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        取代基對甲酰胺二聚體中N-H…O=C氫鍵強度的影響

        2013-01-10 03:38:56鄭艷萍王敬微
        通化師范學院學報 2013年8期
        關鍵詞:甲酰胺鍵長氫鍵

        鄭艷萍,王敬微

        (通化師范學院 化學學院,吉林 通化 134002)

        氫鍵是最重要的相互作用之一,它影響著從無機到生物的許多體系,決定著分子構造、分子聚集狀態(tài)和功能[1-2].對氫鍵強度和本質進行深入研究具有重要意義[3-8].在本文中,我們利用二級微擾理論MP2方法,選取一系列N-H…O=C氫鍵二聚體為研究對象,深入探討不同取代基對N-H…O=C氫鍵強度的影響.

        1 計算方法

        圖1為本文研究的5個氫鍵二聚體.使用MP2/6-31+G**方法優(yōu)化幾何結構,并進行頻率計算來確定所得的結構是穩(wěn)定構型.在MP2/6-31+G**幾何結構基礎上,使用MP2/6-311++G(d,p)、MP2/6-311++G(3df,2p)和MP2/aug-cc-PVTZ方法計算了單點能并進行了基組重疊誤差(BSSE)校正[9].全部計算采用Gaussian03程序包完成.

        圖1 5個氫鍵二聚體體系(R=-Me,-NH2,-H,-CONH2,-CF3)

        2 結果與討論

        2.1 幾何構型

        圖2給出了本文研究的5個氫鍵二聚體的優(yōu)化結構及相應的幾何參數.由圖2可以看出,與甲酰胺二聚體(R=-H)相比,氫鍵受體分子中的供電子基團使氫鍵鍵長r(H…O)縮短,使N-H鍵長r(N-H)和C=O鍵長r(C=O)伸長,吸電子基團使氫鍵鍵長r(H…O)伸長,使N-H鍵長r(N-H)和C=O鍵長r(C=O)縮短.例如:甲酰胺二聚體(R=-H)的r(H…O)為1.973?,r(N-H)為1.014?,r(C=O)為1.235?.當取代基為供電子基團-Me時,r(H…O)為1.952?,縮短了0.021?,r(N-H)與r(C=O)為1.015?和1.239?,分別伸長了0.001?和0.004?.取代基為供電子基團-NH2時,r(H…O)為1.962?,縮短了0.011?,r(N-H)與r(C=O)為1.014?和1.236?,r(C=O)伸長了0.001?.當取代基為吸電子基團-CONH2時,r(H…O)為2.013?,伸長了0.040?,r(N-H)與r(C=O)為1.012?和1.231?,分別縮短了0.002?和0.004?.取代基為吸電子基團-CF3時,r(H…O)為2.043?,伸長了0.07?,r(N-H)與r(C=O)為1.011?和1.227?,分別縮短了0.003?和0.008?.由圖2還可看出,不論取代基為供電子基團還是吸電子基團,二聚體中N-H鍵長r(N-H)和C=O鍵長r(C=O)與單體中的r(N-H)和r(C=O)比較都有所伸長.例如:當取代基為供電子基團-Me時,r(N-H)為1.015?,r(C=O)為1.239?,這與單體中的1.005?和1.232?比較,分別伸長了0.01?和0.007?.當取代基為吸電子基團-CF3時,r(N-H)為1.011?,r(C=O)為1.227?,這與單體中的1.005?和1.221?比較,都伸長了0.006?,表明二聚體中氫鍵的形成使得N-H和C=O鍵變弱.

        圖2 MP2/6-31+G**水平優(yōu)化的5個N-H…O=C氫鍵體系的幾何結構

        2.2 氫鍵能量

        表1中第2~3列,4~5列,6~7列,8~9列給出了在MP2方法下分別使用6-31+G**、6-311++G(d,p)、6-311++G(3df,2p)和aug-cc-PVTZ基組計算得到的5個體系的氫鍵能量.

        由表1可以看出,MP2/6-31+G**(BSSE)計算得到的甲酰胺二聚體(R=-H)的氫鍵能量為-6.04kcal/mol,MP2/6-311++G(d,p)(BSSE)的結果為-5.99kcal/mol,MP2/6-311++G(3df,2p)(BSSE)的結果為-6.80kcal/mol,MP2/aug-cc-PVTZ(BSSE)的結果為-6.97kcal/mol.我們使用MP2/aug-cc-PVTZ(BSSE)的計算結果(-6.97kcal/mol)與文獻報道的甲酰胺二聚體中N-H…O=C的平均氫鍵能量-7.1kcal/mol[4]相符.與MP2/aug-cc-PVTZ計算結果比較,MP2/6-31+G**方法與MP2/6-311++G(d,p)方法計算的結果與之分別相差了0.93kcal/mol和0.98kcal/mol,而MP2/6-311++G(3df,2p)方法計算結果與之僅相差0.17kcal/mol,說明使用MP2/6-311++G(3df,2p)方法可以得到比較可靠的結果.由表1可以看出,MP2/aug-cc-PVTZ方法下不考慮BSSE校正時高估氫鍵相互作用能大約0.6~0.7kcal/mol.由表1還可以看出,用不同的基團取代質子受體分子中的氫原子對N-H…O=C氫鍵強度的影響是不同的.例如:MP2/aug-cc-PVTZ計算結果表明,甲酰胺二聚體(R=-H)的氫鍵相互作用能為-6.97kcal/mol.當取代基為供電子基團-Me時,二聚體的氫鍵相互作用能為-7.55kcal/mol,增強了0.68kcal/mol.取代基為供電子基團-NH2時,二聚體的氫鍵相互作用能為-7.16kcal/mol,增強了0.19kcal/mol.當取代基為吸電子基團-CONH2時,二聚體的氫鍵相互作用能為-5.74kcal/mol,減弱了1.23kcal/mol.取代基為吸電子基團-CF3時,二聚體的氫鍵相互作用能為-5.06kcal/mol,減弱了1.91kcal/mol.由此得出,供電子基團取代質子受體分子中的氫原子使氫鍵作用增強,而吸電子基團使氫鍵作用減弱.

        表1 MP2方法計算得到的5個N-H…O=C體系氫鍵能量 (kcal/mol)

        2.3 自然鍵軌道(NBO)分析

        表2給出了本文研究的5個氫鍵二聚體體系的自然鍵軌道(NBO)分析計算結果,其中qH、qO分別為參與形成氫鍵的氫原子和氧原子的電荷,ΔqH為二聚體中參與形成氫鍵的qH與單體分子中相應的氫原子電荷的差值,ΔqO為二聚體中參與形成氫鍵的qO與單體分子中相應的氧原子電荷的差值.qD、qA分別為質子供體分子和質子受體分子的電荷,Eij為N-H…O=C氫鍵中氧原子的孤對電子(n)對N-H反鍵軌道σ*的二階穩(wěn)定化能,EHB為使用MP2/aug-cc-PVTZ(BSSE)方法計算得到的氫鍵能量.

        表2 MP2/6-31+G**水平5個氫鍵體系的自然鍵軌道分析結果及氫鍵能量(kcal/mol)

        由表2第2~3列可以看出,與甲酰胺二聚體(R=-H)中參與形成氫鍵的氫原子電荷0.4678比較,當取代基為供電子基團-Me時,qH為0.4694,正電荷增加了0.0016.取代基為吸電子基團-CF3時,qH為0.4598,正電荷減少了0.008.由表2中第4~5列可以看出,與甲酰胺二聚體(R=-H)中參與形成氫鍵的氧原子電荷-0.7570比較,當取代基為供電子基團-Me時,qO為-0.7672,負電荷增加了0.0102,這是由于-Me具有供電子能力,從而使參與形成氫鍵的氧原子電荷增加;取代基為吸電子基團-CF3時,qO為-0.7054,負電荷減少了0.0516,這是由于-CF3具有吸電子能力,使參與形成氫鍵的氧原子電荷降低.對于其它的基團都有類似的結果,即氫鍵強度越強,氫鍵N-H…O=C中氫原子的電荷越正,氧原子的電荷越負.由表2中第6~7列可以看出,與甲酰胺二聚體(R=-H)單體分子間電荷轉移量0.0169比較,當取代基為供電子基團-Me時,單體分子間電荷轉移量為0.0186,電荷轉移量增多;當取代基為吸電子基團-CF3時,單體分子間電荷轉移量為0.0120,電荷轉移量減少.表2中第6、第7和第9列數據表明,單體分子間電荷轉移的越多,氫鍵相互作用越強.

        氫鍵作用相對強弱還可以用質子受體的孤對電子對(n)和質子供體的反鍵σ*軌道之間n→σ*的相互作用來描述.由表2可以看出,與甲酰胺二聚體的二階穩(wěn)定化能Eij比較,用不同的取代基取代質子受體分子中的氫原子,供電子基團使得n(O)→σ*(N-H)的二階穩(wěn)定化能Eij增加,而吸電子基團使得n(O)→σ*(N-H)的二階穩(wěn)定化能Eij減弱.例如:甲酰胺二聚體(R=-H)的二階穩(wěn)定化能Eij為14.37kcal/mol,取代基為供電子基團-Me時,二階穩(wěn)定化能Eij為15.48kcal/mol,增加了1.11kcal/mol.取代基為吸電子基團-CF3時,二階穩(wěn)定化能Eij為10.91kcal/mol,減弱了3.46kcal/mol.表2中第8~9列數據表明,氫鍵強度越強,二階穩(wěn)定化能越大.

        3 結論

        本文研究表明,可以通過改變取代基來影響二聚體中N-H…O=C氫鍵的強度.取代基為供電子基團時,氫鍵強度增強,取代基為吸電子基團時,氫鍵強度減弱.并且氫鍵強度越強,N-H…O=C氫鍵中氫原子電荷越正,氧原子電荷越負,單體分子間電荷轉移越多,質子受體的孤對電子對(n)和質子供體的反鍵軌道σ*之間n(O)→σ*(N-H)的二階穩(wěn)定化能越大.

        參考文獻:

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