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        豬細(xì)小病毒和豬圓環(huán)病毒2 型多重PCR檢測(cè)方法的建立與應(yīng)用

        2012-12-23 06:25:22樊振華王娟萍劉文俊米瑞娟姚敬明程海龍
        山西農(nóng)業(yè)科學(xué) 2012年10期
        關(guān)鍵詞:病料單相細(xì)小

        樊振華,王娟萍,孟 帆,吳 忻,劉文俊,米瑞娟,姚敬明,程海龍

        (1.山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,山西太原030032;2.太谷縣畜牧中心,山西太谷030800)

        豬圓環(huán)病毒2 型(PCV2)、豬細(xì)小病毒(PPV)是導(dǎo)致豬繁殖障礙病的主要病原體。其中,豬圓環(huán)病毒(PCV)是1974 年德國(guó)學(xué)者發(fā)現(xiàn)的新病毒[1],1982 年命名為豬圓環(huán)病毒。PCV 有PCV1和PCV2 這2 種血清型。PCV2 具有較強(qiáng)的致病性,其經(jīng)鼻、口腔侵入不同日齡的豬體內(nèi),在扁桃體局部淋巴結(jié)增殖后,向其他淋巴組織、肺、肝、腎傳播,懷孕母豬感染后,經(jīng)胎盤垂直感染給仔豬,初產(chǎn)母豬和新豬群產(chǎn)生繁殖障礙;PCV2 可引起斷奶仔豬多系統(tǒng)衰竭綜合征(PMWS)以及增生性壞死性肺炎、皮炎和腎病綜合征、仔豬先天性震顫,該病多發(fā)生于5~12 周齡的仔豬。豬群患病率3%~50%,死亡率8%~35%,該病發(fā)展緩慢,豬群一次發(fā)病可持續(xù)12~18 個(gè)月。

        豬細(xì)小病毒(PPV)于1967 年首次報(bào)道[1-2]。母豬初產(chǎn)或首次感染者會(huì)發(fā)生流產(chǎn)、死胎,仔豬大量死亡,育成豬發(fā)生皮炎、腹瀉、關(guān)節(jié)炎,豬場(chǎng)一旦感染,3 個(gè)月內(nèi)100%感染,會(huì)造成80%~100%死亡,感染豬很長(zhǎng)時(shí)間帶毒、排毒。這2 種疾病在臨床上呈現(xiàn)出相似的癥狀,又常常發(fā)生混合感染,使臨床診斷非常困難,必須依靠實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行鑒別診斷[3]。

        以往的血清學(xué)診斷準(zhǔn)確率低,病毒分離診斷方法雖然準(zhǔn)確,但操作復(fù)雜,費(fèi)時(shí)、費(fèi)力。多重PCR 技術(shù)是在同一PCR 體系中加入多對(duì)引物,對(duì)多個(gè)目的基因同時(shí)進(jìn)行擴(kuò)增的分子生物學(xué)診斷方法,具有快速、敏感、特異、易于操作的優(yōu)點(diǎn),可用一個(gè)樣品同時(shí)檢測(cè)多種病原體或多個(gè)基因型,達(dá)到對(duì)多種疾病的同步診斷,進(jìn)而縮短檢測(cè)時(shí)間,減少試劑消耗。王宏魁等[4]曾建立了檢測(cè)PCV2 和PCV1 的多重PCR 方法,周海范等[5]曾建立了檢測(cè)PRRSV,PCV2 的多重PCR 方法。

        本試驗(yàn)利用多重PCR 技術(shù)對(duì)PPV 和PCV2進(jìn)行了檢測(cè)研究,建立同時(shí)快速鑒別診斷這2 種病毒的方法,并應(yīng)用于臨床實(shí)踐中,初步查明了山西這2 種豬病毒的感染情況。

        1 材料和方法

        1.1 病毒株、組織病料、陽(yáng)性對(duì)照

        豬細(xì)小病毒株(PPV)、豬圓環(huán)病毒2 型毒株(PCV2)由軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院軍事獸醫(yī)研究所提供,2 種病毒PCR 陽(yáng)性對(duì)照由北京世紀(jì)元亨動(dòng)物疫病防疫技術(shù)有限公司提供,臨床組織病料是山西省農(nóng)科院畜牧獸醫(yī)研究所動(dòng)物基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究課題組從疑似病豬體內(nèi)采集。

        1.2 主要試劑和引物

        1.2.1 試劑 TaKaRa Ex Taq Taq DNA 聚合酶、DNA Marker DL 2 000 等試劑購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司,病毒DNA 抽提試劑盒、PPV 和PCV2 病毒單項(xiàng)PCR 診斷試劑盒購(gòu)自北京世紀(jì)元亨動(dòng)物疫病防疫技術(shù)有限公司。

        1.2.2 引物設(shè)計(jì)與合成 通過(guò)計(jì)算機(jī)網(wǎng)站(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)查找出PPV,PCV2 的基因序列,利用Primer Premier 5.0 軟件按照引物設(shè)計(jì)原則,最后選擇PPV 的VP2 基因、PCV2 的ORF2 基因?yàn)槠鋽U(kuò)增靶序列[6],借助計(jì)算機(jī)篩選設(shè)計(jì)出符合多重PCR 要求的2 對(duì)引物,引物由寶生物工程(大連)有限公司合成(表1)。

        表1 多重PCR 引物

        1.3 試驗(yàn)方法

        1.3.1 病毒模板DNA 的提取

        1.3.1.1 病料采集與處理 取病、死豬有明顯病變與健康部交界處的淋巴結(jié)、扁桃體、脾臟、肺、肝、腎等組織,-70 ℃保存。

        1.3.1.2 病毒模板DNA 的提?。ò纯侱NA 抽提試劑盒操作步驟進(jìn)行) (1)稱取待檢病料0.1 g置組織研磨器中剪碎并研磨,加入1.5 mL PBS(pH 值7.2)繼續(xù)研磨成勻漿后,8 000 r/min 離心5 min,取其上清液100 μL,加入500 μL 消化液、10 μL 蛋白酶K 混勻,置55 ℃水浴中過(guò)夜。病毒細(xì)胞液、血清、陽(yáng)性對(duì)照液、陰性對(duì)照液(滅菌去離子水)可直接取100 μL,加入500 μL 消化液、10 μL 蛋白酶K 混勻,置于室溫下10 min。(2)從水浴鍋中取出樣品,加入酚300 μL(用前不要晃動(dòng),不要吸到上層保護(hù)液)、氯仿/異戊醇混合液(24/1)300 μL,顛倒10 次,12 000 r/min 離心10 min。(3)取500 μL 上清液置于滅菌離心管中,加入500 μL 異丙醇混勻,置液氮中3 min 或-70 ℃冰箱中30 min。取出樣品管,室溫下融化,13 000 r/min 離心15 min。(4)棄上清,倒扣在衛(wèi)生紙上吸干(1 min),沿管壁緩緩加入1 mL 75%乙醇(凍存),13 000 r/min 離心15 min。(5)棄上清,倒扣在吸水紙上吸干(1 min),再將離心管開口置50 ℃恒溫金屬浴中15 min 或真空抽干15 min(以無(wú)乙醇為準(zhǔn))。(6)取出樣品管,用30 μL 滅菌去離子水溶解沉淀,模板-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3.2 單相PCR 檢測(cè)方法的建立 分析測(cè)定PCR 反應(yīng)最適條件,包括退火溫度、引物濃度、MgCl2濃度等因素[7],首先確定每種病毒單相PCR反應(yīng)最佳條件。

        1.3.3 多重PCR 檢測(cè)方法的建立 在單相PCR的基礎(chǔ)上,進(jìn)行多重PCR 試驗(yàn),其反應(yīng)總體積、各引物和試劑的劑量不變,各模板比例按等劑量加入,減少滅菌雙蒸水的用量,擴(kuò)增條件統(tǒng)一以退火溫度較低的循環(huán)參數(shù)為準(zhǔn),試驗(yàn)結(jié)果較好[8]。

        1.3.4 PCR 檢測(cè)敏感性試驗(yàn) 將提取的2 種病毒DNA 模板,用Gene Quant Ⅱ核酸定量?jī)x測(cè)定其含量,然后將2 種病毒模板分別進(jìn)行10 倍系列稀釋,各取1 μL,按照優(yōu)化的PCR 反應(yīng)條件進(jìn)行PCR 檢測(cè),以其模板最高稀釋倍數(shù)擴(kuò)增呈陽(yáng)性為其PCR 的敏感度。

        1.3.5 PCR 特異性試驗(yàn) 將病料作DNA 提取后,用多重PCR 檢測(cè)方法,擴(kuò)增體系中加入2 種被檢測(cè)病毒的引物與DNA 模板,同時(shí)設(shè)豬瘟病毒(CSFV)、豬流感病毒(SIV)及陰性對(duì)照,按以上條件進(jìn)行相同的PCR 擴(kuò)增。

        1.3.6 PCR 產(chǎn)物檢測(cè) 采用1.5 g/L 瓊脂糖凝膠,PCR 產(chǎn)物15 μL,與上樣緩沖液3 μL 混合加樣,用TAE 電泳緩沖液,電壓5 V/cm,單相PCR電泳30 min;多重PCR 電泳40 min,紫外凝膠成像系統(tǒng)中觀察結(jié)果并拍照、記錄。

        1.3.7 自然感染病料的檢測(cè) 用建立的多重PCR 方法,與北京世紀(jì)元亨動(dòng)物疫病防疫技術(shù)有限公司提供的2 種病毒PCR 檢測(cè)試劑盒,對(duì)采集的82 份病料進(jìn)行2 種病毒的單相PCR 檢測(cè)與多重PCR 檢測(cè)對(duì)比試驗(yàn),以多重PCR 檢測(cè)陽(yáng)性數(shù)與單相PCR 檢測(cè)陽(yáng)性數(shù)之比為其二者的陽(yáng)性符合率。

        1.3.8 臨床樣品檢測(cè)應(yīng)用試驗(yàn) 從10 個(gè)發(fā)病豬場(chǎng)和門診病例的病豬無(wú)菌采血樣,分離血清于1.5 mL 離心管中-70 ℃保存?zhèn)溆谩F蕶z病死豬取有明顯病變與健康部交界處的淋巴結(jié)、扁桃體、脾臟、肺、肝、腎等組織,-70 ℃保存。共收集血樣和病料211 份。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 單相PCR 檢測(cè)擴(kuò)增結(jié)果

        按照2 種病毒單相PCR 優(yōu)化后的反應(yīng)條件,分別進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,結(jié)果如圖1、圖2 所示。

        2.2 多重PCR 反應(yīng)條件的優(yōu)化結(jié)果

        多重PCR 反應(yīng)條件為總體積20 μL:MgCl2(150 μmol/L)2 μL,dNTP(2.5 mmol/L)2 μL,10×PCR Buffer 2 μL,2 種病毒的上下游引物混合液各2 μL(每條引物濃度10 pmol/mL),2 種病毒模板各2 μL,Taq 酶(0.5 U/μL)2 μL,滅菌雙蒸水4 μL。

        多重PCR 的擴(kuò)增條件:94 ℃3 min;94 ℃30 s,55 ℃30 s,72 ℃30 s,循環(huán)35 次;72 ℃延伸7 min。

        2.3 PCR 敏感性試驗(yàn)結(jié)果

        測(cè)定出所用模板的DNA 含量是:PPV 為16 ng/μL,PCV2 為19 ng/μL;10 倍稀釋2 種病毒模板后,分別進(jìn)行100~10-5的單相PCR 與多重PCR 擴(kuò)增,結(jié)果如表2 和圖3 所示。

        表2 PCR 敏感性結(jié)果

        由表2 可知,多重PCR 比單項(xiàng)PCR 病毒的最低核酸檢測(cè)量降低了約100.5~102個(gè)數(shù)量級(jí),但仍然具有很強(qiáng)的敏感性,達(dá)到了pg(微微克,10-12g)級(jí)別,表明建立的多重PCR 反應(yīng)具有很高的敏感性。

        2.4 多重PCR 特異性試驗(yàn)結(jié)果

        經(jīng)過(guò)一次擴(kuò)增,可檢測(cè)出多重PCR 相應(yīng)病毒的特異條帶,目的基因全部擴(kuò)出,CSFV,SIV,陰性對(duì)照全部為陰性,而且無(wú)交叉反應(yīng)。多重PCR重復(fù)性及特異性與單相PCR 結(jié)果完全一致。

        2.5 多重PCR 對(duì)自然感染病料的檢測(cè)結(jié)果

        單相PCR 與多重PCR 的陽(yáng)性符合率平均為100%,建立的多重PCR 檢測(cè)方法具有良好的特異性和重復(fù)性,診斷條帶清晰、無(wú)交叉反應(yīng),在臨床診斷中準(zhǔn)確率可達(dá)98%以上,可用于臨床診斷。

        PPV+PCV2 mPCR 擴(kuò)增結(jié)果如圖4 所示。

        2.6 臨床樣品檢測(cè)結(jié)果

        211 份樣品中檢出豬圓環(huán)病毒2 型(PCV2)陽(yáng)性56 份,陽(yáng)性率為27%;豬細(xì)小病毒病(PPV)陽(yáng)性42 份,陽(yáng)性率為20%;二者混合感染17 份,陽(yáng)性率為8%(圖5 和表3)。

        表3 多重PCR 檢測(cè)PPV,PCV2 病原結(jié)果

        3 結(jié)論與討論

        (1)在建立多重PCR 體系中,引物的設(shè)計(jì)是關(guān)鍵,經(jīng)分析PPV,PCV2 基因組信息后,在單相PCR 引物的基礎(chǔ)上,設(shè)計(jì)出了適于多重PCR 的2 對(duì)引物。利用2 對(duì)特異性引物,在一次PCR 中擴(kuò)增出豬細(xì)小病毒(313 bp)、豬圓環(huán)病毒2 型(447 bp)的特異性片斷,成功地建立了PPV,PCV2 的多重PCR 檢測(cè)方法,試驗(yàn)證實(shí)了該方法特異性強(qiáng)、敏感性高和重復(fù)性好,可節(jié)省40%的檢測(cè)成本和時(shí)間,適用于臨床鑒定豬細(xì)小病毒和圓環(huán)病毒2 型,為鑒定這2 種豬病毒提供了一種準(zhǔn)確、快速的技術(shù)手段。

        (2)應(yīng)用山西省農(nóng)科院畜牧獸醫(yī)研究所動(dòng)物基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究課題組建立的多重PCR 檢測(cè)技術(shù),在211 份樣品中檢測(cè)出豬圓環(huán)病毒2 型陽(yáng)性56 份,感染率為27%;豬細(xì)小病毒陽(yáng)性42 份,感染率為20%;二者混合感染陽(yáng)性17 份,混合感染率為8%。證明山西豬群已比較嚴(yán)重地感染了這2 種疫病,今后應(yīng)加強(qiáng)防疫免疫等綜合措施。

        (3)在我國(guó),PCV2 和PPV 造成的豬繁殖障礙最為普遍和嚴(yán)重,特別是這2 種病原?;旌细腥?;病毒既可水平傳播,又可垂直傳播;可以引起70%以上的初產(chǎn)母豬發(fā)生流產(chǎn)、產(chǎn)死胎、弱仔,仔豬死亡,免疫抑制等危害,造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失?,F(xiàn)在豬細(xì)小病毒和圓環(huán)病毒2 型疫苗已經(jīng)在生產(chǎn)中廣泛應(yīng)用,通過(guò)大家不懈的努力,一定能夠有效地控制這2 種病毒的流行。

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