細(xì)胞。因此,這可能是解決毛細(xì)胞缺失造成聽覺障礙的一條新途徑。
miRNA在生物發(fā)育過(guò)程中的作用已被廣泛研究,許多高保守性的miRNA在特定的細(xì)胞、器官和生物過(guò)程(包括疾病)中的作用也得到了充分的認(rèn)識(shí)。miR-183家族在內(nèi)耳發(fā)育中有重要的調(diào)控作用,與聽力損失也有密切的關(guān)系,因此,miR-183家族與聽力損失的相關(guān)性將成為未來(lái)的研究熱點(diǎn)之一,尤其是在促使毛細(xì)胞再生領(lǐng)域及聽力提高等方面,有望探索基因治療方法。
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(2012-10-12收稿)
(本文編輯 周濤)
10.3969/j.issn.1006-7299.2013.04.031
時(shí)間:2013-5-9 13:58
R764.43
A
1006-7299(2013)04-0425-03
1 南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科(南昌 330006)通訊作者:張劍(Email:zhangjian115123@126.com)
△ 為并列第一作者
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